Basic Information

Insect: Empis stercorea
Gene Symbol: zfh2
Assembly: GCA_949752835.1
Location: OX457090.1:2414506-2433348[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-C2H2
Domain: zf-C2H2 domain
PFAM: PF00096
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

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2 15 0.00033 0.033 15.4 1.4 2 23 618 640 617 640 0.96

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7 15 0.0011 0.11 13.8 1.5 1 23 1746 1768 1746 1768 0.96

8 15 0.0028 0.28 12.5 1.7 2 23 1775 1797 1774 1797 0.94

9 15 1.3 1.3e+02 4.1 9.5 1 23 1941 1965 1941 1965 0.94

10 15 0.028 2.9 9.3 0.6 1 22 1992 2013 1992 2016 0.89

11 15 0.012 1.3 10.5 0.1 1 23 2124 2148 2124 2148 0.93

12 15 2.2 2.2e+02 3.4 4.1 1 19 2341 2359 2341 2364 0.92

13 15 0.00019 0.019 16.2 2.8 1 23 3131 3153 3131 3153 0.98

14 15 0.0025 0.26 12.6 1.0 1 23 3309 3331 3309 3331 0.97

15 15 0.00018 0.018 16.3 0.3 2 23 3796 3818 3795 3818 0.97

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
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Sequence Information

Coding Sequence: 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