Ipal000825.1
Basic Information
- Insect
- Iselma pallidipennis
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_037464855.1
- Location
- JAZBHA010000032.1:130729-133334[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 4 0.0079 4.1 7.3 0.0 22 39 270 289 265 291 0.89 2 4 5.1e-07 0.00027 20.7 0.1 9 46 289 330 289 330 0.97 3 4 1.3e-09 6.9e-07 29.0 0.0 1 46 338 383 338 383 0.97 4 4 3.3e-07 0.00017 21.3 0.2 1 43 389 431 389 441 0.94
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAATAAAAccgaaaataatgaagaagacgtagcaaaattaatagaaattatcaatcGACATAAATCTGAGATAAGTCAGgAACTTCGTGAAGAATTTggagattttatcaatttcgaTCAAACTCTAAATGAAGATGGTACACTTGACGATTCTGATACAGAAActgaaattttcgataattccCATGAATTCGATCAACAAccaaacaaccaacaacaagacCCAAATAGGGCTTTAACAGAACATGAAATTGATATAATCAATGCTTGTTCAAATCCTGAATTCAAAGAACTACTCACATTGAAtcgtttgaaaatttccaaattaactAAACTACGTAcatctattaataatttaatatatgaATGTGATCgaaatattaatcaaacagTGATTAATACAGATAGTTCACAATTAGTACCACCATTAAAACCACCCGTATGGAAATTGGGTGCACCGTATTTTAAATGTACAGATTTCTTTTGTAGTCCATATAATGAAGATGTGAAAACGAAAcgttataataatgaattattattaggtgatttattatatgaatCGAAAAAATGGACCAAATTAGACTGtgatcatttattaaatagtgttctattaaattataatattaatagacAAACTGATTTGATAAAACGTATCAATAATTTgagacaaaaaattgataatttagaaaatattgaagagaaaCCGGATCTTTTAAtgaaagttaataatttagaacaaGAATTAGAAAGATTGAAGAATCAAAGTATTAAAGATATACCAGTATTGAATAGTGATGAATATATTGATTGGAATAAAATTGCCCAATCATTTTTTAATGATAAACGTACAGCGGACCAATGCCATCAACAACTATTGGAATTAGTTGATGTATATCGTATGGGTAATGTGATACCATGGCGTAAAATCTCCGAACATTTTCTGGGTCGATCACGCCACCAATTATACCATCATTATACCTATTATCTATCTGAAAGTAATCATATCAAAAAAGGTAAATTCTCCGATGCTGaagatatattattattgatattagtTGATCGTTATGGTACAGATTTTCGTAAATGTTCTGAATTTATTGAGAATCGTAGTCAAGTACAATTGAAAAGTCGTTATCGACAAAATCTTCAAACACATACACGTAAAGgtacatttacaataaatgatgataaagaaatCATGAAACATGTTAATGAAAATGGTGAACAAGCATGGAGTCAATTAAGTGAAAAATTAAATCGTACACGGAATACATTACGTCAACGTTATCAAatcattaaacaatatttaaaacaacatcCAAATGCTGATATTAAAGATATACCGAAACGGAAACATCGTGAATTGATGAAGAATCATAAACATTATGAATTTTTACGTTATATTgctgataaatttaaatattcagaAATTATACCGACTGTTAATATGTTGGAAGAATTCCTACAGAATTCAGCTGAAACTCATGAAATGATAACAAACAATACTAGTAATATTGATAGTGATAAGaattatagtaaaaataataaacaaatcggTTGTAAACCGAGTCGAACACAATATAAGAGAAGTATTGATACAATGTTAACAGATTTCTTTGCTAATTCGTGTAAGATAAGACAACCCAGATATGTGAagaatttcgataaaatatcaaatgatattagtgaaatattatcaattcttaATGTTAATTTAGATATACCGGCGAATTTTCGTGACGATTCTCGATTAGATTATAtcgataaattgattttaaataaattaacaatcaaaCCAACCAACAATCAAGATCAATTAATACCGCCAAATATTAATACATTAGTTGGTCTAAGAAgtatgttaattaaatataaatgtttcaaaGATAGtcaaaattatgataaagATGGTGAGAATAGAATTATGTGGGAGATTGAAAGAAACTTGATTGCTAACTATGATACTGATAGACAGAATCAGATCATTGATGACcgaaaattatttacagaacgttttaataaattgtttacatggagttcaatattatcattggAACCACCAAGTTGtctcaataatgataatcaattaaagaGTAGTGATATGGAAGCCCCATTGgcgaaaaagagaaaattggaaaacgtACGAACTTATTCTAGAAAAACTATCGAACCCATACCTTCAACAAGTCAGtgtgatttataa
- Protein Sequence
- MNKTENNEEDVAKLIEIINRHKSEISQELREEFGDFINFDQTLNEDGTLDDSDTETEIFDNSHEFDQQPNNQQQDPNRALTEHEIDIINACSNPEFKELLTLNRLKISKLTKLRTSINNLIYECDRNINQTVINTDSSQLVPPLKPPVWKLGAPYFKCTDFFCSPYNEDVKTKRYNNELLLGDLLYESKKWTKLDCDHLLNSVLLNYNINRQTDLIKRINNLRQKIDNLENIEEKPDLLMKVNNLEQELERLKNQSIKDIPVLNSDEYIDWNKIAQSFFNDKRTADQCHQQLLELVDVYRMGNVIPWRKISEHFLGRSRHQLYHHYTYYLSESNHIKKGKFSDAEDILLLILVDRYGTDFRKCSEFIENRSQVQLKSRYRQNLQTHTRKGTFTINDDKEIMKHVNENGEQAWSQLSEKLNRTRNTLRQRYQIIKQYLKQHPNADIKDIPKRKHRELMKNHKHYEFLRYIADKFKYSEIIPTVNMLEEFLQNSAETHEMITNNTSNIDSDKNYSKNNKQIGCKPSRTQYKRSIDTMLTDFFANSCKIRQPRYVKNFDKISNDISEILSILNVNLDIPANFRDDSRLDYIDKLILNKLTIKPTNNQDQLIPPNINTLVGLRSMLIKYKCFKDSQNYDKDGENRIMWEIERNLIANYDTDRQNQIIDDRKLFTERFNKLFTWSSILSLEPPSCLNNDNQLKSSDMEAPLAKKRKLENVRTYSRKTIEPIPSTSQCDL
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -