Basic Information

Gene Symbol
IntS14_1
Assembly
GCA_958336335.1
Location
OY284469.1:19529496-19535289[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 3.2e-05 0.051 14.1 0.0 4 31 512 543 509 551 0.88
2 2 1.8e-10 2.8e-07 30.9 0.2 4 41 709 750 707 753 0.91

Sequence Information

Coding Sequence
atgcCGACAATAATAGCATTAGATGTTTCATTATCAATGCAGCGTATATTTCATCAACaagatgatgataataaaatgacATACCATCAATTGGCCGTCCAAGGAATTAATAGATTCGTAGATTACTTATCATGTAATACAAAATTAGAATTTGTTTCattgAACAAAATGGAATTTAATACggaagataataataaaacggcaaataatattcaaacaaTTGCAATACATCAAGCATTTTCAACACTTCGAATACAATGTGCTGGACCACATTTTATTACACATTTAGGTAGAATACGTAATGGCCATGAAGGAAATCTATCACATTCAAGttcaattgataaaatatcagataatgaaaatgttatagaatttgtttttgatgTTGATTACCTAAAAAGTTTAGATCCAAAAGAATGGAAAGATCAAGATCATTATCACGTTTTGGGTTTAAAAGATTTaagaaataaagcCACTGATGACGACATTAAACGTGCATACCGTAAAATTGTTCTTAAACATCACCCAGACAAACGTAAAGCTCAAGGTGAAGATGTTCATACTGATGacgattattttatttgcattacCCGTGCATACGAAACATTAGGAAATCCAATAAAACGTCGTTCATATGATTCAATTGATCCCGAATTTGATGATTCATTACCAACGGCCGGTGATGCTGAAAAAGATTTCTTTggtatttttggaaaatattttgcattaaattCCAGATGGAGTGAAAGAAAAAATGTTCCTGAACTTGGCAATGACAATTCAACACGTCAACatgttgataatttttataattactgGTATGATTTTGATTCTTGGCGTGAATTTAGCTATTTGGATGAAGAGGACAAAGATAAAGGACAAGATCGTGAAGAACGTCGTTGGATAGACAAACAAAACAAGGTTATTCGATTGAAACGTAAGAAAGAGGAAATGACTAGAATACGACAACTTGTAGATTTAGCTTACAATAATGATCCACGaatagtaaaatttaaaaatgaagaTAAAGAAAGAAAGCAGGCGGCTAAACGGGCCCGTATGAATGTTGTACAAGCACAACGTGCCGAAGAGGATCGCATTGTGAAGGAAGCGCAAATTGCAAAAGAATTAGCGGATAAAGCTGAACAAAAACGTATCGAACAAAAAAgacatgaaaatgaaaaacaaaaacgtgCTATGAAAAAAGAACGAAAATTATTGCGTGATAcagttaaagaaaataattattatgcattaacagataaagaaaaaatatacaatatggaAGGTGTTGAGAAAATTtgtgaattattaaaatttttagaaTTACAAGATGTAAATAAAGATCtgtgtggtggtggtggccGTCAATCATTTATCCGTATATTAAAAGATACGGAAGCTCGATTGGAAGAAGAACGTAAGgcattatttgataaaaaaccTCAAGCAAGTAGCAGTACATATCAAGAGAATCTatcaaaaattcaatcaaCAAATACATCGTTGATAACCGTTGATAAAACCACGTTATGGTCACcagaaaatatacaaatattaataaaagcGGTAAATTTATTTCCGGCCGGCACCAATTTACGTTGGGAAGTCATCGCaaactatttaaatatacatggTCAAATACCAACggaatataataaacaatttaccGCTCGtgatgtattaaataaaacaaaagatttacaaaatacagattttacaaaaaattcattaaaatctCGCGTAAACGATAATGCATTTGCATCATTTGAACGTtcaaaaaaagaattaaaaattgttgatAATGCTGACATTAGTGTAAATACAGATAATCCCACAACGATGAAGAAAGgatcacaacaacaacaacaacaacaacagcaaaaaCCAGCGCAAGTGAATGGCATTTCGGGAAAAGAATCATCAGCAAAGGGTaatgcaaaaacaaaaaagacaCCGAATTCGTCGTCGTCGGCAGCGACCACACCACAAAATACCACGCAAAATACCAGTAAATTAAATGGTAATGTGGATAAGCCACCAACAAAAAAAGATGTTAGCGAAACAAAAGATGACCCATTGATAAATGCAAGCGAGAAATCCACATCGGCATCGGCAAAAATATGGACAACTGATGAACAAACCCTTTTAGAACAGGCTATGAAAACATACCCCACATCAACGGCCGATCGTTGGGATAAAATTGCTGAATGTATACCGAATCGTACGAAAAAAGAATGTTTACGTCGTGTTAAAGAAATTGTTGACATTGTTAATGCAAAACGTGACGCAATGCAAATCATGATTTATTCTACTCTGTGCGAATTGGTCGTTCCATTTACACGTGAATACGATGAAATACGAAATGCTTTACTTAACGTTGaacattttgataaaacaTGTTTGGAAAATCTATTACAAGCAGTTCATAATGTTTTGGTAACAAATTGGGGTTCACAGAATTATTGTCAGGTAATTGTATTTACCGATTGCGGAATGGGACTTGGATCCACATcattacaatttacaatagaaaatttaaaaagaaataaatcaatggttgataataaaacaacaacagaattaaatcataaatcatGGATACCATTTTCCTATTCGAGTAAATTAAGTTTTGTGTGTCTGCACGATAAAATGGATTCATATTTTAAGGAATCCCTTGAAATGTATCAACAGTTGCTCGATGCAAGTGGACAAAAAGGACAATTATTTATACCGAAAATATTAACAATGAAAAATACGAATGATGATTTGGAAAATGTTGATCATTCACATGGAAAAAGAGCAAAAATTgaatcatcatttttttataatcaacaTTCACAAAGTGGTGCTTTATCCTTACAACAATTACCAATAACTGatcatataaaatcattttatacagccattgataatttatgtgaagtaaattattatcaatttgaAGCCCAATTAAAATGTGGTGGTTATTTTAAATTGGAATGTCCGGTTATCCTGTGGCCATCACCGACGCCGTATGTAAACGAGGATACAAATGATGGTAGTACAAACATGATATCAAGAAAAATTGAAGTATGTGGTTATTTAAGTTTAGCCGACATTGGATCGCCAATGTGCATAAGTCGTCATTTAATTTTACcgaaatttaattataatgatgGTAAACGTTTGATGACTGAAGATGGTAAAGGTAAAAGTACCAATGAAAACGCACGGCCCAATGATGGTAATAATGGCGTTACGAATGCAAATAATGGAACAAAATCATCTTCAGATTCTATAATACTTCAGGAATAtgaaaaattagaaaatgaTATAAGAAGTTTTTACTCCAGACATGATGCAATGTTGACACCGGTACTTACAATCAATTTAGATGATGACGATAATATCGGTGGTACTATTACAACAACGTTGTCCGCACCCACACCATCCGCccaattaaaaaatgaatccAATTTTGAATCGGTTTGTGTGCTATTGCATGGTGCATTAAAAAGTGAAAATCTTGCTGCATTagtattattaaatgataattggtttggttttataaatgcatatgcTGATGGTAAAAAGAAATCGAATTTAATGTTATCTATTTTGCCACCTGGTTATGATAGAATTCCGTGGTTAGGTGATTTTCGATATTTAGGATTTGTATCAGATTTATTGCCGGGAGAAAATGTTGCATTTCCTGTTAAACCAAATGATAAACGTAGTTATTCACAAAATTGTGTTGTTTGGATAAAACAAGCGGGATTACAATCAGATATTCAAAAGTTATTACGTCATTCCAGGAAGATACCCGATaaaatacaacatttttataagGAATTAAATCGTATACGACGAAATGCATTATCATTGGGATTCATTGAATTATTAGATGGTTTAGCGAATTTATTTGAAGCTGAAATACAATCATTACCGCATACGGTGAGTCCCGATTGTCGCATTCAATTACATCATTCGGCTAGTGaattaagaaaattacataatcgtgatttgaaaatttcaatattaccattaacaacaaaatataatgcacAACAAACGGGAACTCATTGA
Protein Sequence
MPTIIALDVSLSMQRIFHQQDDDNKMTYHQLAVQGINRFVDYLSCNTKLEFVSLNKMEFNTEDNNKTANNIQTIAIHQAFSTLRIQCAGPHFITHLGRIRNGHEGNLSHSSSIDKISDNENVIEFVFDVDYLKSLDPKEWKDQDHYHVLGLKDLRNKATDDDIKRAYRKIVLKHHPDKRKAQGEDVHTDDDYFICITRAYETLGNPIKRRSYDSIDPEFDDSLPTAGDAEKDFFGIFGKYFALNSRWSERKNVPELGNDNSTRQHVDNFYNYWYDFDSWREFSYLDEEDKDKGQDREERRWIDKQNKVIRLKRKKEEMTRIRQLVDLAYNNDPRIVKFKNEDKERKQAAKRARMNVVQAQRAEEDRIVKEAQIAKELADKAEQKRIEQKRHENEKQKRAMKKERKLLRDTVKENNYYALTDKEKIYNMEGVEKICELLKFLELQDVNKDLCGGGGRQSFIRILKDTEARLEEERKALFDKKPQASSSTYQENLSKIQSTNTSLITVDKTTLWSPENIQILIKAVNLFPAGTNLRWEVIANYLNIHGQIPTEYNKQFTARDVLNKTKDLQNTDFTKNSLKSRVNDNAFASFERSKKELKIVDNADISVNTDNPTTMKKGSQQQQQQQQQKPAQVNGISGKESSAKGNAKTKKTPNSSSSAATTPQNTTQNTSKLNGNVDKPPTKKDVSETKDDPLINASEKSTSASAKIWTTDEQTLLEQAMKTYPTSTADRWDKIAECIPNRTKKECLRRVKEIVDIVNAKRDAMQIMIYSTLCELVVPFTREYDEIRNALLNVEHFDKTCLENLLQAVHNVLVTNWGSQNYCQVIVFTDCGMGLGSTSLQFTIENLKRNKSMVDNKTTTELNHKSWIPFSYSSKLSFVCLHDKMDSYFKESLEMYQQLLDASGQKGQLFIPKILTMKNTNDDLENVDHSHGKRAKIESSFFYNQHSQSGALSLQQLPITDHIKSFYTAIDNLCEVNYYQFEAQLKCGGYFKLECPVILWPSPTPYVNEDTNDGSTNMISRKIEVCGYLSLADIGSPMCISRHLILPKFNYNDGKRLMTEDGKGKSTNENARPNDGNNGVTNANNGTKSSSDSIILQEYEKLENDIRSFYSRHDAMLTPVLTINLDDDDNIGGTITTTLSAPTPSAQLKNESNFESVCVLLHGALKSENLAALVLLNDNWFGFINAYADGKKKSNLMLSILPPGYDRIPWLGDFRYLGFVSDLLPGENVAFPVKPNDKRSYSQNCVVWIKQAGLQSDIQKLLRHSRKIPDKIQHFYKELNRIRRNALSLGFIELLDGLANLFEAEIQSLPHTVSPDCRIQLHHSASELRKLHNRDLKISILPLTTKYNAQQTGTH

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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