Basic Information

Gene Symbol
ZMIZ1
Assembly
GCA_949752835.1
Location
OX457085.1:4035620-4043031[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
zf-MIZ
Domain
zf-MIZ domain
PFAM
PF02891
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 0.39 6.2e+03 -2.1 0.9 4 24 697 717 694 721 0.86
2 2 1.2e-24 2e-20 73.1 3.8 1 50 782 831 782 831 0.98

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAATGCCCAGGGGGGCTCCTCAAGGGCTCCTGCCTTAGGGGGCCAATTATCACCACCCGGGGCATattcaacatcatcatcatcatctactTCAACATTGGATACtatacatcaacaacaacagcaacagcatCTCCATCAccaacagcagcagcaacaacattatcaacatcaacaacaacaatatcatcatcatcaagaTCAAcagcattataataattataacggAAATTATAGTGGTGGATGCtcaacaaataatacaaattttataaatactaaTACGAATAATGacagtttaaataatttaaaaaattcttttggaCCAAATTCTGAATTTACTTCATATACACAATCATCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGAACAACACAAGGAACATCGTCACcatcatcaaataataatagtGGTGGTTGTGTAACAGCTGTGGATCatataaatagtaataataataatagtttagGAGGTGGTATTGGTGGTAACAGTATTAATAATagttatcatcatcatcaacataaTAGCAACAATATGGTTGCAGCAACTGGAACACAACAAACCATGGATGGAATGGGTTTCAATTCACAAATGACCAATATGTCAATGCATAATAGTGGCGCTGTAAATAATGTTAATAGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTAGCATGATTGGACAATCACATCATTTAACccatcagcaacaacaacaacaatatatgAACGGAATGAATGGTGGCAGTGGTGGTAATGGTATTGGTTCAATGAATGGTATGAATGGTATGCAACAAAATGGTGGTATGGGTCCCATGACAAATATGAATACAAGTAATAGTAATGTTGTTGGCGGAATGCAAAGTGGTGGTGTTAATGGCAACAGTATTGGTGGTATGAATGGCGGTGGTGTTGGTATGATGGGTGGAACTAATGGTGGTAATATGCAAATGAACTCAATGGCACATATGAACAACATGAACTATAATATGTCGAGACATCATCATATGTCACCAATGAATCAAATGCAAAATATGAGCATGGGTATGAATCCGATGAGTGTTGCTGGtggtaataataatgttaatccTAATTCTGGTATGATGGCAAATAGtcatcatcatcagcaacaacaacaacaaatggcTGCTGCAGCTGCTGCTGcacatcatcaacaacaacaacaacagcaacagcaaatGAATGCTATGAATCCAATGGCTAAAATGCAAGGTATGGCAAATGGTGGTTATCCGCAACGACGTATTGCACCATATCCAAATCCACAAATGCATGCAGCACAAAAAAGGCATGCTGCAGCTGCTGCTGCAGCAGCAGCTGGTATGTATCCTACAATGTCACAGAATCCACAAAATGTTCCTCCACATCCGGGGCAAATGCAATATCCCCATCATCAGTCAAATGGTGTACCAGTTCCTATGCAACCGGGAGGTTATGGAAGACCCGGACAAATGAATCCTTATGGTAGGGCTGGTCCCCCAATGATGCCACAACAGCGACAAAATACACCGCCATATACAAATACAGCTGCAttgcaacagcaacaacaatttTATGGTGGAGGAAATAGCAGTGGTGTTGCTGGCGGTGGTTTACCAATGGCTGGTGGTAATGGAATGGCTAGTAATTATCCAAATGCCCAAGGTTTTCAACAAGACGTGCGGATGAATTACCAGCATAGTCCAGTACCTGGTAATCCTACACCACCACTTACACCTGCCTGTTCAATTCCATATGTTAGTCCAAATCCAGATGTTAAACCGCAAATGGATCACAATGAAGAAATGCGATTAACTTTTCCAGTACGAGATGGTATTATTCTTCAACCCTTCCGATTACTCCATAATCTCTCTGTTAGTAATCATGTATTCCATTTAAAATCAACAGTTTATAACACATTAATGTGCCGATCTGACTTGGAACTACAATTAAAATGTTTCCATCAAGAGGATAGGCAGATGAATACAAATTGGCCACATACAGTAACAGTTTCTGCAAATGCTACGCCGCTTGTTATAGAGCGATCTGAGAAAACTGGACAAGCATTAAGGCCACTTTATTTGAAACAAGTTTGTCAACCAGGACGTAATACTTTACAATTGACAGCTAGCTCTTGCTGTTGTtcACATTTATTTGTCTTACAACTCGTCCATCGACCATCTGTACGGCAAGTACTACAAGGTCTGCATCGTCGAAATCTTTTGCCCGTTGAACATAGTGTGGCGAAAATAAAACGTAATTTTGCAATGGGTATGGCTGCTGGTATACCAGGTCAAACACCACCATCATCAGGTAATGATGTTCAAGGAGCTGATTTCGTTAAAGTTTCATTGAAATGCCCAATAACGAAAAATCGAATAAGATTACCGGCTCGTGGACATGAATGTAAGCATATTCAATGTTTCGATTTGGAAAGTTATCTGTTGCTTAATTGTGAACGAGGTAGTTGGCGATGTCCCGAATGCAATAAACCTGCACTAACTGAAGGCCTAGAAATTGATCAATATATGTGGGCAATACTAAATACACTTAGTAATTCATTAGATGTTGATGAAGTAACGATAGATCAATCAGCTAATTGGAAAGCAGTTAAAGGTATTCCTGGCCCAAATCAAGTAAATGGTATGGCCGGTAGTAGCAATCTAAGTAATAGTACGAATAGTAATAATGGCGGTGGTAGCAATAATAGCGGATTACCGCATATTAAAACAGAAAAACCAGATCCAGATGATATGAAATCATTATCGAAAGTAATGTCACCTGGTTCAACAGCTCTACCCACATGGGATAACTCGCAGGCGATGAGTCCTTATATGTGTCACGATATGAATTCAATAGCAAATGGCAATATGATGGGACAAAGTTGTAATGGTACTCGAAATACATTTGATTCCTTTGGTAATAATAACCAAAATGATAATTCGTCTGGTGGTGACTCATTGGCGCATTTAAATGATTCAGTCAATTCATTGGATCCATTAAATGCTATGGAGAAATCATTAAATGATCAGATGCCACATACACCTCATACACCACATACACCAGGTGGAAATTCAGCTAGTCACCCATTAACACCTGGTGGACCACCAAGTGTTAGTTCAGCGCATAATGAATGCGGTGGTAGTGGCAGTGGTAATAATAATAGCCAAAATAGTAGCTGTCATAATTCACCACAAAATTCATCACCACAAAGTGTTAGTGGatctgttaataataataataataataataatcaacaacaacagcaacaacaatcatcttcatcatcatctgCATCAACaccaataaaaattgaaaatgttggTTCACCTGGTTCAGGTTCATTAAGttcccaacaacaacaacaaattataaattcattgaTTAATTCACAAAATGATagtttaatcaatttaaatgaTACCGATTTAAATGCTGATCTCAATTTTGATCCATCAACGGTTATTGACAGTGATGCAACACATGATCTTAATCTTCTTTCGGATAGTGTTGTTGATCCAATggaaattttatcatatttagaTCCACCAGATTTAACACCACCATCAAGTGGTTCTAGTAATAATCCAAATCAGGATGAAATATTAGCATCATTATTTGATTAG
Protein Sequence
MNAQGGSSRAPALGGQLSPPGAYSTSSSSSTSTLDTIHQQQQQQHLHHQQQQQQHYQHQQQQYHHHQDQQHYNNYNGNYSGGCSTNNTNFINTNTNNDSLNNLKNSFGPNSEFTSYTQSSAASAAAGTTQGTSSPSSNNNSGGCVTAVDHINSNNNNSLGGGIGGNSINNSYHHHQHNSNNMVAATGTQQTMDGMGFNSQMTNMSMHNSGAVNNVNSGGGSGGSMIGQSHHLTHQQQQQQYMNGMNGGSGGNGIGSMNGMNGMQQNGGMGPMTNMNTSNSNVVGGMQSGGVNGNSIGGMNGGGVGMMGGTNGGNMQMNSMAHMNNMNYNMSRHHHMSPMNQMQNMSMGMNPMSVAGGNNNVNPNSGMMANSHHHQQQQQQMAAAAAAAHHQQQQQQQQQMNAMNPMAKMQGMANGGYPQRRIAPYPNPQMHAAQKRHAAAAAAAAAGMYPTMSQNPQNVPPHPGQMQYPHHQSNGVPVPMQPGGYGRPGQMNPYGRAGPPMMPQQRQNTPPYTNTAALQQQQQFYGGGNSSGVAGGGLPMAGGNGMASNYPNAQGFQQDVRMNYQHSPVPGNPTPPLTPACSIPYVSPNPDVKPQMDHNEEMRLTFPVRDGIILQPFRLLHNLSVSNHVFHLKSTVYNTLMCRSDLELQLKCFHQEDRQMNTNWPHTVTVSANATPLVIERSEKTGQALRPLYLKQVCQPGRNTLQLTASSCCCSHLFVLQLVHRPSVRQVLQGLHRRNLLPVEHSVAKIKRNFAMGMAAGIPGQTPPSSGNDVQGADFVKVSLKCPITKNRIRLPARGHECKHIQCFDLESYLLLNCERGSWRCPECNKPALTEGLEIDQYMWAILNTLSNSLDVDEVTIDQSANWKAVKGIPGPNQVNGMAGSSNLSNSTNSNNGGGSNNSGLPHIKTEKPDPDDMKSLSKVMSPGSTALPTWDNSQAMSPYMCHDMNSIANGNMMGQSCNGTRNTFDSFGNNNQNDNSSGGDSLAHLNDSVNSLDPLNAMEKSLNDQMPHTPHTPHTPGGNSASHPLTPGGPPSVSSAHNECGGSGSGNNNSQNSSCHNSPQNSSPQSVSGSVNNNNNNNNQQQQQQQSSSSSSASTPIKIENVGSPGSGSLSSQQQQQIINSLINSQNDSLINLNDTDLNADLNFDPSTVIDSDATHDLNLLSDSVVDPMEILSYLDPPDLTPPSSGSSNNPNQDEILASLFD

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01298084;
90% Identity
iTF_01298084;
80% Identity
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