Basic Information

Insect: Dilophus febrilis
Gene Symbol: zfh2_2
Assembly: GCA_958336335.1
Location: OY284473.1:29546018-29589481[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-C2H2
Domain: zf-C2H2 domain
PFAM: PF00096
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 15 6.5 3.7e+02 2.3 0.4 2 23 346 368 345 368 0.92

2 15 0.00067 0.038 14.8 1.4 2 23 1254 1276 1253 1276 0.96

3 15 0.00017 0.0095 16.7 0.7 1 23 1308 1332 1308 1332 0.92

4 15 0.053 3 8.9 0.4 1 22 1557 1578 1557 1581 0.91

5 15 3.7 2.1e+02 3.0 1.9 1 23 2021 2045 2021 2045 0.91

6 15 4.6 2.6e+02 2.8 2.0 1 23 2492 2515 2492 2515 0.95

7 15 0.00053 0.031 15.1 0.4 2 23 2685 2707 2684 2707 0.96

8 15 3.2 1.8e+02 3.3 0.3 3 22 2820 2839 2818 2842 0.88

9 15 0.0039 0.22 12.4 1.5 1 23 2912 2934 2912 2934 0.96

10 15 1 59 4.8 1.9 2 23 2941 2963 2940 2963 0.92

11 15 0.018 1 10.3 3.3 2 23 3235 3258 3234 3258 0.92

12 15 0.059 3.4 8.7 0.6 1 22 3352 3373 3352 3376 0.89

13 15 0.061 3.5 8.7 0.1 1 23 3542 3566 3542 3566 0.93

14 15 0.00039 0.023 15.6 2.8 1 23 5011 5033 5011 5033 0.98

15 15 0.00054 0.031 15.1 1.2 1 23 5225 5247 5225 5247 0.99

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	15	6.5	3.7e+02	2.3	0.4	2	23	346	368	345	368	0.92
2	15	0.00067	0.038	14.8	1.4	2	23	1254	1276	1253	1276	0.96
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4	15	0.053	3	8.9	0.4	1	22	1557	1578	1557	1581	0.91
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15	15	0.00054	0.031	15.1	1.2	1	23	5225	5247	5225	5247	0.99

Sequence Information

Coding Sequence: 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