Basic Information

Insect: Glossina brevipalpis
Gene Symbol: TRERF1
Assembly: GCA_000671755.1
Location: Scaffold180:251231-306568[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: MYB
Domain: Myb_DNA-binding domain
PFAM: PF00249
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 7.8e-12 7e-09 35.4 0.2 2 45 1830 1873 1829 1874 0.93

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	7.8e-12	7e-09	35.4	0.2	2	45	1830	1873	1829	1874	0.93

Sequence Information

Coding Sequence: ATGTGCAGTGCTTCAGTGGGCACAGAAGGTTCGGTTACGTTACAATTACGCGATGCCAATTCATCGTCATCATCTTCGTCCGATTCCAATCAATCAGTATCGACGGTCAcatcaaatgcatcaaatgcaGTCAGCAGTTTGGATAATGCGTTAACTATTGGTTATCCGGATCCGGAAATGTTGGCTGATGTATTGGGCACTTTGCAGACGGCTTCCCTAAATaataacaataacaacaatcattgtcgtattagtagtaacaatgattgcaatagcaaagtgcaaataaataaattaaacacaatagcaacaactacaacaacagcagcagcaacagcaataacagcagtaacaacaacaacaacaacaacggcaactaacagtgataattttaataatatcaatcaatccaatcatgttaataatcaaaacaataataataataataatatttcgaattctattaattgcaataataacattaaaaattgtgtgaataatttaaaaagtcgtgtaacaattagtcgtcgtacctcgaatctaacccatagttcacaaactcaaaaagattcccctaaatgtacgatagcggccgctgttcaaactgtatcaatttcaacaaatacaactaacaagactaacagttatattaagaattgtttaatacgcagtagcagttgcaataataccaccaatattacatcattggctcaaataatgagcaatagtagttcaactaataacggcagcagcaacaacagcaacagcaacagcaatagcaacagtaacggtaacagtaacggtaacagtagcagtaacagtaacagtaacaataacagcaacagccataacaacagccataacaacagcaacaaccataacaacaaccataacaacaacaaccataacaacaacagcaacaacaataataacacttgcagtaccttacaacaatttcaaagcagtaacagcagtaatttgtcatgcagcaatagcaacagcaattgcagcagtaacagtaactacagttcaaacagtaacgatagttgttttagtatcactagtagcagcaatagcagcagtggcaacATAAGTGTACGTTGTGCCCCTATACCCTGTAATCGTAAAGTTCCTGTTTCATTAACAAATCCACCGAAAATATTGaaaaaaaaCCGTTCAAAACTATCATCACCTAGCCGTCACGGTCCACAACAGTGTCAGATTTGTAATAAGATTTTTGGAAATGCATCAGCGCTGGCTAAACATAAACTGACGCATAGTGACGAACGGAAATACGTGTGTGTTATGTGCTCGAAAGCATTTAAACGACAGGATCATTTAAACGGTCACATGATGACGCACAGAAATAAAAAACCCTACGAATGTAAAGCTGAAGGTTGCGGTAAATCTTATTGTGATGCACGTTCCCTTCGCAGACATACAGAAAATCATCATGCTGGTGTTATAACACCACAAAATCAAAATTTGTCTTCTATTAATGTCAATTGTTCATCAGCGAATCTAAGTTTATCACCAGCTACAGCAAATGGAGATGCAAGCCCACCGGATGGTGCAACATGTTTGGGTACATATCTATCGAATGGTGGTACAGTCGTTGACGCTTCAACTGGTTTAGCTTTAACTGAAGACGAGGTGAAGGCTTTAAAGACGAATGTTACGTTGTTATCACCCACCTCTACACTTTCTTCTTCTTCGTCGTCGGCAGCTAGTAGTAGTGTCGGCACAACAGCTACCGCAGCCACGATAACTTTAACGGATAGCGGTGGTAATATGGAAGGTGAAGGTTTAACTCCTGAACAATTAGATTTGATTAGTAAAATTATGCGTCAAACTAAACAAACCACAGCACAGGTAACCGTATCCTCACACTCCAGTTCACAATCCTATAAAATTGATACATCACCGGCCCAAACGCAAACTCAAAATCCAAGGCCACGAACCTGGAATATGCAATTGCTAAACACTACTCAGAACTTGGCCATTACCGTAGATGAGGTATCAAATGATGCATTACCTCGGAATTTAAATTCACCACTATTGGCCCCGGATGCAAAAGAAGAGGAAGTCAAAGTAGATTTGACATCCGGCCTGAGTTCCTCTACTTTGTTGAATGTAGTTAAAATTGATCAGAAGCCAGTGGAATGCAATCTATGCCATCGTAAATTTAAGAATACGCCAGCCTTAAACGGTCATATGCGTTTGCATGGTGGTTATTTTaaaaaagatcccgaaactaaaaaaagtgaaaaaaaagaaaaTAATGGTCCGCCCTTACAGACAGCCAGTATTGGTGTTCGAGCCCTAATTGAAGAAAAAATTATTAACAAACGAAGTAGAGATTTAAATAAAGGTGCCTTTGTCGTACCTGCACCGCCTACTAATAATTTAGCCAATAATCCGATCCTGCGGAGATCAATTAGTGATTTGGAAAATTTCCTAAGTTCTAAAAATCAGACAAATTCTGGTAATTGCATATCACCGAATCTAAATACGGTACCTAATCCTGCGGTCACTTTTAAAAATAGTGATAGAACTATGCTGAATGCTCAGGATATGGGCTTACCTCAGAGTATTGAAATTTTTAGTACCAAACAACAAAAAACGATGAATAATGTAAGCGTCGGAGTGGGAACGAATCTTACTCAGTCGAATAGTGAATGCAATTTAGTTACAACGACAGAAAAACTAGGAACAACGACGTTGAATACAACGACTTCAACAGGTACAAACACCCGCAGCACTTCAACTGATCCTAAAGATTCCACTTTAATCGAATTGCTAAAGAGAGGAACACGTATTGCTGTCACATCTAAGCAAGCTACCAATGCACCATTAGGTGGAGTGACACGCCAAATTATTAATACCGCTACCAATACAAATTCTCCTTCAAGGGCAGTACTTATACCCTCCGATGTACAAGTCATTCATAATAATAAAGTAAAACTAACAACCACAAGTCAAGAAGTTCAAAATTCATTAAATGATTGCCCAGAATCTACTGGTATATCGTTAACACAAAATTCCCCGTTATCGTTAACCTTAGCGCAGAATGGAGATGTTAACGCAGAAGTCTATACAGTTACTTATGCTAGTGATAATTCTAATTTGTTTGAAGAAACTGAAGTCTATAATGTCAGCGAAGCTGAAATGCTATTGCAAACGGTAGATACTATGCAATTGTTAAATGATTCCAATCATGAAAATCTACTTAAATCTTCCGAACATTCCGAACAATATGAAATTATAAATAGTAATGGACAAATTTTGCAAGCCACATGCCCAACCGATATGAATGGTTCTGATAATTCAGAACGTAAACAACAGCAAATTTTGCCAAATTTTCAACATTTCCATTCCAAAGAACTGCTAATGAATTCTTTAAATCAATCTAATGGAAATTTAAATTCCTTATCCTTGCCATTATCTCAGGAAAGGAAACAACATTATGGTCGATTGAATTCACCGTTACATTCTCCTTTAGCGTATCCAACTCCACCCTCTAGTCATGAAAATGTTACACAAACTTCACCATACGTAGAGGATAATCAACAATATGGCGAAACGTCATCAAATGTCTTTTTTAGTGAATCATTAATAAGAAATGCATCAACAAATTCAATTGGAGAAATGGGAAATGAAAAAATCTCAAAATTAGGAAATGTTGTTATGGACGATGATGATAATTTCGATGATAATAATATTAAAATGGAAGATTTACTTAATGATACAAATACGGATGCGGAACGTGATTTAAGAGAATTTGCTGAAGCAAATTTATCATTTCTTGATGAAGAACAAGAATTTCTAAATGATTCAGGTAATGCTGCGTCACCGTTATCGGAATCTTTCTTTAGCGGTGGCATAAGTTCCGTAGAAGAGGTAAAAGAAGTATTACGTGAAGTTCTAACCGATGATCAAATACAAATAAATTGTGAAAATCAATCAGAGAATATAATTGATTTGTATTATTTACCATGTTTAAGTTTACAATCGCAAATGATGCCAAATTCGGAAGATCCATTATTATCATCTTCACCACGTGATTTTGGTCAACAGAAATTAAATCAAATATCCAATAATGTAAATCAACAACATAACATTCCTCCTCAACAACAAACAACAAATTTAAATTCAAATGCCTCGATTAGCACAAATCAGATTCCCTACcagcaaaataataataataataataataataataataataataatgccgcgatttcagtacaattacaacaacaacaacagcagcaccagcagcaacaccagcagcagcaatcgccacaacaacaacaacaacaacaacaacagcaaggcgtattaaaaatgcaatcaatgcatacaacacaacaaatGCCTTCAGATATTAATCAGGTTATTGTAACAGTACCGGCCAATAATGGTTGTGGCAATACGGCCTCTATTATGCAGTACAATTTTCAAAATATACCGCAAGTACAAATACCAACAAATACCCAACAATATATTGACTCCGTCAATCAATCGCATACACACGCAGCTAATAATAATAATAGCAACAATAGTAGTAGCAATAGAACTATAACAGCGCAGTTAAATGAGGCCTTAACGCAGCCCCTTATTTATACAGGAACCACCGAAAGATCAGAAATGAAATTAATGCCAACACAAATTCAGAATAATACTAATTTAAATGTTGAGCAAAGGcaacaagatccacaacaacaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacaaAGGTTAGAAATTACTGATATCACAAATAATAATTCCAATATTTATTATGGACAACTTGCATCGAACTCGAATGAGCAACAAACTCCATCATATTGTCAGACAACGAATACAGTTAATACTACTGCAGTGTTAACAACCGTTTTACAGCCATTATCCAATCAAACTAATTCCATATTAAAAAGACGTCTAAGAGGTGGTTATAATTCTTCGGATTCCGGCTCTTCTGGCTATCAATCCAAATT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Protein Sequence: MCSASVGTEGSVTLQLRDANSSSSSSSDSNQSVSTVTSNASNAVSSLDNALTIGYPDPEMLADVLGTLQTASLNNNNNNNHCRISSNNDCNSKVQINKLNTIATTTTTAAATAITAVTTTTTTTATNSDNFNNINQSNHVNNQNNNNNNNISNSINCNNNIKNCVNNLKSRVTISRRTSNLTHSSQTQKDSPKCTIAAAVQTVSISTNTTNKTNSYIKNCLIRSSSCNNTTNITSLAQIMSNSSSTNNGSSNNSNSNSNSNSNGNSNGNSSSNSNSNNNSNSHNNSHNNSNNHNNNHNNNNHNNNSNNNNNTCSTLQQFQSSNSSNLSCSNSNSNCSSNSNYSSNSNDSCFSITSSSNSSSGNISVRCAPIPCNRKVPVSLTNPPKILKKNRSKLSSPSRHGPQQCQICNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCVMCSKAFKRQDHLNGHMMTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHAGVITPQNQNLSSINVNCSSANLSLSPATANGDASPPDGATCLGTYLSNGGTVVDASTGLALTEDEVKALKTNVTLLSPTSTLSSSSSSAASSSVGTTATAATITLTDSGGNMEGEGLTPEQLDLISKIMRQTKQTTAQVTVSSHSSSQSYKIDTSPAQTQTQNPRPRTWNMQLLNTTQNLAITVDEVSNDALPRNLNSPLLAPDAKEEEVKVDLTSGLSSSTLLNVVKIDQKPVECNLCHRKFKNTPALNGHMRLHGGYFKKDPETKKSEKKENNGPPLQTASIGVRALIEEKIINKRSRDLNKGAFVVPAPPTNNLANNPILRRSISDLENFLSSKNQTNSGNCISPNLNTVPNPAVTFKNSDRTMLNAQDMGLPQSIEIFSTKQQKTMNNVSVGVGTNLTQSNSECNLVTTTEKLGTTTLNTTTSTGTNTRSTSTDPKDSTLIELLKRGTRIAVTSKQATNAPLGGVTRQIINTATNTNSPSRAVLIPSDVQVIHNNKVKLTTTSQEVQNSLNDCPESTGISLTQNSPLSLTLAQNGDVNAEVYTVTYASDNSNLFEETEVYNVSEAEMLLQTVDTMQLLNDSNHENLLKSSEHSEQYEIINSNGQILQATCPTDMNGSDNSERKQQQILPNFQHFHSKELLMNSLNQSNGNLNSLSLPLSQERKQHYGRLNSPLHSPLAYPTPPSSHENVTQTSPYVEDNQQYGETSSNVFFSESLIRNASTNSIGEMGNEKISKLGNVVMDDDDNFDDNNIKMEDLLNDTNTDAERDLREFAEANLSFLDEEQEFLNDSGNAASPLSESFFSGGISSVEEVKEVLREVLTDDQIQINCENQSENIIDLYYLPCLSLQSQMMPNSEDPLLSSSPRDFGQQKLNQISNNVNQQHNIPPQQQTTNLNSNASISTNQIPYQQNNNNNNNNNNNNNAAISVQLQQQQQQHQQQHQQQQSPQQQQQQQQQQGVLKMQSMHTTQQMPSDINQVIVTVPANNGCGNTASIMQYNFQNIPQVQIPTNTQQYIDSVNQSHTHAANNNNSNNSSSNRTITAQLNEALTQPLIYTGTTERSEMKLMPTQIQNNTNLNVEQRQQDPQQQQQQQQQQQQQRLEITDITNNNSNIYYGQLASNSNEQQTPSYCQTTNTVNTTAVLTTVLQPLSNQTNSILKRRLRGGYNSSDSGSSGYQSKFQTLSPYRSKLRKPSRTHYTPAPILNPARKGHGLYCNILKESNTNLTAFDAFDDDFDDSVGLVDFSDVSKVNLGSAYQAAIPIFKDRSTLITIDEPVKAELMWNPDIQKDENILMRFIDLSKSSATPSGSHTEEMALKTLLKSQGNTASAVLTLLQTQSNPFQMKWSAQELEIFLKGLEKYGKEFSKISKELGSKTTGECIQIYYFWKKLCVDYKVTHLKTETPPVNHSNEVKPYVCEQPDCSASFSSKAALHGHTRIHTYGRNSHNNNNHSVTNPNANNSLPGSISSASACNASSQALSHSINLVNKDNTATTTTTTNQTKDINNDFPCKVCGKVFNKIKSRSAHMKTHRVPENETTVQNANQNQTHQQQQQASNQ

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: iTF_00750397;
90% Identity: iTF_00747723;
80% Identity: iTF_00747723;