Efoe029002.1
Basic Information
- Insect
- Epiblema foenella
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_963556455.1
- Location
- OY747112.1:619810-635191[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2H2
- Domain
- zf-C2H2 domain
- PFAM
- PF00096
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 8 3.5 2.8e+02 3.5 0.0 1 23 2013 2035 2013 2035 0.95 2 8 0.95 76 5.3 1.1 1 23 2073 2095 2073 2095 0.93 3 8 2.8 2.2e+02 3.8 0.1 6 23 2107 2125 2107 2125 0.95 4 8 1.6e-06 0.00013 23.5 0.3 2 23 2184 2205 2183 2205 0.97 5 8 0.021 1.7 10.5 0.1 1 23 2212 2235 2212 2235 0.95 6 8 0.86 68 5.4 0.1 1 23 2241 2263 2241 2263 0.89 7 8 0.24 19 7.1 0.4 2 23 2270 2293 2269 2293 0.91 8 8 0.0043 0.34 12.6 5.7 5 23 2302 2320 2301 2320 0.97
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAGTAACGATACCGAACAGATATTTCTACCCGACTCCACGGGAAACCAGCGTCCCATGCTGCCGAGAACAGGCAACGGGGCGCCGACAATCAACACAATCAATCTTGAGAATGTGGATGACTTTTCGAAGGTGTGCCGGGTGTGTGCAACCATCACGGACCTGGTCATGCCCATATTCAGTGGAGAGGGGGTACGGATTAACCTTGCTGACAAGATAAAGAGACATCTTCCTATTAagGTATGCAGAACCGACCAGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCGGGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGCCTCGCAGGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTACTGCACCAGGTGTCCGCGACCGCCGGCTGCCGCTGGTGGTGTGCTACCAGTGCGTGAGCACGCTGCTGGCCACGCACGAGCTCGTGGCGTGCAGCCAGCAGGCCGACGCcgcgctgcgcaccgcgctCCGCGGCGATGGCAGGCGGGGTGGCCTCATGGGCCGAGACAACGAAACGCCGAAAGAAAGACAGGCGCGGCAGCGGCTGCTGCAGATGAAGCAGGAGCCGGGGGTGCGCGGCGAGGAGCGCTCGGGCGAGACGGACGTTATGTTTAACGACATAGTTAAGAAAGTTCTTGTGAACTATTTCCACACGATGAACATGGATCTTCACGAGGACTGCCAGTTCGCTTGTCAGAAGTGCTCGTGGCGCGGCAACTCCGCCGAGGGTCTGGGGGAACATCTGAACGCGCACCGGGTGCAGGCCGCGGCCGTGGACCGGTTTATACGGCAGTGCGTGACCTTCGAGCAGTGCCTCGACTCGGACGACGAGCCCGTCCGCGAGGAGCCCCCGCCCCTGCCGACGCACTGCTGCCCCTTCTGCGACAGCGTCTTCTCGTCGACGGCGCGGCTCGGGCTGCACATCGCCGAGCACGTGGAGATCGGCGAGGACAGCGCCGTGGAGTGCTGCGGCCTCGTGTTCCGGCAGCGCGCGCCGTTCGTCCGGCACGCGCTGCGCAACCacggccgcgcgccgccgccgggcCCGGCGTGCCGCGCCTGCGGCTGCCGCGCCGACTCCGCCGCCGCCCTCGCCGACCACATCAAGAACGCCCACGCCGATGACGCTATCACGCGCCGACGCCGCTCGGAAGCTCAGCGCGCCGGGCCCAGCAAAGACCAGAAATACATCCCGTCGACCTGCCCCGAGTGCGGCAAATCGTTCTCCAACAAATACAACATGGCGGTGCACGCGCGGTCGCACCGCGCCGCGCCCGAGAAGTTCGCTTGCTCGCGCTGCCCGCGCTCGTACGGCAGCCGCGGCGCGCTGCTCGCGCACACGAAGCTGGTGCACGGCGGCCTTCTCCGCTTCGCTTGTGATTTTTGCGGCGAGCGTTTTCAAAGCCGCGCCGCCCGCGATGTTCACGTCGCCATCCACACGGGGGAGCGCCCCCACGCGTGCACCGTCGAGGGCTGCTCCAGCGCCTTCCGCTCGCGCAATTCGCTCCTGCGGCACTTGGACGCGCATAGAGACGTCCGCGCTTACGCCTGCCATTGCGGTAAAGCTTTCCGCCGCGGCTCGCACCTTAAAACCCATCTCAAAACCCACTCCGCGAAGTCGCAGAACCGGCGAGCTTCAGACGAACCGACGGACTCGACCGGCGCTAACGGCTAA
- Protein Sequence
- MSNDTEQIFLPDSTGNQRPMLPRTGNGAPTINTINLENVDDFSKVCRVCATITDLVMPIFSGEGVRINLADKIKRHLPIKVCRTDQLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATRELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRASQVLHQVSATAGCRWWCATSTAPGVRDRRLPLVVCYQCVSTLLATHELVACSQQADAALRTALRGDGRRGGLMGRDNETPKERQARQRLLQMKQEPGVRGEERSGETDVMFNDIVKKVLVNYFHTMNMDLHEDCQFACQKCSWRGNSAEGLGEHLNAHRVQAAAVDRFIRQCVTFEQCLDSDDEPVREEPPPLPTHCCPFCDSVFSSTARLGLHIAEHVEIGEDSAVECCGLVFRQRAPFVRHALRNHGRAPPPGPACRACGCRADSAAALADHIKNAHADDAITRRRRSEAQRAGPSKDQKYIPSTCPECGKSFSNKYNMAVHARSHRAAPEKFACSRCPRSYGSRGALLAHTKLVHGGLLRFACDFCGERFQSRAARDVHVAIHTGERPHACTVEGCSSAFRSRNSLLRHLDAHRDVRAYACHCGKAFRRGSHLKTHLKTHSAKSQNRRASDEPTDSTGANG
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