Lvar020897.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Leucophenga varia
Gene Symbol
-
Assembly
GCA_018903435.1
Location
JAEIFJ010001527.1:60808-74488[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 30 7.6e-16 2.5e-12 47.7 3.0 1 86 90 162 90 163 0.84
2 30 4.3e-15 1.4e-11 45.3 3.7 1 87 190 259 190 259 0.83
3 30 2.2e-16 7.1e-13 49.5 0.2 1 87 281 353 281 353 0.85
4 30 3.9e-16 1.3e-12 48.7 3.1 1 86 429 498 429 499 0.82
5 30 7.3e-15 2.4e-11 44.6 5.3 1 86 523 594 523 595 0.81
6 30 0.0008 2.6 9.2 0.1 50 87 614 640 602 640 0.74
7 30 4.2e-11 1.4e-07 32.5 1.0 1 79 685 747 685 757 0.71
8 30 5.3e-16 1.7e-12 48.2 0.2 1 86 782 850 782 851 0.80
9 30 1.1e-06 0.0037 18.3 1.7 25 86 877 924 871 925 0.78
10 30 3.6e-15 1.2e-11 45.6 3.9 1 87 952 1024 952 1024 0.85
11 30 1.3e-14 4.2e-11 43.8 2.8 1 86 1087 1159 1087 1160 0.82
12 30 3.6e-12 1.2e-08 36.0 0.3 1 86 1182 1249 1182 1250 0.81
13 30 6.3e-15 2.1e-11 44.8 1.7 1 87 1363 1432 1363 1432 0.82
14 30 9.3e-12 3e-08 34.6 2.0 1 86 1522 1589 1522 1590 0.78
15 30 1.1e-12 3.5e-09 37.6 2.3 1 86 1692 1763 1692 1764 0.80
16 30 6.9e-14 2.3e-10 41.4 0.4 1 86 1800 1872 1800 1873 0.81
17 30 2.6e-14 8.6e-11 42.8 2.0 1 87 1901 1972 1901 1972 0.83
18 30 1.5e-14 5e-11 43.5 0.1 1 87 1993 2063 1993 2063 0.84
19 30 4.9e-05 0.16 13.1 0.1 1 58 2116 2166 2116 2185 0.82
20 30 8e-13 2.6e-09 38.0 0.3 1 86 2207 2280 2207 2281 0.82
21 30 5.5e-16 1.8e-12 48.2 1.1 1 87 2309 2393 2309 2393 0.78
22 30 2.5e-13 8.3e-10 39.6 0.3 1 86 2545 2616 2545 2617 0.76
23 30 5.6e-12 1.8e-08 35.3 5.7 1 87 2700 2771 2700 2771 0.82
24 30 1.8e-14 5.8e-11 43.3 2.0 1 86 2841 2911 2841 2945 0.86
25 30 7.4e-15 2.4e-11 44.6 0.0 1 87 2968 3044 2968 3044 0.78
26 30 5.1e-15 1.7e-11 45.1 2.8 1 86 3098 3168 3098 3169 0.83
27 30 3.4e-13 1.1e-09 39.2 0.4 1 86 3264 3333 3264 3334 0.82
28 30 1.1e-13 3.4e-10 40.9 0.1 1 87 3471 3541 3471 3541 0.85
29 30 2.4e-13 7.8e-10 39.7 2.6 1 86 3578 3645 3578 3646 0.80
30 30 8e-12 2.6e-08 34.8 0.9 1 87 3652 3720 3652 3720 0.83

Sequence Information

Coding Sequence
ATGCCGCATATAAAGTCTGAGATTAAAGTCGAACCAGATTTCTATGCAACAACAGCAACAAATTCCACAGACTATCAGCAGCAGCAACGTCAAATGAATACGTCGTCGCACAATTTTAATGATTATAACAACACCACAAATGATTCCTATTCAAGTTCACATAATTCATCTAGTTATATGAACGATTACGCAGATGCTGCTACACTGAATGCACAACAAATACAAGCAGCTAATGCCTCAACATTGGATGATTCGGAAGAAGCAGTGTGTTGTGTACCACGCTGTGGCGTACGTAAGAGTACAAGCTCTACACTGCAGTTTTTTACATTTCCCAAAGATGAAAAATACTTGCATCAGTGGCTAAGTAATCTGAAAATGCTACACATACCGGCATCCACTTATGTGGATTATCGCATTTGTAGTTTACATTTTCCGAAACGTTGCATTAATCGTTATTCGCTGTGTTATTGGGCTGTGCCGACATTTAATTTGGGACACGATGATGTTGCAAATCTTTATCAGAATCGTGAGCTAACAAATACATTTACCACGGGTGAAATAGCACGTTGCAGCATGCCAAATTGTAAGAGTACACGCGGCGAGAGTAATGTAAAATTCTATAATTTTCCCAAAGACATTAAAAGTCTGATTAAATGGTGCCAAAATGCTCGTTTGCCAGTACAAACGAAGGAACCACGTCACTTTTGTGGACGTCATTTTGAAGATCGTTGCATTGGTAAATTTCGGCTGAAACCATGGGCTGTGCCAACGTTAAATCTGGGTACGCCGTACGGTAAAATCCATGACAATCCACAGAATCTGTTTACGGAGGAAAAACGTTGTTGTCTGACATTTTGTCGTCGTAGTCGTTCGTCTGATTTTAATATGTCGCTATATCGTTTTCCGCGTGATGAAGTACTGCTGCAGCGTTGGTGTTATAATCTACGTTTGGATCCGTCAATTTATCGTGGTAAAAATCATAAAATATGCAGCGCACATTTTATAAAGGAAGCGCTGGGTCTACGAAAACTTTCACCGGGCGCTGTACCCACTTTAAATTTGGGTCATAACGATACATTTAATATCTACGAAAATGAATTGTACGCACCACCACCGCCGCCGCCACAGAAATATTATCGTCAATCGAGTAACATGTCAATGTCTAACTCAGCTGATAGCTACAAGAATAGCACACTCTTTATGCCACCGGAAGCAGCATCACCCTATTCGAATATTACAAATTCCGCTAGTAATACACCAAATGTCACCGAATCCATGGATGTTTGTTGTGTTCCAGAATGCGATACGAAACGTAATAATAACGAAGATATAACGCTGCACACAATACCACGACGTCCTGAACAATTGCAAAAATGGTGTCACAATCTTAAAATGGATGAAGATAAAATGCACAAAGGCTTGCGCGTTTGTAGTTTACATTTTGAGCCATATTGCATTGGTGGCTGTATGCGTCCGTTTGCAGTGCCAACGCTACGTTTGGGACACGACGATGAGAACATTTACAAAAATCCGGATGTTATTAAAAAGCTTAATATACGTGAAACATGCTGCGTACAAATTTGTAAACGTAATCGTGAACGTGATCATGCCAACTTGCATCGTTTTCCCTCGAATCCGATTTTATTACAAAAATGGTGCGATAATTTACGCAAACCAGTGCCAGACGGTACGAAAATGTTTAACGATGCCATCTGTGAGGTACATTTTGAGGATCGTTGTTTGCGTAATAAACGTTTAGAGAAATGGTCTGTGCCGACTTTAAAATTGGGTCACAATGATCTGGTACATGTGCTACCCACGGATGAGGAAATATCCGAGCTTTTACGTATTTGTAATCTGCACTTTGAATCGCATTGTATTGGCAAACGTATGCATGCCTGGGCTATACCAACGCTAAATCTGGGCAACAATATAGAAAATCTCTATGAAAATCCGGAACATCATACGATGTATATAAAGAAAGAGCGTAAACAAAAATGGGGACACTCTGATGATGCTGCGTATGGAACAAAAGCCGCTTGGGTGCCACGCTGCTGTTTGCCACATTGTCGCAAAATGCGCGCCACAGACAATGTGCAATTGTATCGTTTTCCGAGTAATAATCGTGCCATGCTCAGCAAATGGGCGCATAATCTACAAGTTGCGCTTGTGGGCAGCGCACAGCGACGTGTATGCTCGGCGCATTTTGTACCCGAAGTGCTGACCAAGAAATGTCCAATACAACACTCTGTACCTACGCTGGATCTCAATACGCCGCCAGGCTATAAAATATATCAGAATCCAGCGCGACTTTTGGCACCGAAAATCAATTCGCAACGCGTTTGTGTCATCGAAAGTTGTCGCAAAACACGCGCGGATGGCGTTAAGCTTTTCCGCTTTCCACATAGCACTGCTTTGCTACGCAAATGGTTGCATAATCTCAAAACACGCCCAAAGGGTGGACGCATACACTGCCGCATCTGTTCGGATCATTTTGAGCCGTATGCTTATACTGAGAAGCGTTTAGCTAGTGGTGCAGTACCAACATTAGATTTGGGCCACAATGACGACGATCTTTATCCTAATGAGGCGGAAGCATTCGCTGAAGAAAATTGTTGTGTACCCGGTTGTGATGTAGATCAATTATGGAAATGGTGTAACAATTTGAAAATGAATCCTATTGATTGTCCGGGCATACGCATATGTAATAAGCATTTTGAACCGGAATGCATTGGTACCAAACATCTATTTAAATGGGCTATACCAACATTAGCGCTGGGACATGATGACACGGATATTGAGCTGGTGCCAATACCCAAACAAGATGAACGTTATGCGGATCAAGTTTTTAAATGCTGCGTCGTAAGCTGTGGCAAGACGCGTAAACATGATGAGGTACAAATGAATAGCTTTCCTAAAGATCCAAAACAATTTCGTCATTGGAAACATAATCTTAAGCTGGAACATTTAAACTTTAACGAACGTGAAAAGTACAAAATCTGTAATGCACATTTTGAGGATATTTGCATTGGTAAGACACGTTTAAATGTGGGCGCAATACCAACCATAAATCTGGGACATGAAGACACTGATGGACTGTATAAAGTGCGTCCGGAGAAGCTGCAAACAAATTTATTTGGTAAGCATCGTGCAGTGCTGGAATCTGAAACAAGTGCGGATAGCAAAATAACGGAAGATGTCAACTCAGATTTAAATTTAACACAAGTAAAAATGAAAAAATCTTCAAATATTTTAAAATGCTGCGTGCCCAATTGTCGCAAAAGTCGTCTGCAACATGGCGTCGATCTTTACAGCTTTCCATTCAGCAGCAATAATCCGGTGCTACTAAAGAAATGGCGCCACAATGTGCAGCTATCAATGTCAGCATTAAATCAAGATTTACGCATTTGCAATATGCATTTTCATAAACGTTGTTTCGATGGCAAAGAACTGCGCCCGTGGGCAGTACCTACTATGCAGCTCGGACACTACGATCCGATTTATGAAAATCCAAAAAATATACCCGGTTTCTTTCTGCCCGTTTGCGCGCTTAATCATTGTCGTAAGCGGCGTACAATTGATAATGATTTGCGTACATATCAATTTCCAAAAGGTTATCTGCTCGAGAAATGGTGCGCAAATTTACAACTCGAAGTGGAAAATTGTCGCGGACGCATTTGTGCGGAACACTTTGAACCGGAAGTACGCGGTAAATTGAAATTAAAAACTGGTGCAGTGCCAACATTAAAATTAGGACACAATGATGCAATACCATATAATAATGAAGATATCAAAGAGGCTGAGCAGAATAAACGTGAATGGCAGGCGGCGGCAGCAAGTAAGCATCATGATGAGCAGCAGCTATACGATGAAATGGAAGCAGTCGATATGAATAATACAGATGAAATGATGACTGCTGCTGAGGATGATGATGATTATTATGATCCATTGAAATTTGTCGAGACGACGCAGCAGCCGGATGAAACAAAAGTTGAGGAGAAATTAACAAAAATTATACAAGAACATACCTACTATCCGTATGCCGCCAGAAAAGCAGAGAAGCCAGTAAATAATGTGACACCAATTTGTTGCCTAAAACATTGTCGCAAAGAGAAAACGCCGGAACGACATTTGAGCACCTTTGGTTTTCCCAAGGATCAACAAGTGCTGCTAAAGTGGTGTGATAATTTGAAATTAAAATTAAACGATTGCATCGGGCGTGTTTGTATAGAACATTTTGAACCGGATGTGCTGGGCAGTCGAAAGCTAAAACAGGGAGCAGTGCCAACAATTAATGTGGGACACAATGAAGCGTTACGTTATAGTTGCTATGGCTATGAAATGCCAACGCCGGAACAACAAATGCGACAACAACAAGACGACAATACAACGGATGCAAGTAGCAATGAATCGGATGAATTTGAAGCAGGCGGCGAGGAGGCAACAGCTGACAACTCAAATGGTTCGGTTTTTCGGCTTTTTAGCCTAAAACATTGTCGCAAAAGGAAAACATCCGAACCACCCGACATGCCAAATAACACGACAACACGTAGCATAATGCAATGTTGTGTTCCAAATTGTCATAGAACTAATCTGGAGACACGTTTAAATCGTTTACCAAAGCAACGTTTACTTTATTTAAAATGGGCGCATAATTTACAATTAACAACAACGCCGGAACGACGTAATTTCCGTGTTTGTAATGTACACTTTGAAACGTATTGCAAGCGTAATGGTTTTATACTGAATGGTGCTATACCCACATTAAAATTGGGAAACACTGTGAAAATCTATCATAACAATTCAAAGCAGCTGCTGCGGCGGCAGCGGCGTTGGCGTCGCCATGCAAATAACAAACAGAAGAAGCAGCATGATGTAAGCAAAAAAACAGCAACAACGACGACGACGATAAAAACGAAAACAAATCTAATGCAGCAAGCAATCTGGAAACGTTTCGATTTAGCTGATATGTATAATGATGGCAGCAGTAATTCATTCATAATGCAGCAACAGCCGCAAAAGAATTTTATTAAAACCACAAAATCAGAATCACCAAAACGCATACCCAAAGTCTGTTGTATATCCACGTGCAATGCTGATATACAAGAACGGCGTCAACTATTTCGTTTTCCGGCGGCGGCAGCGGCCACAGAATGTCAATTACAAAAATGGTGCGTTAATACACAGCAACCTATGGGCAAGGTATCCAGTTTATATATATGCTATCGTCACTTTGAGCCGGATGCAATTTGTCAATATCAGCTACGCCCATGGGCAGTGCCAACACTTGAGCTGGGACACACGGATTTCATAATACAAAATGCAAAACATTTGGGTAACTTTCATACGGATGATGAGCATACCAGCGAAGATATGCAATATATACGTAGTAATTATTGTGCCGTAATTAGTTGTTTTCAAAAGCGCAGCACAAGCATACGTCTCTATCCGTATCCAAGTGAAATGTCGCTAATACGCAAATGGGCTACAAATTGTAAGCATCGTGCATTTCAAGCTAGCAAATATGGACTACAAATATGTCAAATGCACTTTGAACCGGATTGCTTTGAGAGCACGGATAATGGTGAATTGCGTGCTGGTGCAGTGCCTACGTTAAAACTTGGTTTAGGCGAGGGACAACATATTGTCACGAGTGAATGGGTTGAGGTGAAGCGTAAAACGCCTACATTTCGCATGCATTGCATAGCGCCGGGATGTTCCGCAACAAATACAGAGGATACACGTTTATTTATGTTTCCGAAGATACCGGAAACATTTGAGCTGTGGTGTAAAAATCTTAAATTGAATCAGGATGTGCAAAAGCATAAGGATATGCATTTGTGTAAGCGTCACTTTGAGCCGCATTGTTTTACGGAATCGGAACGTTTGTATAGAGGCGCCTTGCCTACGCTAAACTTGGGTCATAACGATACAGATAATGTGACACATTATGAACGTTACAATTTAGTGAGTCACTGTTGTGTGCGCGGTTGTGGTAAGACCAAAGAGGATGGTGTACGTTTAAGTGCATTTCCAATTAATGTGGAATTATATGAAAAATGGTTGCATAATTTGCGGCTGCCGGAAACGTATCAAATTACAGTAAAGGATAATGTTTGTAATCGCCATTTTGAGCCACAATGCTATCAATATGGACGTTTAATAAGCGGTGCAATGCCGACGCTGCATTTGGGACATGAAGATGAAAAGGATGCGGAGGAGTATATTTTATATCAAAATGATAACTTAAGCTCGAATCTGAAACGTTTTAAAAGTGTGCCACGTACGCATACGCCTACGTCTACGGCAGCAACTACATTGCCTTTAGTATTACCAGAATTTGATTGCTGTTTTCCCGAATGCGAACAATTAGCAAATCCAAAAATGCGTCAGGAATTTAAGTTTCCGGCTGATGTGGCAATACGTGAATTGTGGTGCACTGTATTGGGCTGTAAAGTGGATGATATAGATGCTTTAAAACTATGTCCATTGCACTACATCTATCTTTATGAAATAACTATGGAAGCTGATATAGAAAACATTACGCCGGAAACGCTTGAGTCACTTCGAGCGGAATATCTAAAAGCTAAAAGCAATGCACGCATTTTACAAATAAATTGCGCTGTGCCACATTGCACCAGTCTGCTGCCGCGTGATAATATTAAATTGTATCCATTACCATTTAATCATGATACGCTGGAAAAATGGTTACACAATTTAAATCTAACAAATGTTGGCAATCGGCGTACGCTGCTAAAAGTATGCGGCGAACATTTTGAAGCACGCTGTACACAGGCATCGGCAGTAAAACGTTTAAAGATCTGGTCCATACCAACGTTAAAACTGCCGCCGGAGGTGGTTCAAGCTGGCAAGATTTATGAGAATCCAAGCATCAATGAATTAGAACGTTATAATTCGGAATATTGTTGCATAAGCGGCTGTAAAAATGCGCGCGATGCTGTTAAGGCAGAGCACGATGAAGGCGACGACGATGCAAACACACCGACGCCCGTAACATTCTATTCATTTCCACGCCGTGATGCTGAAGTCTTACGCAAATGGTTGCACAATACACAGCAGAAGGCGCGCGATTCATTTGGTGCACGCGTCTGTGCGCGTCATTTTGAAAGTTATTGCTTTGGTAAGCGTCTACGTAATTGGGCCATACCAACATTGCACTTGAGTACGGAGCTGCAGGATATTTGTCAAAATCCAAGAAGTCATTTTGAGCCAATTGTCAAAATGGAATTGTTAGATGATGATGAAATGTTGGATAATACTGTGGAACAATCCTTTCAAACCAATGGTGGCGATGACGATAGTCAAGCGGCTTATGATGCGGCGGATACGTATGATGCTGATGATGATGTTCTTATGCAGTATACGCCAAATGATACAAGTCAATATGCTGCTGATAATGATGAAACATACCAAGATGATGATGACGATGATGTTACGGGTATGGGCGCTTTGGAGGTAATGTTAGAAGTTGGACATATAGAACAGCTGGATACATACGAAATAAAAGATGAACCAATAATACCGGCACACACTGTGGTACAAGAAGGCATATATAAATCAAGCATTATTAGCAAACAAGCACAGCCCACTACAAATGCAAATGCGCGACGCTGTTGCATTGTGGGCTGTACAACGCGTAATACAACGGATGCCAGCATTAAATTGCATAAATTTCCACAAGCGCCGCTGGTACTGAAGAAATGGATGCATAATAGTCAAACGATTGTCGATCGTACATGTCCATGGCGTTATCGTATATGTGGACTACACTTTGAGCCGGGTGCATTTAATGGTTATCGTTTTCGTTATGGCACTATGCCAACGCTACGCTTGGGACCAAATCGTCCGGCGCAAATCTATGAAAATGAATTTAATCTTGAGAAAAGTAGTCATAGCAGCAACGTTGCCATTGCGGCAGCATATAGTATACCAAAACCAATACGCATACGCGATCATACGGGAAAGTTTGTTAAAAAAGATCTAACATCGTCGACGTCGACGCCGTTTAAGCAGGAACGCGATGATAATAGCATGGATGATGACACATATATGAAGCAACTTAAGACGGGCAAATATTGTCAGGTCAAGGGATGTCACAATCATCTGCATACCGAAGGCGTAACGCTGCATAAATTTCCGCAACAAATGCGTTTATGGAAGAAGTGGAAACATAATACGCAGATACCCATCGATAATAATTTTCCATGGCGTTTTCGCGTGTGTTGCGTACATTTTCATCGTAGTTGTTTGGCCAAGTCACGTTTACTCTTGGGCAGTGTGCCGACGCTAAATTTGGGACCCGATGCGCCGGCACAATTATATCAAAATGAATTCTCACCTGAAATACAATTGGAATGTGATGATGAATTAAATACGGAAACGGATTATGTTGATATCGATTGTAGTCAAGATTACGTGGCTGACGATGATTACGATGAGGACAGTAACGCTGATTATATGCCAAAGCAAACGTTTAAAAGCAACAGTGTCATGGGTAAATGTTGCATACCCGGTTGTAATATGCAAAAAACAACGCCGGGACTCACATTTCATAAATATCCAAGTCCTACGGAAATTTTGAAAAAATGGTTACACAATACACAAGTAAAAGTTGATTTAAATTTTCGTTGGCGTTATCGTATTTGTAGTTTACACTTTGAGCCGGCATGTTTTCGGGGAGCACGCCTAGCAGCCGGTTGTGTGCCAACGCTATGTTTGGGCCCAAATGCGCCGGCGCAATTGTATACAAATCAGAAGGTATTAAAACGCATGGAACGCTGCGAACAAAATAATATAACACCAAAAGCAATACCGGATATAAAACCAAAAATCGATTATATACCAACAAGCACCACGACAAGCGCTTTTAATCGTTTAACATGTTCGATAGCAACATGTTTACGTGTCTCGGGACAAGATGGTGTTTCATTGCATCGTTTGCCGCATGATGCTGCAGCGCGTGCGAAATGGTTAATACACTGCACTGTGGATCAGAAATTAGCTAATAATATTTATTATTTACGCATTTGTAGTCGTCATTTTGAGGCACATTGTTATATGGGTGTACCCGGAAAACGTTATTTGAAGCAAGGCGCATATCCGACATTAAATTTACCAAAATTAACGGGCAAAGAAACGGAAATTGTCATCAAAGAAGAACTTGTGAAGCAGCAGCAGCAGGCGGCGACGGCGTTGGAGCAGGAACAAGAGCAACTTACGGCAGATAATGTTAATATTACGTATAATGAAATAAAATCCGGCTATGGTAAATGTTCGCTGCTGCATTGTCAAAAGCAGAAATCACAGCACGGTGTCACCATTTATAAATTTCCAAAAGCCTTGGCGCAACAACAACGTTGGTCACACAATTTACGCATACGCTATGATCCGCAACGTCCGTGGAAATATTTGATATGTAGCGAACATTTCGAAAAGGAATGTGCCAATTCACGTAAATTATATAAATGGGCAGTACCTACACTGTTGCTCGGTGATAATGTTCCCATTTTATTGTATACAAATAATCAATGTAAACAATTATGTAGCGGCGTGACAGGCAGCTCATCGGATGATAATGAAGCGGATGAAAAGCCACAAACAAGCACTGCAGCAGCAACAGCACCGGTTAATTCGTCCATTTTAACAACGCGTCTACTCGGCGATGTGCGCGTAAAAAAGGAGGCAACGGAACAGTTTGAATCAAATTCAGCCTTCTGGGCTGCAGCTGCACGTGCGCCGCCGGCTATGTTGAATTATAAAAATAAAATCTGTTGTTTGCCACATTGTCGCTTGCCACGTGGTGAGGGCATTAAATTATTTCGTTTACCAACAAATGTGCATTTGATACGTAAATGGGAACATAATACGGGCATCAGTTTCAATGAATCGCAACGTAATACAAAATTAATTTGTAGTCGTCATTTTCCGTCAAATCTAATTGGTATACGTCGCCTGTCGAAGAGTGCAGTGCCCACATTGG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Protein Sequence
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