Eliv008818.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Empis livida
Gene Symbol
-
Assembly
GCA_963932195.1
Location
OZ010647.1:13819814-13832960[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
zf-C2H2
Domain
zf-C2H2 domain
PFAM
PF00096
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 16 0.0021 0.13 12.9 2.9 1 23 341 364 341 364 0.96
2 16 0.00025 0.015 15.8 1.9 2 23 369 391 368 391 0.97
3 16 0.039 2.3 9.0 3.3 1 23 430 453 430 453 0.94
4 16 0.0004 0.024 15.2 0.8 2 23 462 483 462 483 0.97
5 16 0.0015 0.09 13.4 1.2 1 23 489 511 489 511 0.99
6 16 0.0089 0.54 11.0 0.3 1 23 517 540 517 540 0.97
7 16 0.00077 0.046 14.3 1.2 1 23 546 569 546 569 0.97
8 16 0.00033 0.02 15.5 4.4 1 23 578 600 578 600 0.98
9 16 0.00043 0.026 15.1 1.4 1 23 750 773 750 773 0.97
10 16 0.00016 0.0099 16.5 3.2 1 23 783 805 783 805 0.98
11 16 0.027 1.7 9.5 3.8 1 23 811 833 811 833 0.99
12 16 0.00061 0.037 14.7 1.5 1 23 839 862 839 862 0.97
13 16 1.2e-06 7.1e-05 23.2 1.5 1 23 868 891 868 891 0.97
14 16 0.00064 0.039 14.6 1.1 1 23 900 922 900 922 0.98
15 16 0.9 54 4.7 0.4 1 14 928 941 928 943 0.89
16 16 0.041 2.5 8.9 0.1 5 23 943 961 941 961 0.96

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGAACCtgataaagattttttatttattgaagaaaTCAAATCACACCCAGCATTATACAATTCTAATCATGTGAATTATGCTAATATGAATGTTAGAAATGAACTATGGGAAgaaattactgaaaaatttaaactgaCGATTAATgcaAAACATAAATGGAAAGATATTCGTGATCGTTATGTACgtgaaaaaaagaaagagaaaaatagaacAAAACCACGATTAACTACATATCCACCGTGGAAATGTTTACCTAAATTACGATGGTTAGATGACCATTTACGAACTTATACATTTGTaactCGTCAACCAACTagtaaaaaaactaaaacaaataaaaagaaaaataatcaaaacacTAAAACTACTACGAATCCtaataaaagtaaagaaaCTATAGAGattgaatatgaaatttgtaaaaatgatGATATTAAAGAAGAGGatataaatgatataaaagTAGAAGAAAATACGTTTAAAACcaaagaaattgaattttatgaagaTTGTAAAACTGATGAAATTGATCCATTTAAAATAACCGCAGAACATAAATGTGGTCAAATATATAtggataatgaaaaattaatatttttatgcgatttttgtgaaaatttattttatgaaagtaATACATTTTGTGCTCATATATTACATGTTCATCCATCTGATTGTATAAGGAAAACTAATAAtgattcattattaaatttggaatatGAAAACGAAGTTGAATTTCTGGAGTTTAATGATAGTAATGATGTTCCATCAGTCAATACATCTGAATATGATGATTATTCatttcaaaacattaaaaaaactgataGTAGTAATGATGAGACACAAACATCACAAGATCTTAACTCTAATATAGATGATTCAACAAAttcaaactttttaaataaaacagaaaacgatttgcaaaaaaatgaagataatTCTGATTCGGACAATGAACctgaaatgaatatttttaatttacagcGACCTAAAAAAATcccaaatgaaaataatgaatatccATGTCCGATGTGTGATAAGACATATAGATTATATCATTCATTAACATATCATTTTCGGAATTTGCAtgctaatattaataaatgtgaTCATTGCGATGAAATCTTTCAAAGTGCTACATCATTGAAAAcacatttaagaaaaattcatcGTGTATTTAGACGGAAAATTGGTCaagaagaattattaaataatgttaaaaaacaattgaataaaaatgaaataccaTTAGTACCACCACAAATCCGAAATAATGATGATCGATTTGTATGCCtgatatgtaataataattattcacgTCATGAAACATTACGCAAACATCATATAAATGTACAtttaaatggtaaaaatatagtaaatcgTTGCGAATTATGTGATAAAACATTTCaaacagaatatttattaaaaatacataaagcAACGCATAATGATAAtcgtaaatataaatgtacaaAATGTGATGCTGATTTTGTACATCCAAAATTTTTAGGTATACATTTGCGTTCACATTTAGGTAATCGTAAATATCCATGTGAATACTGTTCAGAAACATTTCCAAAAAGAATTGATAAAATCGCTCATGAACGTACTAAACACACTAAAGAAAAACCATATCAATGTGAAAATTGTTTAGaatcatttacaaaatattcagaattaaTAGTACATAAAAATCGTAAACATAATCCAAATCAAGTAAAACGGACATATGTGTGTTCTTATTGTAATAAAGTATTTCATAGGAACGATTCTTATAGTTATCATGTCCGTAAACATGAAGGAAAAAGACCATTTCAATGTACTGTTTctaAAAGGAGATTTAGATCATTACGAGATCGTTATGTACgtgaaaagaagaaaattgatcaacaacttttaattactaaaactGTTGATTATCCAAATTGGCGATATTATTCACATCTAACATtcttagataaatatttacgaaAGAATAAaTCATATGATACCAATGAAATGGATGATTTAGTTAAAGAGGagacaataaattattttaattctaaaaatgatGATCCACTTAGTGtacaaagtttaaaatatgaaattgaatttttagatgagaataatagtaataataacaataatagtATAATATCATTAGATTCAGaatataatgataataattataataatgaaccaaatacaaaaaaattattaattaattatgaaaaaccaccaaaattattaaatgaaaataatgaatatccATGTACACAATGTGATAAAacatatacaatatataaatcattaagGGATCATTATCGTATTAATCATACATCTAAATATATAGCAAGATCAAGATATTATTGTGATCaatgtgataaaaattatcattcaCGATTTCAATTACGTGCTCATATGAATATACATAAAGGTGTTAGACCCTATAAATGTCATTTATGTTCAGCTGATTTTACACAtccacaatatttaaattttcatatacgaatacatttaaatgataaaCGATATCCatgtaaatattgtaataagaaatttataagacCATATGAAAGAATTTATCATGAACGGTCTAATcatacaaatgaaaaattatatcaatgtGATGATTGTGGtcaaacatttattaaaaactcaCAATTAAAacgacataaaaatattaaacataatccAAATTATATTAGACCATTATATGAATgtgatatttgtaaaaatacatttacatCAAAAGAATCTATGTTGAAGCATAAATTAATACATGAAGGTAAAAAACCATTTGATTGTGATATTTGCGGTagtaaatttcgaacacgacATGATATATGTGACAAAAGATTTGCACAAGGTCCTGGTTTATATAGTCATATGAAATCACATGAGGATTATTCAAAATGTAATGCATTGTATATacagaaaactaatataacTACAAGTGAAGAGTTTGCAAAATTTGAGTTTCAGCCTAAATGGATTAAGTCTAGGATATTCTGGAATGCAACATTTGAAAGCCGTTTTcgaaaacaatataataatcCCCAAAATTATCCAGTGAAGataattttacttttacatTCACATAATGATCCTGGATGGCTAGAGACTTATGCCCAATATTTTAAGACGCAAACTAAAAGTATCTTAGATACTGTTATACAGAAAATGATCGAATTTACAGATATGACGTTTGTTTGGTCAGAGATATGTTTTTTAGAATTATGGTGGAAACAAGCTAACTCatatcaaaaatatgctttaaaagaattaatcgATTCTGGTAGATTTGAAATAGTAACAGGTGGTTGGGTAATGACAGATGAAGCAAATGTTCATTTATATCCAATGATTGATCAATTGATTGAAggtcatcaatggttaaaaaataatttaaatatagaaccAAAAATTGGTTGGTCTATAGATCCATTTGGTCATGGTGCAACATTACCATATTTATTATCAGCTAGTAATTTTGATGGTACAATTATACAAAGAATACATTTTGGATGGAAATATTGGtttgcaaataataaaaatggtgaTTTTATATGGCAACCACTATGGAGAACATCTGATAAAATTAAtcgtaatttattaatacataatatgccatttgaaatttatacaaCTGATACGACATGTGGAccagatacatatatatgtagagaatttaattttaattcttattattcaaaaaatataaatagatataATGTTGCTGAAAAATCTGAAACTTTAATGGAACAATATTCACGTACAGCATCATTATTTAAGCATAATGttggtttaatattaattggtgAAGATTTTTCATATGATTCACCAGATAAActtaataaacaatatttaaattataaaaaattaataacatatattaatgataataaaaattattttaatactgaaattaaatttggtacACCAAATGAATATTTCGAAGAAATACGTAAACGTTCTGATCAATTTCCAACATTAAAAGgtgatttttttgtatattcagATACTCATGATCGTAGCCCAGCATATTGGTCTGGTTATTATACAAATCGaccatattataaatatttatccaaTCTATTAGAACATAATTTACGATcaagtgaaattttatatactttaacatataatattatacgacaaaacaaaaatcaattaaataataatttaaaattattacaaataaattatgataatattattacagcTAGACAGTGTTTAGGTGTATTTCAACATCATGATGCTATAACTGGTACATCAAACCAATTTGTAATGGAAGATTATAGATCTGGATTAGAACGAAATATTCAATATACAATTGAATTACAAGAAATTCTAATAGAAatgttattacaaaataatatatataatcaaaatttcctACAAAATCAATTACGTGAAAactatgttataaatttttatgattccattacaaaattttttataatatttaattcattagcACAAAAACGTctagaaataatgaaaatcaaaaCAGCTGAATCaaatgtattaatattaaatgaaaatggtataccagtaaaatatcaaataaatccaatatggaaatataatattaataataatacaataaatatttcaaatacagaatatgaaattatatttttagcgGAATTACCAccattatgtatattaaagtatcaagtaatatttattgatgaaGATGGTTCAAATATGGCAACAATATACTGTAAtgattgtaatattaataataattcaacaatatttgaaatttttgaaaaaccatCTGGTGATATACaattagaaaatcaaaaacttCGTTTAGTAATGGATGATGAAAatggtttattaaaattattaacacttAAACAAACAAACGAATCAATggaatttgtaattaattttggtgCATATAAAACTACACGAAGTGgtgcatatatatttaaaactgatgATGACATTcctgaaattaatatattagatCAATATCTGaataatagtaatatattaattattag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Protein Sequence
MEPDKDFLFIEEIKSHPALYNSNHVNYANMNVRNELWEEITEKFKLTINAKHKWKDIRDRYVREKKKEKNRTKPRLTTYPPWKCLPKLRWLDDHLRTYTFVTRQPTSKKTKTNKKKNNQNTKTTTNPNKSKETIEIEYEICKNDDIKEEDINDIKVEENTFKTKEIEFYEDCKTDEIDPFKITAEHKCGQIYMDNEKLIFLCDFCENLFYESNTFCAHILHVHPSDCIRKTNNDSLLNLEYENEVEFLEFNDSNDVPSVNTSEYDDYSFQNIKKTDSSNDETQTSQDLNSNIDDSTNSNFLNKTENDLQKNEDNSDSDNEPEMNIFNLQRPKKIPNENNEYPCPMCDKTYRLYHSLTYHFRNLHANINKCDHCDEIFQSATSLKTHLRKIHRVFRRKIGQEELLNNVKKQLNKNEIPLVPPQIRNNDDRFVCLICNNNYSRHETLRKHHINVHLNGKNIVNRCELCDKTFQTEYLLKIHKATHNDNRKYKCTKCDADFVHPKFLGIHLRSHLGNRKYPCEYCSETFPKRIDKIAHERTKHTKEKPYQCENCLESFTKYSELIVHKNRKHNPNQVKRTYVCSYCNKVFHRNDSYSYHVRKHEGKRPFQCTVSKRRFRSLRDRYVREKKKIDQQLLITKTVDYPNWRYYSHLTFLDKYLRKNKSYDTNEMDDLVKEETINYFNSKNDDPLSVQSLKYEIEFLDENNSNNNNNSIISLDSEYNDNNYNNEPNTKKLLINYEKPPKLLNENNEYPCTQCDKTYTIYKSLRDHYRINHTSKYIARSRYYCDQCDKNYHSRFQLRAHMNIHKGVRPYKCHLCSADFTHPQYLNFHIRIHLNDKRYPCKYCNKKFIRPYERIYHERSNHTNEKLYQCDDCGQTFIKNSQLKRHKNIKHNPNYIRPLYECDICKNTFTSKESMLKHKLIHEGKKPFDCDICGSKFRTRHDICDKRFAQGPGLYSHMKSHEDYSKCNALYIQKTNITTSEEFAKFEFQPKWIKSRIFWNATFESRFRKQYNNPQNYPVKIILLLHSHNDPGWLETYAQYFKTQTKSILDTVIQKMIEFTDMTFVWSEICFLELWWKQANSYQKYALKELIDSGRFEIVTGGWVMTDEANVHLYPMIDQLIEGHQWLKNNLNIEPKIGWSIDPFGHGATLPYLLSASNFDGTIIQRIHFGWKYWFANNKNGDFIWQPLWRTSDKINRNLLIHNMPFEIYTTDTTCGPDTYICREFNFNSYYSKNINRYNVAEKSETLMEQYSRTASLFKHNVGLILIGEDFSYDSPDKLNKQYLNYKKLITYINDNKNYFNTEIKFGTPNEYFEEIRKRSDQFPTLKGDFFVYSDTHDRSPAYWSGYYTNRPYYKYLSNLLEHNLRSSEILYTLTYNIIRQNKNQLNNNLKLLQINYDNIITARQCLGVFQHHDAITGTSNQFVMEDYRSGLERNIQYTIELQEILIEMLLQNNIYNQNFLQNQLRENYVINFYDSITKFFIIFNSLAQKRLEIMKIKTAESNVLILNENGIPVKYQINPIWKYNINNNTINISNTEYEIIFLAELPPLCILKYQVIFIDEDGSNMATIYCNDCNINNNSTIFEIFEKPSGDIQLENQKLRLVMDDENGLLKLLTLKQTNESMEFVINFGAYKTTRSGAYIFKTDDDIPEINILDQYLNNSNILIISGHLATNIIIFFKSFLIHNIRILNTQTYLDNGIYIQNILDLGPIENNKDSEIFIRFESDIQNGIDLPEFYSDQNGFQHQHRIKIPEIRIEGNYYPITTSAFIQDHKKRFTLLTSNSHGAASLRFGELEIMLDRRTANNDYRGNSEGIKETVLLDHKFWLIIEDIKFVNKNNYQVLSLLANKLSNNLRYPVHLYFINDAQKSINLKKKLNFIKYDLPCDIHLLNVRTLTDESQSKLPSRSALVLLHRQGYDCNIGELPFDNTCNNTIIATNTFFNDLSIELIKSTTLTGLNNIGIITNNQRIFIEPMDVQTFNFTFAIQ

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90% Identity
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80% Identity
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