Basic Information

Insect: Flexamia atlantica
Gene Symbol: -
Assembly: GCA_035578135.1
Location: JAQJVK010000019.1:12892188-12903771[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-NF-X1
Domain: zf-NF-X1 domain
PFAM: PF01422
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: This domain is presumed to be a zinc binding domain. The following pattern describes the zinc finger. C-X(1-6)-H-X-C-X3-C(H/C)-X(3-4)-(H/C)-X(1-10)-C Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. Two position can be either his or cys. This family includes Swiss:P40798, Swiss:Q12986 and Swiss:P53971. The zinc fingers in Swiss:Q12986 bind to DNA [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

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4 32 0.0019 60 6.1 0.2 8 15 120 127 119 129 0.90

5 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 157 164 156 165 0.92

6 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 194 201 193 202 0.92

7 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 231 238 230 239 0.92

8 32 0.0044 1.4e+02 4.9 0.3 8 15 268 275 267 276 0.92

9 32 0.087 2.7e+03 0.8 0.1 8 13 305 310 304 311 0.86

10 32 0.0038 1.2e+02 5.2 0.2 8 15 336 343 335 345 0.92

11 32 0.0044 1.4e+02 4.9 0.3 8 15 373 380 372 381 0.92

12 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 410 417 409 418 0.92

13 32 0.0019 60 6.1 0.2 8 15 447 454 446 456 0.90

14 32 0.006 1.9e+02 4.5 0.3 9 15 466 472 464 473 0.91

15 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 502 509 501 510 0.92

16 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 539 546 538 547 0.92

17 32 0.0024 76 5.8 0.2 8 15 576 583 575 585 0.89

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22 32 0.087 2.7e+03 0.8 0.1 8 13 773 778 772 779 0.86

23 32 0.0033 1e+02 5.4 0.5 8 15 810 817 809 817 0.93

24 32 0.011 3.6e+02 3.6 0.7 9 15 818 824 818 825 0.92

25 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 854 861 853 862 0.92

26 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 891 898 890 899 0.92

27 32 0.0019 60 6.1 0.2 8 15 928 935 927 937 0.90

28 32 0.0025 78 5.7 0.3 8 15 965 972 964 973 0.92

29 32 0.011 3.4e+02 3.7 1.7 8 15 1014 1021 1013 1022 0.92

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31 32 0.087 2.7e+03 0.8 0.1 8 13 1088 1093 1087 1094 0.86

32 32 0.98 3.1e+04 -2.6 1.7 10 13 1132 1135 1129 1136 0.82

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	32	0.18	5.6e+03	-0.2	0.1	9	13	10	14	9	15	0.85
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Sequence Information

Coding Sequence: ATGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACTGATCTGCCACTCTGGGTCGCGTTTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACTCTGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCTTGTGTGGCTACTGCTATAGATATGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATATGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCTTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATATGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGACCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTACTTCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACAATGGGGCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGACCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGACCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCATACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTGCCGCTACATATATGCCACACTGGGTCGTGGGTGGCTGCTGAGGAAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTATAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACATATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACATATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTGCCGCTACATATATGCCACACTGGGTCGTGGGTGGCTGCTGAGGAAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGACTCATGCTATAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGATATGCCACACTGGGTTGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCCGCTACACTGGTCGTGGGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACATATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGATATGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGAGTGTGGCTGCTGCTACATATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGATATGCCACACTGGGTTGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACATATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTGCCGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGGGTGGCTGCCGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTATAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGACTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGACGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGATATGCCACACTGGGTTGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCCGCTACACTGGTCGTGGGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCTCACTGGGTCGAGTGTGGCTGCTGCACCAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTACTGCTATAGATCTGCCACACCGGGTCGTGTGTGGCTCCTGCTCTAGATCTGCCACACTGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACAGTGGGTCGTGTGTGGCTCCTGCTACAGATCTGCCATACCGGGTCGTGTGTGGCTGCTGCTACAGATCTGCCACAATGGGTCGTGTGTGGCTCCTGCTACAGATCTGCCACACCGGGTCGTTCGTGGATGCAAATGGCGGTGACCCTCGGTGGGCTGGGGTAGCTGCAGATAACCAGAGTATGGGTAATGCAGATAGACCAGGAAGTAATTGCAGATCTGCCACTGAAGGCTGTCACAAGGGTCATATCTGTTTGATCATAGCTCTCGTCTTGATATGCCCTGATATTGAGAAGCCGTTTGTCATATCTTGTGACGCCACTGGCTTGGGAGTTGGAGCAGTCTTAACCAGGATAACAGAGAACAGGACTCTACTGGACAACCTCCTGGTCTTAATGGAGAACAGGTCATTGCATACGGAGCGAAAATGCCTGGCCTTAATTGGGGCAGTGGAGAAGTTCCGGCCTTATGTCGAGGGAGGTCACTTTACCATCATAATAGACCATTACAGTCTCCTATGGTTGCACAATTTAAATGACCCCAAGGACGTCTAG
Protein Sequence: MGRVWLLLLICHSGSRLAAATDLPLWVVCGCCYRSATLGRVWLLLQICHTGSCVATAIDMPQWVVCGYCYRSATLGRVWLLLQICHTGSCVAAATDLPHRVVCGYCYRSATPGRVWLLLQICHTGSCVTAATDLPHRVVCGYCYRSATLGRVWLLLQICHTGSCVATATDLPQWVVCGCCYRSATLGRVWLLLQICHTGSCVATATDLPHWVVCGYCYRYATMGRVWLLLQICHTGSCVATATDLPHWVLCGYCYRSATLGRVWLLLQICHNGSCVAAATDLPQWVVCGYCYRSATPGRVWLLLQICHTGSYLPHWVVCGYCYRPATLGRVWLLLQICHNGSCVATSTDLPHRVVCGYCYRSATMGRVWLLLQICHNGSCVAAATDLPQWVVCGYCYRSATMGRVWLLLQICHTGSCVATAIDLPHWVVCGYCYRSATPGRVWLLLQICHTGSCVTAATDLPHRVICHTGSCVATATDLPHRVVCGYCYRPATLGRVWLLLQICHTGSCVATATDLPHRVVCDCCYRSATPGRVWLLLQICHTGSCVATATDLPHRVVCGCRYIYATLGRGWLLRKICHTGSCVTAAIDLPHRVVCDCCYRSATPGRVWLLLQICHTGSCVTAATDLPHRVVCGYCYISATPGRVWLLLHICHTGSCVATATDLPHRVVCGCRYIYATLGRGWLLRKICHTGSCVTHAIDLPHRVVCGYCYRYATLGCVWLLLQIRYTGRGWLLLQICHTGSCVATATYLPHRVVCGYCYRYATPGRVWLLLQICHTGSSVAAATYLPHWVVCGYCYRYATLGCVWLLLQICHTGSCICHTGSCVATATDLPHRVVCGYCYISATPGRVWLLLQICHTGSCVAAATDLPHRVVCGCCYRSATLGRVWLLLQICHTGSCVAAATDLPHWVVGGCRYRSATPGRVWLLLQICHTGSCVTAAIDLPHRVVCDCCYRSATPGRVWLLLQICHTGSCVATAIDMPHWVVCGCCYRSATLVVGGCCYRSASLGRVWLLHQICHNGSCVATAIDLPHRVVCGSCSRSATLGRVWLLLQICHSGSCVAPATDLPYRVVCGCCYRSATMGRVWLLLQICHTGSFVDANGGDPRWAGVAADNQSMGNADRPGSNCRSATEGCHKGHICLIIALVLICPDIEKPFVISCDATGLGVGAVLTRITENRTLLDNLLVLMENRSLHTERKCLALIGAVEKFRPYVEGGHFTIIIDHYSLLWLHNLNDPKDV

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: -
90% Identity: -
80% Identity: -