Basic Information

Gene Symbol
CSRNP3_1
Assembly
GCA_958336335.1
Location
OY284471.1:7954352-7960051[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
CSRNP_N
Domain
CSRNP_N domain
PFAM
PF16019
TF Group
Unclassified Structure
Description
This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 0.094 2.2e+03 -1.3 1.8 60 109 56 81 21 131 0.52
2 5 1 2.4e+04 -4.7 2.2 80 105 228 253 191 284 0.53
3 5 2.1e-27 5e-23 82.6 0.1 2 103 441 542 440 560 0.68
4 5 3.1e-64 7.5e-60 202.9 13.4 80 217 583 719 571 720 0.92
5 5 1 2.4e+04 -4.9 3.2 103 103 1176 1176 1128 1259 0.53

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTTAAATCcatttaagaattttttaaataatttacaaaaaaatgcCGGTAATCGATTTTTCggATTATCAAATCAATCAGTAAATGGAACAAGTTCCACGACAACaaaaacaaccaaaacaacaacaacaacaacaacaaccccTAGCAGCAGTATAATGGAAAAtgaagaacaacaacaacaacaacaacaatttattgattatgaaaataatcgtataaaaaattctgttgccgatgatgatgaatttacAAATCGATTGCtaattaatgatgatgatgctgataATGATGATCCATTATCAGATCCATTAGCAATTGatgatgaattaaatttattatcatcatcatcatcatcatcttcaaataatcaatcaaataaTTCTGCATTACGAATACCAAGCGATGCGGATGCAAATGATTCGGAGGATGGTGGTGatagaagaagaaaatatttagacaatgaaaaatcaataaataaaattgtggtAATCGAAAGTGGGGCTGCTGATGATGGAATAACTCAAAGAAAATCATATCGTAAAGAAGaaattgtatttgtaaatataaatcatttaaaacgTAATTTTTGTACCATTGAagatattcaaaaaaaatcaatttattgtaatgataatgatgatgataaaaaaaatataattattaataatgagCTTGATATTGATGATGAGGGGGATGAAGTGGATGAAGGGGATGATGCGAATCCGGATGTTGATGaagaagaaattaaaaatgttattattaatgattatgatatgaatgaaaatattacaaCGGCTAGTAGTGACGGTGACGTTGactgtgatgatgatgatcaagaATTTGAAGAATTAGAAAATAGAAATGTCATTAAAAAACCATCATCAGTAGATGAATCACCAATGAATAATCTATTGGATGATAAGAAACcatcattaaatattattagcAATAATTCAATAACTCAATTAACATCTGTCAATAATCAAGTACCATCCGTTGTTGGTGAtggtttaataaattatcaacaacaaaattcaactgataatttattattagatgATTGTTGTGTATTACGAAGTTCTGATAATGGTTCTGATTCTGGTTTAGGTTCAGAAACAACAACGACGTCCATTACGACTTTATcattatgtaataataataataatcagaatgatgataataaaattcctATTATTATGAAACGTAGTAATTTAAAAAGACGTTCCCAACCAATTTTAGATGATCATTTATTAACagatgattataataataataataataataatatgatgaatatGATGAATAAACCAAAAAGACCAAAACGTAGTATCACATTTAATGATGTTACAGTTTATTATTTTCCACGTATACAAGGTTTTGTTTGTGTACCATCACAGGGTGGTTGTACACTTGGTATGACCTCACAGCACATTGATTGTAAACGTTTTTCAATTGCCGAACATTTAACTGAACGACGATTGCATAGACATCAACAAACACATGCATTAAAATCACTTATGTATTCGGGAACGGGAACGggaatttgtaataataatgacaGTAATGTCAATGGTAattctaataaattaattgaaattaatgccagtaatagtaatagtaatagtaatagtaatgATGCAAATGCAAATATAGTAGAAACTGCTGTTGAAGACCAACCACCAGTAATTGTTGGTTCATGTTCAAGTGATGGGGGTGATGCCAGTGATagcgatgatgatgacgatgatgatgatgatgatgatgatgatgaacaaCAATTAAGTGATAATAGTAGTAGTTCTTCAGAATTGGATACAGAATCAACAAATGGTGGTTTTGTTCAACCAATAACGGCAAGACAACGtcgtttaattttaaaatcagcCGGTATCCGATTTATTGATTGTGATGAAAAAGATGAATGTAAAAGTATACGATCATCACGTGAATTTTGTGGATGTTCGTGTCGTGATTATTGTGATCCAGATACATGTTTTTGTAGTCAATCGGGTATTAAATGTCagGTTGATCGTTTACATTTTCCATGTGGTTGTACACGTGATGGTTGTGGAAATCGAACGGGTCGCATTGAATTTAATCCAAATCGTGTACGTACCCATTTCATACATACAATAATGCGTTTAAATTtagaagataaaaaattaccaGCAGAAAAATCACGTCAAAACACGTCCAATGTTATTATGTCAAATCAATTATCAATACCGCAATCATCaccgtcatcatcatcaattgcCATTGAATCAATAGCAAGAAATGATTTTAGTAATCATCGTCCTGCTTCTGATACGAATTTACAACAATTTCAAATGTTAAATAGTCAAAATGTTAGTGAAATTGTTTGTAAAACAGAATGGAATTCAACGGAAATGGAAACGACAGGAAATGTTTTATTACCACcattacaaaatacatttaattataatatttatcatcatcCACATCATCCGCATCCACATCCACATCATATGGATTATTCAAAGAATCATTCCACAATGTATGAATCTTCTTTGCAACCAATACCAGCACTGCCGTCGTCATCGTCTTCGTTGTCTTCGTTGTCATCCTCTACGTCTACATCTACTTCGACATCATCAACAATACATTCATCATTTTCacaacataataatttaaatatttatgaattggATTTAATGCGATTACATCCAATTgataatttatcatcatcatcatcatcatcatcatcaataacaacaacagcgacaacaacaacatcatcaccTCATTATGATTTTACAGATGTTTTAATGAATGAACCGTCATCGTCATCTTCGTTATCTTCAACAACAGCAGCTTCAACGTCATCAAAATTGTCATCATCACCATccaatttattaatagaacaatcaaataatacaaatgataTTTGCTTAACTGCCAATCCTCATAATCATCACAATGAAATGTATtcatcaatttataatttaagtCAAGATGATGTTGAACatgatttagaaaattataatcaaataacacaatcattattaattaaaaccaATTATCAAAATGATATTCATTCAACGTCAACGATTACAACGTCGTCATCATCGTTATCATCGTCTTCAGCGTTATCAGAGTTATCAACGCAGTTATCATCGTCGTTATCATCATCACCAGGAGCAGTGACAGTTACAGGGACAGAAAAAACATCCCAGCAATCAACCAATTACAgtgaaaatgatatttttttaaataacataaattttagtacaacaacaacaacaacatcagaATCATCTGTTAATTATCAAcatcataattttattgatgaCAATCGAATTTTACCATTATTATCTGAAAGTGTACCATTGTCTGATGATTATCTATCATCGGGTGATTTGTTAAATGATGAGAATCACAAACACGACGATGACAACGACAACGTTATGGAAAATTGTCAACGATTAACAAATGATGAAGACAACAAAACAGCAACAGCAACTGAATATCAATCAACTCAAatcattaaagaaaatgatgattgtaatgaatttgtaaatttaCATCCACCAGAAGCCAATTCAGATCATATGAAtgcaattaataatttattagaaataaatCGTAATAATGTtacattattatcatcatcaacaacaatgGAAACAACGGAAACAAAGGCAACAACAATGGCAATTACTAAACCGTTATCAATCAGAGAACAAgagaatttaaataaaaatgtggttgttgttgttgatgatgataaaaataataataatcttattaATAATGAAGATGAAATTGAAAAGCAATTCAATGGAATAGTTGGTAAAAAGGAATCCActaatttaattgataatgaattaataacaaaaccaacaacaacaccTTTGATAACAGAAataccaaataataaattaaattacgaTATTAcgacaattgaaaataattcagaatctttaacatcatcatcatcatcttcaaaTCCAGTTGATGTTTTATCTAATGATGAtgtagatgatgatgataaaaagAGGATAGTTGATAATAGTTTGGCTACCAACACcgccaccgccaccaccaattcttcttcttcttcagTAACAACAGACATTATTGATGAGAGCTTAagtgaaattattaaaaatagtatTGTTGTTGAAAGTGTTTTGGCATAA
Protein Sequence
MLNPFKNFLNNLQKNAGNRFFGLSNQSVNGTSSTTTKTTKTTTTTTTTPSSSIMENEEQQQQQQQFIDYENNRIKNSVADDDEFTNRLLINDDDADNDDPLSDPLAIDDELNLLSSSSSSSSNNQSNNSALRIPSDADANDSEDGGDRRRKYLDNEKSINKIVVIESGAADDGITQRKSYRKEEIVFVNINHLKRNFCTIEDIQKKSIYCNDNDDDKKNIIINNELDIDDEGDEVDEGDDANPDVDEEEIKNVIINDYDMNENITTASSDGDVDCDDDDQEFEELENRNVIKKPSSVDESPMNNLLDDKKPSLNIISNNSITQLTSVNNQVPSVVGDGLINYQQQNSTDNLLLDDCCVLRSSDNGSDSGLGSETTTTSITTLSLCNNNNNQNDDNKIPIIMKRSNLKRRSQPILDDHLLTDDYNNNNNNNMMNMMNKPKRPKRSITFNDVTVYYFPRIQGFVCVPSQGGCTLGMTSQHIDCKRFSIAEHLTERRLHRHQQTHALKSLMYSGTGTGICNNNDSNVNGNSNKLIEINASNSNSNSNSNDANANIVETAVEDQPPVIVGSCSSDGGDASDSDDDDDDDDDDDDDEQQLSDNSSSSSELDTESTNGGFVQPITARQRRLILKSAGIRFIDCDEKDECKSIRSSREFCGCSCRDYCDPDTCFCSQSGIKCQVDRLHFPCGCTRDGCGNRTGRIEFNPNRVRTHFIHTIMRLNLEDKKLPAEKSRQNTSNVIMSNQLSIPQSSPSSSSIAIESIARNDFSNHRPASDTNLQQFQMLNSQNVSEIVCKTEWNSTEMETTGNVLLPPLQNTFNYNIYHHPHHPHPHPHHMDYSKNHSTMYESSLQPIPALPSSSSSLSSLSSSTSTSTSTSSTIHSSFSQHNNLNIYELDLMRLHPIDNLSSSSSSSSSITTTATTTTSSPHYDFTDVLMNEPSSSSSLSSTTAASTSSKLSSSPSNLLIEQSNNTNDICLTANPHNHHNEMYSSIYNLSQDDVEHDLENYNQITQSLLIKTNYQNDIHSTSTITTSSSSLSSSSALSELSTQLSSSLSSSPGAVTVTGTEKTSQQSTNYSENDIFLNNINFSTTTTTTSESSVNYQHHNFIDDNRILPLLSESVPLSDDYLSSGDLLNDENHKHDDDNDNVMENCQRLTNDEDNKTATATEYQSTQIIKENDDCNEFVNLHPPEANSDHMNAINNLLEINRNNVTLLSSSTTMETTETKATTMAITKPLSIREQENLNKNVVVVVDDDKNNNNLINNEDEIEKQFNGIVGKKESTNLIDNELITKPTTTPLITEIPNNKLNYDITTIENNSESLTSSSSSSNPVDVLSNDDVDDDDKKRIVDNSLATNTATATTNSSSSSVTTDIIDESLSEIIKNSIVVESVLA

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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