Ltri005593.1
Basic Information
- Insect
- Lydus trimaculatus
- Gene Symbol
- L3MBTL3
- Assembly
- GCA_037414755.1
- Location
- JAZBGY010000784.1:17885-21773[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2HC
- Domain
- zf-C2HC domain
- PFAM
- PF01530
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This is a DNA binding zinc finger domain.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 1.3e-14 3.7e-11 42.5 5.0 1 29 897 926 897 926 0.98
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTCATCTTTAACAAGTGACCCACCATCATCAAGGGACAACggtgaatttttacaaaatcatgttgaagattcatttaattgttattcaacaacaaaaaatgaatcatttcAACAAGTAAGATCACAAATGCTACcatttgtttatatacaaacaccgacaaaattaccattttcatCACCAACAACCGCAATcactacaacaacagcaacaactacaactattactaccactactactactactactacaactattacaaataataataataataataataatttactagTAAATAGTTTGCCACAATTACAATTTGCCACAATaccaacaaattgtttaaatcaaaaaacatcaacattagTACAATCGAATCAAAGTGTTATATTAACACCGGTAAAAACTGATGGTAaatcacaacaattattaatacatAAATCATCTGTACCAATTGTACCagtaacaacagcaacaaaattAACTGGTACATATTTAACAATGTTGAAACCAgtaacaaaaatcaatgatgagaataattgcaaaaaattagataataataattctaatgataatagtaataatggtacaacaaatcaaaaaatattattagcaCCAATGCCAAAAAGTATAAAAAATCGTCTATCAGTTACTGTAACCACTAATACGAATATACAaccaaaatttacatttatgcCATTAACTATAccacaacaagaacaacaacaacaacaacaacaagatgagaaagtatttaatataaaaataacaaatggtCAAATACAGAATGATGAcaatcaaattgaaacaacaaaaacaacagatattattgttaataatgatgaaattgttgatttaagtCAAAATTCGACGAAAAGTGACGGTATTGaacattttctaattgatGAATCTATTGattctaaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaaattgtagtaaatcgtgatttaaataaagataattttagattttcaaaACATGGTATATCGATATTGAagaagaattttcaaaatgataaatttcgtaatttatcaaaatttacaacaaaagataatgatgttgatattgaaaatcgtttattacctcaacaacaacaacaacaacaacaacagcaaccaCAACAACCAAACAAAACTGAACGTAGACGTAAATCGAATTTCTCATATAGAAAAGATTATGATGATATGGAGATTTTAGATGAACCGAAATTAGATCAATTCAAAGatattttcgattataatCAAGATTTAACATTAACTAAATTAAAGAATGGCagtaataattgcaataataacaacaataataataataatgttgataaagatttaaaaaaatatttaaaatggcATAATGGTATTGGTAGTTTGCCTGATGTTGaatatcataaatatattgaacaaaaattagataaaactaAACGAGTAGAACAACAgcctcaacaacaacaacaaccaaacaaTGAAATCCAAGAAGATTTACATTGTATTGAATGTGGTTGTTATGGCTTACCATCTGAATTTATAACACCGAAATATTGTAGTTTAGATTGTCAAGAAgctggtaataataaattattaaaagttagggatttaaaatttaaacaacATGAGAATCTTAGTggtaatagtgatgatgaaattatatcaaatgataataattctcaAGATAAATATTCATATCCATGGACATGTACGAAAAAGGGTTTTTCATGGACAAAATATTTAGAACATGTTAAAGCAAAATCAGcaccaattaaattatttaaagatcCATTCCCATATGATCGTAATAATTTTCGTATTGGTATGAAATTAGAAGGTATTGATCCATTACATCCATCATATTTTTGTGTATTAACAATATCAGATATATGCGGTTATCGTTTACGTTTACATTTTGATGGTTATCCggataattatgatttttggTTAAATGCAGATAGTATTGATATATTTCCAATTGGTTGGTGTGAAAAACATGGACATATATTACAACCACCGCCTGGTTATAAAATTGGCAATTTCAACtggatgaattatttaaaacaaacaaaatcaacagcAGCACCCAAACATTTATTTGCTAATAGAGTGGGAAATACGATATGTCCCAACGGTTTCCGTATTGGTATGAAATTAGAAGCTGTCGATAAGAAGAATTCATCATTAGTTTGTGTAGCTACAGTACGTGATATGATGGATAATCGTATTTTAGTCCATTTCGATAGTTGGGATgatatttatgattattgGGCTGATCCAACATCACCATATATACATCCGGTTGGTTGGTGTGATCAAACTGGACATAGTCTAACACCACCAAATGattatcCAAATCCGGAAACGTTCTCAtggaataaatatttaaaagaaacaaaatccTCAGCTGTACCATCTAGAGCATTCAAACAACGTCCATCTAATGGTTTTAAACGTGGTATGCGTTTAGAATGTGTTGATAAACGTGTACCACAATTAATACGTGTTGCTACTGTTGATCAAGTTAAAAACCATCAAATACGTATACATTTTGATGGTTGGCCTGATCGTTATAGTTATTggattgatgatgatagtgatgatatACATCCAGTTGGATGGTGTCATAAAACTGGTCATCCATTAGAACCACCATTAACACCTGATGATATTTACGATTTTTTGGAATGTCCAACAGTTGGTTGTCGTGGTATTGGTCATTTACATGGTCCTAAATATGCTACACATTCtgaacaacaatattgtcCATATGCTGAAGATAATATCGATGCAGAACGGGTATTACCAGATCGATTATTATCACCAGATCGATTAATTGAAGCAGTTGTGCCTGTTTCTTGTATACCAAAAGAGAAAATaaaaacaaagcGATCATCGAAATTTCGTCGTTTAGATTCAACAAattccacaacaacaaaactatcaattggtacaaaaattgatgataatttctttgttaaaaAGCCACGTCGTAAATATCGTAAAcgtttaaaaattgatgagaatggtgatggtggtggtggtgattgtggtaatgttgatgttgatgatgatgatgatgatgaagatgatgatgaaaataaaataaaagcaaatcaattgattgaattatcaaaaattgaaccAGCCCAACAAGAAATATGGCAAAAACATTCACAGTTTCTACAAACATATATAAGAAATTGTGATGATGTACGTGATTGGTTAGATGATCgtgttattgaatttataaatagtaTACCAGATTGTAGATTTGAtgttgaacaatttaaaacgATGAAAATTGATGGTGAAGCATTTCTATCATTAAGTCAAAAAGATTTATTAGATATTTTACATATGAAAATGGGACCTgctattaaattatataatattattgttttattgagaCAAAAAGTCAGTCACAACAGCCTTTTCCATTGA
- Protein Sequence
- MSSLTSDPPSSRDNGEFLQNHVEDSFNCYSTTKNESFQQVRSQMLPFVYIQTPTKLPFSSPTTAITTTTATTTTITTTTTTTTTTITNNNNNNNNLLVNSLPQLQFATIPTNCLNQKTSTLVQSNQSVILTPVKTDGKSQQLLIHKSSVPIVPVTTATKLTGTYLTMLKPVTKINDENNCKKLDNNNSNDNSNNGTTNQKILLAPMPKSIKNRLSVTVTTNTNIQPKFTFMPLTIPQQEQQQQQQQDEKVFNIKITNGQIQNDDNQIETTKTTDIIVNNDEIVDLSQNSTKSDGIEHFLIDESIDSKQQQQQQQQQQIVVNRDLNKDNFRFSKHGISILKKNFQNDKFRNLSKFTTKDNDVDIENRLLPQQQQQQQQQQPQQPNKTERRRKSNFSYRKDYDDMEILDEPKLDQFKDIFDYNQDLTLTKLKNGSNNCNNNNNNNNNVDKDLKKYLKWHNGIGSLPDVEYHKYIEQKLDKTKRVEQQPQQQQQPNNEIQEDLHCIECGCYGLPSEFITPKYCSLDCQEAGNNKLLKVRDLKFKQHENLSGNSDDEIISNDNNSQDKYSYPWTCTKKGFSWTKYLEHVKAKSAPIKLFKDPFPYDRNNFRIGMKLEGIDPLHPSYFCVLTISDICGYRLRLHFDGYPDNYDFWLNADSIDIFPIGWCEKHGHILQPPPGYKIGNFNWMNYLKQTKSTAAPKHLFANRVGNTICPNGFRIGMKLEAVDKKNSSLVCVATVRDMMDNRILVHFDSWDDIYDYWADPTSPYIHPVGWCDQTGHSLTPPNDYPNPETFSWNKYLKETKSSAVPSRAFKQRPSNGFKRGMRLECVDKRVPQLIRVATVDQVKNHQIRIHFDGWPDRYSYWIDDDSDDIHPVGWCHKTGHPLEPPLTPDDIYDFLECPTVGCRGIGHLHGPKYATHSEQQYCPYAEDNIDAERVLPDRLLSPDRLIEAVVPVSCIPKEKIKTKRSSKFRRLDSTNSTTTKLSIGTKIDDNFFVKKPRRKYRKRLKIDENGDGGGGDCGNVDVDDDDDDEDDDENKIKANQLIELSKIEPAQQEIWQKHSQFLQTYIRNCDDVRDWLDDRVIEFINSIPDCRFDVEQFKTMKIDGEAFLSLSQKDLLDILHMKMGPAIKLYNIIVLLRQKVSHNSLFH
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 80% Identity
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