Basic Information

Gene Symbol
L3MBTL3
Assembly
GCA_002803265.2
Location
NW:362935-372674[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
zf-C2HC
Domain
zf-C2HC domain
PFAM
PF01530
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
This is a DNA binding zinc finger domain.
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 2.6 1e+04 -3.9 1.2 2 6 633 637 633 637 0.95
2 2 1.8e-08 7.2e-05 22.2 0.3 1 28 1261 1288 1261 1289 0.97

Sequence Information

Coding Sequence
AtggatttaaattcattaaaagatCCTCACAATTCACGTTGTAACATTAGTCCATTAAATGACAACAGTAATACAAGTGGTACAAATGTTACCAAATTAAATGAATCTACTTTAGTTAAACTAGaacaaaaagaaattaaacattttgaaattgatgatgatgatgatgatgatgatgactgTGTTGTATTATCTGAACAACAGGTGCCAGTAAAGCAAATGATAGCAACTACCTCTGTAGNNNNNNNNNNTGAACAACAGGTGCCAGTAAAGCAAATGATAGCAACTACCTCTGTAGTTAATGTGcctaaactaattaaaatcaataaacatcCTCACTACATAAAAAGTTCATCGGATATCAGTAATAATACAAGTGGTACAAAAGTTACCAAATTTAATGAATCTATTTCTACTAAACTTCAAGCTCAAGACACtggaaatgttaaaattagaGATAAACATGATGTTGAAATATCTAAACGACAGAGGCCAGTAAATCAAATTATGGAAACTACTTCtgttataaatgaaaacaatctTCACAAAATTAGTAGTTCATTGGATAACAGCAATAGTAGGACTGATAaagaaattatcaaattaaatgaatcTACTTCAACCAAAGTACAAGAACGAAAAAAAACCGAACATTTTAAAGTTggtgataaaaatgttgttgaaACATTTAATCAACAAGTGCCAATAAAGCACACGATTCCTACTGCATCTGTTATTAAATCACCTACTATAAATGTAAAGGATATAAATTTTCGTAAATCTCATATGGAATTGAGTAATTtagtgaaaattaataataaaaaacgtaaTATAGAAGttgctaaattaaataaatctacttCAACTAAAGTATATGAACAAAAAACACCTGTAAATTTAAGAATTcttgataattttagtaattatgaaaaatctaaACTGATTCCATATGAGAAAGTTATTAAAACttcttttgttattaatacacccaaaaaaattccaaataaaatatttgtaaaaccaaacaatttttctttaaatttagaaaaaattgctGTTCCAAAAACAGTTATGTCTAATGTGAAAACGCTACCTTCATTTATGTCTAGCCAAATTAAAAAGCCATCAACAATCTCCATACCTTCAACTACACACATCAATCcaaaaaaaccaattattacAAGATTGCAACCAAAGTTAAATCctgttaatattacaaataataaatgtgtttcaACATCAAAACCCgggttcaaaataatatcttcaaATGATCTCAAGTCAAAAATGGTTCTATTTCCACAAAATAAaggtaaatatgtattaacaaatatagataatagaaaAGTTACAAATTTTCCATCTTATATTTCTACTTCACCAATGTCAAAACCATCAAATTCTATAATACCAGTTACAGTCGCTGAAAAGTTTAATACTGttgaaaaaccaaaaattaaaaatattaaatcaaaatttgttgTTAGCTTCAAAgcatttcaaaatcaaaaattcaaagCTTTACcgattgaaaaaaacattgttttcaaaaaattcattaatttatttaaatcaaacgtTAAATTTCAACCTATACAACAGAGTTCTACAAATTCatttattagaaaacaaaaaagaaaacttaaaCCTCATACAGATTCATCtagttctaaaataattaagattgaCTTAAGTACTACAGAGTCTGAACATAATCAGCATGAAAAAGAACtatcattaaacaaaaataaaaatttaactgattTTGGTAATTTAAGTAGACCGATAAAGCATATACCCCATACTATTACCAGTAaagatgtaataaaaaatcatacaaatatggttattataaatgataaaactaaaataaataccaatgttaaaaaaaatttgtgccCTGTGCCTGGGTTTATTCAACTATCATCAAAACCTGAATCTCTAATCAAAACATATGGTCAATCTACAAAATATgGTAATTTTACTACTAAAGAACCAAACACTGTAAGattagtacattttaattctattaatcaatcaaaaacaaaattgaatgcTAATGTTCATGGAGATGGTAAACATGTattagtacaatttttaaaaaacaataatagtaattcaaATAGTACTATTGCTAAAGTTCCTActgataaaatgttgaaaataattcctAATAAAGTTCATGTGCCACAAtatcaaaaaattaatacagcaactaatgaaaaaaatatgatttatcctCATGTATCATTCTTGGAACCATGGAAGAGAAGTTCAAAGTCAAATACTCATGCTAAAACCTCAAGAATGACAAAATCAGTTCCCGTTAAAATGATTATGCCAAAAATTTCAcaaacaGGTGTGAGTGGTCCATTTAATCAATGTGAATATGAATATTGTGATACAATAGCATACAAACCTGAAATGATAGATTATAAGTATTGTAGTTTAGTgtgtaaaagtttaaatactaaaCTAATGATAGCTACACAAAAGCCAAAACCTATTGCTGCTGCACAACCACAAGAAAATAcagatttatcaaaaaaacctGTGATTGATCGAAAAATGCTTTTAGCAAAATTGAGAAgtagaattaataaaagaaagcAAAGCTTACCATCTtttcaaaaagaaaatgtgTCTGGTCATGATTTGGATCAAGTTGAACAACTTAATAAGATGGCTTTAAAAATGCCACCACCTGCAATACCAATAACTGTAAACCATTCTTTAccatataaaagaaaattttttaacctaAATGAAGCTTCAGCAGttgttcaaaattgtaaacAAGAAActgcaaaaatatttagctaTTTGCAACATACTGATTATATACCTGCTCCaagaaaattgtttgataatcCCTTTCCACATGATTCTAACCCTTTTAAAATTGGACAAAGATTAGAAGGTATTGATCCAGAACATGAAgcattattttgtgtaatgaCTGTAGTGGAAGTTtgtgGATATCgcattaagttaaattttgatgGCTATtcagatatatataatttttgggtAAATGCAGATTGCCCGGATTTGTTTTTTCCTAGATGGTGTGAACAAAACTCTCGCACTTTACAACCACCAAAGAATTATAATCAACCATTTAAGTGGACTGATTACCTTAAAATACCAGGTGTTATGCCTGCTCCAAAATGGAATTTTCCTAATGCCTTAAATACTAATCGTATCACTAATCATTCATTTCGTATTCGAGCGAAACTAGAAGCATTAGATAAATTAACCCGCACAACATCAAAGCCGCTTATATGTGTTGCTACTGTTGCTGATATTTTGGGGAATCGTATACGTATTCATTTTGATGGTTGGGCAGATGATTTTGATTACTGGACAGATATCACATCAACTAATATACATCCAGTTGGATGGTGTGATAAGAATGGACGTTCTTTATGTCCACCTAGTGGTTatgataattgcAAAGGAAAAAAACCTTTTTCTTGGGCTAATTACTTAAAAGAAACCAATAGTGAGCCTGTACCAGAAGATGCATTTTTTCGCAGACCATTACGAGAATTTACTAATAGCATGGCTATTGAAGTAGTTGATATTGCTAATCCTTCATTAATTAGAATTGCTAAAGTAGTAGATGTTAAAGGAGatgaacttaaaatactttatgatGGATTCGATACCATATATGCATACTGGATTGAAGATGACAATCCAAATATACATCCCCTTGGATGGTGTTTAAAGACCAATCATCCAATTGAGCtatttaaagcgaACTCAATACTTTGGACTTGTAGAGTTCCTGGTTGTAATGGTAAAGGCAATGTaaataattccaaaaataCTCATGTATTAGCTAAAGATTGTCCATATGAATTTGAGTcatggaaaaaattaatttctgggTTAGCAATTAAACCTGATAGGATAAAACCTGAGGACTATCTAATACCTTCAGTTCcgagttttttggaACCTGTAAGTACTGTTGCACCAaaagaagataaaaaaaaaggaaaattgaagtcaaataaaataaaaatctgtaaTTTTAAGAAACCTACAAAAAAATTCAGTAACAGatcaaaaatgaattttaaaaagaaggtACCTAACGGTCGATctaaatgtgtttataaaagAGCTGTTGATGCAATGGACGAATTAGATGTAATCATAGGTGTCAATGATTATACCAGTTATGGTTATGGTTCTTTTAAACGCCCAAGGCTTAATGTATGGACCAGGCATAGCGTTCTACAAGGTGtaccaatatttaatactactgATGTGAGAAAATGGCCTGTAAGAGAAGTAGCTACTTTTGTCGAAATAGTAGTGTCTAATAATTACACAGATGATGATCCCTCTGATCGaatcaaaatatctaaatcttttattaatcagGAAATTGATGGTGATGTATTTTTGATGTTAACTCAAAAAGATTTGAtggatatattaaacattcctCTTGGTCCAGCACTAAAACTGCATAATGCCATTGTAGTGTTAAGACAACGAACTTCTACATTAGATGTTGTAAATGGACTgtcaaaactaaaacaaaaataa
Protein Sequence
MDLNSLKDPHNSRCNISPLNDNSNTSGTNVTKLNESTLVKLEQKEIKHFEIDDDDDDDDDCVVLSEQQVPVKQMIATTSVXXXXEQQVPVKQMIATTSVVNVPKLIKINKHPHYIKSSSDISNNTSGTKVTKFNESISTKLQAQDTGNVKIRDKHDVEISKRQRPVNQIMETTSVINENNLHKISSSLDNSNSRTDKEIIKLNESTSTKVQERKKTEHFKVGDKNVVETFNQQVPIKHTIPTASVIKSPTINVKDINFRKSHMELSNLVKINNKKRNIEVAKLNKSTSTKVYEQKTPVNLRILDNFSNYEKSKLIPYEKVIKTSFVINTPKKIPNKIFVKPNNFSLNLEKIAVPKTVMSNVKTLPSFMSSQIKKPSTISIPSTTHINPKKPIITRLQPKLNPVNITNNKCVSTSKPGFKIISSNDLKSKMVLFPQNKGKYVLTNIDNRKVTNFPSYISTSPMSKPSNSIIPVTVAEKFNTVEKPKIKNIKSKFVVSFKAFQNQKFKALPIEKNIVFKKFINLFKSNVKFQPIQQSSTNSFIRKQKRKLKPHTDSSSSKIIKIDLSTTESEHNQHEKELSLNKNKNLTDFGNLSRPIKHIPHTITSKDVIKNHTNMVIINDKTKINTNVKKNLCPVPGFIQLSSKPESLIKTYGQSTKYGNFTTKEPNTVRLVHFNSINQSKTKLNANVHGDGKHVLVQFLKNNNSNSNSTIAKVPTDKMLKIIPNKVHVPQYQKINTATNEKNMIYPHVSFLEPWKRSSKSNTHAKTSRMTKSVPVKMIMPKISQTGVSGPFNQCEYEYCDTIAYKPEMIDYKYCSLVCKSLNTKLMIATQKPKPIAAAQPQENTDLSKKPVIDRKMLLAKLRSRINKRKQSLPSFQKENVSGHDLDQVEQLNKMALKMPPPAIPITVNHSLPYKRKFFNLNEASAVVQNCKQETAKIFSYLQHTDYIPAPRKLFDNPFPHDSNPFKIGQRLEGIDPEHEALFCVMTVVEVCGYRIKLNFDGYSDIYNFWVNADCPDLFFPRWCEQNSRTLQPPKNYNQPFKWTDYLKIPGVMPAPKWNFPNALNTNRITNHSFRIRAKLEALDKLTRTTSKPLICVATVADILGNRIRIHFDGWADDFDYWTDITSTNIHPVGWCDKNGRSLCPPSGYDNCKGKKPFSWANYLKETNSEPVPEDAFFRRPLREFTNSMAIEVVDIANPSLIRIAKVVDVKGDELKILYDGFDTIYAYWIEDDNPNIHPLGWCLKTNHPIELFKANSILWTCRVPGCNGKGNVNNSKNTHVLAKDCPYEFESWKKLISGLAIKPDRIKPEDYLIPSVPSFLEPVSTVAPKEDKKKGKLKSNKIKICNFKKPTKKFSNRSKMNFKKKVPNGRSKCVYKRAVDAMDELDVIIGVNDYTSYGYGSFKRPRLNVWTRHSVLQGVPIFNTTDVRKWPVREVATFVEIVVSNNYTDDDPSDRIKISKSFINQEIDGDVFLMLTQKDLMDILNIPLGPALKLHNAIVVLRQRTSTLDVVNGLSKLKQK

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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