Este014381.1
Basic Information
- Insect
- Empis stercorea
- Gene Symbol
- Mblk-1_1
- Assembly
- GCA_949752835.1
- Location
- OX457086.1:52286224-52308002[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- HTH
- Domain
- HTH_psq domain
- PFAM
- PF05225
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 2.1e-16 2.6e-13 50.2 0.1 1 45 300 345 300 345 0.95 2 2 2.7e-18 3.5e-15 56.2 0.0 1 43 780 823 780 825 0.95
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCGTGATTTCAGGTGCATAGCATATTgtTTAGAAAGATTTGCTGAAGAGTTGATGGGACGCAGGAAATGGAAACATTTTCAAGAAGTTTTATCACGAACACAATTAAATACAAATCAAAACCGAACAGAGCAgacaaatatagaaaatttagaaCCATCAATATTGGAAAATCATTTAACAGAGAAACAAGCAGAACAATTTACTACAACAATCAAAACCgaattaaaagataatttaaatttaattaacgattcaataaataataaagaaatagaagaaaatattttaataaaaaattcatcaatAAAAACATCACCAAAAATTGGTGAAGAACCAATAAATAATCCAATTGATTGGAAACCAAGTGATAAGTGTTATTTTTGTGTGGACGGTAAACTTCTCACAGTGAACGAAAAAGGTGATTTGGTGGCCGAGTCGGGCCCGGCCTTGCCCGAGGCAGAGCTCACTAATaggTCAACAATAGATAGCGATAGTGATTCTAGCAATAGTACACCGGACACAATAACAAATAATCATACacaattaaatactaaaaaattaataacatcaCATACTAGAGATTCACATCCACCGAATATGACCTCATTTGAATCAATGGCTGCACAAATAGCAGCTATATCAAAAATTCAAGGACTACAATCTGGTTTAGGTCAACTTTATCcatcttTATGGTATCATCAGTTAGCCCAACAATTACCATTGGGTCCAACTACCTCAGAAACATCAGCTGCCGCTTTAAGTCCTTCaaataaagattcaccaagtccCAGTGAAACAACCGGTGAACAGCCATTAGATCTAAGTTCCAAACCATCACCAGTTTTTAGagcAAAACCACGAATAAATGCAGCAGTTACTGGTCGCCGAACATATACTGAAGAAGAATTAGCAATGGCATTACAGGATATATTAAGCGGTAAGTTAGGTACAAGACGTGCAGCTGTTATTTATGGAATACCTCGATCAACATTACGtaataaagtttataaaattGCAATGGAACAAAAACGTGAaatatcatcaacatcatcatcatcaacacaTCAACCAAATTTAGATGCATTagatgctgatgatgatgataaagatGGTTCTGGTGATGATGAACGAGATGATAAATTAATAGATAATTCTTTATTAGCACAACAAGTTGATCATTTATCACGATTTGAAACATCACATTTAGCAGCAGCAGCATTACAAAAACTTAGAAAATCAAATGTAgttaataatgaaattgataCTGTTAaaccatcaacatcatcatcatcaacatcagatggacaaaataaattattacattcaCCAGTTAATCAAACAGTAACAGGAGTAACATCAGCTGTTGgttcaacaacaacaccaaTACCACAACAATCTCAGACACCACCAATAACACCAAATCGATGGTTAGATACAAATGTATTATTACAAAGTTTATTATTATCGGGTAGTTTAGGTGGACTGCCAAatttattacaacaacaacaaccaaaaatgGACGATCCAGCTGCGTTACAAGAAGTatttaatacaatattaatGCAACAAGAAGAAATTAtgaaagaacaattaaaaaattcaacagaaaatagagataatttaaataatggtaaatcaaatttaattgatcCATTATTGTTAATGCAAAATTTACCATTATTACGGCAACAACAATTGAATCAATTACATACACCACATTTACCAAAATCTGAAACACCTGATACATCATCATCAGTTGATTTAAATGAAACAAGTGATGATGgtgttatattaaaaattccgTCCTTTAAACCAGTTGTACCTGGATCATCAGCATCAAGTAAAAATGGTGATAGTGCAATATCACCATCATCTATAACTGGTCATGGTTTAAGTTCAATATTATCACGTAGTCCTCatcaaacaaataataataacaataatatgtCTGGTATTTCACCACCATTAATGAGACAAAGTAGTGAATCACAATCACCACCAATATTATCATTGCGTGAAGTAATTGCAAATAGTATAAGTCGAACAtttaatcaacaacaaaaagatACAAATACTAAATCATATAATCAACatgaatcatcatcatcatcatcattaaatgaacaacaacaaaataaaaaacgtgCAAGCATATCAGTTATCAAAACAATTGGTGGTACAGATATATCACAATTTGCATCAAcaccaaatttattaaatacttatcatcatcatcatcatagtcaccatcatcatcatcatcaaaatgcATTAAATGCTGCTAATGCAGCTGGTAAAGGTACACGTCCTAAACGTGGTAAATATCGTAATTATGATCGTGATAGTTTAGTTGAAGCTGTTAAAGCTGTTCAACGTGGTGAAATGTCTGTACATAGAGCTGGTAGCTATTATGGTGTACCACATTCAACATTAGAATATAAAGTTAAAGAAAGACATTTAATGAGACCTAGAAAACGTGAACCAAAACCACAACAGAATGATGAACGAACTGGTGGTAgtggtagtaataataataatattagtaatatatCATCTGGTACAAAACATTCCAATTTACCTGGTTTAACAAATGTTGTAAataatatagataaattaaaatcaccATCTGGTGCTAGTGGTTCATTACAACAACAatcaaaatcatcatcatcatctggtttaaaaaattcaaataattcacCATTTCCAAGTACATCACCAAATGGTATGAAATTACCAATATTTGATTCAGCTATGGCAGCACAATTACAATATGCACCACATTTATTTTGGCCTCATACTGCAGCTGGTTTTAGTAGTTTACCAATTGATTTTCAAAGACAAGCTGCAGCAGCGGCTGCTGTTAATGCTGCTGGTGGTGGTACAACTGGACAACAATCAACAAGTGGTTTTACAACACAAAATGCTGAAAGTTTTTTAGCATCACAAATGATCCAAAGATTTCATGAAGAAACAAATCGTATAAATGCAGCTGCTGCCGCTACAACTGTAACaagtaataacaataataattatcaaaaatcaacaaatataTCACCATCTTTAATTgctacaacaaattcaatttcaacCACACCATCAATtgcaacaaatttaaataatattaataataatacaaataataatattaataataatacaacaaatataaataatagttgTAGCGGTGTTAGTACTAGTAGTAATAGCAGTAGTGGTAGTATTTCAAATGTGCCTATTGCTAAAAGTGCTCGTGAAATTGCTGAAAGTTTATATGATACTGGTGGTGCAAATGGTTCATCATTTTTAGATGGTATTATACGTCAAACATTAGATCGTAAAAGTAATAATGATATAAAACCAACACATGGAGCATTACTTGATCAATTagttaaaaatactaataaaacaataacaagtccatcattaataaataatattaatgaaaatcatCAACATCACCagcaaaatcaaaatattcatcaatctttaacaaataataatagtaataataataataataaaagatctGGTAGTCCAATACAATATCCTGTGATTGATATTAAACGTGAACGTTCTAATTCACCAatatcacaacaacaacaacaacatcattcACATTTATCAATGGCACTAACACCAATAAATGATCATCATAATAAACGTAATTCATTAAcagattgtaataaattaaatgatggtgataataatatattaatagaaTCATctgaaaatgataatttaattaatgatattATCAAATCAAATGATAGTAATATGATGATTAAATTAGAAgataatcaattaaattcaataGGAAGACTACAACATCATCAGCTTCATCAACAATTAACATCATCaacgtcatcatcatcatcaaatataCGATCTATTGATGATTTAAATGGTGGCAATAGTATaagtggtaataataataataataataataatagtggtgGTATTATTAGTGGTGGtgttaataatattagtatacTCCAAGAAAAATTAGGACACATTAAATCTGAAACCGAAGACAGTTTATAG
- Protein Sequence
- MRDFRCIAYCLERFAEELMGRRKWKHFQEVLSRTQLNTNQNRTEQTNIENLEPSILENHLTEKQAEQFTTTIKTELKDNLNLINDSINNKEIEENILIKNSSIKTSPKIGEEPINNPIDWKPSDKCYFCVDGKLLTVNEKGDLVAESGPALPEAELTNRSTIDSDSDSSNSTPDTITNNHTQLNTKKLITSHTRDSHPPNMTSFESMAAQIAAISKIQGLQSGLGQLYPSLWYHQLAQQLPLGPTTSETSAAALSPSNKDSPSPSETTGEQPLDLSSKPSPVFRAKPRINAAVTGRRTYTEEELAMALQDILSGKLGTRRAAVIYGIPRSTLRNKVYKIAMEQKREISSTSSSSTHQPNLDALDADDDDKDGSGDDERDDKLIDNSLLAQQVDHLSRFETSHLAAAALQKLRKSNVVNNEIDTVKPSTSSSSTSDGQNKLLHSPVNQTVTGVTSAVGSTTTPIPQQSQTPPITPNRWLDTNVLLQSLLLSGSLGGLPNLLQQQQPKMDDPAALQEVFNTILMQQEEIMKEQLKNSTENRDNLNNGKSNLIDPLLLMQNLPLLRQQQLNQLHTPHLPKSETPDTSSSVDLNETSDDGVILKIPSFKPVVPGSSASSKNGDSAISPSSITGHGLSSILSRSPHQTNNNNNNMSGISPPLMRQSSESQSPPILSLREVIANSISRTFNQQQKDTNTKSYNQHESSSSSSLNEQQQNKKRASISVIKTIGGTDISQFASTPNLLNTYHHHHHSHHHHHHQNALNAANAAGKGTRPKRGKYRNYDRDSLVEAVKAVQRGEMSVHRAGSYYGVPHSTLEYKVKERHLMRPRKREPKPQQNDERTGGSGSNNNNISNISSGTKHSNLPGLTNVVNNIDKLKSPSGASGSLQQQSKSSSSSGLKNSNNSPFPSTSPNGMKLPIFDSAMAAQLQYAPHLFWPHTAAGFSSLPIDFQRQAAAAAAVNAAGGGTTGQQSTSGFTTQNAESFLASQMIQRFHEETNRINAAAAATTVTSNNNNNYQKSTNISPSLIATTNSISTTPSIATNLNNINNNTNNNINNNTTNINNSCSGVSTSSNSSSGSISNVPIAKSAREIAESLYDTGGANGSSFLDGIIRQTLDRKSNNDIKPTHGALLDQLVKNTNKTITSPSLINNINENHQHHQQNQNIHQSLTNNNSNNNNNKRSGSPIQYPVIDIKRERSNSPISQQQQQHHSHLSMALTPINDHHNKRNSLTDCNKLNDGDNNILIESSENDNLINDIIKSNDSNMMIKLEDNQLNSIGRLQHHQLHQQLTSSTSSSSSNIRSIDDLNGGNSISGNNNNNNNNSGGIISGGVNNISILQEKLGHIKSETEDSL
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