Basic Information

Gene Symbol
TFCP2
Assembly
GCA_949752835.1
Location
OX457088.1:57547620-57563529[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
CP2
Domain
CP2 domain
PFAM
PF04516
TF Group
Beta-Scaffold Factors
Description
This family represents a conserved region in the CP2 transcription factor family.
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 3.8e-54 4e-50 171.0 1.5 8 185 308 482 296 496 0.87
2 2 2e-14 2.1e-10 41.1 0.1 173 221 532 580 518 582 0.92

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGCTCTATCATTGTTATCACATCCTAGTTATACTGATTTACAACAATCATTTTTTGATACATCATCAATATTAAGGAATAAtactacaaataataatattattaatagtagtaatattaataataataataatattaattatattgattattattcattttctaaTGATGAAATGGaattcaattcaaattcaattaatgGCCAGaattcaTCAAATCatgcaaataataattataataattatgaacaAGTTATAGATTTTGTTGATTCACCACCAAACTCGAAAGAATCTTGGCCAGGTGATTATACAAAagAGGATCAACCACCAGGACCAACAATTGTTGATGTCCAaacaatttattcaaataattcaaATCGTAAGAGGCGAATGGATTGGGATGAATTGAATATTAatcaaacaaataataataataataatgataatgatcaTAATACGAAAATACAAAATCTTGATGATAATAAGGAACctgaaaaaaagaaatcaacagGACGTGGAAGTTGGGCAGATGATATAGATTTTGATTTAAATGGAGAATTCAGTAATAATGGttatttaaataaTGCTGaatcatttttatcattttcaccAGCATTAACAGTTTTAAAACAGGAAATACCATCACCAAGTTCTGATTTAccacaacaacagcagcagcagcaaaaaGGTAATAAAAGTCCccatcaacaaaatttaaatacagaTAAATTACAAcaagaaaatgataataatcaaCAAGAGAGTTCAATAAATGGATCTCCACAACAtcaccaacaacaacagcagaAACAAGGTCAACAACAAGGATCTCATTCAACATTAGATAATGGTTTAAATGCTAATAGTCTTGGTACTAATTTTCAACAACTTTTACAACAACAGGAAAATTTAGATAATACTAGTGCTCGTAATAGTCCACATCATACAGATAATATTAAATCTGATACAGCATCTGATgataataaatttcaatatattttggcAGCTGCAACATCAATTGCAACTAAAAGTAATGAAGAAactttaacatatttaaatcaAGGACAAagttatgaaattaaattaaagaaaattggtGATTTATCATATTATcgtgataaattattaaagagtgttataaaaatatgttttcatgAACGACGTCTGCAATATATGGAACGTGAACAAATGCAACAATGGCAATCAGCTAGACCAGGTGAACGTATTATTGAAGTTGATATACCATTATCATATGGTTTATGTCATGTAACACAATCATTAAatcaacaatatttaaatactgTTGATATATTATGGGATCCAATGAAAGAAGTTGGTgtatatattaaagtaaattgtATATCAACTGAATTTACACCAAAAAAACACGGCGGCGAAAAAGGTGTACCATTTAGAATACAAATAGAAACATATTTAGAAAATGgaacaacaataaataataatacaacaaatttaattaataataataatagtacaacatcaacaacaccaacaattaatattaataataataataataataataataatacaaatacaaataacattaataataataataataataattcgcCAACAAATGCgattattaataatacaaatagtgATAATTGTTTGGGTAAACCAATACATGCAGCTGCTTGCCAAATTAaggtatttaaattaaaaggagCTGATCGAAAACATAAACAAGATCGTGAAAAAATTCAAAGACGTCCACCATCTGAACAAGAAAAATATCAACCAAGTTATGAATGTACAATATTAAATGATATATCATTAGATTCAATAACAtcaaattcaacaacaacaggATGTTTAAGTCCAGAATatATGAAAATTTGGCCAAATTCACCTGTACATATGCCAAAATATGAAGGTATATTACCATTTACAAGtacaaattcaacaacaaataatattaattcaaatataccAAGTCCAATAGCTATAAATAGTGTAACatcaacaaatacaaataatttaaaattaatggatCAAAATATGGTATCACCACAACAAATTGATATGGATGATTATgCTGGACAAATAACAAAAGATTCAACACCAGTTCAAGTATCACAATGGTTAACATATCATCGATTAAGTACATATTTAGGAACATTTGCACATTTTTCGGGATCTGATattttaagaatGTCAAAGGAAGATTTAATTCAAGTTTGTGGTTTAGCTGATGGTATTCGAATGTTTAATATATTACATgcaaaagcaATAACACCACGTTTAACAATTTATATTAGTTTTGATGGTAGCAGTTATCatgcaatttatttaatatcaaatacaattaaagaattaacatataaaatatttaaattaccagGATTTTTTGAAATGTGTGCTAATGGTGGTACAAATATTAAtggtattgaaaataataatggttATCCAGGATGGGgaatGCTTTCAAAATACTCAGGAAGTggatcaaatatttataatgatgcatcaaaattaaatatatatacaactGGTCCATCTGGTATTCATGTTATGGTTAATGATGAAGTTTTAAGTAATGCAATTAAAGATAATAGTTTATATTCATTGGAAATGCTTAATGgcaaaatattaatgaaatcagttaataaaattgataatatttaa
Protein Sequence
MALSLLSHPSYTDLQQSFFDTSSILRNNTTNNNIINSSNINNNNNINYIDYYSFSNDEMEFNSNSINGQNSSNHANNNYNNYEQVIDFVDSPPNSKESWPGDYTKEDQPPGPTIVDVQTIYSNNSNRKRRMDWDELNINQTNNNNNNDNDHNTKIQNLDDNKEPEKKKSTGRGSWADDIDFDLNGEFSNNGYLNNAESFLSFSPALTVLKQEIPSPSSDLPQQQQQQQKGNKSPHQQNLNTDKLQQENDNNQQESSINGSPQHHQQQQQKQGQQQGSHSTLDNGLNANSLGTNFQQLLQQQENLDNTSARNSPHHTDNIKSDTASDDNKFQYILAAATSIATKSNEETLTYLNQGQSYEIKLKKIGDLSYYRDKLLKSVIKICFHERRLQYMEREQMQQWQSARPGERIIEVDIPLSYGLCHVTQSLNQQYLNTVDILWDPMKEVGVYIKVNCISTEFTPKKHGGEKGVPFRIQIETYLENGTTINNNTTNLINNNNSTTSTTPTININNNNNNNNNTNTNNINNNNNNNSPTNAIINNTNSDNCLGKPIHAAACQIKVFKLKGADRKHKQDREKIQRRPPSEQEKYQPSYECTILNDISLDSITSNSTTTGCLSPEYMKIWPNSPVHMPKYEGILPFTSTNSTTNNINSNIPSPIAINSVTSTNTNNLKLMDQNMVSPQQIDMDDYAGQITKDSTPVQVSQWLTYHRLSTYLGTFAHFSGSDILRMSKEDLIQVCGLADGIRMFNILHAKAITPRLTIYISFDGSSYHAIYLISNTIKELTYKIFKLPGFFEMCANGGTNINGIENNNGYPGWGMLSKYSGSGSNIYNDASKLNIYTTGPSGIHVMVNDEVLSNAIKDNSLYSLEMLNGKILMKSVNKIDNI

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00642974;
90% Identity
-
80% Identity
-