Basic Information

Gene Symbol
Atf6
Assembly
GCA_015586225.1
Location
NW:133943-156366[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
TF_bZIP
Domain
bZIP domain
PFAM
AnimalTFDB
TF Group
Basic Domians group
Description
bZIP proteins are homo- or heterodimers that contain highly basic DNA binding regions adjacent to regions of α-helix that fold together as coiled coils
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 1.2e-16 1.1e-13 50.7 8.7 2 62 498 558 497 560 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGATGTGGACAATGAAAACTTTTACGATGAAATAGCATCGTTTATGCCGCAACcgggagactatagtctagaagaTTTAGATGAAATAATACGTTCTACAGACTCTCACTTGGATGCTTCGTTGGACATAAATGCATTTGCTAGTGCTTTTAATCAAAATGATTTTGATATGACAATAGCTGAAACGGGAAAAAATAATGACGAGCAAAAGCCAGCAACAATACAACATTACCCACAATCGATGGGAGAGGAAACACAGAAAAATTACGAAAatgattttcaatttaattttccagCATTTCCTTCACCTGCTACCTCACAACAATCGGCAGGTTATTCATCTCCCTATGAGACACCGGCTCGTACATCATCACCCACCTCCATAGATGGTGATCATTTTAATCCAGatgattttattaattttctcaATGATGATGATGTAAAAATTGATGATTTGACACGCGAAACTATTATGaaactaaatgaaaattgtcGCAATACACCCTCACCAACAGGCAGCTGTACAAGTTCTAGTGGTAGTTCCACAAGTGGCATACAGAGTGACGCTTCATCGGTGTCTTCTATGtcacaaaattataaatgtagAATGAGCCAAGAACAGGATGATGATCTATTagagtttattaaatttaaaaatgagaaatttgatCGTGAGAAACAAATGAATAATGAATCATCTATAACAACACAATCTGCTCAACAATGTTCGGATAATACAGCTTCTATGGGAGTGGAAATGCcagcaccaacaacaacaacaactcctGCAGCTAACTTAATGCCTATTACTTTGCCGGTATTGCCTGTGACTAACATACAAAGTGTACCGCCCGTAAACTTTGTACAAGGAACTATAATTCCTGTACAAACGGTACCTTTAACAACCGTTAATCCGGTGGTTAATATTAAAGCACCCACGgctattaaaattgaaaacaaaacacCAGCCAATAAAACTGTTAAAGTGGCGGCAACTGCAAATACAACCACTGTTGGTAGTCCAAAAGTAACACCACCCACAAATGCAAAACCCAAAACCATATTCCTATCCTCGAATGATTTCAAAGCTTTAATGCAAAAAATGAATACAAATGGCAAAAAAATCACTGGAGCTAATGGTCAAATGCcgaaaattataatgaaaactgcTAATGGCAAAGTTATAACtgcaaataaattaacaaacaatTCCACCAATAGCACAACAATATCATCGTCGACGCCCTCGTCTGTCAGTATTAATAATTCCCCTACGACAGCAGCTGCATCTTCACAATCTCAATCTATACAATTTGTATCGAAAATGGTTAAAGCCAGTGGACCCATGTTGGTTAAGCAACAACCCTCCAAAGTTGTCACATCGAATGCACGTTCTGCTGCAGTTATGGCTGCTGCCAGAGCCACACTGAGCCACACCAGAACTAATCGCAACGACTTGGGTATGCTAAGGGGTCTCAACGAtgacaaattgttaaaaaaacaattgcGTATGCTAAAGAATCGAGAATCGGCCTCATTGTCACGTAAAAAGAAAAAGGAATATGTTGAAAGATTAGAGAATCGTATAAGTGATTTGGAAAAGGAGAACTATTCATTAAAAGGGGAAAATTCCTCTTTACGTTCACAATTAATGGCATTCGCTCAAACCTGCAATTGTAAACATGGCAATGTTAGTGAATTCATTCTCAACACCCTAAATATGGATGGTAAAAATGGTGGAGCAGTATTAAATGCAATCGATACAACATATCTTTTGAACAATGCCAAACAACATTTGGATAATTGTGGCAGTGCTgcaaataatcataataattgtggtagtacaacaacaacagcatcaacAACACATCATGTGAAGATAGCTCCAAAACCTGCCAACGCCTCGGGTGCATTCTCGAATAAAGGTTTCAAACAACGCATGAATGCGGCCACAGTTAAGAAAAATGTGGCTGTACTCTTTGCCATGGCGTTTATGGTAACATTGAATGTgggtaattttcaaaattatctaAATAAATCTGCTCTCGAGAATGCCATCGAGACAACGGTCAACGATGAGCCAGTGGTACAAACTGGACGACGTTTGTTGTGGGTTCCAAATGAACATGAGTTTCACGAACAGACAAATCGCAGTAAGCGTGAAACTGAAATGGCAAATATGCCACCACCGCCATTGCATTTCTTGCGTCCCGTTAATCGTACCACAGCGGATAAGATGAATGGCACTTCGGCTAAAGATGAGCCACCTATAAAAAGGCCTTTGACTACGACTTATGCAAATGCTACACAGGAAAATATGCGATTGGCAAGGAATTTACATAAATGGATTGGCGGCAATGACTATTTGAATTTAACTGGCAACGGAATTGGCAATGATTTTGAACAAATGGATCACTTTAAATTTAACTCTGGCTCTTATATGGACTACGATTTACCGCTACAGGCTCCCATTGGCACGAAACAGAAACGTAAAATCTTTTTGGACACagaaacacaacaaaaacacacaaaattgAATATGGAAGGAGAACGTAATTCATTAGACTTGTTTAAGCCCAGAATTAGTGAGGAATATTTGAGACTTTTTAGAGGCATTAAAAGACAAGATGATACTTTCTATGTTTTATCCTTTAATATGGATCATATACTATTACCGGCTTCCGTTTATAATAAAAGTTCACGCCCTAAAATGTCTCTCATGTTACCGGCCGGAGACCCATCACACAATGGCGATATTGTGCTAATGCAAATTGACTGCGAAGTCATTAATACCACAGAGCTGGAGATCAAATCCCATATGATACCAGAAAAATTAAGACCCTCTAAATATTCGGCAAATGTACGTGTTAATCCAAATGATGTTGCCAACAATGAAACGGCTGGTCCAGCTTCAGCTGCGGCAactaaaacaaatgaaatacCTTTAAAGAGAGAAGAATTGAAAGAGAAACCTTCTGCTCCGCGTACTTATTTTATGATGGGACCCAAAAATCAAGTCTCCTCCACGCAAGCATCTAATTCCACGGTCAGCGGTGTAAATGTGGTTAAAAGGAAACCAActattgttaaattaaatgcCAACGATAGTGTTATTGGCAGTGGCGTTTTAAATGTACGCAATTCTACATTATTTTCACGCATGCGCGAAACGGTTGTTTCACAGAATAATGGTTTTGTAGCGGCTACAGAtgttaagaaattaatttaa
Protein Sequence
MDVDNENFYDEIASFMPQPGDYSLEDLDEIIRSTDSHLDASLDINAFASAFNQNDFDMTIAETGKNNDEQKPATIQHYPQSMGEETQKNYENDFQFNFPAFPSPATSQQSAGYSSPYETPARTSSPTSIDGDHFNPDDFINFLNDDDVKIDDLTRETIMKLNENCRNTPSPTGSCTSSSGSSTSGIQSDASSVSSMSQNYKCRMSQEQDDDLLEFIKFKNEKFDREKQMNNESSITTQSAQQCSDNTASMGVEMPAPTTTTTPAANLMPITLPVLPVTNIQSVPPVNFVQGTIIPVQTVPLTTVNPVVNIKAPTAIKIENKTPANKTVKVAATANTTTVGSPKVTPPTNAKPKTIFLSSNDFKALMQKMNTNGKKITGANGQMPKIIMKTANGKVITANKLTNNSTNSTTISSSTPSSVSINNSPTTAAASSQSQSIQFVSKMVKASGPMLVKQQPSKVVTSNARSAAVMAAARATLSHTRTNRNDLGMLRGLNDDKLLKKQLRMLKNRESASLSRKKKKEYVERLENRISDLEKENYSLKGENSSLRSQLMAFAQTCNCKHGNVSEFILNTLNMDGKNGGAVLNAIDTTYLLNNAKQHLDNCGSAANNHNNCGSTTTTASTTHHVKIAPKPANASGAFSNKGFKQRMNAATVKKNVAVLFAMAFMVTLNVGNFQNYLNKSALENAIETTVNDEPVVQTGRRLLWVPNEHEFHEQTNRSKRETEMANMPPPPLHFLRPVNRTTADKMNGTSAKDEPPIKRPLTTTYANATQENMRLARNLHKWIGGNDYLNLTGNGIGNDFEQMDHFKFNSGSYMDYDLPLQAPIGTKQKRKIFLDTETQQKHTKLNMEGERNSLDLFKPRISEEYLRLFRGIKRQDDTFYVLSFNMDHILLPASVYNKSSRPKMSLMLPAGDPSHNGDIVLMQIDCEVINTTELEIKSHMIPEKLRPSKYSANVRVNPNDVANNETAGPASAAATKTNEIPLKREELKEKPSAPRTYFMMGPKNQVSSTQASNSTVSGVNVVKRKPTIVKLNANDSVIGSGVLNVRNSTLFSRMRETVVSQNNGFVAATDVKKLI

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

90% Identity
iTF_00921193;
80% Identity
-