Basic Information

Gene Symbol
ARID5B_1
Assembly
GCA_958336335.1
Location
OY284472.1:5216399-5230560[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 2.1e-11 4.2e-08 33.9 0.9 2 89 650 730 649 730 0.85

Sequence Information

Coding Sequence
atgaccGTTGGTAATCCATGTGGGCATCATGGACCATTTACGTTTTTTAAAGGATTACGTATAACACCACAACCAGAAATAcaatcatcaacaacaacaaccacaacaacaacaaatggtGACACATATTGTAATAACAATAACGGTGGCAactataacaataataataatataaataatataaataataataataataataacataaatagTTCAAATGGAACAAATGGATGTATAACAAATtctaataattcaaaaacaaatggATGTAtagatgatgataatattaataatggattaaattatgataatacaacaaataataataataataataatacaaatacaaataataataatactacaAATAATGATccgattaaaattaaacaaagtTCAAGACGTTGTGTCAGTGAAAAACGCGATGAAAtgaaacaattattaaataatgtaaatgatgcagatgaaaaaaatattaattataaatgtacaaatggtTTTCGAAAACCATTGGTATTGGCATTGGGTGATTGTGTTCCAGTTCGCCCATGGTCCGATTCACCAATTGCCTGTTTAGCCGAATTGCGTATGGTTTGGAAAGATAAAAGTGAACCTCATTTATTAACTGGTTtacgattatattttttaccagAAAATACACCAATCGGTAGAAATTGTCATGGTGAGGACGAAGTATTGGCAATAGCCGATAAAGTTGTTATACGTgcaaatgatttattaaattggaTTGATGGAAAATTAATGTGGAATTGGGCATCGCATGCTGGTAATACAAAAGCGATTGAAATATGTGATCGATTGAATACGACGAATCAAGACGACAGCCAGAACGACGGCGGCGGCGTTGACGACAACGACGATAGCCACAACAACGGCAATAGTGATCATAAAACTAATAGTGGTAATAGtcaattaacaaataaaaaacagacATTAAAATGTTCACCAATTGATTTTACCGAGGTTGACAAAGaaaaagaTGCATTTACCAGATCTCGTATTGTAGTTGTAAGCTATGCAAGATATTGTCGTTATCGTGCCACCCTAAAACGTATCGAAGgtgttgaaaatgaatattggCGTAATCAATTAATACGAATAATGGGTGGTTTTACAACATTAGAACCAAATACTAGGATAATGTTTTGCAAgGAAACATTTGAATATCCTGAATTAGAAACACATGAATTGTTATGTAATCATTTGGCACCGAAATTAAAGGGACGTCCACGTGGTCGCCGAAAGATATTACGTTCAACATCACCAACATCTCGATTGTTACGTGGTGAATCACCGGGTAGCGATTCGGGTACATCAGAAATATCGGCTTGTTCCATTGAAAAAGTATATTCCAAATATTCACCATTATATGTAAAACCAAATTTTCGTCAAGGTACTCAAGTATTGGCTACCCGGCCTCAATTACGTTATAATCCAAGGCCGGCACGTTCGAAAAAATCTGAATCTGATtcaaaatcacaaaaaatcaataaactattaccaaataaattgaaattgaataaacaacaacagcagcagcaacaacaatcGCAACAATcgcaacaacaacataaaCAAAAAGGTCGTCCATCGTCAAGAAGACAACGATTATTAATAAGAAATCGTAAAGGAGGTACTGATGAATCCGAATATGATGAAGATGATCGTAGTGAAGGTGATGATGCGGATgccgatgatgatgacgatgaggatgtcgatgatgaagatgaagaagaagatgatgaaatCGAAGAGGTGGTTGAAGAtgcaaatgaaaataaatcgaaaaataataaaaataaaatgttgtaCAATAAccaaaagaatattattagtaataataatcataataaaaatgatattaaaacaatattaaatatgaaaattgacCAACATACAAAAGGTGGTGATTTGGTGTTTAAACAAGAGGTTACATTTTTAagtgaattattaaaatttcactTTGAGAATAATTCCAGATTACAACCACAATTTTGGAAAAGtttacaaaaattacatttacGAACAATTTACGAACGAGTACTGAAATTGGGCGGTTACAATAAAGTGAATGAgaaaaaattatggaaaacattattcggtaatcaaacaaatataaatacaattataacCCGTACAAAATATCAACGTGCCCTATTGCCATTTGAATTGCatcaaaaatcaaattcaagAACAAccaaaaatcatcatcatcaaaaatatgacatatttaataataaaataacaacaacaacaacaacagcaaataataaatcaataatcaaaataaataaagatcaACATTCAATTGATATTGATGATCGTAAagtaataaatgaaaaatcaattgtGGCAGACCGAATAACAGAAAACaaatcaacatcatcaatGAATGTTAATGATTGTACGAATGATGGtgattcattaaatatatcatcatttaCAGCCTCATTACCAAATGGCacatcaattataaaaattgaacgTGAACgtgataaagaaaattataataccaatcccaataataataataataaaaaattaaaatctgaAATTCCGGATCAACGTAATAATGATTTAGCAATTAAagatgaaatgaaattattgaaacaaCAAGACCAATTACATCATTTATCAATGCCATCGGCGGTATCCGTACCATTAACCGTAATTCTTGGTTCTGGTAGTGCTGGTAATAACTCAACAAATGATTTAACCAATAATCACCATCAATCAACATCACATTcagaaattaaaatacatcAATCACCAAATACAACAATTACCATACATCAAACAACAATTCATCCACAAAATacgcagcagcagcagcaagATCCAACGGTGTCTGCCAACGGACAAATGCCAAAAATGCCAATTGGATcacaacaaattaataataatacatcaattagaaatccatttaataatttttcacaacagcaacagcaacaacaaattaccaatcaaatacaaattcaaCAAATTACAATGCCAAATGGtcatgataatataaatacatgtagTATTATTAAACAAGATAAAAATGGACAAGAAAtacaaattgataaaataattggTAGTGGTCGTTCATCATCGTCGGCTATTGATGAATTTAGTGGTCGTGATTCTTGTGCATTTATAGCACAACCAAAAATTGGACAACCAAATGGATtaacaaatacaataattaataatggtGTTGGTGGTGTTGGTACTGCTGGTACTGGAACAAATAGCGGACCATCAAAAACGATATCATCCTTAAGACAGGTACGTGTAAAATCAGATCGTTCAAAGGATTCCCgtcaaatatataatcaacaacaacagcaacagcaacaatcatctcaattacaattacaatcaTCAATACCGTATATTCCGGCGACGGCGGCAGCGGCCGTACATTTATTAAGTGCTCAACAATTGTTACAACAGCATTTTAgtgaaaaaccaaaaaatgaaaaagaaaatataccatttttgGCCGGATCCAAAACAACAACGATTACACCAATATTGGGTAATAGcaataaaaattatccatCTGGTGGTAATCCTGGTAATAGTGCTGCTGGTACCAATACCTCTGGTAATGGTGATGTTATCGATTTAATTGATGACAGTGATGATAGTAGTAATAGTTCACGTCCATCCGTTACCATAACACCACAAACATCATCAATCATCTCAACCACAAATAATGATctaaatcaacaacaacattattataagCAACGTATACAACAATATCATGAACATGTACAACAGCTGCAGCAACAGCAAAATCAACATCAACagcaaaatcaaaatcaacatcaacaacaacatccaCTATCCGATAAACAATTTACCGATTCGATAATGCcacatttaaaaaagaaaaaatgggATATATTAAAAGAGGGTGGATTAGAGGTAACGGCAATAagtttaaataatacaaatcaTCATGGATCATCAAGTTcttcatataataatagtaatggTTATAGcagtaatagtaataataatacaactACAACAGGTAATAAAAGAGGTAGACGAAAagatattgataaaaaatcgTATATGTTACCACCAGATATTGTTGTTAATCCATCAACGGCCTCCACATCCTCATCAACATCAATCCGGGTACGTTCACCAAATgaaattaatgtaaaattacCGAAATGTTTACCAACACcaaaatttcaatcaaaatgTATGTACACAACAACGGGTAATATTTTTGGTAATCCAAAAGATGATATTccaattgaaaatgaaaatttaaatgcagTAATAAAAAGTACAAGTAGTAAACGTGCCACAGCATcagctgctgctgctgctgctgctgcttcTTCTTCTGCCAGTAATTCTAGTAgtaattcaatttcattaaaGTCCATAACAACAACACCACCAGAACTTCTCGATTTAAcgtttaaacaaaaatttaaaaattcaattgatattttaCGTTTACCACCTCAATCACAAccatataatttacaaaaatcatcatcattggcaaataataaacaaaaaaatagtcTTCAAATAACATTATTACCATCGAcaaatggtaataataataataataatggaattATTCCCATACCATCTGCGTCCGGAGGAGGAGTGTCAGTAACATTGACATCACAAGGATCACCGTCGATGCCATCAAGTAATTTGACAACGTCATCAAATGGAATACCCCTATCAAAACAACAATTAACTCATGtacaaataatacataattcacaaaatcataatattaaacgtaaatcAATTGATTCAAAATCATCATTAATGCAATTACAATATGGGCCACCACCagagaaaaaacaaaatacatcatcttcatctgcatcatcatcatcatcatcaccattaGCAATGCCAGCAACAACAGCCACATTAACACCATTAAATATACCTCAAATTCGTGGTACTCCACCGCCAAATCATCAATCAATACCATCACC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Protein Sequence
MTVGNPCGHHGPFTFFKGLRITPQPEIQSSTTTTTTTTNGDTYCNNNNGGNYNNNNNINNINNNNNNNINSSNGTNGCITNSNNSKTNGCIDDDNINNGLNYDNTTNNNNNNNTNTNNNNTTNNDPIKIKQSSRRCVSEKRDEMKQLLNNVNDADEKNINYKCTNGFRKPLVLALGDCVPVRPWSDSPIACLAELRMVWKDKSEPHLLTGLRLYFLPENTPIGRNCHGEDEVLAIADKVVIRANDLLNWIDGKLMWNWASHAGNTKAIEICDRLNTTNQDDSQNDGGGVDDNDDSHNNGNSDHKTNSGNSQLTNKKQTLKCSPIDFTEVDKEKDAFTRSRIVVVSYARYCRYRATLKRIEGVENEYWRNQLIRIMGGFTTLEPNTRIMFCKETFEYPELETHELLCNHLAPKLKGRPRGRRKILRSTSPTSRLLRGESPGSDSGTSEISACSIEKVYSKYSPLYVKPNFRQGTQVLATRPQLRYNPRPARSKKSESDSKSQKINKLLPNKLKLNKQQQQQQQQSQQSQQQHKQKGRPSSRRQRLLIRNRKGGTDESEYDEDDRSEGDDADADDDDDEDVDDEDEEEDDEIEEVVEDANENKSKNNKNKMLYNNQKNIISNNNHNKNDIKTILNMKIDQHTKGGDLVFKQEVTFLSELLKFHFENNSRLQPQFWKSLQKLHLRTIYERVLKLGGYNKVNEKKLWKTLFGNQTNINTIITRTKYQRALLPFELHQKSNSRTTKNHHHQKYDIFNNKITTTTTTANNKSIIKINKDQHSIDIDDRKVINEKSIVADRITENKSTSSMNVNDCTNDGDSLNISSFTASLPNGTSIIKIERERDKENYNTNPNNNNNKKLKSEIPDQRNNDLAIKDEMKLLKQQDQLHHLSMPSAVSVPLTVILGSGSAGNNSTNDLTNNHHQSTSHSEIKIHQSPNTTITIHQTTIHPQNTQQQQQDPTVSANGQMPKMPIGSQQINNNTSIRNPFNNFSQQQQQQQITNQIQIQQITMPNGHDNINTCSIIKQDKNGQEIQIDKIIGSGRSSSSAIDEFSGRDSCAFIAQPKIGQPNGLTNTIINNGVGGVGTAGTGTNSGPSKTISSLRQVRVKSDRSKDSRQIYNQQQQQQQQSSQLQLQSSIPYIPATAAAAVHLLSAQQLLQQHFSEKPKNEKENIPFLAGSKTTTITPILGNSNKNYPSGGNPGNSAAGTNTSGNGDVIDLIDDSDDSSNSSRPSVTITPQTSSIISTTNNDLNQQQHYYKQRIQQYHEHVQQLQQQQNQHQQQNQNQHQQQHPLSDKQFTDSIMPHLKKKKWDILKEGGLEVTAISLNNTNHHGSSSSSYNNSNGYSSNSNNNTTTTGNKRGRRKDIDKKSYMLPPDIVVNPSTASTSSSTSIRVRSPNEINVKLPKCLPTPKFQSKCMYTTTGNIFGNPKDDIPIENENLNAVIKSTSSKRATASAAAAAAAASSSASNSSSNSISLKSITTTPPELLDLTFKQKFKNSIDILRLPPQSQPYNLQKSSSLANNKQKNSLQITLLPSTNGNNNNNNGIIPIPSASGGGVSVTLTSQGSPSMPSSNLTTSSNGIPLSKQQLTHVQIIHNSQNHNIKRKSIDSKSSLMQLQYGPPPEKKQNTSSSSASSSSSSPLAMPATTATLTPLNIPQIRGTPPPNHQSIPSPHLQNNHHLNTTNVVQPPPKGSSPKTTISMNNSHNNNNNNNNNGTSSNNSTASVTTNQINQFTAAALAAAAFSAAAAASSSSSSSSSTSTNNNNNNGQNNSSINDFKFNPFLLQNLLQTANAFPGLLNTTNSNNNNNNNNNNNNNKNNNNNSNNNSNNNGNGNNNQNNNIQSSLPAPTQTSSFSGFPSFLPMIDPLYLTAMYANPALFLPFQQQQQQQQQQQQQQQQQQALTQELLQQLLRNFTPDIMGNLNNTKS

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
-
80% Identity
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