Basic Information

Gene Symbol
pias4a
Assembly
GCA_949089665.1
Location
CARXXK010000002.1:83254071-83275401[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
zf-MIZ
Domain
zf-MIZ domain
PFAM
PF02891
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 1e-20 3.9e-17 63.7 0.9 3 49 312 358 310 359 0.94
2 2 1e-20 3.9e-17 63.7 0.9 3 49 892 938 890 939 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
aTGCGACACACGTCCgtacataataaagaCTTGATTAAGTTGGTACATGATTTCACACTAAATCAACTACAGCAAATTTTAGAAGCTGTTAAGCAGAACACATCTGGTAGCAAACGATCTTTACTCAAACGTGTTATACGTTTATTAATTGGTGCTCCTTTACCAGAAACAAAAAtcttacgaaaaaaaattttacaagtcTATGATTGTAAACCGAAACAAAACCAACAATCTCAACAACCACCGCAGGCACCAGTTGTACAACAGCCAATTTTTTTACAAGCTCAAAACAACCTTCAAATTCATAGCCAATCTTATACACCACCAAGACCAAATCCTATACAACCTTTTGTTGAAACCCCAAGCCTAGATATACAATTTGAGCACTTACCATTCCTTAAGACagtacatacattattaatgCCTATGGGCAtctattctaataataattctgcCAAATTTAATGGGCTATTTGATCTAACAAATAATGTTAGAAATTCTATTGTTGAATCATTCAATATTGCCAGTcgagaatatgaaattaaaattattttaagattacaACAAGTTCAACTTGATGAAAACGTTACTGGAAGTTTACCTTACAATCTCACAGTTTCTGTAAATGGTCGTAAATGTAAGTTACCTATCCCCAAAAAAAAAGCGGGCATCACAAGGCGGTACAATATTCCTATAGATATTACTAAACAAACGCTTTCAAGAAAATTTTCAAAGAACAAATTAAGAGTTACATGGTCAAAAGAACCACACAAATATATGGCTGGTCTATATGTGGTCCACAGATTGACTTGGAATGATTTGGTTGTAGAACTTAAAAAAAGACCCGTACGTGCCTCTGTTAAAACTAAAGAACtcattaaaaaaactattgaaaatctTGCTGATATGGATGTAGATACTATGCTTGCTACTGTTAAGGATCCATTAACTCAATTAAGAATGCAACTTCCTGCTCGAGGTGTAGACTGTAAACATTTACAGTGTTTCGATGCAATACCATTTTTACAGATGAATGAACAAAAGGAAACATGGAAATGCACATTATGTGGAAAACAAATTAAGTTTGAAAACATTGAAATtgatgagttttttttaatcatgCTCCAAAGTCCAGATTTAAGCGAAGAAtgtgaaaatgttgttttatttaaagatGGGACATGGTCAGAGAGAAATAATAgcgaattttcaaacaattGTAGAACAAATGAATGTGGATCTACAAACAATAGAGAAGTGTTTACATTGTCAGATTCTGATGATGATAATATGGAAGAATCTGTGATAAAATCTAAACATGTTACAGAAACTGTAGGTCTATCAAATCCTTCTGAAAGTGACATTGTGTTAGACttaagtcttaaaaataattcaactatATCGGTTTCTGGTAGTTCAAAGTATGAACCCATGGTCACATTAAATAACGATTCTAATCCATCAACTTCAGCTAATTCAAAGGTCACCACCACGTTGGCCTGGTCGCAGCCGATGTTGTTGTTCCTATTGTTGTTCTTGCATGGTTTGTCCCCCCCGGACCTCCGGGCGACAGTCCTGGCCGATCTAATTGTCCTACTCCATGGCTGGGGACATTGCACACTTTGGACGGATGACCACTGTCGAGAAGTGTTACGGCGAATGACTACTTTTCGGCAGCAACGCAGTGGTGGCGGCCTTTCAGGATCGTTGGTCATACTCGAATCTATAATGGATAAATCAATCGTTCGATGCAATgtacataataaagaCTTGATTAAGTTGGTACATGATTTCACACTAAATCAACTACAGCAAATTTTAGAAGCTGTTAAGCAGAACACATCTGGTAGCAAACGATCTTTACTCAAACGTGTTATACGTTTATTAATTGGTGCTCCTTTACCAGAAACAAAAAtcttacgaaaaaaaattttacaagtcTATGATTGTAAACCGAAACAAAACCAACAATCTCAACAACCACCGCAGGCACCAGTTGTACAACAGCCAATTTTTTTACAAGCTCAAAACAACCTTCAAATTCATAGCCAATCTTATACACCACCAAGACCAAATCCTATACAACCTTTTGTTGAAACCCCAAGTCTAGCTATACAATTTGAGCACTTACCATTCCTTGAGACagtacatacattattaatgCCTATGGGCAtctattctaataataattctgcCGAATTTAATGGGCTATTTGATCTAACAAAAAATGTTAGAAATTCTATTGTTGAATCATTCAATATTGCCAGTcgagaatatgaaattaaaattattttaagattacaACAAGTTCAACTTGATGAAAATGTTACTGGAAGTTTACCTTACAATCTCACAGTTTCTGTAAATGGTCGTAAATGTAAGTTACCTATCCCCAAAAAAAAAGCGGGCATCACAAGGCGGTACAATATTCCTATAGATATTACTAAACAAACGCTTTCAAGAAAATTTTCAAAGAACAAATTAAGAGTTACATGGTCAGAAGACCCACACAAATATATGGCTGGTCTATATGTGGTCCACAGATTGACTTGGAATGATTTGGTTGTAGAACTTAAAAAAAGACCCGTACGTGCCTCTGTTAAAACTAAAGAACtcattaaaaaaactattgaaaatctTGCTGATATGGATGTAGATACTATGCTTGCTACTGTTAAGGATCCATTAACTCAATTAAGAATGCAACTTCCTGCTCGAGGTGTAGACTGTAAACATTTACAGTGTTTCGATGCAATACCATTTTTACAGATGAATGAACAAAAGGAAACATGGAAATGCACATTATGTGGAAAACAAATTAAGTTTGAAAACATTGAAATtgatgagttttttttaatcatgCTCCAAAGTCCAGATTTAAGCGAAGAAtgtgaaaatgttgttttatttaaagatGGGACATGGTCAGAGAGAAATAATAgcgaattttcaaacaattGTAGAACAAATGAATGTGGATCTACAAACAATAGAGAAGTGTTTACATTGTCAGATTCTGATGATGATAATAGTAATTGTTAA
Protein Sequence
MRHTSVHNKDLIKLVHDFTLNQLQQILEAVKQNTSGSKRSLLKRVIRLLIGAPLPETKILRKKILQVYDCKPKQNQQSQQPPQAPVVQQPIFLQAQNNLQIHSQSYTPPRPNPIQPFVETPSLDIQFEHLPFLKTVHTLLMPMGIYSNNNSAKFNGLFDLTNNVRNSIVESFNIASREYEIKIILRLQQVQLDENVTGSLPYNLTVSVNGRKCKLPIPKKKAGITRRYNIPIDITKQTLSRKFSKNKLRVTWSKEPHKYMAGLYVVHRLTWNDLVVELKKRPVRASVKTKELIKKTIENLADMDVDTMLATVKDPLTQLRMQLPARGVDCKHLQCFDAIPFLQMNEQKETWKCTLCGKQIKFENIEIDEFFLIMLQSPDLSEECENVVLFKDGTWSERNNSEFSNNCRTNECGSTNNREVFTLSDSDDDNMEESVIKSKHVTETVGLSNPSESDIVLDLSLKNNSTISVSGSSKYEPMVTLNNDSNPSTSANSKVTTTLAWSQPMLLFLLLFLHGLSPPDLRATVLADLIVLLHGWGHCTLWTDDHCREVLRRMTTFRQQRSGGGLSGSLVILESIMDKSIVRCNVHNKDLIKLVHDFTLNQLQQILEAVKQNTSGSKRSLLKRVIRLLIGAPLPETKILRKKILQVYDCKPKQNQQSQQPPQAPVVQQPIFLQAQNNLQIHSQSYTPPRPNPIQPFVETPSLAIQFEHLPFLETVHTLLMPMGIYSNNNSAEFNGLFDLTKNVRNSIVESFNIASREYEIKIILRLQQVQLDENVTGSLPYNLTVSVNGRKCKLPIPKKKAGITRRYNIPIDITKQTLSRKFSKNKLRVTWSEDPHKYMAGLYVVHRLTWNDLVVELKKRPVRASVKTKELIKKTIENLADMDVDTMLATVKDPLTQLRMQLPARGVDCKHLQCFDAIPFLQMNEQKETWKCTLCGKQIKFENIEIDEFFLIMLQSPDLSEECENVVLFKDGTWSERNNSEFSNNCRTNECGSTNNREVFTLSDSDDDNSNC

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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