Basic Information

Gene Symbol
Mblk-1_1
Assembly
GCA_963693315.1
Location
OY856188.1:207017579-207050015[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
HTH
Domain
HTH_psq domain
PFAM
PF05225
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 8.2e-16 6.5e-13 50.6 0.0 1 45 611 656 611 656 0.96
2 2 1.5e-17 1.2e-14 56.2 0.0 1 43 1045 1088 1045 1090 0.95

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGGTCGGAGTCAAAACTGCAAAATACGAAGTCAAAATTCAATACAGGCTTTTTGCAAACGTCATATGAATGTAGTTAAACCTTCTTTACAATattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattgaattggattggattggattgggtttggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggattggagTGGATTGGATTCAATTGGATTGGATTGGAGTGaCGCCACTGGATTCCGATAGTGATAGTAGTGATAGCTGCTCTGAAGGTgaagtacaaaataatatacCAACACAATTACAATCAACGCCGGCTTTACAAGCAGCTGCAGTTAATAAACGGCTACGGGAATTACTAAGTGGGTCGTTGTCAGGGAACATGACCTCATTGGAATCAATGGCTGCTACAATACAAGCTGTCGCTACACTGCAGGGATTATCTGTGTCAGGACTTAATAATATTTATCCAGGTTTGTTCTACCAAACATTCGCTCATCatcaacaacagcaacaacaacagcaacaacatcaacaacaacaaacaattgGCTCGAATACAACAAATAACATTACTGAATCTATATCACCAAATGTAGgaccaaataaaatattatctAGTCCAACATCAACACCTTCAACGTCTGAACAACCATTAGACTTGAGTGCCAAATCAAGTACACCAACATTTCCATCAAATGATCCACGTTCTGCATTACAAAGTGTGAGaGCGAAGCCACGTGTATCAACTGTAGCTGGTCGTCGGACATACACGGAAGAAGAACTACAACATGCTTTACAGGATATTATTAGCGGGAAGTTGGGTACCCGTCGTGCTGCGGTTCTATACGGTATACCACGATCAACTTTACGTAATAAAGTTTATAAACTGGCAATGGAACAAAAACGAGAGGCGTTAATCATACAACAATCTGTTTCAATACAACCAAACGATGATGATGATAAAGATATTTTGTCCGATGGAGATGATGACAACAAAGATGTTGAAAAAAATACAGGGAATTTTTCGATACAACAACAAACATCAGTATCGCCGTCAGTTTTATCTTCACATAGCTTACTGAATCAAGAAACAGAACGGAAGTCTTCAAACATCCCATCACCAAATATACATCAGCACTCACAATCAACAACACAAGCATCGCCGCTAGGACAACCTTGGTTAGATCCCAACGTTATGTTACTTTTAACAGGTGGACTGGGTGCGATGCCAAATTTAATGTCTCCGAAACCGGAAGATATGTCATCCGTACCCGACTTCTTACGAAACCTTATGATTCAACATGAAATGCTTAAATTAGGTGGGGGACAAAACATAGACAACAATTTAAATAATGGCAAACCAACGAACAGTACAACGGATCCTAGATTCTTACCattattacaacaacaacatcatcaacaacaacaacatcaacaaTCACAGCATAGACTTCATCGGAAATCTGATACACCAGAAACAACATCATCTGCTGATATTAATGAAAGTGACGATTCTAATGTGATATTAAAAATTCCGTCCTTTAAACCTGTTGCCGGTGGTTCGTCGTCAGCCTCATCCACTCCAACTGCCACAGCCaccaaattaaataacaatagTAATCATGAAAGTTTGATGAATAGTCCACACCATCAACAACATCTACATAATCATCACAGTAGTAATACCACAGCGTCTCAAAATAGTCCTACAAATCATTTAATATCAACAGGTATATCACCAAACCTACGACGAAAAAATAGTGATTCCCACTCACCTCCAATGCTTCCTGATAAAAACATGCTATCAATTCATGACGTGATTGCCAGTAGTATAAGTAAGAGTTTTCAACAACAAGCATCTCATCATCACACTCACCATCCAGCCGATCTCATGGACCAATATAAAAGACCACAAATTtctgttataaaaaatataggTGGTACTGATATATCAAGATTTGCTACTAGTCCAAACATGATGAGCGCCAGTACGTTAAGTAgtttaaataattcattaaCAGGGACTGGAGGAAAAGGAACACGCCCGAAACGGGGCAAGTATAGAAACTATGACCGAGATAGCTTGGTGGAAGCTGTAAAAGCTGTACAACGAGGTGAAATGTCTGTTCACCGAGCAGGAAGTTATTATGGAGTTCCGCACTCAACATTAGAATATAAAGTTAAAGAACGTCATCTAATGAGACCACGAAAACGTGAACCAAAACCTCAACCATTGGATTCATCATCAACATCCACCACAACCAGTAGTAGTACAAAACCATCAGATTTAACTAGTGCAGCTGGAACTTTAAGAACATTagataaaagtaaaatcctACAGCCAGTAAAACCACAATTAAAAACACCTCCACCATTCCCATCCACATCACCTAATGGCATGAAAATGCAAATGTATGATCCTGCAATTCCACCACAATTTCAGTATGGCTCACCATTGTTTTGGTCACATCATGGAAACTTTCCTGGCTTAGATTTTTCACGCACTCAGCAAGGAGTTGCATTTCCACCAAATCCAGAACAATATTTTGCATCACAAATGATACAAAAGTTACAAGAAGAATCAACAAGATCCCAGTTAGCAAAATCAGCATCAAATACACCTAACCAAAATAATCCTGTAAAAAGTGCAAGAGAGCTGGCTGAAAGTATATATGATGCAAATGCGAATGGTTTATTATTAGACGGTATCATACGGCAAAGCTTAGACCGtggtaaaaatgaaataacacATAATGTACTCCTTGATCAATTGGTTAAACATAATCGATCTAATTCAATAACAAGTGACGAAACGAATTCAAATCATGGTACAAAACGTTCAGGGAGTCCTTTAAATTATTCTCATTTGGATATAAAACGTGAAAGATCTAGTCCAATGATGTCATCATCTGAGAGTGATCGAGATACACCAGAATCACAATTTAATAGTAATCAATCAAATACTGCAgctgtagaaaatttaattaaactaagAGATGGCATTCCACTACAACAAAATagtaatacaaaattattaactgaagaattaaatggaaaatcatcgatattattaaataaacatcAATCCGATAATGATGACAGtacataa
Protein Sequence
MGRSQNCKIRSQNSIQAFCKRHMNVVKPSLQYWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIELDWIGLGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGLDWIGVDWIQLDWIGVTPLDSDSDSSDSCSEGEVQNNIPTQLQSTPALQAAAVNKRLRELLSGSLSGNMTSLESMAATIQAVATLQGLSVSGLNNIYPGLFYQTFAHHQQQQQQQQQHQQQQTIGSNTTNNITESISPNVGPNKILSSPTSTPSTSEQPLDLSAKSSTPTFPSNDPRSALQSVRAKPRVSTVAGRRTYTEEELQHALQDIISGKLGTRRAAVLYGIPRSTLRNKVYKLAMEQKREALIIQQSVSIQPNDDDDKDILSDGDDDNKDVEKNTGNFSIQQQTSVSPSVLSSHSLLNQETERKSSNIPSPNIHQHSQSTTQASPLGQPWLDPNVMLLLTGGLGAMPNLMSPKPEDMSSVPDFLRNLMIQHEMLKLGGGQNIDNNLNNGKPTNSTTDPRFLPLLQQQHHQQQQHQQSQHRLHRKSDTPETTSSADINESDDSNVILKIPSFKPVAGGSSSASSTPTATATKLNNNSNHESLMNSPHHQQHLHNHHSSNTTASQNSPTNHLISTGISPNLRRKNSDSHSPPMLPDKNMLSIHDVIASSISKSFQQQASHHHTHHPADLMDQYKRPQISVIKNIGGTDISRFATSPNMMSASTLSSLNNSLTGTGGKGTRPKRGKYRNYDRDSLVEAVKAVQRGEMSVHRAGSYYGVPHSTLEYKVKERHLMRPRKREPKPQPLDSSSTSTTTSSSTKPSDLTSAAGTLRTLDKSKILQPVKPQLKTPPPFPSTSPNGMKMQMYDPAIPPQFQYGSPLFWSHHGNFPGLDFSRTQQGVAFPPNPEQYFASQMIQKLQEESTRSQLAKSASNTPNQNNPVKSARELAESIYDANANGLLLDGIIRQSLDRGKNEITHNVLLDQLVKHNRSNSITSDETNSNHGTKRSGSPLNYSHLDIKRERSSPMMSSSESDRDTPESQFNSNQSNTAAVENLIKLRDGIPLQQNSNTKLLTEELNGKSSILLNKHQSDNDDST

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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