Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_000671755.1
Location
Scaffold2:1161663-1177868[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 34 6.9e-16 6.2e-13 49.0 2.2 1 86 308 380 308 381 0.85
2 34 4.3e-15 3.9e-12 46.5 4.5 1 87 408 477 408 477 0.82
3 34 6.8e-17 6.1e-14 52.2 0.6 1 87 499 571 499 571 0.85
4 34 1.2e-14 1e-11 45.1 4.5 1 86 648 716 648 717 0.78
5 34 1.4e-15 1.2e-12 48.0 7.0 1 86 741 812 741 813 0.81
6 34 8e-12 7.2e-09 36.0 0.9 1 87 848 916 848 916 0.81
7 34 8.2e-11 7.4e-08 32.7 3.7 1 85 956 1023 956 1025 0.73
8 34 1.5e-15 1.3e-12 48.0 1.2 1 87 1052 1122 1051 1122 0.81
9 34 1.1e-13 9.8e-11 42.0 1.0 1 86 1145 1214 1145 1215 0.80
10 34 9.9e-13 8.9e-10 38.9 2.5 1 87 1243 1315 1243 1315 0.86
11 34 0.052 47 4.5 0.0 20 63 1395 1436 1380 1455 0.67
12 34 1.1e-10 9.6e-08 32.4 1.8 1 86 1476 1547 1470 1548 0.77
13 34 6.4e-15 5.8e-12 45.9 0.4 1 87 1578 1650 1578 1650 0.83
14 34 6.3e-15 5.6e-12 45.9 2.1 1 86 1697 1767 1697 1768 0.81
15 34 6.7e-14 6e-11 42.6 1.1 1 87 1790 1859 1790 1859 0.78
16 34 2e-15 1.8e-12 47.5 0.3 1 87 1989 2058 1989 2058 0.79
17 34 3.8e-14 3.4e-11 43.4 2.2 1 87 2117 2194 2117 2194 0.81
18 34 7.1e-09 6.4e-06 26.5 1.8 1 87 2215 2288 2215 2288 0.74
19 34 1.9e-14 1.7e-11 44.4 0.5 1 86 2314 2382 2314 2383 0.82
20 34 2e-12 1.8e-09 37.9 0.8 1 86 2407 2476 2407 2477 0.81
21 34 9.3e-17 8.4e-14 51.8 1.3 1 87 2498 2576 2498 2576 0.84
22 34 5.9e-08 5.3e-05 23.6 0.9 1 61 2594 2646 2594 2663 0.76
23 34 9.5e-11 8.5e-08 32.5 3.9 1 86 2685 2754 2685 2755 0.83
24 34 2.3e-12 2e-09 37.7 5.0 1 86 2780 2851 2780 2852 0.82
25 34 2.4e-13 2.2e-10 40.8 2.5 1 87 2872 2945 2872 2945 0.77
26 34 2.5e-10 2.2e-07 31.2 0.3 1 87 2972 3047 2972 3047 0.79
27 34 3.1e-13 2.7e-10 40.5 0.3 1 87 3207 3282 3207 3282 0.84
28 34 6.2e-10 5.6e-07 29.9 0.3 1 86 3305 3374 3305 3375 0.76
29 34 2e-15 1.8e-12 47.5 1.0 1 86 3409 3483 3409 3484 0.82
30 34 3e-06 0.0027 18.1 0.3 1 58 3515 3562 3515 3585 0.80
31 34 1.5e-14 1.3e-11 44.8 1.7 1 86 3605 3682 3605 3683 0.83
32 34 9.8e-12 8.8e-09 35.7 0.8 1 87 3712 3784 3712 3784 0.81
33 34 9.9e-14 8.9e-11 42.1 3.7 1 87 4127 4201 4127 4201 0.82
34 34 2.2e-11 2e-08 34.6 0.9 1 86 4225 4292 4225 4293 0.83

Sequence Information

Coding Sequence
atgctatatattcactacaatcgtgacCCTTTAAATTTTCCACGTCGCAAAGTGCAAACAGAACGTTCCTTGACTCTACCCATATGTCAGCGATGTAAACAAGTTTTCTTAAAACGACAAAATTATGCGCATCATGTTGCTTTATCAGTGTGCGATATTGTTGAATACGATTTAAAATGTTCCATCTGCCCTATGTCGTTTATGTCCAATGAGGAATTGAATTCGCACGAACATTTGCATCGTTCAAATCATTATTTTTGTCAAAAATATTGTGGGAAACATTACGAGACAATATTGGAATGTGAACAACATGAGTATACACAGCATGACTATGAATCATACAAATGCAATATTTGTTTGCTAGAATTTCCGTTACGTGAAGAACTATTACAGCATTTACCGTTGCATAAATTTCAAATTCGTTTTGTATGTTCGGTATGTCGTGAATGGTTTCAAATTCTGGCAGAATTACATGAGCATTGTGTGGCGGCGCCAAATCTTTGTGGCAAGTTTTACAACAAAGATGCTCTCAACAAAAGCCAAAAACACGATTCTTCACATAGTCAGTTATCTAAAGTGAGAAACAGTTTAAGCTACAACAAAATCCCTAGCGAGACAAGCACACAAGAAGATTCTCAATCCAATAGTGCTAGCAGAAGTTTTATCATTTCACCTGATGAACAAGAGGTGAAAACTGAAATTAAAGTTGAACCAGATTTCTATCCACCTCTAGAACAAGGAGATTTTGATCGGTTCGATGGTGATTACAATTCCGAAAACTTTTCTTCAACCTCATCGATAAGCAATCAAAATTTGAACTTTTTGCATGACTTTCAAGATAATGCATCGAGTAGCACCAATTCATCGTATAATATGCCGCCTGCCAGTAATGAAGCAGTGGGTGGAGATGAAGATGCTGTGTGTTGCGTGCGTTTGTGTGGGGTAAGCAAATTCAGAAGCCCGACTCTACAGTTTTTTGGTTTTCCACGTGACAATAAGTATCTGCAACAATGGTTACATAATTTAAAAATGCCTTACGATCATCAGGCCAATTATACCCAATATCGTATTTGTAGTTTACACTTTCCAAAACGATGTATGAATCGTTATTCATTAAGCTATTGGGCAGTACCAACTTTTAATTTGGGCCACGACGACGTAGCGAATATATATCAGAATCGCGAAATTAGTAATAACATTGCCATCGGAGAGATGTCTCAGTGTTACATGCCGGGATGTCGATCGCAACGGGGCGAAAGTAATGTGAAATTTTACAATTTTCCCAAAGATTTAAAAACTTTGATAAAATGGTGTCAAAATGCACGATTACCAGTACATGCTAAAGAGCCGCGACATTTTTGTTCACGACACTTTGAAGAGAAATGTTTCGGTAAATTCCGTTTAAAACCATGGGCCATACCTACTTTACATTTAGGCACTGTGTATGGAAAAATTCATGATAATCCCAATGTTTCGTATCTGGAGGAAAAGAAATGTTGTTTACCCTTTTGCCGAAAAAGCCGGTCAGACGACTTTAATTTATCTCTTTATCGTTTTCCTCGCGATGAAACCTTACTGCGTAAATGGTGCTACAATTTACGTTTGCATCCAGATGTTTATCGTGGCAAAAATCAGAAAATCTGCTCTCATCATTTTATTAAAGAAGCCTTGGGATTGCGTAAACTTTCGCCGGGCGCAGTGCCCACTTTGAATTTAGGACATAGCGATCGTGTGAATATCTATGAAAATGAATTATTATCTGCCCCTATTAATCCTGCGCCCAATTCCTTCGTTAAAATGTCTAAATACCATCATTCTTCCCATTCAAGTTCCTCTTCTTCGATTTATGATGAAGTTTTCACTAATAATTGCTCTTCTTCATCAGCAAAGTTTACTTCTTCTTCAACACCAAATTCAAATGCTTTAGACTTGGGTGACATGTGCTTAGTACCATCGTGTAAAAACACTAGACACACTGAAAATATTACCTTGCATACCATACCTCGACGACCGGAACAATTGAAAAAATGGTGTCATAACCTCAAAATGAATTTAGAAAAACATCATAAAAGTATACGCATTTGTAGCGCTCATTTTGAAAGCTATTGCATTGGCGGATGCATGAGACCTTTTGCTGTGCCTACCTTAGAGTTAGGTCACGACGATCCTAACATATATCGAAATCCAGATGTCATCAAAAAGTTGAATATACGCGAGACTTGTTGTGTTCCCTGTTGCAAACGTAATCGCGATCGGGATCATGCCAACTTGCACCGTTTCCCTACTAACCCTGAATTACTACAAAAATGGTGTGAAAACTTGCAGAAGCCTGTACCTGACGGCACAAAGCTCTTCAATGATGCCGTTTGTGAAGTTCATTTTGAAGATAAATGTTTACGTAACAAACGTTTGGAAAAATGGGCTATACCTACTCTGAAATTAGGATACGAACCTGTAGTTTATCAGCTACCGTCAGAGCAAGAGATAATGGAATTCTGGTCTAAGCCCCCAGCTCCTAACAACGGCGATGAGTTAGGTGAATGCTGCGTATCTACTTGCAAACGAAATCCGCAAGTGGATGATGTTAGATTGTATCGACCGCCCGAGGACGCTGAGCAATTAGTTAAGTGGTCTCACAATTTACAAATAGAAGTAACGGAATTATCTTCCCTAAAAATATGTAATCTCCACTTTGAGGCGCATTGCATAGGTAAACGTTTACTTAACTGGGCCATGCCCACTCTAAATTTGGCCTCGAGCGTTGAGCATTTATTTGAGAATCCTCCTCCCACCTCGTCTAACTATAAAAGAAAAGTGAAAATCGAATGCCAAAAACCTCAGGAATTCACTAAATGGTCGCCACGTTGCTGTTTATCGCATTGTCGTAAAACTCGCAGTCATGATCAGGTACAACTTTATAGATTTCCTGTTAATATTCATACCTTAACAAAATGGTGCCATAATCTTCAATTGCCCACAGTGGGTAGTTCTCATCGTCGTATTTGTTCAGCTCATTTCGAAGCAGCTGTGCTTACAAAGCGTTGCCCTATAGCTTTTGCAGTCCCCACACTAGACCTTAATACACCGCTTGGCTATAAAATCTATCAAAATTCTCCAAAACTTAAGCAACACAGGATTATCAATCAACGATGTTGTGTAGTGAACACATGTCGTAAGACACGTTCTGATGGTGTCCAATTATTTCGTTTTCCCAATAATCGTGTTATGCTTAATAAATGGCGTCATAATCTTAAGCATCTTCCAAAAGGTAAGTTAAGTTCGCAATTTCGCATTTGCTCATTGCATTTCGAAAAACATTCAGTAGGCTTGAAGCGCCTGTCACCTGGTGCCATTCCCACGCTAAATTTAGGTCATGATAGTTCGGAGGATTTATATCCGAATGAAACCAGATCGTTCTTCGAATTGGATAAATGTGTTGTAACGGGCTGTTCGTCCAGTAAAGATATGGAAAATGTTCGTCTTTTCAAATTTCCTCGAGAGGACGAAGAATTGTTAGGGAAATGGTGTCATAACCTAAAAATGAATACCTCGGAATGCCTGGGCATAAGAATATGCAATAAACATTTTGAAACAGAATGTATGGGTCCTAAATTATTATACAAATGGTCTATACCGACTTTAAAGCTAGGTTATGATGAAAATGAACCATTAGAAATTATACCTAATCCTCCGCCAGAAAAACGCACTGGGGATGTTCTATTCAAATGTTGTGTTTCAAGTTGTGGTAAAACACGGAAATACGACGAGGCTCAAATGAACAGTTTTCCTAAAAACATAAAAATGTTTCGTCGATGGAAACATAACCTCAAACTGGATTATTTAAATTTCAAGGAACGAGAGAAATTTAAGATTTGCAACGATCACTTCGAAGCCATATGTGTGGGAAAGACTAGGTTGAATTTTGGCGCTATACCTACATTGAATTTAGGACATGATGACATGGATGATTTGTATAAAATAAATCCAGATAAAGTGAAACCTAATTTATTTATAAAGCAATCGACATACGAGGAAGATCCACTCGAAATTGGTTACCCGAATGACAACATAGCGGAAGAAGATATAGAAGAACAAATGGAATCTTCCATTTTACCAATGGATATATCTAATCTGAAATGTGCTTACTATGAATGCATAGGCCCAAAGTGTTTATTACGCGAACCATATAGTTTACCACAAACGGAAGTGTTTAGAAAAATGTGGTTCTCTTTGATGAGCGTACAAGATAGCTTTGCTGGCGGAGAAAGCAAGCTGTGTGGGCTACATTACCAAAAAGTTTTTGAAAATTGTGAAGAAGAAATGTTATCTTTAATGACAGAAAATGAAGAATTAAAAGCAGATTTTGAAAAACTTCAAAATGCTTATCACAAATCGGAGATATCTTTAATTATCAAAAGCTGTAAATGCAGCAGTAGAGATTGCACTAACTCTTTAATTTTACCACACATCAGACTTTATCAATTCCCATACGGTAAAGAACTTAAGGAAAAGTGGTCTTATAATACCGGCATAGAGCCAGATGAACATCGTCGTTATTTAAACAAAGTATGTTGTATTCATTTTGAATCGTACTGTTTTACCTCAAATCAACGTTTACGATCGTGGGCTATACCTACTTTAGAACTGAAACATTTAGAAGCCGATACGTTGTATAAAAATCCTGATTTAACAAAAATAGATCGCCGTTTATTGGGTCCTCACATTATGAAATGTTGTGTCCGTGACTGCAATGGAGAAAATAGCGTCATAGAAGGTGAATCTTTGAAATTGTTTAGTTTCCCATTGGATGAAGATTTACTAACAAAATGGTGTGAAAATCTAAAGATGTGTCCACAACAAACTCCAATTTTCAAAATTTGTTCTTTACATTTTGAACGGCAATGTTACGGCTTAACACGTTTACGTATAGGAGCCGTACCCACTGTGAATCTTGGCCATTCTGATGAACCTCGACATTGCATTCCAAACAACATTAAGAA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Protein Sequence
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