Dfeb014810.1
Basic Information
- Insect
- Dilophus febrilis
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_958336335.1
- Location
- OY284471.1:22097334-22105942[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2H2
- Domain
- zf-C2H2 domain
- PFAM
- PF00096
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 26 0.00077 0.044 14.6 1.8 1 23 238 259 238 259 0.98 2 26 0.0015 0.083 13.8 1.4 1 23 282 305 282 305 0.97 3 26 0.55 31 5.7 0.1 2 23 342 364 341 364 0.93 4 26 1.6 91 4.2 0.6 2 23 436 459 435 459 0.91 5 26 0.00041 0.023 15.5 2.1 1 23 461 483 461 483 0.97 6 26 0.00061 0.035 15.0 1.5 3 23 490 510 489 510 0.98 7 26 0.001 0.059 14.2 0.9 1 23 515 537 515 537 0.97 8 26 0.0068 0.39 11.7 1.1 3 23 544 566 543 566 0.90 9 26 0.96 55 4.9 2.7 1 23 940 962 940 962 0.84 10 26 0.027 1.5 9.8 2.3 1 23 985 1008 985 1009 0.95 11 26 0.00063 0.036 14.9 2.1 2 23 1045 1067 1044 1067 0.94 12 26 5.9e-05 0.0034 18.2 1.6 1 23 1364 1385 1364 1385 0.98 13 26 0.036 2.1 9.4 3.2 1 23 1408 1431 1408 1431 0.97 14 26 0.094 5.4 8.1 0.0 2 23 1468 1489 1467 1489 0.96 15 26 0.0018 0.11 13.4 7.8 1 23 1600 1622 1600 1622 0.98 16 26 0.00098 0.056 14.3 1.3 2 23 1628 1649 1627 1649 0.96 17 26 0.0003 0.017 15.9 0.5 1 23 1654 1676 1654 1676 0.98 18 26 0.085 4.9 8.2 1.3 2 23 1682 1705 1682 1705 0.92 19 26 0.39 23 6.1 3.1 1 23 2078 2099 2078 2099 0.85 20 26 0.066 3.8 8.6 0.3 1 23 2122 2145 2122 2145 0.93 21 26 0.16 9.4 7.3 0.1 2 23 2184 2206 2183 2206 0.95 22 26 0.001 0.058 14.3 1.9 1 23 2268 2292 2268 2292 0.91 23 26 7.7 4.4e+02 2.1 3.2 1 23 2294 2316 2294 2316 0.95 24 26 0.00033 0.019 15.8 0.2 3 23 2323 2343 2321 2343 0.96 25 26 0.00059 0.034 15.0 2.0 1 23 2347 2369 2347 2369 0.98 26 26 0.16 8.9 7.4 0.9 1 23 2374 2398 2374 2398 0.95
Sequence Information
- Coding Sequence
- atggataataACCCATTTAAATGCTGTAATtgtaaaatacaatttattggATTAGGTAAATTTTTGGAACATAAaagtaaatgttttttaaatggtACACCACCAACAATTGATCCAGTAATAAATAATGCTGCAATGATTGAACCAACAATTACGACATACTTACAATTAAATGATGAAGccacaattttaaattatcaaatgcTACCGGAATCACATACCGGAGAACATCATCCAgatgaattttcattaaattccAATAATACAATTGACAATGCGTCAACAATAACACCGTCAATATCACCAAAAACAAgttcatcatcaccatcattaTGGTCATCACATTATCATACAACATCTACAATTCAAGTCAATGAAATAATACAACCGATTTTCTACTATACAGAATTACAACATACATCATCAACCGGTCATAATCCATTTATTCGTGATACAGTAATTAAAACAGATTTTAATTGTTCTCAATTGGAAGAAAATTCaacgataattaattatccACCGGTTGAACCGGTTGgaattcaattgaataatccaacaagtaaaataataaaaccaacTAGAAAtcgtcaaaaaaaaaaggaattatCGACTAGTAATAATGATATGGTAAAAATTTCATCTCCCAAACAAACGATTACACAACACAAACAAAAACGAATACGTAAAAAACCGTGGGAACGTAAAAGAAATTATCAATGTCGAATATGTGGACGTAGTTTTCATGAGAATAAACTAGAACGGCATgtgaatatacatttaatatggCCAGATACATTAGAGTCTAACATTGGAACGGGTAATTTTGATATTTCGGCTGGTATCTATCGTTGTAATTATTGCCCCGAACGTATtgatacatttaaaaatttacgTACTCATATGAGTCGTCTgcataaaaatgttaaattgtACATGTGTCCGATGAGTGAATGTCGTCAATTATTTGCCTATCAAGATTTAATCATTGAACATAGTAAGGGATGTGCATTTAATTCAACCGTACAATGTTCGATATGCtcacaatattttagtttaacAAAAGAATTGGATATTCATTTGTTGTTGGAACATCGAAAAGAAATTGGTATGGGTGAAGGACAACCACGTCCAAAATTGGGTGTTATCACAAGtgaattaacaaatttaaaaaatgttaatgcCATGATAGCCACCACAATAATAACGGAAAACGATATAATAACAAAAGCTGTACCTGACCAAAGCTATActaataatgatgataaagGCGACGGCCGCGATGGATCTGTTAAATTACATCCAAATCAATGTCCAATATGTTTGGTAAAATATCGTAGTGAAGTTATGATGTTAAAACATTTACATACCGATAATCATAAGCATGAATGTGAAATTTGttctaaaatatttataaataaacgtGCGTTAACCAGTCATTTGCATATCCACCGTGATCAAAAAGCAATATGTCCCGTATGTAATCGatcatttaaaatgaaaaaagtaTTACATGTTCATATGTTAACGCATACCGATCGTCAATTCATTTGTGATATTTGTGGTCAGGTAACATCTCATAAATCGACAATTGCCAAACACTTTCGAATCCATACAAATccaaaagaaaaatgtttaataaatggaTGTAAAAAAGTATTTCGACATTTGGATCGTTTACAGGCCCATCAAgaaattcataaaaaacaattacaaaaaaTTGACCAGCaaatgaaaagtaaaaaaaaatataaaaaaagattaaaatcaattattggATCATCAGCTGCGATAGCAATCACTCCATCCAATACAAATGATGTTATTCCAGTGAACAACAAAGAAGAAAATCGTCAATTAATCAAAAAACGAATGTTtcattttaagaaaaatgttacAATACCCGGAATTGTTGTTGAAAGTGGTCAAATTACAAAAggtattgaaattttaaatgaatacactaaagttaattcaaataaatttgtatattttaacaatacgCATCCGAATTATGACAATAAAAATCATGATAAACATGCGGCGATAAagttaaaatttgaaaatgaaattcaaacCACCCACAAAGAAATTGATgatggattattattatttgagtATGATAATTTGGTAAAAGAGAATATTTGTGAATGGTCTACTAACGATAATATTGATCGATTGAATTTAAATTCCAATGAACAAAATAGTAATAGAATGAATTTAGAATTTGTTGAATGTAATGATGcagttaaaaatgaatataataatgttagtGTATCATTGGAAAAACTACCAGATCATGTAGTGAATGTATTGttaaaaaaggaaaatccCATCGACAAATTATCAGATGAATCTGATGAAAATATATCGATTTCAAAGTTACAAAAATCAATACacaaaaacaattcaaaaaaatttattctacataaaaaagataatgcaaaaaatgataaaaattttgaatttgttgAATGTACAccaattcaaaatgaaaatacctCATCGTCAGTTGAACATTGCAttgaacaaataaatacaGTGTCGTCTGAACAACTGTTAGCCGTAACTCACAATGAATTCGAAGACAATAGGACATGGGTCAAAACAgataaaaatacctttaatCAATGTAACACAACAAATCAACGAAAGACCGATGACAAGGTAAACAGACgaaatacaatgaaaaaaattaaaattcccAAAAAAGccaaatcaataaaaaaacaatcacCAACGGAATCCGAATGGCCAACGGAACGTTTACAATTGTTCATTACCCGGTTATCGGTTAAAACGAAAACCACTGCAAAAACATTTGAATGCAATGTATgtggtaaatattttaaagcaACTGCAAGTCATTTACATCATGTACAATCGCATCGCGTCTGGTCATTAACGAAAAACACTCACATTGGCAACAGTACATTTGATACAATTGAGAAAATTTTTCGTTGTCCATTTTGTCCGGAAACTTATCGAATGCATGCACCATTACGATCACATATGGCCTATACCCATCACAATGAAAAAGTATACGTTTGTCCGTTAAGTAAATGCATGGAATTATTTACCGATGATCATCAATATCTATTACATTGCCGTCAATGTGTTTTTCAATCAACGGTACGCTGTTCAATATGTAAACGATTCTTTAGTAATCCGCATGAATTAACTAcccataaaattattaaacataaattagtgaaaaattcagatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgacggtGATGGtgttaataTAAATCCAGAAAAATTTGTACAATTTTACATAGGAATAGTCTGGAAAAACGGTTCTGGTGGACAATTCCCGGAaatTCAATGTACACAACAATCAAGAACATCATTGATAAATGTTGATGGAATGACaaatccatcatcatcatcatccataGTTAGTTCTACCCCAATGAATTGTCATAATTCCACATATAATCCAACTGTAATATCAATTTCTCATGGACAAAGTCCACCGCGGGAAAtacatcaacaacatcaattACAACACCCACAGCAACAATTAATGCAACAACATgatgaacaacaacaacaatttcaACAGGGCCAGAATCAacaagaattattattaacatcaaatttcaataatataattgatgtATCATCAATATCACCATCATCACCGGCATCGTTATGGGTTTCCCATTCATCGTCGCctgtaaatgaaataaaaccGTTAATGTACACCTCAGAATTGCAATCAACTGATgttctaaaaaatatatttatacaagaTGCAATAGCAATAACCGATATAAAACcagaattaaaatatcaacTAAACATATCATTAGATCCATCATCAATAATAGATTATCGTACAACATTAACAATAACacctccaccaccaccaccaccaccaacaacaACCCCAACAAcagatttaaataatataacaattaaaaaaccaaaaaaaattcgtaataaaaagataaaaatggAATTTGATCCAAATAATGTTGGAGAAGCACCCGCACCCACACGCAGACCGGTTAAAGTAAAACCATTACGTGTTCGTAAAAGAGCATGCGAATTAAGTAGATCATATCAATGTAAAATATGTGGACGTAGTTTTCGtcgaaataaattaaaaggaCATATGCAAATACATTTGGTATGGCCGGATACATTACAGGCAAACATTGGCACTGGCAATTTTGATGAATTACTGGGAATTTATCGGTGTAATTATTGCCCGGAGCGCATTGATACATTTAAGAAATTACGTACGCATATGCATTcattacataaaaatgttaaattgtACATGTGTCCGATGAGTGAATGTCGTCAATTATTTGCCTATCAAGATTTAATCATTGAACATAGTAAATGGTGTTCGTTTAAATCGACCATTCAATGTCCAATAtgttatcaatattttaatgtaatcaGAGAATTAGAAATTCACATTTTAGaacataaaaatgaaattttaaatgatgttAAAGCACAACATTATCCATCTGAGAAATTGCAATCACAACCAATAAAAATTGCTGTAGAAATGATAAGCAAATCAACGAATttaaatacagaaaatattGGGGAAAATACAACAGCAACAAATGTTGATGGTATTTCTAAAGATGATCGAATGATACCGTATCAAATTGGTGCGGATATTGATGgtgctggtggtggtggtggtggtggtgatcAGCAATTACATCCATATCAATGTCcaatatgttttgtaaaacATGGCAGtcaaataatgttattaaaacatttacataAAGATAGTCATGAGCATAAATGTGATGTGTGTCAGAAAATGTTTCGTCATAAAAGAGCGTTAACCATGCATTTGCATACACATCGTGATTTACGGTGTATCTGTCCAATATGTAATCGTTCCTTTAAAATgccaaaaatattaaatacccATATGCTTACGCATACCCAACGTGAATTTATTTGTGATTTATGTGGTACTGTGACAACGCTAAAATCCAGTTTAGCTAGACATTTTCGAACGCATAATAAACCAGTTGAAAAATGTGGAGTAAGCGGTTGTAAACGAATATTCAGACGTATTGATTGTCTGAAAGCCCATCGAATATTACATGAAAGACAAGTGAAACGaaGTGGAActaaagttaaaataaaaaagttaagACATCGTCGATATTCAAATTCAAGTGATAGTGATGAAAATCTAAATCTaaatgacaataataatattaaagtaaaaaaaattaagaaacgTAGAACttcgaatttaaaaaaaaattttataattccgGGTATTGTCATCGAAGGtggtaaaataataaaaggtGGTGATATCCTAAAGGAATATACAATATtgggtaataataataataataacgttGTTGAAAATATAACTGAAATCATATCAGAACCGGCAACAGAACAAATTTCACTTAAACACAACGATGATTGTCCGGTGGTTACTGATGATTATAATCATCCCATTCCGGATGACAATGATTACATTGTGGATTGGTTAGATGATGGTTATTTGTCACCTGTAAACAATGAATTGGAACAGTcagttaataattttattattcctGATGATtacaataatgaaaaaaagaaCAGGAATAATAACAAGAACAAGGAGAAGAAGaagaatagaaaatttaaaaaaattaatggtgATAATGATCCTATTACCAATGGGATTGATATGAATAGTAATGGTAAAGATTTTGAATTTGTCGAATGTGTTCCGgaagaaaataattatacagtTTCGGTATCAATAGAAAGACTACCgacaaatataacaaataaatatttatcaaaaataaaaacaaattcaaaaccAGAACCAGAACACAACGAACATAACGAATACCTGGATAATTTATTGGTATCGACACCAATCAAACCAACTGAATCATCTGCAGATGAATGCACGTCGGATGAATTCACGGATAATATACCAATTTCGGAATTACGTGAATGTTCAATGGTCGATGGTCCATGGATGATGAGTTGCGGTGAACAAAATGAAATCCCCGTAAAACctaaaagaaaatatgttaTGACAAATCgaagaaaaaaacaaccaaTTGTGAAAAAACCAAAAAGGGTGTTAAAGGTGGATCGGGCCGATGTCCGACCACCACCACCGAATTCCAAATGGCCCGTTGAGCgtatccatttatttattacacgTCTTTCGgtgaaaacaaaaacaaccgTACGAACATTTGAATGTAATATATGTGGTCGTCATTTTAAAGCTAGCGGTGTACATAATCACGTACATGCTCATCGTGTTTGGTCATTCACCAAAAAAACACACATCGGTAATGCCACATTCGATTCCACCGATAAACTGTATCGCTGTCCATATTGTCCGGCCGCATACAAATTGCATCCACCATTACGTTCCCACATGGTTCAAAATCATTTCAATGAAAAACTATTTGTATGTCCGTTAAGTAAATGCCAGCAATTGTTTGTCGACGATCATGAATTTCTTGAACATTGTCGTGAATGTGTATTTAATTCCAAAGATAATGTACGTTGTACGATATGCTATCGATTTTTCATCAGTGACATTGAATTAAATGAACATAAAATAATGGCACATCAAATGGTGGATAATACGGATCCGGATGCTGACGAGCGGGCTGATGCTGCTgctaatgatgatgatgatgatgatgctggTAACGATAAAATTGAACCGGATAAAAAAAGTGAAACTAATTCGATGGTTGATCGTCAATTAAATGGTAGTATTCCGATTTGTAAATCATTTActcaaaataaattcaaatgtgATATCTGTCATGcaacatttaaaaatagaattctATTGGTAAAGCACACGAATCGAGATTCACATgatcataaatgtatatattgtggTAAAGAATTTTTGTCACTGCGAAGAGTACGTCGACATTATTTAACACATCGTGATGTACCAAAAATGTGTTATATTTGTGGTAAAATATTTAGCGTACAGGCCTATTTAAATTCACATGTCCTGAGGCATACAAAATGCCATACATGTGATATTTGTCAAAAAATGTTTGCCCGCAAAGAAATCCTATTGAAACATATTAAACGGCATGGTGATCCGTTATATGCATGCACACATACCGGTTGTCGGGTGGTGTATCGTCGTAAggaattaattgaaaaacaCATTGAAAAACATAATGCAGTTCAGCAAATTGTTagtgaaaatgaaaattaa
- Protein Sequence
- MDNNPFKCCNCKIQFIGLGKFLEHKSKCFLNGTPPTIDPVINNAAMIEPTITTYLQLNDEATILNYQMLPESHTGEHHPDEFSLNSNNTIDNASTITPSISPKTSSSSPSLWSSHYHTTSTIQVNEIIQPIFYYTELQHTSSTGHNPFIRDTVIKTDFNCSQLEENSTIINYPPVEPVGIQLNNPTSKIIKPTRNRQKKKELSTSNNDMVKISSPKQTITQHKQKRIRKKPWERKRNYQCRICGRSFHENKLERHVNIHLIWPDTLESNIGTGNFDISAGIYRCNYCPERIDTFKNLRTHMSRLHKNVKLYMCPMSECRQLFAYQDLIIEHSKGCAFNSTVQCSICSQYFSLTKELDIHLLLEHRKEIGMGEGQPRPKLGVITSELTNLKNVNAMIATTIITENDIITKAVPDQSYTNNDDKGDGRDGSVKLHPNQCPICLVKYRSEVMMLKHLHTDNHKHECEICSKIFINKRALTSHLHIHRDQKAICPVCNRSFKMKKVLHVHMLTHTDRQFICDICGQVTSHKSTIAKHFRIHTNPKEKCLINGCKKVFRHLDRLQAHQEIHKKQLQKIDQQMKSKKKYKKRLKSIIGSSAAIAITPSNTNDVIPVNNKEENRQLIKKRMFHFKKNVTIPGIVVESGQITKGIEILNEYTKVNSNKFVYFNNTHPNYDNKNHDKHAAIKLKFENEIQTTHKEIDDGLLLFEYDNLVKENICEWSTNDNIDRLNLNSNEQNSNRMNLEFVECNDAVKNEYNNVSVSLEKLPDHVVNVLLKKENPIDKLSDESDENISISKLQKSIHKNNSKKFILHKKDNAKNDKNFEFVECTPIQNENTSSSVEHCIEQINTVSSEQLLAVTHNEFEDNRTWVKTDKNTFNQCNTTNQRKTDDKVNRRNTMKKIKIPKKAKSIKKQSPTESEWPTERLQLFITRLSVKTKTTAKTFECNVCGKYFKATASHLHHVQSHRVWSLTKNTHIGNSTFDTIEKIFRCPFCPETYRMHAPLRSHMAYTHHNEKVYVCPLSKCMELFTDDHQYLLHCRQCVFQSTVRCSICKRFFSNPHELTTHKIIKHKLVKNSDDDDDDDDDDDGDGVNINPEKFVQFYIGIVWKNGSGGQFPEIQCTQQSRTSLINVDGMTNPSSSSSIVSSTPMNCHNSTYNPTVISISHGQSPPREIHQQHQLQHPQQQLMQQHDEQQQQFQQGQNQQELLLTSNFNNIIDVSSISPSSPASLWVSHSSSPVNEIKPLMYTSELQSTDVLKNIFIQDAIAITDIKPELKYQLNISLDPSSIIDYRTTLTITPPPPPPPPTTTPTTDLNNITIKKPKKIRNKKIKMEFDPNNVGEAPAPTRRPVKVKPLRVRKRACELSRSYQCKICGRSFRRNKLKGHMQIHLVWPDTLQANIGTGNFDELLGIYRCNYCPERIDTFKKLRTHMHSLHKNVKLYMCPMSECRQLFAYQDLIIEHSKWCSFKSTIQCPICYQYFNVIRELEIHILEHKNEILNDVKAQHYPSEKLQSQPIKIAVEMISKSTNLNTENIGENTTATNVDGISKDDRMIPYQIGADIDGAGGGGGGGDQQLHPYQCPICFVKHGSQIMLLKHLHKDSHEHKCDVCQKMFRHKRALTMHLHTHRDLRCICPICNRSFKMPKILNTHMLTHTQREFICDLCGTVTTLKSSLARHFRTHNKPVEKCGVSGCKRIFRRIDCLKAHRILHERQVKRSGTKVKIKKLRHRRYSNSSDSDENLNLNDNNNIKVKKIKKRRTSNLKKNFIIPGIVIEGGKIIKGGDILKEYTILGNNNNNNVVENITEIISEPATEQISLKHNDDCPVVTDDYNHPIPDDNDYIVDWLDDGYLSPVNNELEQSVNNFIIPDDYNNEKKNRNNNKNKEKKKNRKFKKINGDNDPITNGIDMNSNGKDFEFVECVPEENNYTVSVSIERLPTNITNKYLSKIKTNSKPEPEHNEHNEYLDNLLVSTPIKPTESSADECTSDEFTDNIPISELRECSMVDGPWMMSCGEQNEIPVKPKRKYVMTNRRKKQPIVKKPKRVLKVDRADVRPPPPNSKWPVERIHLFITRLSVKTKTTVRTFECNICGRHFKASGVHNHVHAHRVWSFTKKTHIGNATFDSTDKLYRCPYCPAAYKLHPPLRSHMVQNHFNEKLFVCPLSKCQQLFVDDHEFLEHCRECVFNSKDNVRCTICYRFFISDIELNEHKIMAHQMVDNTDPDADERADAAANDDDDDDAGNDKIEPDKKSETNSMVDRQLNGSIPICKSFTQNKFKCDICHATFKNRILLVKHTNRDSHDHKCIYCGKEFLSLRRVRRHYLTHRDVPKMCYICGKIFSVQAYLNSHVLRHTKCHTCDICQKMFARKEILLKHIKRHGDPLYACTHTGCRVVYRRKELIEKHIEKHNAVQQIVSENEN
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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