Ipal004175.1
Basic Information
- Insect
- Iselma pallidipennis
- Gene Symbol
- Kdm5
- Assembly
- GCA_037464855.1
- Location
- JAZBHA010000293.1:76874-83665[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 4 4.8e-26 9.8e-23 80.0 0.0 2 89 108 192 107 192 0.95 2 4 6.4 1.3e+04 -3.7 0.0 48 70 795 818 793 829 0.67 3 4 5.3 1.1e+04 -3.4 0.0 6 36 1014 1047 1011 1071 0.59 4 4 0.027 55 3.9 0.1 33 80 1230 1276 1227 1286 0.72
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGACATcgaaaatagataaattggCTAGTCCGGCCAAATTAAAAACAggaccaacaacaaaaccagaaACATATTGTTACAAAGAAGAGGCCTTCGAATTTGAACCACCACCAGAAGCGCCTGTATTTTATCCAACTGAAGATGAATTCAATGATCCATTagaatatattaataaaatacgtaaATATGCTGAAGATTCTGgtatatgtaaaataaaaccaccaccaaATTGGCAGCCACCCTTTGCTGTTGATGTGGATAAACTAAGATTTACACCGAGAATTCAAAGACTTAATGAATTAGagGCAAAGACACGTGTTAAGTTGAATTTTCTTGATCAAATCGCCAAATTTTGGGAATTACAAGGTTCAACATTGAAAATTCCAATGGTTGAGAAACGTTGTATAGACCTTTATACATTACATAGCATTGTCCAAAGTCTaggcGGTTTTGAACAAGTAACCAAAGATAGAAAATGGTCCAAAGTTGCATTAAATATGGGATATCCACCTGGGAAAAGTAGTATAGGAACAATACTTAAATCACATTATGAACGATTAATATAtccatttgatttatttaaattgggtaaaactttaaatattaaaatggCATCTCCTTCAACCAACGAAGAAGCtgaaaaaactgataaagatTATAAACCTCATGGTATTGCAGGAAGAATGCAAATAAAACCACCACCCGAAAAACATGCCCGACGTTCTAAAAGATTTGAATCTGAAGTTAAAACAGAAGATGATGTTAAACAAGAATgtaaagatgataataaagaattgaaaCGTCTTCAGTTTTATGGTGCTGGACCGAAAATGGTTgttaataaagataaaaatggagataaaagaaacaaaaatcacCATTATGATTTTGATCCGttAGCAAAATATGTATGTCATAATTGTAATCGTGGCGATTCAGAAGAATATATGTTATTATGTGATGGTTGTGATGATAGTTATCATACATTCTGTTTAATGCCACCATTAACTGAAATACCAAAAGGTGATTGGCGTTGTCCAAAATGTGTAGCTGAGGAAGTTTCAAAACCAATGGAAGCATTTGGTTTTGAACAAGCCCAACGTGAATATACATTACAACAATTTGGTGATATGGCTGATCAATTTAAATcggaatattttaatatgcCTGTTCATTTGGTACCAACAAGTGTAGTAGAAAAAGAATTTTGGCGTATTGTATCATCTATAGATGAAGATGTAACTGTTGAATATGGTGCTGATCTTCATACAATGGATCATGGTTCTGGTTTTCCAACAAAGacatcattaaatttattacctGGTGATAAAGAATATGCTGATTCAGGatggaatttaaataatttacctgTATTAGAAAATTCCGTATTAGGTTATATTAATGCTGATATATCAGGTATGAAGGTGCCTTGGATGTATGTTGGAATGTGTTTTGCTACATTTTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGagttattcaataaattatttacattggGGTGAAGCTAAAACATGGTATGGTGTACCTGGTAAAATGGCTGAAGCATTTGAAGAAACAATGAAATCAGCTGCACCAGAATTATTTCATTCACAACCAGATTTATTACATCAATtagtaacaataatgaatCCAAATATATTAATGAAAGCTGGTGTACCTGTATATAGAACAGATCAAAATGCTGGTGAATTTGTTATTACATTTCCACGTGCATATCATGCTGGTTTTAATCAAGGTTATAATTTTGCTGAAGCTGTTAATTTTGCACCAGCTGATTGGTTAAGAATGGGTCGTGAGTGTATTCTACACTATTCGAATTTGAGACGATTTTGTGTCTTCTCACATGACGAATTAGTTTGCAAGATGGCTCTTGATTCAGATAAACTTGGTCTTACTATTGCAGCAGCTACTTATCAAGATATGTTACAGATGGTTGAAAATGAGAAACAACTTCGGAAAAATCTCCTAGATGCGGGTGTATCAAATGCTGAGCGTGAAGcatttgaattattaccaGATGATGAGCGTCAATGCGATACTTGTAAAACTACATGCTTCCTTTCTGCAGTTACTTGTAAGTGTTCTCCTGATATATTGGTTTGTCTTCGTCATTATGCAAATCTTTGTAAATGTCATCCAGAAAATTATACATTAAGATATCGTTATACATTAGATGAATTACCTGTTATGTTGAAATCACTTAAATTAAAAGCTGAATCATTTGATCATTGGgtaaataaagtaaaagatGCATTAGATCCTAAAACACcaaaaacattaacattaaatgaattaaaggCATTATTAAATGAAGCTGATGgaaagaaatttccaaaatgtgaattattacaaacattaacaGATGCTGTAGAAGATGCTGAAAAATGTGCACGTGTTATACaacaattagatttaaataaaatgagaacaagaacaagaaatgCATCAGatacaaaatataaacttACATTAAAAgaactaaatttatttaatgaagaaTTGGATAGTTTAGCTTGTGTACTTGAAGAAGCTAAAAGTATTAAAGATTTACttgaagaaacaaaaaaatttgaaactacCAGTAAAGAATTACTTGACATGAAAATTAGTGAATGTTCTATAGgtgaattagaaaattgtataaGTCAaggtaataatttatgtatagAACTGCCTAATTTACGTAGTATTAAAATAAGATTACGACAAGCATTATGGCTTAATGATGTTTTATCATATAAAAAACGAACTGAAGTACTTGGATTAGAATCAAtacgaaatattattaaaactggTAATGTATTACCACCAAATCCAGAAATTGAATGTGAATTAACTGAATTACAaacacttttattaaaaagtgaAGAATGGGAAGAAAAAGTTAAAGCTATACTTAAAGATAAAGGTGGTGATGTAATGATAGaagttgataaattattaaaagaagcCAGTCAAATTAATTCATATCTTCCATCCGaggaatttttatttgatgcTATGGATAAAGCACGGGATTGGTTAAGACAATTAGAAGAAATGAATTCAGCTGAATATTATCCATATTTTGATGATATGGAAGAATTAATTCGAAGAGGACATCAacttgatttatatttaattgaagttACTAAATTAGAATCATATTTAGATTTTGCTAATAGTTGGAAGGAGAGAACAAGTCGTGCTTTTCTTAGAAAAAATTCCCCATATGGCCTAATGGATGCCCTATCTCCAAGGATACAATTTAATATTGCACAAAAATGTAGAAGAAAGAATCAAGATGAAGAACAtggtatatttaatttaactagTGATATGGATCCGGCTACTGTTGTTGCACTATTTCGTGAAGCCGAACaaaaagaaatggaaatgATTCGTAATTTACGTTCGACTAATTCGGAAAAAAGTTTAGATCCAAATGATAATGCAACATTTTGTATATGTCAAAAAGGTGTATTCGGTTTAATGATGCAATGTGAATTATGTAAAGATTGGTTCCATTCTGATTGCGTTCAACTTCCAAAAGTGGCTTCATCAAAGTACAAAGGCAATTTTACATGTGTTGCATTACATTTAGGTTTTAAAGactgtaaatttttgtgtacGAATTGTTATAGAACTAGACGTCCACGTCTAGATGCtatattattacttttaatgGCATTACAGAAACTTTACGTTCGTGTACCAGAAGGTGAAGCATTACAAAGTTTAACAGAACGAGCAATGAATTGGCAAGATCGAGCTAGACAATTAATGCAAACACCTGAATTAGAAGCTgctaaaaatcaattaaattcatttacacaaaaatatacagaaGCGGCAGCTAGACAAAGaactgaaaaaattatatcaaatgaATTGAAACGAGCCTATAAAAATCCTGAATTACATCAAAGAGTACAAGAAATTGCACCATTCAGTGGTGTTAATCAAGATGAAACTAAATCCGATAGTAATGATTTATCAGATGATTCAAAAGATTGTTCAACAGATGATAGAATGGGTGAACATGCTTATTCATTACATTTACCGAAATTCGATTCAAGTGAATATCGATTACAACTTAATCCAGAAATGAAAAAACATATTGAAGAACTTCTAATGGAAGGTGATTTATTAGAAGTTTATCTTGATGAAACTTTCcaattatggaaattattgCAAGCGTCTCGAGATCCTGAAAAAGAGGCTATTCTAATTGATTTCGATacCCATCCAAAGAACGTTCCGGTGAAACGTGGTCGTAAACGTCGTtccgatgataatgatatagtaaaaattaaaccaaaaacaaataaaggtATCGAAACCGATAAAAAacctaaaacaacaaaaacaagagaacaacaaccaaaaaaagatAATGGACGACGAAAAGGACGTCGACGTCAATCAATTGGTtcagaagatgatgatgaagaaatttGTGCAGCAACTGGTTGTTTAAAACCATCAGGTGAAAATGTTGATTGGGTACAATGTGATGGTGGTTGCGATAAATGGTTTCATATGGCTTGTGTTGGTTTATCAGCACAAGATAttaatgaagatgaagattatatatgtattacatGTTCAGAAAATACAGCATATGAAACATATGATCAAGTTGAATATAAATTGCCAGCTAAACGAGATGTTTCCAATTATCCCCTGCCTTCCACATCTAAAGAGACCGATTAG
- Protein Sequence
- MTSKIDKLASPAKLKTGPTTKPETYCYKEEAFEFEPPPEAPVFYPTEDEFNDPLEYINKIRKYAEDSGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSTLKIPMVEKRCIDLYTLHSIVQSLGGFEQVTKDRKWSKVALNMGYPPGKSSIGTILKSHYERLIYPFDLFKLGKTLNIKMASPSTNEEAEKTDKDYKPHGIAGRMQIKPPPEKHARRSKRFESEVKTEDDVKQECKDDNKELKRLQFYGAGPKMVVNKDKNGDKRNKNHHYDFDPLAKYVCHNCNRGDSEEYMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLTEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPMEAFGFEQAQREYTLQQFGDMADQFKSEYFNMPVHLVPTSVVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSLNLLPGDKEYADSGWNLNNLPVLENSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEAKTWYGVPGKMAEAFEETMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPNILMKAGVPVYRTDQNAGEFVITFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLRMGRECILHYSNLRRFCVFSHDELVCKMALDSDKLGLTIAAATYQDMLQMVENEKQLRKNLLDAGVSNAEREAFELLPDDERQCDTCKTTCFLSAVTCKCSPDILVCLRHYANLCKCHPENYTLRYRYTLDELPVMLKSLKLKAESFDHWVNKVKDALDPKTPKTLTLNELKALLNEADGKKFPKCELLQTLTDAVEDAEKCARVIQQLDLNKMRTRTRNASDTKYKLTLKELNLFNEELDSLACVLEEAKSIKDLLEETKKFETTSKELLDMKISECSIGELENCISQGNNLCIELPNLRSIKIRLRQALWLNDVLSYKKRTEVLGLESIRNIIKTGNVLPPNPEIECELTELQTLLLKSEEWEEKVKAILKDKGGDVMIEVDKLLKEASQINSYLPSEEFLFDAMDKARDWLRQLEEMNSAEYYPYFDDMEELIRRGHQLDLYLIEVTKLESYLDFANSWKERTSRAFLRKNSPYGLMDALSPRIQFNIAQKCRRKNQDEEHGIFNLTSDMDPATVVALFREAEQKEMEMIRNLRSTNSEKSLDPNDNATFCICQKGVFGLMMQCELCKDWFHSDCVQLPKVASSKYKGNFTCVALHLGFKDCKFLCTNCYRTRRPRLDAILLLLMALQKLYVRVPEGEALQSLTERAMNWQDRARQLMQTPELEAAKNQLNSFTQKYTEAAARQRTEKIISNELKRAYKNPELHQRVQEIAPFSGVNQDETKSDSNDLSDDSKDCSTDDRMGEHAYSLHLPKFDSSEYRLQLNPEMKKHIEELLMEGDLLEVYLDETFQLWKLLQASRDPEKEAILIDFDTHPKNVPVKRGRKRRSDDNDIVKIKPKTNKGIETDKKPKTTKTREQQPKKDNGRRKGRRRQSIGSEDDDEEICAATGCLKPSGENVDWVQCDGGCDKWFHMACVGLSAQDINEDEDYICITCSENTAYETYDQVEYKLPAKRDVSNYPLPSTSKETD
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01480636;
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
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