Gfus000669.1
Basic Information
- Insect
- Glossina fuscipes
- Gene Symbol
- TRERF1
- Assembly
- None
- Location
- Scaffold26:68794-96824[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 2.6 3.7e+03 -1.7 0.0 6 22 1757 1773 1756 1784 0.83 2 2 1e-11 1.5e-08 34.8 0.2 2 45 1790 1833 1789 1834 0.93
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCAACCATAAACTCGGTACCGAAAAGTATACACCTGCCGTTAGCTGGTCTCCCTGCGACGCCGCGTGTGCTCATGTGCAGTGCTTCAGTGGGCACGGAAGGTTCGGTTACTTTAAAATTACGCGATGCCAATTCATCGTCCTCGCCTTCGTCCGATTCCAATCAATCAGTGTCGACAGTCGCATCAAACGCTTCAAATGCAGTCAACAGTTTGGATAATGCGTTAACTATTGGTTATCCGGATCCGGAAATGTTGGCTGATGTATTGGGCACTTTGCAAACGGCTTCCCTAAATAATAATAACAATCATTATCgtagcaatagtaatgattgcaatagcaaagtgcaaataaataaattaaacacaatagtaacaacaggagcggcaacaccaacaccaacaccaacatcaacaacaacagcaacagcaacagcaacaggaacgacaactaacagtgatagcaatcccaataatatcaataccaatcatattaataataatcaaaataacaatgttgcgaataccaataataatTGCATTAACAACATTAAAAACTGTGCGAATAATTTAAAAAGTCGTGTAACCATTAGTCGTCGTACCTCAAACGTAGCGCACAGTTCACAAACCCAAAAAGATTCCCCTAAATGTACGATAGCGGCCGCTGTTCAAACTGTATCCATTTcaacaaataccaccaacaagactaacagttacattaaaaattgcttgatacgcagtagcagttgcaataataccaccaatattacgtcattggctcaaataatgagcaatagcagttcgagtaacggcaacagcaacagcaacggcaacatcaatagtaacagcaatagcaatagcaataacaacggctgtagcagcaacagcagcagcaacagcaacagcaacagcaacagcagcagcaataataataataacgctagcagtacctttcaacaatttcaaagcagtagcaacagtaatttgtcatgcagcaatagcaacagcaattgcagcagtaacagtaactacagttcaaacagtaacgatagttgttttagtataactagtagcagcaatagcagcagtggcaataTAAGTGTACGTTGTGCCCCCATTCCCTGTAATCGCAAAGTTCCTGTTTCATTAACAAATCCACCGAAAATATTGaaaaaaaaCCGTTCAAAACTATCTTCGCCTAGCCGTCACGGTCCACAACAGTGTCAGatttGCAATAAAATATTTGGAAATGCATCAGCACTGGCTAAACATAAATTGACGCACAGTGACGAACGGAAATACGTGTGTGTTATGTGCTCAAAAGCATTTAAACGACAGGATCATTTAAACGGTCACATGATGACGCATAGAAATAAAAAACCATACGAATGTAAAGCTGAGGGCTGTGGTAAATCTTATTGCGATGCACGTTCCCTGCGTAGACATACCGAAAATCATCATGCTGGCGTTATAACCCCGCAAAATCAAAACTTGTCATCTATTAATGTCAATTGTTCATCAGCAAATTTAAGTTTATCACCAGCTACCGCAAACGGAGATGCAAGCTCACCAGATGGTGCAACATGTTTGGGTACGTATCTTTCGAATGGCGGTACAGTGGTTGATGCGTCAACTGGTTTAGCTTTAACTGAAGACGAGGTGAAGGCTTTAAAGACCAATGTTACATTGCTATCACCCACCTCTACTCTTTCTTCTTCTTCGTCGTCGGCTAGTAGTATCGCGTCGGCATCGACTGCGGCCACTATAACTTTAACAGATAGCGGTGGCAATATGGAGGGCGAAGGTCTAACCCCCGAACAATTAGATTTGATTAGTAAAATTATGCGTCAAACTAAGCAAACAACAGCACAGGTAACCGTGTCCTCACACTCCAGTTCACAATCCTATAAAATTGACACATCACCGGCCCAGACGCAAACACAGAATCCAAGACCACGAACCTGGAATATGCAATTGCTAAACACTACTCAGAACTTGGCCATTACCGTGGATGAGGTGTCCAATGATGCAATAACTCGCAATATAGATTCACCACTATTGGCCATGGACGCTAAGGAGGAGGAAGTCAAAATCGATTTAACTTCCGGCTTGAATTCCTCTTCCTTATTAAATGTAGTTAAAATTGATCAGAAGCCAGTGGAATGTAATTTATGCCATCGCAAATTTAAGAATACGCCAGCTTTAAACGGTCACATGCGTTTGCATGGCGGTTATTTTAAAAAAGATCCCGAGACTaaaaaaagcgaaaaaaaGGAGAATAATGGTCCGCCTTTGCAAACAGCTAGTATTGGTGTTCGAGCCCTAATCGAAGAGAAAATTATTAACAAGCGAAGTAGAGATATAAATAAGGGTTCTTTTGCCGTACCTGCTCCGCCTGCCAATAATTTAGCCAATAATCCGATCTTGCGGAGATCAATTAGCGATTTGGAAAATTTCCTAAGCTCTAAAAGTCAGACAAGTTCTGGTAGTTGCATAACATCGAATCTAAATACGATGCCTACCCCATCAGTCGCTTTTAAAAATAATAATAGAACTATGCTCAATGCCCAGGATATGGGTTTACCTCAGAGTATTGAAATTTTCAGTACCAAACAACAAAAACCAATGAATAATGTGAGCGTGGGAGTGGGCACGAATCTCACTCAGCTGAATAGTGAATGCAATTCAGTGACAACGACAGAAAAACCAGGAACAACGACGTTGAACACAACGACTTCTACAGGAACGACAACCCGCAGCACATCAACTGATCCAAAAGATTCCACTTTAATTGAATTATTAAAGAGAGGAACACGTATCGCTGTCACGTCCAAGCAAGCATCAAACGCACCATTGGGTGGCGTGACGCGTCAAATTGTTAACACCGCCACAACAACAAATTCTCCTTCAAGGGCCGTACTTATACCCTCCGATGTACAAGTTATTAATAACAAGGTTAAGCTGGCAACTACAACCCAACAAGAAATCGAGAATTCATTAAACAATTGCCCAGAATCCAGTGGTATATCGTTAGCGCAAAATTCCCCATTGTCCTTGACCTTATCGCAGAATGGAGATGTCAATGCAGAAGTGTACACTGTCACCTATGCTAGTGACAATTCGAATTTGTTTGAAGAAACTGAGGTTTACAATGTCAGCGAGGCCGAAATGCTATTGCAAACAGTAGACACAATGCAATTGTTGAATGATTCCAATCATGAAAACCTGCTCAAATCTTCTGAACATTCCGAACAATATGAAATTATAGATAATAATGGTCAAGTGTTGCAGCCCGCTTGTCCAACGGATATTAATAATGGCTCAGAATGTAAGCAACAACAACAAATTTTGCCGAATTTTCAACATTTCCATTCCAAAGAACTACTAATGAATCCTTTAACTCAATCCAATGGAAATTTAAATTCCTTGTCCATGCCATTAGTTGAACGGAAACAACTTTACGGGAGGCTGAATTCACCTTTGCATTCTCCGTTAGCCTATCCGACTCCTCCCTCCAGCCATGAAAATGTTACACAAACTTCTCCCTACGTAGACGATAATCAACAGTATGGCGAAACATCGAATGTCTTTTTTAGTGAATCGTTAATAAGTAACGCTTCAACATGTGCAAATGGAGAAATGGAGAATGAAAAAATAACAAAATTAGGAAATATTATGGGAGATAATAATTTCGATAATAATAATATTAAGATGGAGGATTTACTTAGTGATACCAATACGGATGCGGAACGTGATTTAAGAGAATTCGCCGAAGCCAATCTTTCATTTCTAGATGAGGAACAAGAATTTCTAAATGATTCGGGCAACGCTGCATCTCCATTGTCAGAGTCTTTCTTTAACGGTGGCATAGGTTCAGTAGAAGAGGTAAAAGAAGTATTACGTGAGGTCTTAACCGAAGATCAAATACAAATTAATTGCGAAAGTCAATCAGAGAATATAATCGACTTGTATTACTTGCCATGCTTAAGTTTGCAATCGCAAATGATGCCAAATTCGGAAGATCCGTTGCTGTCATCGTCACCTCGTGATTTTGGTCAACAGAAATTGACTCAAACGGCAAATAATACAAGTCAACACATTCCTCACCAACAACAATCAAATCTAAATTCAAATGCCTCGACCAGTACAAGCCAGAATCCCTACCTGCAGAGTAATAATGCCGCGATTtcagtacaactacaacaacaacagcagcagcagcagcagcagcagcaacaacagcaacaacagcaaccatcacaacagcagcaaGGCGTATTAAAGATGCAGCCACTGCAAACGCAACAAATGCCTTCAGAGATTAATCAGGTTATTGTAACAGTACCGGCCAATGGTTGTGGCAATACGGCCTCTATCATGCAGTACAATTTTCAAAATACACCGCAAGTACAAATTCCAACAAATACCCAGCAATATATTGACTCCGCCAATCAATCACATACACAAGCTAGCAATAGCAGCAGTAGCAATAGAACAATAACAGCGCAGTTAAATGAGGCCTTAACGCAGCCCCTTGTTTACACAGGAACCACCGAAAGATCAGAAATGAAATTAATGCCAACGCAAATTAATAATCGCCTTAATTTAAATATTGAGCAAAGGCAACAAGAGACCCAACAACAACGGTTGCAAATTACTGATGTCTTAAATAATTCTAATATTTATTATGGACAAATCGCATCCAATGAACAGCAACAACAAACGCCACAGTATTGTCAAACGTCAAATGCGACGAATAGCACGTCAGTGTTGACTACCATTCTACAGCCATTATCCAATCAAACTAATTCCATATTAAAAAGACGTCTAAGAGGTTATAATTCCTCGGATTCGGGCTCATCTGGTTATCAGTTAAAGTTCCAAACTTTATCACCGTACCGATCTAAATTAAGGAAACCCTCAAGGACTCATTATACACCTGCTCCAATTTTAAATCCTGCGCGCAAAGGTCACGGTTTGTATTGCAACATTCTTAAGGA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- Protein Sequence
- MATINSVPKSIHLPLAGLPATPRVLMCSASVGTEGSVTLKLRDANSSSSPSSDSNQSVSTVASNASNAVNSLDNALTIGYPDPEMLADVLGTLQTASLNNNNNHYRSNSNDCNSKVQINKLNTIVTTGAATPTPTPTSTTTATATATGTTTNSDSNPNNINTNHINNNQNNNVANTNNNCINNIKNCANNLKSRVTISRRTSNVAHSSQTQKDSPKCTIAAAVQTVSISTNTTNKTNSYIKNCLIRSSSCNNTTNITSLAQIMSNSSSSNGNSNSNGNINSNSNSNSNNNGCSSNSSSNSNSNSNSSSNNNNNASSTFQQFQSSSNSNLSCSNSNSNCSSNSNYSSNSNDSCFSITSSSNSSSGNISVRCAPIPCNRKVPVSLTNPPKILKKNRSKLSSPSRHGPQQCQICNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCVMCSKAFKRQDHLNGHMMTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHAGVITPQNQNLSSINVNCSSANLSLSPATANGDASSPDGATCLGTYLSNGGTVVDASTGLALTEDEVKALKTNVTLLSPTSTLSSSSSSASSIASASTAATITLTDSGGNMEGEGLTPEQLDLISKIMRQTKQTTAQVTVSSHSSSQSYKIDTSPAQTQTQNPRPRTWNMQLLNTTQNLAITVDEVSNDAITRNIDSPLLAMDAKEEEVKIDLTSGLNSSSLLNVVKIDQKPVECNLCHRKFKNTPALNGHMRLHGGYFKKDPETKKSEKKENNGPPLQTASIGVRALIEEKIINKRSRDINKGSFAVPAPPANNLANNPILRRSISDLENFLSSKSQTSSGSCITSNLNTMPTPSVAFKNNNRTMLNAQDMGLPQSIEIFSTKQQKPMNNVSVGVGTNLTQLNSECNSVTTTEKPGTTTLNTTTSTGTTTRSTSTDPKDSTLIELLKRGTRIAVTSKQASNAPLGGVTRQIVNTATTTNSPSRAVLIPSDVQVINNKVKLATTTQQEIENSLNNCPESSGISLAQNSPLSLTLSQNGDVNAEVYTVTYASDNSNLFEETEVYNVSEAEMLLQTVDTMQLLNDSNHENLLKSSEHSEQYEIIDNNGQVLQPACPTDINNGSECKQQQQILPNFQHFHSKELLMNPLTQSNGNLNSLSMPLVERKQLYGRLNSPLHSPLAYPTPPSSHENVTQTSPYVDDNQQYGETSNVFFSESLISNASTCANGEMENEKITKLGNIMGDNNFDNNNIKMEDLLSDTNTDAERDLREFAEANLSFLDEEQEFLNDSGNAASPLSESFFNGGIGSVEEVKEVLREVLTEDQIQINCESQSENIIDLYYLPCLSLQSQMMPNSEDPLLSSSPRDFGQQKLTQTANNTSQHIPHQQQSNLNSNASTSTSQNPYLQSNNAAISVQLQQQQQQQQQQQQQQQQQQPSQQQQGVLKMQPLQTQQMPSEINQVIVTVPANGCGNTASIMQYNFQNTPQVQIPTNTQQYIDSANQSHTQASNSSSSNRTITAQLNEALTQPLVYTGTTERSEMKLMPTQINNRLNLNIEQRQQETQQQRLQITDVLNNSNIYYGQIASNEQQQQTPQYCQTSNATNSTSVLTTILQPLSNQTNSILKRRLRGYNSSDSGSSGYQLKFQTLSPYRSKLRKPSRTHYTPAPILNPARKGHGLYCNILKESNTNLSAFDAFDDDFEDSVGLVDFSDVSKVNLGSAYQAAIPIFKERSTLTAIDEPVKAELMWNPDIQRDENILMRFIDLSKSSATPSGSHTEEIALKTLLKSHGNTASAVLTLLQTQSNPFQMKWSAQELETFLKGLEKYGKEFSKISKELGSKTTGECIQIYYFWKKLCVDYKVTHLKTETPPVNHSNEVKPYVCEQPDCSASFSSKAALHGHTRIHTYGRNSHNNNHSATNPNANNSLPGSISSTSACTASSQALSHSVNLVNKDNTTATNTKDINNDFPCKVCGKVFNKIKSRSAHMKTHRVPENETTVQNANQNQTHQQQQQQQQANNH
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00750397;
- 90% Identity
- iTF_00749955;
- 80% Identity
- iTF_00748495;