Druf001715.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similar Transcription Factors

Basic Information

Insect
Drymonia ruficornis
Gene Symbol
-
Assembly
GCA_947859195.1
Location
OX401930.1:7003945-7036673[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
zf-C2H2
Domain
zf-C2H2 domain
PFAM
PF00096
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 28 0.096 5.8 7.7 0.7 1 23 474 496 474 496 0.97
2 28 6.4e-05 0.0039 17.6 1.5 1 23 511 533 511 533 0.97
3 28 2.5e-05 0.0015 19.0 1.4 1 23 539 561 539 561 0.98
4 28 0.00025 0.015 15.8 2.3 1 23 568 590 568 590 0.99
5 28 2.3e-05 0.0014 19.0 0.4 1 23 596 618 596 618 0.93
6 28 2.6e-05 0.0016 18.9 0.1 1 23 624 646 624 646 0.98
7 28 0.00013 0.0081 16.6 1.2 1 23 652 675 652 675 0.95
8 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 681 694 681 698 0.90
9 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 742 755 742 759 0.90
10 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 803 816 803 820 0.90
11 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 864 877 864 881 0.90
12 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 925 938 925 942 0.90
13 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 986 999 986 1003 0.90
14 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1047 1060 1047 1064 0.90
15 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1108 1121 1108 1125 0.90
16 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1169 1182 1169 1186 0.90
17 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1230 1243 1230 1247 0.90
18 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1291 1304 1291 1308 0.90
19 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1352 1365 1352 1369 0.90
20 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1413 1426 1413 1430 0.90
21 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1474 1487 1474 1491 0.90
22 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1535 1548 1535 1552 0.90
23 28 0.14 8.4 7.1 1.8 1 14 1596 1609 1596 1613 0.90
24 28 0.00067 0.04 14.4 6.5 1 23 1657 1680 1657 1680 0.97
25 28 0.00066 0.04 14.5 0.3 2 23 4571 4592 4570 4592 0.96
26 28 6.2e-05 0.0037 17.7 1.0 1 23 4598 4620 4598 4620 0.97
27 28 0.044 2.6 8.7 0.1 1 22 4626 4647 4626 4647 0.97
28 28 0.044 2.6 8.7 0.1 1 22 4650 4671 4650 4671 0.97

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAATTATTGTTGTTTGATATGCAATAACCGAAATGGTTTGGCTCTCAGAAACGCTACCAGTATATTCGCTGAAACTAATACACTACCATCCGGCAAGCAAGTAGCTGAAGTATTATGCGAGATACTAGGCAAGACCGTGCAAGAAAAAAATGCACATGCAAACATATTGTGCAAGAAATGTTTCAGGTCTTGTTTTGACTACGATTCTATGCAAGTACGATTGCAAGCAATCAAATACCAATTAATGGATCAGTTCAAACAATCGCTATCATCAATCAATTTGGATTATGAAACGTATGAGCAACAAGGTACTATTGCACCCAAACCTTCACCGAGAAAGCTGGTGTTGCCAGCGTCAAAACTACAACCTATCCCACCAGATTTACTTCTAAAAGTGGGGAAAATGGCGGCTCTTTCGAAACATTCTATTGTTATTCCTAAACCAAAGCCTGTATCATCATCAACAGTGAATCTCAAAGTGACAGTGGGCTCGTCAGTACTAACACACACAATCAAAACCACTACAGCTAAAGCCGCTGAGACGGAAACAGTTTTATCTCTCTCTAACACACTGAAAAATGAGATAGAGAGCATGGTGGCGTCGAAAGAAAGTTTACCACAGATTATTAATGAATTAAAGACGGAAAATACTGATGATTCAATGGAGTTGGATGATGATCCGCTCACTGTCGTGACAACATCCGAGGGGGGGGATTTGGTGCTGCAAGTGGAAGGAGCCGAGACGGAGTCTAACGAGGTGTCGTTAGAAGAGTACATGCAGCTGGGCGGGGGCGGCGCGCGGGACTATGTACTGGGCACCTGCCAGGATGATGACGACGATGAAGATGATGATGATGATGAACACACAATAGTATTGAACAGCGAGACGGGATCCATCCTTCGCATGGTGTCCGGCCAGAAGCTGGTGTACGAGGACGGCGAGATCTCGTTCGTCATGCCCGACGACGAGCAGCGCGCCGACGCCGACACCGACCCCGCCGACACCGCCGACACCGCCGACACCGCCGACACCGCCGACAACGATAACGACCAGCCCGACAGCCAGGATTCCAACGACGAGTCTCAGATAGAGTTGCAGGTGTCAGGGGACGAGGAGACTGCGAACGCTATCATAGCCGCCGCGCAGGAACAAGGCGGTGCGTTCATAAAGGTGGAGTCTGGCGAGATGTACCGCGTCAAGTCCGTGCTGGCGGGCGGCGCGCTGCAGCTGCGCGCGGCGCGTGCGCACGCGCAGGTGCACCACGCGGCCGCGCAGCTCCTCGCAAGAGACGGGGACAACTACCGCTGCCTGCTCTGTAACAACAACCATGATGATAACGACGATAATGAGGAAGCGGTAGTGGGCAACGCGGACGAAATAATGCAGCACTTGAAGTCGGTCCACGACGCACGCGCCTACATCTGCCGCGCGTGCGGCGCCACCATGCGCAAGCGCAGCGACTACACCAAACACATGGATACACACAAGCCCAAGCAGTCGGTGCTGGGCTCCGGCAGGAGCAAGCAGTACCCTTGTACTGTGTGCGGCAAGGGATTCAGCAGCCGCACACTGCTGCGGGACCACCAGCACCAGCACTCGGGCGCGCGGCCCTACGCCTGCGCGCACTGCAACAAGGCGTTCGGCTCCAAGTACACGCTGCAGGCGCATCTCAAGACACACCAGGATCGTCCGCGGCCGTTCAAGTGCGGCAAATGCGACAAGTCGTTCCTGACGCAGCAGAACTTGAACCAGCACGAGAAAACGCACTTGGGGATCAAAGACTTCGTGTGCAACGTGTGCAACAAGGCGTTCAGCACACAACACAATTTGGAAGTGCACGGCGTCGTGCACTCCGGAAACAAGGCATTCCGCTGCTCCGCCTGCGGGAAGGCCTTCGCCAGACGCGCAGAGCTCAGGGACCATGTCAGGATCCACACTGGCGAGCGTCCGTTCGCGTGCGACATATGCCCGGCGCGGTTCACGCAGAGATCGAACCTGCACTCGCACCGCCGCGCCACGCATCTGGACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAAACGACGCAGGTACACACTACGACAAGCGCTACCACTGCACCCACTGCCCCAAGCGGTTCAA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Protein Sequence
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