Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_013282895.1
Location
scaffold:33271280-33274735[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 9 0.99 2e+03 -0.4 0.0 23 43 141 162 134 165 0.86
2 9 0.037 73 4.2 0.0 23 44 240 262 234 264 0.92
3 9 1.7 3.3e+03 -1.1 0.0 19 41 336 360 333 364 0.68
4 9 0.59 1.2e+03 0.3 0.0 15 38 486 518 479 520 0.70
5 9 0.0065 13 6.6 0.0 23 44 600 621 591 621 0.89
6 9 0.2 4.1e+02 1.8 0.0 23 43 666 687 655 688 0.86
7 9 1.4 2.8e+03 -0.9 0.0 22 31 733 749 712 751 0.64
8 9 0.22 4.5e+02 1.7 0.0 21 34 850 867 841 869 0.79
9 9 0.81 1.6e+03 -0.1 0.0 9 44 1024 1074 1024 1076 0.73

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCTGTTATTACCATTTGTAAAACTTCTGATGAAATGAATACGTTTAAAAATCAATCAACTACTAAACTTATAAATTCTTCTACTTTGCCAAAGTCATCTGAAAAGAAAACATTAGTAACTGTCCCATCTACATCTGCTATTCAGTCAAGCAAGATATTGTTGATTAATAATGTTGAAGGTCAACCAGTATCAGGAATATTGCTACCTTCGAATCATTTCATGTTGAAATTGAATCAAAATCAACCTCAACTCGAATCAGATCTAGATGAATACACTGAACGCGAATTTACTTCAAAGTATTTTTCAATGAATAAAAGTGAAAAAAAAATATTTCGAGAAACATTTTTTCGTACACTTCTTGATTTTATGCACCAAATTGTAAAGGATGGCCGTATTGTTAGCTCTTCTGACTCTATTTGGGAACATGTTTCTTCAAAATTAAATAATATACTTAAGCCAAAAAGTATTTATAACCGTTTTATATTAAACAAACATTCTTGTAGAACGAGATTAATTGAAGCATATCTGAAGGATCCTAAAAGTCAAACAAAAGATATATCTGTATTAAACCATATGATGAAAACAGATATGCGTCATGAGGTTGTTGAAAAAAGACCAGGCCATGTTGATAATGACACATTTTATGATGCTTTGTTTGTTTTTAAAGATAAAGTTCTAAAAGATGGAGAAGTAGCACCAAGTGTTGATTCTGTCTGGAATCAAATATCAGCACATTTGAATTATGCTTTAAAGCCAAATAGTATTTATTTAAGATTTAAACGTAATACCCATAATTGTCATAAAAAATTGCTGACTCAATGTAAGCTTGATCCATCTAAAGCTAGGACTTACGATGTTCCTAGCCGAAGGTTTTTACCATCTATAGAAAAACCGGTAAACAAAGTAAAAAAAAAAAGTTTAAAGTTCGAAGATTTTAATAAATTTTTTAAAGCATTATATACCCATAGACATATGATCATACAAAATGGTTCAATTGCGAGATATAATAATTCTGTATGGGATGAAGTTGCAAAGATGTTAGATTATGCTTTACAACCATCGGATGTACATTCAAAGTTTATTCGTAACCATGATTTATGCCAGACTAAATTAATAGAAGCATGTAAAGAAGATGAAAATTTCACGCCATTAGTAGTACCCAAATTTAATAAACCTAATTGTGTATCTGATGAAGTTTTTTTCAATATATTATGTAAATATCGTGACGAAATTTTACAGAATGGAAGTGAAATAGCTAAATTTTCCCACCCTGTTTGGACTCAAATTTCAAGAGATCTAAATGATACTTTAAAGCCAGCGACTGTTTATTTTAGAGTTACCAGGAATTCTCAGCTGTGCCTAAATAGACTTCTTAAGCCAACTGAAATATTAACAGACTATAAAGATATTATTAACAAAGACAAATTTTTTGAAACAATATGCTTATATAAATATTCAATAATGAATGGTGATCAAGTTGTAGATTTAAATGATCCAGTTTGGAATGAAATTTGTCTTCGACTAAACACTACATTAACTCCTGATGCTATATATGATGCAATTTCTAAAGATAAAGATTCGTGTAAGACTAAAATGATTCAAGCTCTAAAAACAGAACGTAGTGTTTTTTCTGGTGAAAATCCTGATATATCAGAAAAGATGACTGAATTATCACCAATTGTTGAATGTAATGTTTTTAATGAACCTACGTATGATTTTAATAAAGTATTGAATGAATTTAAGGACTGTATTTTACAACCCAATGGACAAATGGCTTTAAATGACGACCCTGTATGGAAACAAATATCTTCTCGTTTGAAAAACCTGAATGCGAATGAAATTTATTTGCGCTTCATTAACGATTACAATAATTGTCGTACACAAATTTTCGGTACTAACCCAGTTCATAAAAACAAGTTATTTGAAGTAATATTTGCACATCGTCATTTAATTCTAAACAATAATGTTATTGCAAATATTGATAATGAAGTTTGGACAAAAATGAGTGAAAAACTAAACTATGCATTAACATCTAAGGAAATTTATTTGAAATTTATTAAGGATGTCGATTGTTGTCGTACCAAGTTGTTGAAATTTTCAAAAAAAGACTTCACTCGCTCCCAGGGAAATGATAAAGATAAATTTTTAGATGTTATAATGAACCATAAAGATTCTATATTAAAAAATGGAACACATGCTAAACCTAGTGATCCAATTTGGAGTGAAATTGCATCTAAACTAAATTTTTCAGTAAAACCTTTAACTCTTTATAATAATTTTATGTTAAATAGGCATAAATGTCAACAAAAACTTTTAGAAGCTTGTGAAATAGATAAAAAAGAAGTAGTGTCTTCACCGATTTCATCAAAAATAACTTCCCAGATGGATCATGATTACACAAAAGGTGAAATGGATACTAGTTTTGAAGATTTAATTTCTATGAGACAAAAAGTTGGTTACGTACAAGAAAATGACTTCATTGATGCTTGTTTAGTGTTTAAAGAAAGGTTGATAAAAAATAATAGAATTGTGGCATCAACCGATAATGTTTGGAATGACATATCAAAGCATCTTAATTATGCAATAAAAGGTAAAACAGCTTATTTGAGGTTTAAACGTAACACTCATGATTGCCAAGGGAAATTGTTTAAAAGTTTTCAAATAAACAATATTTCGTATGAAAAAGATGATGAGTCATATTCTGTTGAAGATCAAAATATTGAGAATGAGATGTTCTTTGATGCAATATCAATTTTCAAACATTCAATTATTAACAATGGTATTTTTGCTACGGAGACTAGTCCAGTTTGGTTAGATGTTTCAAATTTAATGAATAAATTATTAACTCCTAATGAAGCATTTTGGAAATTTCGTCAAAATATAGAATCGTGTAGAACAAAACTAATACAGAAATGTATTGATGATTGGAACAATGAATCATCTTCAGTAATTAAAAATCGAATCCAAGTAATTAAATTTAAAGAAGCGTTGTGGAATGAAAATTTAAAATCTGAACAAATTGTAAAAACGAATAAAAAAATGTACACAAAACCATTAAATATAAACGATGATATTTTTTATGATGCTATTTATAAATATAAACGCGATATTTTCCATAATGATTTAATTGCAAACTCTTCAAATCCTGTATGGACAGCTATTTCCAACGAATTAAATAATGAATTGGAGCCATCAATCATATACTCCAGATTCAAAAATAATATGACTAAATGTAACCTGAAATTTGCAGAAGCAGCACAAAGACACAATCTCTATAAATTGAAACAAAATCAAATGAAAAACCAAAAACAATTGGCAGCTGATGAAAATATTAAGGACTCATGTGATCAAAATATGGTAGTTGATTATGATGATGAAGAAATTGTTGAATATGGCGTAGACAAGTTTAAAATAAAACGTTATAAGCACAATAGTAAATCTACAACTAAATAA
Protein Sequence
MSVITICKTSDEMNTFKNQSTTKLINSSTLPKSSEKKTLVTVPSTSAIQSSKILLINNVEGQPVSGILLPSNHFMLKLNQNQPQLESDLDEYTEREFTSKYFSMNKSEKKIFRETFFRTLLDFMHQIVKDGRIVSSSDSIWEHVSSKLNNILKPKSIYNRFILNKHSCRTRLIEAYLKDPKSQTKDISVLNHMMKTDMRHEVVEKRPGHVDNDTFYDALFVFKDKVLKDGEVAPSVDSVWNQISAHLNYALKPNSIYLRFKRNTHNCHKKLLTQCKLDPSKARTYDVPSRRFLPSIEKPVNKVKKKSLKFEDFNKFFKALYTHRHMIIQNGSIARYNNSVWDEVAKMLDYALQPSDVHSKFIRNHDLCQTKLIEACKEDENFTPLVVPKFNKPNCVSDEVFFNILCKYRDEILQNGSEIAKFSHPVWTQISRDLNDTLKPATVYFRVTRNSQLCLNRLLKPTEILTDYKDIINKDKFFETICLYKYSIMNGDQVVDLNDPVWNEICLRLNTTLTPDAIYDAISKDKDSCKTKMIQALKTERSVFSGENPDISEKMTELSPIVECNVFNEPTYDFNKVLNEFKDCILQPNGQMALNDDPVWKQISSRLKNLNANEIYLRFINDYNNCRTQIFGTNPVHKNKLFEVIFAHRHLILNNNVIANIDNEVWTKMSEKLNYALTSKEIYLKFIKDVDCCRTKLLKFSKKDFTRSQGNDKDKFLDVIMNHKDSILKNGTHAKPSDPIWSEIASKLNFSVKPLTLYNNFMLNRHKCQQKLLEACEIDKKEVVSSPISSKITSQMDHDYTKGEMDTSFEDLISMRQKVGYVQENDFIDACLVFKERLIKNNRIVASTDNVWNDISKHLNYAIKGKTAYLRFKRNTHDCQGKLFKSFQINNISYEKDDESYSVEDQNIENEMFFDAISIFKHSIINNGIFATETSPVWLDVSNLMNKLLTPNEAFWKFRQNIESCRTKLIQKCIDDWNNESSSVIKNRIQVIKFKEALWNENLKSEQIVKTNKKMYTKPLNINDDIFYDAIYKYKRDIFHNDLIANSSNPVWTAISNELNNELEPSIIYSRFKNNMTKCNLKFAEAAQRHNLYKLKQNQMKNQKQLAADENIKDSCDQNMVVDYDDEEIVEYGVDKFKIKRYKHNSKSTTK

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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