Basic Information

Insect: Lamprigera yunnana
Gene Symbol: bab1
Assembly: GCA_013368075.1
Location: JABVZV010002652.1:1880967-1912070[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: HTH
Domain: HTH_psq domain
PFAM: PF05225
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 2 8.4e-10 7.8e-07 28.8 0.0 1 35 33 68 33 73 0.92

2 2 1.5e-16 1.4e-13 50.5 0.0 2 43 196 238 195 240 0.95

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	2	8.4e-10	7.8e-07	28.8	0.0	1	35	33	68	33	73	0.92
2	2	1.5e-16	1.4e-13	50.5	0.0	2	43	196	238	195	240	0.95

Sequence Information

Coding Sequence: atggttgatgaattACCAACGGTGGAGACATCTGTTTTTCGTTTAACTAGTCACACATaTTATCGCAACTTACTAAAGCTTAAAACGCCGACATGGACGCAAGAACAGTTAAAGGAAGCGATCGACGCTGTTGTACAACAGAAAATGCGTTTCACTCAGGCTTCGTCGCGCTACGGAATACCCAAGGGAACACTTTACGATAATATTCTGGGCAAATCGAAACGCATGGCTGTATTAGAGGAAGCAGGTTTGACACCGCGCGAAGAGGAAGCGGTTTTAGAATTTTGTTGCGACGTTTCGGTTTCGCCGTACAACAGGCGCACGAAAAAATCGCTTCAGTCCATATTAAACTTTGTCGAAAAGATACGTCGCGTACGCGATCCCGAGTTCATGTTCACGGGATTATCGGGGTTTAGATGGTGGTGGGCGTTTTGCAAGAAGCACAGTATCGTTTCTCTTTTTTACGACAACGCAGATAGTTACCAATACCAACTGCAATCAATGTGGCAAAAGTGTTGGAGTACCAATCAAAGTCTTGTACATAATTTACGGTTCCGAGAGAGGGGTCCCCTGAAATCGTGGAGACCAGAAACGATGGCCGAAGCAATTTTTTCCGTTCTAAAAGAGGGATTGTCATTATCTCAAGCGGCAAGAAAATACGATATACCATATCCAACTTTTGTACTTTACGCTAATAGAGTACACAATATGTTAGGACCTTCAGCGGATGGGGGTTCAGatTTACGACCAAAAGGCAGAGGAAGACCCCAAAGAATATTATTAGGTGTTTGGCCAGATGAACACATTAAAGGAGTTATACGAGCTGTAGTATTTAGGGATTCTCATCATATAAAAGAGGAACCAGTCTTAGCGTATCAAAGAATGCACGATGGTGTTGGTTTACCATCGAATTATCCAAATAGTTCTTGTAGTAATGGATCAGAATCTACGGTATCACCGGGAGCAGCAGCTGCCGCAGCAGTAGCAGCTGTTGCCCAAGGATTAAGGCAACAAATGTGTAATATGATGGCAGCAGCTCAACAGCAGAATTCAACGCATGACGCCAATATAGTAAATTCGTTATCGTTAGGTGGACATTGCGGTTCTACAACGGTTCCCAGCAATGGCACCGCTCCGTTAAGTATGAGTATGAGTAATATAGCGGCAATGCGGTTAGGAAGTCCTGCTGGGAGTGTACAAGATTTAAGAATTAGTCCCGCCGGATCGGGTTTAGAAAGTCCCTTATCATCGCCTTTAGGACTTACTATGTCAAACGCCATGGAAGCAACCGCACTTAATTTAGGAATGGGAAATAACGTGGACGTTGCTAGCATTGGCGTTTCCGGTATGACATATAAACCTGCACGACCATTTACATCGCCTAGAGCGGAAAATCTCTTCCAAGAGGATATAGATGATTTGGTAAAACCTATGCATACGTCTACTCCTCGGTCCAAAGACACAATGGCTTCCATCAAATTGGAACCACTAACAGAGTGTCGTGTACTATATgtatcaaattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaaagcgattataaaacatcatggGAACAGACTCtaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaaggaaagcgattataaaacatcatggGAACAGACTCtaaaggcacatttaaaaatccatactggtaatgaatataagtgtaaggaatgtgattataaaacaatgcgAAAAGacagtctaaaggaacatataaaaattcataccggtgataGTCATAAATGCAAggtatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaacaattgtgattttaaaacggtGCTGAAAGgcaatctaaaggaacatgtgaacaTTCATACTGGCGACAGATATAAatgcaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtaacaattgtgattttaaaacggtGCTGAAAGgcaatctaaaggaacatatgaacATTCATACTGGCAACAGATATAAatgcaaggaatgtgattatagaacaTCATGGAAAAACAATCTaaagacacatttaaaaatccatactggtgatgaatataaatgcaaggaatgtgattataaaacaatatggaaacaaagtctaaaggcacatttaaaaatccatactggtgatgaatataagtgtagcaattgtgattttaaaacggtGCTGAAAGgcaatctaaaggaacatatggaCATTCATACTGGCAACAGATATAAatgcaaggaatgtgattatagaacaTCATGGAAAAACAATCTaaagacacatttaaaaatccatactggtgatcaatacaagtgtaaggaatgtgattataaaacaccgtggaaaattaatttaaaaaggcaTATTGAAGTTTATATGCATGATAAAGAtctataa
Protein Sequence: MVDELPTVETSVFRLTSHTYYRNLLKLKTPTWTQEQLKEAIDAVVQQKMRFTQASSRYGIPKGTLYDNILGKSKRMAVLEEAGLTPREEEAVLEFCCDVSVSPYNRRTKKSLQSILNFVEKIRRVRDPEFMFTGLSGFRWWWAFCKKHSIVSLFYDNADSYQYQLQSMWQKCWSTNQSLVHNLRFRERGPLKSWRPETMAEAIFSVLKEGLSLSQAARKYDIPYPTFVLYANRVHNMLGPSADGGSDLRPKGRGRPQRILLGVWPDEHIKGVIRAVVFRDSHHIKEEPVLAYQRMHDGVGLPSNYPNSSCSNGSESTVSPGAAAAAAVAAVAQGLRQQMCNMMAAAQQQNSTHDANIVNSLSLGGHCGSTTVPSNGTAPLSMSMSNIAAMRLGSPAGSVQDLRISPAGSGLESPLSSPLGLTMSNAMEATALNLGMGNNVDVASIGVSGMTYKPARPFTSPRAENLFQEDIDDLVKPMHTSTPRSKDTMASIKLEPLTECRVLYVSNYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCKESDYKTSWEQTLKAHLKIHTGDEYKCKESDYKTSWEQTLKAHLKIHTGNEYKCKECDYKTMRKDSLKEHIKIHTGDSHKCKVCDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCNNCDFKTVLKGNLKEHVNIHTGDRYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCNNCDFKTVLKGNLKEHMNIHTGNRYKCKECDYRTSWKNNLKTHLKIHTGDEYKCKECDYKTIWKQSLKAHLKIHTGDEYKCSNCDFKTVLKGNLKEHMDIHTGNRYKCKECDYRTSWKNNLKTHLKIHTGDQYKCKECDYKTPWKINLKRHIEVYMHDKDL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: iTF_00854200;
90% Identity: iTF_00854200;
80% Identity: iTF_00854200;