Basic Information

Insect: Fissipunctia ypsillon
Gene Symbol: -
Assembly: GCA_947568875.1
Location: OX387645.1:27673831-27675009[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: CUT
Domain: Homeobox|CUT
PFAM: PF02376
TF Group: Helix-turn-helix
Description: The CUT domain is a DNA-binding motif which can bind independently or in cooperation with the homeodomain, often found downstream of the CUT domain. Multiple copies of the CUT domain can exist in one protein (eg Swiss:P10180).
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 12 0.018 1.5e+02 3.3 3.0 26 26 54 54 2 105 0.66

2 12 0.011 88 4.0 0.2 18 36 106 124 93 137 0.54

3 12 0.032 2.6e+02 2.5 0.1 17 36 125 144 121 152 0.77

4 12 0.016 1.3e+02 3.5 0.1 20 37 138 155 130 168 0.55

5 12 0.015 1.2e+02 3.6 0.1 16 34 164 182 152 192 0.57

6 12 0.0084 68 4.4 0.4 25 35 193 203 172 225 0.54

7 12 0.034 2.8e+02 2.4 0.1 17 36 215 234 212 242 0.78

8 12 0.02 1.6e+02 3.2 0.1 18 37 226 245 219 254 0.61

9 12 0.016 1.3e+02 3.5 0.1 16 35 254 273 243 281 0.56

10 12 0.013 1e+02 3.8 0.2 17 35 275 293 263 304 0.54

11 12 0.0095 77 4.2 0.2 20 35 298 313 282 332 0.56

12 12 0.0046 37 5.2 0.3 16 28 354 366 323 391 0.57

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	12	0.018	1.5e+02	3.3	3.0	26	26	54	54	2	105	0.66
2	12	0.011	88	4.0	0.2	18	36	106	124	93	137	0.54
3	12	0.032	2.6e+02	2.5	0.1	17	36	125	144	121	152	0.77
4	12	0.016	1.3e+02	3.5	0.1	20	37	138	155	130	168	0.55
5	12	0.015	1.2e+02	3.6	0.1	16	34	164	182	152	192	0.57
6	12	0.0084	68	4.4	0.4	25	35	193	203	172	225	0.54
7	12	0.034	2.8e+02	2.4	0.1	17	36	215	234	212	242	0.78
8	12	0.02	1.6e+02	3.2	0.1	18	37	226	245	219	254	0.61
9	12	0.016	1.3e+02	3.5	0.1	16	35	254	273	243	281	0.56
10	12	0.013	1e+02	3.8	0.2	17	35	275	293	263	304	0.54
11	12	0.0095	77	4.2	0.2	20	35	298	313	282	332	0.56
12	12	0.0046	37	5.2	0.3	16	28	354	366	323	391	0.57

Sequence Information

Coding Sequence: ATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTTATGTTATGAGTCAGTCTGCACTAGCAACTACCTACACCTATACTTCTCCTTTCGCACTTTTACGAAGTTTGTGA
Protein Sequence: MSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATYVMSQSALATTYTYTSPFALLRSL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: -
90% Identity: -
80% Identity: -