Basic Information

Gene Symbol
osa_1
Assembly
GCA_963693315.1
Location
OY856187.1:185231369-185277739[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 2.4 2.8e+04 -2.0 0.0 17 47 360 388 351 393 0.72
2 2 4.9e-24 5.7e-20 74.0 0.0 3 89 583 669 581 669 0.91

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACTAGAAAATGCAACTACTGCATCATACCACATACAGAAAATAGTGAATGTCCGCTCGAAGAAGGTATGGTTAAACGTAGTTGCGCTAATTGTCAAGGCAATCATCCAGCAAATTCAACTATGTGCCCCAAGCGACAGGAATATTTGCAACATAGACAACACCAAGCAATGAAAAACAAAAGCCGTCAAACAAATCAGATACCAGCACAAGTCAATAACTTCACCTTTCCTAGCTTAAATAGTAGGGCTTTCTCTAACTTTATTCATACCAATAGAACTAATAGTACAAATATTTCATATGCAAATATTGCAGACGATGATCCAAGTGGACAAAATAGCAATGACAGTTCAAGTGGTGGTGGAACAGGAATGGGTATCACACCAGGTACACCAAATTCGCAGGCTATGAGACCTACACCATCGCCGACAGGTTCAACAAGTTCAAGGTCTATGTCGCCGGCTGTTGgTCAACAAAGTGTACAAATGCCGCCACGTCCTTCTAGTAGTCATTCCCAAGTCCCAAATCAAACACAAACGTCGAATAGTAATAACAGTAGTAATAGTAAcaatagtaatagtaataatCCAAATCATAATAATCAGCAACCGCCACCATCATCACTAGATCCAGCTTTAACATCATCATCGGCACGTCCAACATCAGCATCAACAACTCCAATACCAATAGGTGGTGGATCACCTCAAACGAGTGTTGGTGGCGGCGGAGGAGGAGTAATGGCAGCTGCACAAGGAAGTTATCAAGCACCACCACCGCCATCTCATATGCATCCATATAAAATGAGTCCAAGTCCAGCAAATGCTCCACAAAATATGTCACCATATCCCCCTCAATCACAACAGTATTCAAGTAACTATTCACCACGACCACACTATCCAGGTAATTATGGACCACCGCCAGCTGGTCAACCTCCAACATCAAATAATATGCCACCTGGGCCGGGTCAATATCCAGGTCGTCCAATGCCAAACGCAGGGTCATTTCCTTACCAACAAAATTGGGGTCCACCAGCTCCACAAGGAAGTAGTATGATTAGTAATCATGTGCAAGGAAAAAGCACTCCACAACCATCAACACCAAGCGGATCTCCAAGACCTTTAACGTATTTGAAGCAACACCTGCAGCACAAAGGTGGTTATACTGGTGCACAAAGTCCTACCCCACCACAAGTATTTGGTAACGGGCCTGGAATGCACCCTCCAATGGCACCACCGCATCATATGGGACCACCGATGGGTCCAACTAATATGGGACCTCCATCAAGTGCACCTCAAAATCAACCTCCTTCGTCTGGGCCTAGTAGTCATCCAGATAGTAATCTATCTATACATTCAGACAGTCAAGATAATGGTCTTAATTCATCAAACAATACATCACATCCTGTTACCTCAATTGTTACAACGGGTCCAGATGGGACACAATTAGATGAAGTTAGTCAACAAAGTACTTTATCAAACACCTCAGCTGCTTCAGGTGAAGATCCTCAATGTTCAACTCCAAAATCGAGAAAAAATGAAGTATATAATCAAACACATTTGGCACCACCTAATGCATCTCCCGGTTCACATGGGCCTCATGaagattttgaaatgaattctCCATCATGGCCTCGAACTCCAGCTAGTCCGATATTTAACAGTCATGTACCAACAGAAACGTTTCGTTCGTCAAAAaAATCTGATAGTCTATGCAAATTATTTGATATGGATGATAATCCAGATCGACGCGGCTGGTTAGAtaaattattaagttttatGGAAGAAAGACGTACACCAATAACAGCATGTCCGACAATTTCAAAAACACCGTTAGATCTATTTAGGTTGTATTTATATGTGAAAGAACGAGGTGGTTTTGTTGAAGTGTGCAAGgttACCAAAAGTAAAACATGGAAAGATATTGCCGGTTTATTAGGAATTGGTGCTAGCAGTAGTGCGGCATATACATTAAGAAAACATTATACAAAAAACTTATTAGCATATGAATGTCATTTTGACCGTGGTGGAATTGATCCTCAGCCAATAATACAACAAGTCGAAGCTGGATCAAAGAAAAAGAACTCAAAACAAGCAGCATCTGTACCATCACCGGGGTTGTgTTCATCAAATAGTCAAGATTCATTTCCAGCCCCGGGTGCTAGTGGGGCTAGTATGGATGGTTATGGTGGATATCCTGGAAATTACCAACCTGGTTCAACACCGGATTATAATGCTCCACCAATGCAAAGGCCACCATCACAAAATAACTCACAATCCCCTCATCCAGGTTTAGGACAATCTACGATTACCGGTGATAATATAAATGTGAATAATCCATTTGATGAGCCAGTTGGTGTCCCACGCGTTGCTCCGTTTCAACAGGATACATCATATGCTAATTCTGTTTCGCGTACACAAGgTCCATATCAAGGAcaaccaaattataaccaatATGGTACACCTGATCAATATCCTCCACAACCACCAGGACAATATCCCCCAGCCCAAGGTCAATTTCCTTCAAATAATCGTTCTATGTATCCTCCATATGGACCTGAAGGAACCGATCCCGCCGCACCTCCAACATCCGGTGCACCACCACCAACGACAACTGACCCATATAGAGGTTATGTTAATGCTCCTAGTCCGTATCCACCACCACCACCACGACCATATTCACAACAACCACCACCTGGTGCAGCACAAACACCAGCACCAGCAGCAGCGCCACAAACAGTTGGTTCGACAGTACCAGGTGCTCCACCTGGTGCATATCCTCCACAACCAGCGCAACAACAAGATTATTATAGACAACAAGATCAAtcaCCACAACCAAGAAGACATCCCGATTTTACAAAAGAACCACAACCATATTCACCTTATCAACAAAGACCTCAAATGTATGGTGGATGGCAAAATAGTTCTGGACAGTACAGAGGACAATATCCACCACCACAAACTACACCACAACAATGGGGAAGTGGACAAAGGCCCCCAGGTCCGCCAGGACCTTCACAACCTCCAGGACAATGGGATCCTAATCGTTATATAAATCAAGCACAACAGCCTTCTTATCCACCAAATCAACAGAATCCGCCACAATGGAGTAACATGCCACCACAATCAAATGCTGGTTCAAGTTCACCACTACGACCACAGCAACGTGGTGGTAAACCGTATCCAATACCGGCAAATCCTCAAACAGGAACAAAACCAAACCAACAGGGGAATAATAGTTCACAGTTTCAAACATCCGGTCTACCACCGAAACGTGATATAGTATTTCCACCAGATAGTGTTGAATCAACAACACCAGTATTATATAGAAGAAAACGATTATGTCGTAGTGATGTAGGACAAATCGATGCATGGAAAATATTCATGGCATTACGTTCGGGTTTACTTAGTGAAAGTACATGGGCCTTAGACGTTTTAAATATATTACTATTTGATGATTCGTCGGTTCATTACTTTGGTTTAACACATCTGCCCGGTttacttaaattattattagatcattttcaaaaaagtttatcaGATATGTTTGATGTTGATTGTGATAATTATAAAGATATTAGTAATACTAAAAGTTCAACAATGACAAGTTCAAATACAAAATCATCAGGATCATCGTTACTGTATGATAGAAATAGTAAAAAGATTAAATGTATAACAGAAGAAGACGAAGATGATTATGAAATTGATAATAGTCGAAATAATCGAAATAGTTTAAACGATTTAATTGATAATGAAAGTGGCGATGTAGAAAAAGTTGATTTAGGCTCGGTACTTAATTTACCGAATCCCGACGAAAGAGTTTTATTAATGACATCAGCAAATAATTATACATTTAATACACGAAAAGGATTACCTGTTAAAATAGTACCAGCCGAAGATGATATATTTGTATTAGATAGTATTAGAACATGGGATTTAGATTCAAATAAAGATTATCATTTATTAACAACAATTGGTAATGATCCGTGGACATTTGGACATACAATACCTGAACCTCATTCATACATAATGGATTGCTTTAAAGCTGAAATACTAAACAttccattttctttaattagatataataaaatgaaaaataaaaataatattaatgataaatGTTCTAGAAATGGTGATAgtataaataaaagtaattttaatagttgtaataataatattagtaGTAGTAacaatacaaatataaataatagGACAAAGTTAAATAATGCAATTGATAACGATGATGATATGAAATTACGACCATCAAATACAACAACGATTCacaatattaataatagttGTAATAGCAATAGTAGCACCAGTAATAGTATTGGTGGTATGTCATCAACATCATCCTCATCGATATTGTCACATTCATCGATTACAAATACAAACCTTTTATTAGCAAACGATAATAGTAGTTCTATTAACCTTAAAAAGCAACCAATGGATAGTGATTGTCGCCATATTGATATGGAACTAGAACGTATCATTCCAAATGGTCCACAAATAACGAATGATGATGATAATACAATAACTTCAACcgatgaaaatattaaaaataaattattattactatcaTCAACggaaaataaagttaaaaatgaatttgatgTGAAGTCAAGTATTATAGATCCGGCAGCTACATTAAAACGACGTCGAATGAGCGATTACGAAGATGAATGTTACACTAGGGATGAAGCTAGTTTATATCTTGTAACTGAGAGTCAAGATTCATTAGCAAGACGTTGTGTTtgtttatcaaatattttaagaaatttaacgTTTGTTCCAGGTAATGAAACCGAATTTGTCAAATCATCAACATTTTTAGCTATATtaggaaaattattattactgcATCATGATCATCCTGTACGAACATTAAAGACAAGAAATTACGATCGTGAAGAGGAtgcagattttgctgattcaTGTAGTAGTTTACAAGGTGAAAATGAATGGTGGTGGGATTACTTAATACAAATTCGTGAGAATATGTTAGTTATTGCTGCAAATATTGCTGGACAAATGGATTTATCACGCTATGATGAATTTATAACAAGACCAATATTAGACGGCTTACTACATTGGGCTGTTTGTCCATCAGCACATGGACAAGATTCGTTTCCTACATGTGGGAGTAATTCACCACTATCACCACAACGTTTAGCATTAGAAGCTTTATGTAAATTATGTGTAACCGACGCTAATGTTGATTTAGTTATAGCTACACCACCATTTTTCCGTCTTGAGAAATTATGTGCGGTTCTAACAAGGCATTTGTGTCGGAACGAAGATCAAGTATTACGAGAATTTTCCGTAAATCTATTACATTACTTAGCTGCAGCTGATAGTGCTATGTCAAGAACTGTTGCGATGCAAAGTCCATGTATATCGTATTTAGTTGCCTTTATCGAACAAGCTGAACAAACTGCATTAGGTGTTGCTAATCAACATGGTATTAATTTCCTACGTGAAAATCCTGATTCAATGGGTACAAGTTTAGATATGTTACGCCGTGCAGCTGGGACATTATTACATTTGGCTAAACATCCTGATAATCGACCATTATTTATGCAACAAGAACAAAGATTATTAGGTCTTGTTATGAGCCATATATTAGATCAACAAGTTGCACTTATAATATCACGTGTACTATTTCAAGTATCCAGAGGTTCTGGTCCACTCATGACTACTGAAATTCGATCACCATTCTCAACAAGACCACAACAAACGTCTAATAAAGGAACAGCTATTGCTTCATCGTAA
Protein Sequence
MTRKCNYCIIPHTENSECPLEEGMVKRSCANCQGNHPANSTMCPKRQEYLQHRQHQAMKNKSRQTNQIPAQVNNFTFPSLNSRAFSNFIHTNRTNSTNISYANIADDDPSGQNSNDSSSGGGTGMGITPGTPNSQAMRPTPSPTGSTSSRSMSPAVGQQSVQMPPRPSSSHSQVPNQTQTSNSNNSSNSNNSNSNNPNHNNQQPPPSSLDPALTSSSARPTSASTTPIPIGGGSPQTSVGGGGGGVMAAAQGSYQAPPPPSHMHPYKMSPSPANAPQNMSPYPPQSQQYSSNYSPRPHYPGNYGPPPAGQPPTSNNMPPGPGQYPGRPMPNAGSFPYQQNWGPPAPQGSSMISNHVQGKSTPQPSTPSGSPRPLTYLKQHLQHKGGYTGAQSPTPPQVFGNGPGMHPPMAPPHHMGPPMGPTNMGPPSSAPQNQPPSSGPSSHPDSNLSIHSDSQDNGLNSSNNTSHPVTSIVTTGPDGTQLDEVSQQSTLSNTSAASGEDPQCSTPKSRKNEVYNQTHLAPPNASPGSHGPHEDFEMNSPSWPRTPASPIFNSHVPTETFRSSKKSDSLCKLFDMDDNPDRRGWLDKLLSFMEERRTPITACPTISKTPLDLFRLYLYVKERGGFVEVCKVTKSKTWKDIAGLLGIGASSSAAYTLRKHYTKNLLAYECHFDRGGIDPQPIIQQVEAGSKKKNSKQAASVPSPGLCSSNSQDSFPAPGASGASMDGYGGYPGNYQPGSTPDYNAPPMQRPPSQNNSQSPHPGLGQSTITGDNINVNNPFDEPVGVPRVAPFQQDTSYANSVSRTQGPYQGQPNYNQYGTPDQYPPQPPGQYPPAQGQFPSNNRSMYPPYGPEGTDPAAPPTSGAPPPTTTDPYRGYVNAPSPYPPPPPRPYSQQPPPGAAQTPAPAAAPQTVGSTVPGAPPGAYPPQPAQQQDYYRQQDQSPQPRRHPDFTKEPQPYSPYQQRPQMYGGWQNSSGQYRGQYPPPQTTPQQWGSGQRPPGPPGPSQPPGQWDPNRYINQAQQPSYPPNQQNPPQWSNMPPQSNAGSSSPLRPQQRGGKPYPIPANPQTGTKPNQQGNNSSQFQTSGLPPKRDIVFPPDSVESTTPVLYRRKRLCRSDVGQIDAWKIFMALRSGLLSESTWALDVLNILLFDDSSVHYFGLTHLPGLLKLLLDHFQKSLSDMFDVDCDNYKDISNTKSSTMTSSNTKSSGSSLLYDRNSKKIKCITEEDEDDYEIDNSRNNRNSLNDLIDNESGDVEKVDLGSVLNLPNPDERVLLMTSANNYTFNTRKGLPVKIVPAEDDIFVLDSIRTWDLDSNKDYHLLTTIGNDPWTFGHTIPEPHSYIMDCFKAEILNIPFSLIRYNKMKNKNNINDKCSRNGDSINKSNFNSCNNNISSSNNTNINNRTKLNNAIDNDDDMKLRPSNTTTIHNINNSCNSNSSTSNSIGGMSSTSSSSILSHSSITNTNLLLANDNSSSINLKKQPMDSDCRHIDMELERIIPNGPQITNDDDNTITSTDENIKNKLLLLSSTENKVKNEFDVKSSIIDPAATLKRRRMSDYEDECYTRDEASLYLVTESQDSLARRCVCLSNILRNLTFVPGNETEFVKSSTFLAILGKLLLLHHDHPVRTLKTRNYDREEDADFADSCSSLQGENEWWWDYLIQIRENMLVIAANIAGQMDLSRYDEFITRPILDGLLHWAVCPSAHGQDSFPTCGSNSPLSPQRLALEALCKLCVTDANVDLVIATPPFFRLEKLCAVLTRHLCRNEDQVLREFSVNLLHYLAAADSAMSRTVAMQSPCISYLVAFIEQAEQTALGVANQHGINFLRENPDSMGTSLDMLRRAAGTLLHLAKHPDNRPLFMQQEQRLLGLVMSHILDQQVALIISRVLFQVSRGSGPLMTTEIRSPFSTRPQQTSNKGTAIASS

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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