Basic Information

Gene Symbol
Camta1_1
Assembly
GCA_958336335.1
Location
OY284469.1:34750521-34767044[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
CG-1
Domain
CG-1 domain
PFAM
PF03859
TF Group
Unclassified Structure
Description
CG-1 domains are highly conserved domains of about 130 amino-acid residues containing a predicted bipartite NLS and named after a partial cDNA clone isolated from parsley encoding a sequence-specific DNA-binding protein [2]. CG-1 domains are associated with CAMTA proteins (for CAlModulin -binding Transcription Activator) that are transcription factors containing a calmodulin -binding domain and ankyrins (ANK) motifs [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 2.8e-35 6.7e-31 106.8 1.5 40 116 2 76 1 76 0.97
2 5 0.42 1e+04 -3.4 0.4 20 42 543 565 531 573 0.73
3 5 0.71 1.7e+04 -4.1 0.5 65 94 675 704 667 708 0.77
4 5 0.49 1.2e+04 -3.6 1.2 21 87 1751 1776 1705 1784 0.58
5 5 0.5 1.2e+04 -3.6 1.0 8 34 1951 1978 1944 1986 0.63

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTTGTTGTATTCAAGAAAGAAAGTACGTTACCGACGAGATGGCTATTGCTGGAAAAAAAGAAAGGATGGAAAAACAACACGAGAGGATcatatgaaattgaaagtACAAGGAACTGagTGTATTTATGGATGTTATGTTCATTCGGCAATTCTACCTACATTTCATCGAAGATGTTATTGGCTATTACAgAATCCAGACATTGTTTTAGTACATTATCTAAATGTACCATATCCGGATGATAATAAAATGGCTGTAATAACACCAAGTTTGGCTTTATTTGGTGATAAAAAAGAATGGACAAAAGATGAACTTGTTAGTCAATTAAAACCAATGTttttcagTGAAGATGAACCGGATTCAAATaatgatatagaaatatctACTGCCGAAACGGTTGAAGCTATTGTTGcccaattaattgataaacAACGTGTGGCACGTCAAAATGCATTAGTAAAACAATTGGAATGTGGTTGCCCGGATTCAACGTGTGCCGATGGTAAATCTTGTTCACACCCAACTCGGCGATTAACATCAACAACGAAAAATAATCAATCGAATGCTGAAAAAACACGtcaagaaaataataataatcaagtTTCAAGTACAACACCAAATGTTATTATTGGTTCAAGGTTGTATACAAGATGGGTTGATCGTCGAGGTCGTGATCAATTAACAgaaatttcatcaaataatttaacatcaacagcagcaacagcagcagctaccttaacaaaacaaaataatgatGGACCTATTCATTTTCAAGTCATTCCGGCATCAtcacaacaacagcaacaacaacaacaacaacaaacacaTACCATTTCcaataatcaaatattaacTAGAACTAATTCCAAtgcaaatattacaaataataataataataataattctaataacagcaataataataattctatcaATCAACAACAATTATCCAATATAACcaattctaataataataatataaataataatcaaataaatatttcaaattgtgctaatttaaattcaaataataataaaaataatatcaataacaatattaataataataataataacagtgGTCAATTAACTACAATTACAACGCATTCCAATCAAATAAGTTTAAATAATTCTgcttcttcatcttcatcatccaCATCCACATTATTATCTTCATCTGCTACAACAACAACACTATCATCATCGTTATCATCCTCAACATCCCCATCAGCATCGtcgtcatcttcatcatccTCGTGTTCATCTTCAGTAGCCAGTGATagtttaaattcaataaatatgaatGGTCACAACGATAATAATCACATAACAATTACAACCAATTTAAATCAAGAACAACAATCAtctaatgataataataataataataataataacaataaacataatattattgtaagtCATCCACAACGTACATCtacaaatacaattatatcgaatagcaataataataataataataataataataccaataacaaTCGTATTGGTAATGCACCAATTTCATCAACCGCACCGCCATTAGTACTTAGTTTATCACAgataCAAGGAACAACGGGtagtttattaattttaaatggacAACAGCAATCATTTTTATGTCAAAGTCAAaatcaacaacagcaacaaaaACAGCCGCAGCATCAGCCGCAACATCACCAATTACAATTACAACGAAAACccaataaaaatgaaacaatctgtaataataacaacaataataataataataataatatttttaatcaaaccATGTCGGCCAATTTAATTCCAAAATTAGAAGCAATGGATGCTAgttcttcatcatcatcatcatcatcaacaacatcatcgTCTGTTGTAACTGTAGCAAACGTTGATAAACAAATGGATAATGTTTATGAAAGTATGAGCTATACATCAACTCATCAAAATACACCGGTAGATAGTCCaatgaaaaataattctagtaatattaataataataataataataacaataataataataatattaataataataataataataatcatcatcacaataatattgataataataatagtatcaatgcaaataataatcataatagtATTAATAATAGCTTAGcTAAAGAACTTCatgatacattttttaatgaaaccTTAGAATTGTCACAAgaagatatacaaaaaacattaaGTGCCAATATGCCATTAGATGGACATAATGGTGAATCAATTGTCGGTGATTTAAATCCAATTGGTGATATTGATTGTGattttggtAGTACAAACGTTCATGATGATGTATTTGAGAATCTCGATGCATTTGATATGTTTGTTGAATTTCCTGATTTAGAATTAGATGGAAAACACAGTCTATTGAATACATCAAATGAACATTTagataatattgataaaatgaatttaaataataccACAAGTattcaatcaaatttaaacaataataatataaataatgataataataatattactaataatagtagtaataCTATGAATAATTCAATGAATACAACATTAAATACGCATagtaataatgataataataataataataataataatcataattgtAATAGtaccaataatataattaatattaatggtaataataataataataataatgatgtgTATACAATAAGTGATTATAGTCCGGAATGGGCTTATCCAGAAGGTGGTATTAAAGTATTGGTAACGGGTCCATGGGAACCAAGTTTACATTATACAGTGTTATTTGATTCATTCCCAGTGCCCACTACATTTGTACAAAGTGGCGTATTACGTTGTTTTTGTCCAGCACATGAAGTTGGATTTGCTACGCTACAAGTTGCCTGTGATGGTTTTGTGATATCGAATTCtgttatttttgaatataaatcaCCGCCAAATGTTGAAACAATTTGTGAGGGAACGGCCAACgatagtttatataaaataagtttgTACAATCGTTTGGAATCAATCGATGAACGTTTACATATTAAATCGGAACCAAATGAtttgCCTGAagattgtttattatttaatcaatcACATTTTGAAGACCGCCTGGTAAATTATTGTCAATTGTTAACATCAAAACAATGGCGTTCGATGACGCCCAGTACATGGAATACCGGATTTAAGGGTATGACATTATTGCATCTTTCCGCAGCCCTTGGCTATTCAAAATTGGTTTGTGCCATGTTAACATGGCGAACGGATAATCCAAGTGTTATATTAGAAACGGAAATTGATGCATTGAGTCAAGACAATCAAGGATATACTCCTCTTATGTGGTCATGTTCAAAGGGACATTTAGATACTtcgataattttatataaatggaattttaatgcattaaatgtaaaaaatcgTTTTCAGCAAACGCCAATTGATATTGCAAAATCAAATGGttttaataatttggCATCCGAATTAAATCGTTTCGAAACGCAAAGGCTGttacaaaaacaacaatgtcAACTAAATTTAGCTTCATTCTCCAATTTATTATCGgataaagataataataataataataataataataatagtcataataataataatgaaaataataataacaataataataataatggtaataataatatgaataataaaaataataatagtaataataataataataatgcaagCAATAGTAAAATTATTAGTGCTGAAAacaccaataataataataataacagcaATCCCAATAGCAATAACTTTgaatacaatattaatgcaCATCTACCTGTATCATTTTCAAATGCATCATCACCTGGCTACTCAAAAGATAATGAACTTGAcggtaataataaaatacaaaatattatcaatcacaatattaataataataataataacttaattaatataattgatattgcctcatcatcatcaccatgTTCTTTCCGGACGTTAACTGGATCAGCAATATCATTAGTTAGTAATCGAAGTCATGATGGGATATTTTTAAGACCCGGTTTAATCTCAAATCCTAGCCCACCGGGATCTAAATTATCAAAACGATCATCGGTTGATAGTGGAATTAATATGGAAATTCGAAATATATCAAGAGCTGGTAAAATAATACGTGAACAACAATTGAAATTAACAAGATTTGATAGGAGTATGTCTCTACCAACATCGAATTCATCGTTGTCATTTGCGAATACCgatgatattgataattttgcGCTATCCATTGATTCGGCCATGGAAATGCCTTCATTTACAAATACCAATTTAAATAGCAGTAGTAATACCTCATTACTATCGCCGATGCGAAAAATAGATTTTGCTTTATGCGAAATATCTGCTGGCGATAGTAGCCCAATTCCAGAACTACAAAATATAACTGATGACGAGGAAAGTCGTCATCAAACTGAAACTCATCATCTTGAGGAtgataataatgttaatatgCAAGAGGGTGGTCAAGTAGTTGTAGGGGATGGTAATGACGTGAAAGTATTAACATTAGCCGAACAAATTATAGCAGCAATGCCCGAACgtattaaaaatgaaacaaataatattgaattaatgGCATTGGGTAGTCCACTTGTTGAATCGCTTACTGCAGACGCATCATGTATGAACGTTTTAAGTGACACATTTATGGAACCACTTTTGGACACCTTACAATCGAATCCCTTTGATcaagaatttaattttgaatttagcGATCATAATTATCGATATAATGATGTTAGCCCACCGAGTTCAAGTTCATTAAGTCCCGACGATGATAGTTCCGCTCAAGTGTTAAGTCCGGGCAGTTATACTACCAATGTACCGCCAGATCCACCAATGCAATCACCAAATCCACCACCAACAACACAAGATTTTACCGAATTTTTACAGGCATCAAATGCAACATTAAAACCATTTGAGGCggcattttcaaatttaacattaactgATCGTGAACAACGTGAACTTTATGAGGCGGCAAAATGTATTCAAAAAGCATATCGTTCGTATAAAGGTCGTAAGAA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Protein Sequence
MLLYSRKKVRYRRDGYCWKKRKDGKTTREDHMKLKVQGTECIYGCYVHSAILPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPYPDDNKMAVITPSLALFGDKKEWTKDELVSQLKPMFFSEDEPDSNNDIEISTAETVEAIVAQLIDKQRVARQNALVKQLECGCPDSTCADGKSCSHPTRRLTSTTKNNQSNAEKTRQENNNNQVSSTTPNVIIGSRLYTRWVDRRGRDQLTEISSNNLTSTAATAAATLTKQNNDGPIHFQVIPASSQQQQQQQQQQTHTISNNQILTRTNSNANITNNNNNNNSNNSNNNNSINQQQLSNITNSNNNNINNNQINISNCANLNSNNNKNNINNNINNNNNNSGQLTTITTHSNQISLNNSASSSSSSTSTLLSSSATTTTLSSSLSSSTSPSASSSSSSSSCSSSVASDSLNSINMNGHNDNNHITITTNLNQEQQSSNDNNNNNNNNNKHNIIVSHPQRTSTNTIISNSNNNNNNNNNTNNNRIGNAPISSTAPPLVLSLSQIQGTTGSLLILNGQQQSFLCQSQNQQQQQKQPQHQPQHHQLQLQRKPNKNETICNNNNNNNNNNNIFNQTMSANLIPKLEAMDASSSSSSSSSTTSSSVVTVANVDKQMDNVYESMSYTSTHQNTPVDSPMKNNSSNINNNNNNNNNNNNINNNNNNNHHHNNIDNNNSINANNNHNSINNSLAKELHDTFFNETLELSQEDIQKTLSANMPLDGHNGESIVGDLNPIGDIDCDFGSTNVHDDVFENLDAFDMFVEFPDLELDGKHSLLNTSNEHLDNIDKMNLNNTTSIQSNLNNNNINNDNNNITNNSSNTMNNSMNTTLNTHSNNDNNNNNNNNHNCNSTNNIININGNNNNNNNDVYTISDYSPEWAYPEGGIKVLVTGPWEPSLHYTVLFDSFPVPTTFVQSGVLRCFCPAHEVGFATLQVACDGFVISNSVIFEYKSPPNVETICEGTANDSLYKISLYNRLESIDERLHIKSEPNDLPEDCLLFNQSHFEDRLVNYCQLLTSKQWRSMTPSTWNTGFKGMTLLHLSAALGYSKLVCAMLTWRTDNPSVILETEIDALSQDNQGYTPLMWSCSKGHLDTSIILYKWNFNALNVKNRFQQTPIDIAKSNGFNNLASELNRFETQRLLQKQQCQLNLASFSNLLSDKDNNNNNNNNNSHNNNNENNNNNNNNNGNNNMNNKNNNSNNNNNNASNSKIISAENTNNNNNNSNPNSNNFEYNINAHLPVSFSNASSPGYSKDNELDGNNKIQNIINHNINNNNNNLINIIDIASSSSPCSFRTLTGSAISLVSNRSHDGIFLRPGLISNPSPPGSKLSKRSSVDSGINMEIRNISRAGKIIREQQLKLTRFDRSMSLPTSNSSLSFANTDDIDNFALSIDSAMEMPSFTNTNLNSSSNTSLLSPMRKIDFALCEISAGDSSPIPELQNITDDEESRHQTETHHLEDDNNVNMQEGGQVVVGDGNDVKVLTLAEQIIAAMPERIKNETNNIELMALGSPLVESLTADASCMNVLSDTFMEPLLDTLQSNPFDQEFNFEFSDHNYRYNDVSPPSSSSLSPDDDSSAQVLSPGSYTTNVPPDPPMQSPNPPPTTQDFTEFLQASNATLKPFEAAFSNLTLTDREQRELYEAAKCIQKAYRSYKGRKKLEEQDKERTAAILIQNYYRRYKQYAYYRQMTHAALVIQNRYRSYCENKRFKKSQSQTGATSNVQSNENSNNVQQHHQQPQQQQQQQQQHQHQHQQNPTNSECLQNFYNHFQQQEQQNSSGSGSKEASPSGPLKRTYSQRTQNQAARKIQQFMRQSKLKLQRERAEKERLAHQRRAEYLQSLQYPVSQEVQYTDHSNEQSTQLQEQNNIQQDLQHQQIPHQINNEEQQSSYHIQDFHQQQQQQQPTHFQPPLQSSTSQSQEICNFEQSQNQFHISHQQHIEEQEQHQQVQQLLQQNQQHQLQPQIQHQQPQPQQHYGSQQFWNN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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