Basic Information

Insect
Empis livida
Gene Symbol
TRERF1
Assembly
GCA_963932195.1
Location
OZ010645.1:27607212-27628803[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 2.2e-08 2.3e-05 24.6 0.1 3 45 1645 1687 1643 1688 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTGCAGTGCGTCAATGGGTGCTGAAGGTTCAGTAACATTACAATTACGTGAAGCTGTTCAACCTCCAGATTCTAATAATTCACTTGATACAGCTTTAACAATTGGTTATCCAGATCCAGAAATGTTAGCAGATGTCTTAGGTACACTACAAGCTGCAgcCTTAAATAATAGTAACAGTAGCACATTAGTTACTACAAATAGCAATCCATCATGTACTACTacaataaatggaaaaatacaaaataacatttcaacaacaataaataataatagtgcCAACAGTAATAGTAGCAGCAATAGCAACAACcatataaatatcaataataataatacaatttgtaatcaaataaataataatataaattgtagcAGTAGTGGTAACAGTAATAGCAGCACAACAAGCAGCAGTAGTAATATTAGTGAAAATTCTTGTAATTCTGTTACTATATCACAAAATCCTACAATTGTTGTTAGAAAACCAAGGCCTAAAACATCATCACCAACACGACATGGTCCTCAACAATGTCAGgtATGCAGTAAAGTATTTGGAAATGCATCAGCTCTGgctaaacataaattaactcATAGCGATGAAAGGAAATATGTTTGTGCAATGTGTTCAAAAGCTTTTAAGAGACAGGATCATTTAAATGGTCATATGCTAAcacatagaaataaaaaaccatatgAATGTAAAGCAGAAGGATGTGGTAAATCATATTGTGATGCAAGATCATTAAGACGACATACAGAGAATCATCATAGCGCATTAGCAATGACAGCAACAACACCATCTAATCAATCATTATCGCCATCAACGGGACCACCAACTGGTCTTAGTTTATCGCCAGCAACTGCAAGTGgtGATGCTAGTTCACCTCATGGTGCTACATGTGTACAATATATATCAAATTGTGGTGATGGTGGTAATAATTCTAAACCATCATCACCAAGTTCACCTGCTGGTTCTGGTAATGAGGGTCTTACTAGGCAACAATTGGATCTCATTAGTCAAATTATGCAACAGACAAAACAAGCTAGTGCACAAGTAACAGTTTCCACAAATCATAATGGTTTAAAACATCAGCAACAAAATCAACAGCAAACACAACAGCAGCAATCTCAGAGACCTAGAACATGGAATATGCagACACAGTTGCAACAAACTCAAACGAAATCACCAAATTcccttgaaaattttacaactttAAATGGTGCCACAATAACAACTGGTGGAATTACAATAAATGGACCTAATATCACATCATCAGCTGCATCAACATCAGTACCAATATCTACTGCACAACAGCAAAATCAACACCATAACCAACAAAATCAAACTGTAATCCAACAAAATCAAATTGGtcaaactataaatattgttaaaattgaacaaaaaccagttgaatgtaatttatgtcatagaaaatttaaaaatgtaccAGCATTAAATGGTCATATGAGATTACATGgtggatattttaaaaaagaaaatgaaacaaaaaaatgtgaaaaaaaagaatcagTTGGGCCACCATTACAAACAGCAAGTATTGGTGTAAGAGcattaattgaagaaaaaataattagtaaaagaACTAAAGATTTAAAGggTGCCTTTGTAGTACCTGCCCCACCCTTAACTACAACTCGTCGTACAAgtgatatagaaaattttttaacccCAAAAACACCTGGAACTACATTAACATTACAAGGTCAATCAAATTTGATTTCAAGTCAATCAGCTGGAATAGTATCTACTACAACTACAAATAATGGTCAATTATCAACAACAATAGGTTCAACTactttacaattaaataaacaacaaactgtacaaaaaattacaaatattagtACTATTAGTCAAGGTACTTCAACAGATTCAAAAGATGCTACattaatagaattattaaaacgTGGTACAAAAGTTGCGGTTAAAAGAACATGCTCTGATACTAGTCCACTATTTAGTACAACGGGTACAGTTATATTACCATCAGATCAATCATTATCATCCCCAAATACACCAAATCCAACACCACCATTATCAATATCATTACAAAATGGTGAAACTGCACCGTTGGCTTTAACAATATCACAAGCACCAAATGGTACCGGTGATGTATTTACACTTACCTATTCAACAGATTCATCCTCAAcattttttagtgaaaatgaTGTTTATAGTGTTTCTGATACAGCTATGCTTTTACAAGCAGTTGATTCCATGCAATTACTTAATGATTCCACAACAAATCAATTGGATGATACTGCAACAATTAGTGATTATACactaaaaaatgataataattcaacacaaataacaaaaacaaatttaactaataataatagtaataataataataataataataataataataataataataataataacaataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataatattaataataataataataataataataataataataatcataataaaaataataaaaataatcataataataaaaataataatgttagaCAAGAATTTACAGCATCATCAAAACAATTACAGGATGTTTTAAATTCACCATTACCAGATAGTTTAGCTGAATTTGGTACATTTCATTCCAAGGATTTTATCCTATATAATTGTGGTAGTACACAAAATACAACATCATCAATATCAACACAATCATCATCTGTATCACCACTGCCATCACCGTTAGCATATCCGACCCCACCAGCAAGTCATGAGGCTGTTACAGAATCATCACCATTTTTGGACGATTCCCACCATTTTCCTGATACAAGTGCATTCTTTGATGATAAATCCACcgttaattttattcatgaTAATAGTGAccatcaattttttaaagaaagtgTTAATGATGATTGTGATTTAACtgaaaatgagaaaattttaaaattaaaaaatgaattatttaatgatagtAAAAGTGTATTTGATGATAATGAACatcatgaattttttaaatgtaatgaTAACAGTTCAGATGTATTTGACAGTCATGTAAAAGttgaagatttattaaatgaaaatagtgGTGAAGAATGtgatttaaaagattttaatgatcaaaatttatcatttttagatgaaccacaaaattttttagatgatTCACGTAATCCAAGCTCACCATTATCTGAATCATTTTTTACAAGTGGTATTGGTACAGCTGAAGAAGTTAAAGAAGTACTTAAAGATGTTCTcccaaatgaaaatttaacatgTGATAATCAATGTGAAAAtgatattgatttatattatttaccgGGACTAACATTACAATCACAAATGATGCCTAATTCAGATGAtccattattatcatcatcaccaAAAGATTTTGGTCataatagaatattattgCAGCACCAACATCAACAAaatcaacatcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacaacaacagcagcagcaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacagcaacatcaacaacatcaacaacaggAACAGCagcaccaacaacaacaacaacaggaacaacagcaacagcaacagcaacagcaacagcaacagcaacagcaacagcaacagcaacagcatcagcaacagcaacagcaacagcaacaacaacaacaaaaacaacaacaacaacaccaacaacaccaacaacaccaacaacaccaacaacagcaacaacagcaacaacaaaaacaacaacaacaattccAAATACAAAAGTTTGATCCAGTccatttttttagtaataataataatagtacaacaaatattaaaagacCTAGAacaaatgataatattattaataatacaaatattaatggtATAACTGCCGCAAGTACAACTGCTATACATACCAATATAAGTGGAGCAGTAACCATGACAGTTCAATCATCACACCAtcagcagcagcaacaacaacaacaaatacaaGAACCGCAGTATATCCAACAAAAAGACAACAATAATACTACAATAGACTCATTTATCAATCCGACATTGCCAACTGTAATTAATATCACTTCAACCAATAGCTGCCATCAATCACGAACAAATAATGTCATACATAACCAAACTATACAACCACCaccaccaacaacaacaacaatcccatcatcatcatcatcagtaCCATCAGTTACTTCACCAACATCAACAACACAAATAACTAGTTCAATATTAAAACGTCGACTACGTCAGGgtagtattaataatttcataccaaaaaaacatgaaatttatcGATCTAAATTACGTAGGCCATCAACAACACATTATACACCATCACCATTATTAAATCCAGATCGTAAAGCATCTggtttatatacaaatttaccaaaatctTTAATTCATGATACAATTAGTTTTGGTGATGAATTTGATGATACTGCTAGCTTAGTAGCATTTTTAGATGATTCCAAAGTAAATATTGGTACTGCTTATCAAGCAACAATACCACCAATTACAAATAAtggtattaataatttattaatgattaaaaataaagatttcataagaaataataataagtataatgataataataattatgatgaaTTAATGTGGGATCCGAATATAATACCAAAGAGTCttaataatgatgaaaaatcattaatacgTTTTATTGAGTTAAGTAAATCATCAGCTGTTCCATTGGGTTTTCATTCAGAAGAAGTAGCACTTAAAGCATTATTAGAGTCAAATGGTGATACACATGTAgctgtattaaatttattgcaatcaCCATCTAATTCAGTACATTTAAAATGGACTGGTACAgaagttgaaatatttttaaaaggtcTTGAAAAATATGGTAAAGATTTTTATCG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Protein Sequence
MCSASMGAEGSVTLQLREAVQPPDSNNSLDTALTIGYPDPEMLADVLGTLQAAALNNSNSSTLVTTNSNPSCTTTINGKIQNNISTTINNNSANSNSSSNSNNHININNNNTICNQINNNINCSSSGNSNSSTTSSSSNISENSCNSVTISQNPTIVVRKPRPKTSSPTRHGPQQCQVCSKVFGNASALAKHKLTHSDERKYVCAMCSKAFKRQDHLNGHMLTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHSALAMTATTPSNQSLSPSTGPPTGLSLSPATASGDASSPHGATCVQYISNCGDGGNNSKPSSPSSPAGSGNEGLTRQQLDLISQIMQQTKQASAQVTVSTNHNGLKHQQQNQQQTQQQQSQRPRTWNMQTQLQQTQTKSPNSLENFTTLNGATITTGGITINGPNITSSAASTSVPISTAQQQNQHHNQQNQTVIQQNQIGQTINIVKIEQKPVECNLCHRKFKNVPALNGHMRLHGGYFKKENETKKCEKKESVGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRTKDLKGAFVVPAPPLTTTRRTSDIENFLTPKTPGTTLTLQGQSNLISSQSAGIVSTTTTNNGQLSTTIGSTTLQLNKQQTVQKITNISTISQGTSTDSKDATLIELLKRGTKVAVKRTCSDTSPLFSTTGTVILPSDQSLSSPNTPNPTPPLSISLQNGETAPLALTISQAPNGTGDVFTLTYSTDSSSTFFSENDVYSVSDTAMLLQAVDSMQLLNDSTTNQLDDTATISDYTLKNDNNSTQITKTNLTNNNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNINNNNNNNNNNNNHNKNNKNNHNNKNNNVRQEFTASSKQLQDVLNSPLPDSLAEFGTFHSKDFILYNCGSTQNTTSSISTQSSSVSPLPSPLAYPTPPASHEAVTESSPFLDDSHHFPDTSAFFDDKSTVNFIHDNSDHQFFKESVNDDCDLTENEKILKLKNELFNDSKSVFDDNEHHEFFKCNDNSSDVFDSHVKVEDLLNENSGEECDLKDFNDQNLSFLDEPQNFLDDSRNPSSPLSESFFTSGIGTAEEVKEVLKDVLPNENLTCDNQCENDIDLYYLPGLTLQSQMMPNSDDPLLSSSPKDFGHNRILLQHQHQQNQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQHQQQEQQHQQQQQQEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQKQQQQHQQHQQHQQHQQQQQQQQQKQQQQFQIQKFDPVHFFSNNNNSTTNIKRPRTNDNIINNTNINGITAASTTAIHTNISGAVTMTVQSSHHQQQQQQQQIQEPQYIQQKDNNNTTIDSFINPTLPTVINITSTNSCHQSRTNNVIHNQTIQPPPPTTTTIPSSSSSVPSVTSPTSTTQITSSILKRRLRQGSINNFIPKKHEIYRSKLRRPSTTHYTPSPLLNPDRKASGLYTNLPKSLIHDTISFGDEFDDTASLVAFLDDSKVNIGTAYQATIPPITNNGINNLLMIKNKDFIRNNNKYNDNNNYDELMWDPNIIPKSLNNDEKSLIRFIELSKSSAVPLGFHSEEVALKALLESNGDTHVAVLNLLQSPSNSVHLKWTGTEVEIFLKGLEKYGKDFYRISAEIITKSTSDCIQLYYFWKKLCIDYKTTHLRQDSYDTIDHHHNQNNSTHIELRSHVCEMPDCSASFTSKAALHGHTRIHCIGRNNILNGISTSSSTATPNSNGHSNGSGNGTSTTGTTIQNGNGITNSHSNIFTFALNNNNSSIQNSNNKDDFPCKVCGKVFNKVKSRSAHMKSHRPQENDQLIQNNNNNINNLNNNQQTIILSSN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00643587;
90% Identity
iTF_00643587;
80% Identity
iTF_00643587;