Ltri001485.1
Basic Information
- Insect
- Lydus trimaculatus
- Gene Symbol
- mybA
- Assembly
- GCA_037414755.1
- Location
- JAZBGY010000124.1:21608-24123[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 5 0.034 26 4.7 0.0 22 45 265 290 259 291 0.85 2 5 9.4e-12 7e-09 35.3 0.5 1 43 297 341 297 342 0.96 3 5 1.3e-11 9.7e-09 34.9 0.0 2 46 351 400 350 400 0.95 4 5 3.7e-09 2.8e-06 27.0 0.0 1 46 408 453 408 453 0.97 5 5 1.5e-06 0.0011 18.7 0.1 1 43 459 501 459 504 0.95
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGAttataacgataataatgaacaagaTGTGgcgaaattaattgaaattatcaatcatcataaaactgaaataagcaaaGAACTCGAAGATGAATTCggtgattttatcaattttgatcaaaataaaaatgaagatATATTATTTGAAGATTCCGATACAGATATTGAAGTTTTCGATGATGAAGAAACCACACtcaatgaacaacaacaacaatcgaatgGTTTAACAGAATATGAAGCTGAACTGATTGATTCATGTAGAGATCCAGAATTACAACAAGTACTCACATTGAATCgttcgaaaaatttcaaattaatcaaattacgTTCgtatattgataatttattgtatgaatgtgataaaacaattaatcaacaaaatattagtTATGGTGATGATTTCacattaccaccaccaattaAACCAACAATATGGAAATTGGGTGCAccatattttaaatcaataaattattattgtagtccatataatgatgatgttaaacGTAAGAAAACTAATcgagaattattattaaatgatttattatatgaaCCACAACCATGGACGAAATTAGattgtgataatttattaaatggtgttttattaaattataatattaataaacaaactaatATCAAACGACAGATTTGTAgtttaaaacagaaaattgagACTAGTGACGacaaacaacatttatcaaCAAAGATACACGATCTAGAAGATGAATTGGAACGGTTGAATACTGTCGGTATCAATGATACACCGCCTGCATTAAATAGTGATGATTATATCGATTGGGGTAAAGTTGCAGAGACTTTTCTTGATGATAGAAGAACTGGTGATGAATGTCGTGCATTATGGCACATTTATTTACATCCGAATATTAATAAGAAATCTTGGACTAAAGAAGagaacaataaattgatgaaattagtaAAAGAgcataattatcaaaattgggaattaatttcatcaaaattagaAACGAATCGTTCACCATTCACAGTAGCCTTACATTATTATCGTGATTTACATGATAAATATGCTCATAcgaaatttacacaaaatgaagatcaattattattggaattagTTGATTTGTATCGTATTGGTGGTAATTTTATACCATGGCGTAAAATAGCTGAATATTTCCCATATAGATCACGTCAACAATTATACCATCATTACACGTATTATCTATCAAagaatgatttaataaaaaaaggcAAATTTTCAGATGCTgaagatattttattattaattttagttgatcGTTTTGGTACAGATTTTCGTAAATGTTCTGAATTTATTGAGAATCGTAGTCAAGTACAATTGAAAAGTCGTTATCgacaaaatttagaaaattataaacgtAAAGGCACATttacaaatgatgatgatttagaaatattgaaacatgTTAAACATAATGGTGAACGTTTATGGGGTATATTAAGTAAGAAATTAAATCGTACTAGAGGTACATTACGGCAacgttatcaaattattaaacaatatttaaaaacaaatacaaatgcTAATATTGAAGATATACCAAAACGTAAACATCGTGAATTGATGAAGCAACATCAACATTACGAATTTATACGGTATGTTGctgataaatttaaagatgTGGAAATTGTACCGACTTTAGATGTAATTAAAGAATTCCTACAGAATcctgataatgatgatgatgatgatgatcgtaCAACTaccacaataaaattgaatagaaatcAGTGTAATAACAAAAGTACGAAAAGTATCGACACAATGCTGATAGATTTCTTTGCCAATTCgtgtaaattacaacaaagGAAATATGTGAAGAATTTCGATAGAATCTCGAATGTTGTTAGTGAAACTTTAACAATTCTAGATGCTAATCTAGAAATACCAGCCGATTATGATAACGATTCTAGATTAGACCATATAGATAAGATTATTTTGAATCGGTTAACAATAAAGAatgatttagataaaaatcgtttattacCGCCCAATATTAGTACGTTAATTGGTTTAAGAAGTATGCTacttaaacataaatattccGATAAGAATGACAATGATgataatcgaattttatgGGAAATTGAACGTAATCTAAtaaatcatgataataatgaacaaaatcaaattataaatgatcGACAATTGTTTACTGAACGTTTCAACAAATTGTTCACATGGAGCTCGATTTTATCATTGGAACCACCACCGCCAATCTGTaccgatgatgatgatgatttagacGAACCGATGGCTAAACGGCgcaaattggaaaatattaaaacttaCACCAAacgaaatacaataaaacccTCAACAAGTCGATGTAATTTGTGA
- Protein Sequence
- MDYNDNNEQDVAKLIEIINHHKTEISKELEDEFGDFINFDQNKNEDILFEDSDTDIEVFDDEETTLNEQQQQSNGLTEYEAELIDSCRDPELQQVLTLNRSKNFKLIKLRSYIDNLLYECDKTINQQNISYGDDFTLPPPIKPTIWKLGAPYFKSINYYCSPYNDDVKRKKTNRELLLNDLLYEPQPWTKLDCDNLLNGVLLNYNINKQTNIKRQICSLKQKIETSDDKQHLSTKIHDLEDELERLNTVGINDTPPALNSDDYIDWGKVAETFLDDRRTGDECRALWHIYLHPNINKKSWTKEENNKLMKLVKEHNYQNWELISSKLETNRSPFTVALHYYRDLHDKYAHTKFTQNEDQLLLELVDLYRIGGNFIPWRKIAEYFPYRSRQQLYHHYTYYLSKNDLIKKGKFSDAEDILLLILVDRFGTDFRKCSEFIENRSQVQLKSRYRQNLENYKRKGTFTNDDDLEILKHVKHNGERLWGILSKKLNRTRGTLRQRYQIIKQYLKTNTNANIEDIPKRKHRELMKQHQHYEFIRYVADKFKDVEIVPTLDVIKEFLQNPDNDDDDDDRTTTTIKLNRNQCNNKSTKSIDTMLIDFFANSCKLQQRKYVKNFDRISNVVSETLTILDANLEIPADYDNDSRLDHIDKIILNRLTIKNDLDKNRLLPPNISTLIGLRSMLLKHKYSDKNDNDDNRILWEIERNLINHDNNEQNQIINDRQLFTERFNKLFTWSSILSLEPPPPICTDDDDDLDEPMAKRRKLENIKTYTKRNTIKPSTSRCNL
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -