Lsal016587.1
Basic Information
- Insect
- Leucoma salicis
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_948253155.1
- Location
- OX411826.1:17465315-17483449[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2H2
- Domain
- zf-C2H2 domain
- PFAM
- PF00096
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 7 2.2e-05 0.002 19.2 0.8 2 23 2624 2645 2623 2645 0.96 2 7 0.022 2 9.7 1.0 1 23 2651 2673 2651 2673 0.97 3 7 0.023 2.2 9.6 2.1 2 21 2680 2699 2679 2704 0.93 4 7 0.013 1.2 10.5 0.2 1 23 2712 2735 2712 2735 0.93 5 7 0.18 17 6.8 0.3 2 23 2742 2766 2741 2766 0.95 6 7 3.5e-05 0.0033 18.5 4.5 1 23 2775 2797 2775 2797 0.98 7 7 0.34 32 6.0 0.1 1 23 2803 2826 2803 2826 0.93
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTGTAGACCTCTCCGTAACCAGCAGCACGTGCCCACAGATGGCGCTGCCGCACGTGTAGTGGCGCGTGGTCGCGCGCGGCGGTGGCGGCCGACCACGCCGCCCGCGCGCACCCCCCCGCGCCGCCCCGCGCGCACGTGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTATACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCTGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCGCTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTGCACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGAGTGCCCTGCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTATACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGAGAGTGCCCTCCACCTTCCTCACTGACACTATCTGCGCACCCCCGTACCTATGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCTGTGAGTGTCCTCCACCTTCCTCACTGACACTATCCGTACACCCCCGCACCTGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGAGAGTGCCCTCCACCTTCCTCACTGACACTATCTACGCACCCCCGTACCTATGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCTGTGAGTGTCCTCCACCTTCCTCACTGACTCTATCTGTGCACCCCCGCACCAGTGCGCCGCCTGCGGACATGTTGCGCCGTGATACTCTGGGCAAACTCCGCAACCACATCAAGAGCCACGGTGCGAGGCAGGAATGTGAGCTGTGTGGAAAAAGTTTCAGAGATCGCACCTCGCTACGGACACATCTCTTCATACATCGAGGCGAGAAAGAGTACTCCTGTCCAAAATGTAACAAGAAATTTTTGTTCAAGAAAGCGATGGAGGTACATTTGGTCACTCACGAAGCGCCAGCGAATCTCTACTGTTACCAGTGCGACATGAATTTCAAGAACCGGATGTCTTTCACCCAACATATGAAGTATAGTCTCAAACACATTGACCCGGCGAAACTTAAGTATGCCTGTCAGCTCTGCGACAAGAAATTCATAAAAGCCACTAGATTGGAAGAACACAGACTGGCTGTACATCTGAAGGCGACGCCCATACAATGTACCGTGGCGGAGTGTGTGTTTGCCTGCTCGTCGAAGCCGGTACTACGCACGCATATGCGCATGGTGCATCGTAATGTACGAGCACAGAGGAACCACGTCTGTCACACCTGTGGGAAGACTTACACTACGAAGAAAACACTCGAAGGCCACATCCGCAGTCACACGGGCGAGCGGCCTTTCACATGTGGCCTGTGCCCTGCGACATTTGGCTACGAGGCCGCCTTGTATAACCACAACAAGCTTGTGCATTTGAAGGTCAAGATCGGCTATCTCCTGCTACAGCAAAACGCAACGATGTGCTTCATGGCCGGTCACACGGGAGATGGTGGTACCAACCCGCTCGGGCCCGATACCAAGTGA
- Protein Sequence
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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