Basic Information

Gene Symbol
mier1
Assembly
GCA_907269125.1
Location
OU026150.1:5778508-5795447[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 3 2.4e+03 -1.4 0.0 15 31 258 274 257 281 0.81
2 2 3.1e-08 2.5e-05 24.1 0.4 4 46 417 460 414 460 0.91

Sequence Information

Coding Sequence
atGGATGTGACTAGATCACCGCCCGACAGTCAGCCCTCTACCACGACGACAACAAACCGCAAGCGCAATCAACTAAACATGAGCAACACACTCCTGGCGTCCGCCACACTCTTCGATACATATCTGCAGGATTGTCAGCAGCAGCCGTCCTCTCcggcgtcgtcgtcgacgtcccAGACGACCGGCGACACAACCTTCGAGCCTTCCATCGACATGATGGTCAACGATTTCGACGACGAACAAACGCTTACCGAGGAGGAAGCTCTGGCCGAACTCGAGGCTCAGGATCCTGCCGATGAGATCGCGACTCTGCAGAGGGAGAGTGAGATGCCGATTGAGTTGCTCATTGCACAGTATAAGCACGTGGCCGAGGACTACCACCAGAGGAAACAGAAtcgaaaaaaatcaatgaaaaagaaTCGGTCACGGAAGCATTCAAAGAAGCATCCGGCGCCGGCCAGCACGAGCTCCCCTCCCAGCAGCATGGGCACCACGACAATACCAATGACAACGCTGGTCGACGACGAGATCATAGTTATCGAGGAGAGTGACGAGGAAGTCGAGCTGATGAAGACCGAAGTGGCCGATGTCCCCGATGCCGGGGACGAGGAGGACAATGGTGTTTGTGAGGGACGAGATGAACAACtggctgacgatgatgatgtcgaCGAAGACGAGGGCGAATTTGGAGACGAAGAAATGGACGAGGTGGAAGCTGATGTCGATATAATCCACAACAACAGAGCTGCTGACTTCAGCAAGCGATCGCATCTGCTGGAATTGTACCCGGAGAAATTCGCAAGCATTCAGCAAAAATTAGATGATGAGCAAAcagacgacgaggacgacgacgacgacgattcgGACTACATTAAGAAAACCATAATGGTGGGCTCAGCCTACCAAGCAACCATTCCACTTGGCCTGTCCAAGTATGGTGATGTGCTGCCCTACGAGAACGAAGACAAACTCATATGGGAGCCATCGCAGGTGAGCGAACAGGAAGTTGAAGATTATCTCATTCGTGTGCGTGAAATCAAGTCGACATTGAGCACGTCACCAGTGGAAGAGGAAATCCCATCGTCATCCGCGTCTGTAACATCGGAGTCAGATCAGGGACTGGGCAGTAATCTAATCAAGGATGATGAGCAGgcCTTACATCTATTGGTTCAGTGCGGATACAACTTCAAGGAGGCGCTGCGGCGCAAACGCTTGAACGCGGTCCCACTTACCGGTTCCATGAGCCTGTGGTCGGAGGAGGAGTGTCGCAATTTCGAAGAGGGCATACAAAAGTATGGCAAAGATTTTCGAAAAATACGACAAACCTTGgTGCGAACAAGATCGATCCGGGAATTGGTTCAGTTCTACTATTTGTGGAAGAAGACCGATCGCCGCGATCAGGATTTTGTTGATTCCGATACCATCGACCATATGGACGTCTATCTGGACTTCGATGAGCGCGATACAGGATCGAATGGCGGTGGCAAACACATATCCTCTTCATTAATCAATGACAGCTTAATATCAACTCAAACATTCCCGCTGAAGAAGCAGCACCATGTGACAACGGCATCGTCCACATTGAGCAATTTCTCAATTATGAACGAATCGAAGCGTGTTGCATGCGgcaacacaaaaaaatcatcgcaCAGTAAGAAGTCACATGGTGGTGGCGCAAGTGCGACGGCGGATCAAGCCACCACACAATCAGCGTATCGTCGTCGTAGTAGTCTACTCGCTGCCAACAAGGCTCATCATCATATTGGCGAGAATGCATTCGTTGATACATCATCGTCAACAAGCAACGCAAATTTATGGCCTTCCAAGAAAGCTGTGGACACTGCCTTATgttacgactacgactacgactacgactacgactacgactactactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactgcgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgacgacgactacgacgacgactacgactacgacgacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgactacgaccaCGACTAG
Protein Sequence
MDVTRSPPDSQPSTTTTTNRKRNQLNMSNTLLASATLFDTYLQDCQQQPSSPASSSTSQTTGDTTFEPSIDMMVNDFDDEQTLTEEEALAELEAQDPADEIATLQRESEMPIELLIAQYKHVAEDYHQRKQNRKKSMKKNRSRKHSKKHPAPASTSSPPSSMGTTTIPMTTLVDDEIIVIEESDEEVELMKTEVADVPDAGDEEDNGVCEGRDEQLADDDDVDEDEGEFGDEEMDEVEADVDIIHNNRAADFSKRSHLLELYPEKFASIQQKLDDEQTDDEDDDDDDSDYIKKTIMVGSAYQATIPLGLSKYGDVLPYENEDKLIWEPSQVSEQEVEDYLIRVREIKSTLSTSPVEEEIPSSSASVTSESDQGLGSNLIKDDEQALHLLVQCGYNFKEALRRKRLNAVPLTGSMSLWSEEECRNFEEGIQKYGKDFRKIRQTLVRTRSIRELVQFYYLWKKTDRRDQDFVDSDTIDHMDVYLDFDERDTGSNGGGKHISSSLINDSLISTQTFPLKKQHHVTTASSTLSNFSIMNESKRVACGNTKKSSHSKKSHGGGASATADQATTQSAYRRRSSLLAANKAHHHIGENAFVDTSSSTSNANLWPSKKAVDTALCYDYDYDYDYDYDYYYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDCDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDDDYDDDYDYDDDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDYDHD*

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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