Basic Information

Gene Symbol
Kdm5_2
Assembly
GCA_958336335.1
Location
OY284473.1:2061343-2085396[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 2.1e-15 4.2e-12 46.7 0.1 3 74 299 390 297 439 0.82
2 2 2.2 4.3e+03 -1.4 0.1 7 38 1524 1555 1522 1563 0.89

Sequence Information

Coding Sequence
atggTACCATGGAACGATCCATTAATGGAACGACGATCCATCAATGACCATAAAGATGGAGTGGAAGTTATAAAACAAGAGAAAAAAGATGAAGAAGATGAAGAAAATcataagaattttataaaattaaccGAAAAATTTGATTCTACGGAAAATTCTAATGTTTTCCATGATCAATTAAACCACGATTCAACCATTAACAATTTAACCATttggttaaataaaaatcaacaacCATTTGAATCATTTGAGGACTATCAACaccataaattaaatatttggcCAAAATTACGACCAATCATTTTGAATACGggtaaaatacaatttaaacaTTTGGATAATTCCATggtagaagaagaagaagaaaaggATCCAGAGGATCAGGCGCATGATCAAGATCAAAAGAAGGAGTTGACATTGAAAATTGAACGGATGATGAACGAAAAATCATCTTCAATCAACAATTCAATgataaatgatgatgaaattaatatgaaattaaaaaaaattaatgatccATGGATCCATGGAACAAAAATGGTGGATGTGGATGATGTGGATGTGGATGAATCCATTTTGTATTCAAAACAATCAACAAATCCAATTGGAACCCATTTAACAAAACACAttgaatttaaacaattttcaattgataaaTGGAATGCATTTGAATGGAATCAACCGGCAGAAGCACCAACATTTTATCCAACCTACGATGAATTTAGTAATTTAATGGAATATATCGAAAGTATCCGAATGGTTGGCGAACAATTTGgtatttgtaaaattgtaCCGCCCGTTAAGgattGGCTTCCGCCATTACAAGCAAATGATTTAACATTTCATACACGCGTGCAGAGACTTAATGAATTGGATGGTCAAATtcgtataaaattaaattttttaggacaaattatgaaattttgggAATTACAGGATTGTCCATTGAAAATCCCATTGATAGATGACAGTGGCGGCGTCAGTGGCGGCGGCAGTGGCAGTGGCAGTGTCGTCGGTCAACCATTAGATTTATACGCTTTGCATAATTTGGTAAATAAAGAGGGTGGCCTTGAACAagttataaaacataataaatggAAAGAAATTGGACGacgtttattaaataatcatcatcatcatcatcatcatcaaaatgccacaacaacaacaacaacaacaacaacaaaatatcaTTCATCAAATTCACAACAACCGCAACAACAGCAACGGAATGGaagcagcaacagcaacagcaacagtaatcgttttggtatatttttacGTAAACAATACGAACGTATTTTATATccatttgatatatttttggCTCAATTACGGACGGCCGACGCAAATGATGGtcattatgatgatgatgatgatgatgatgatgattattttgatGTTATTGAAGCCGTTCAAATGATGGAAACAAAAGTTCGTTTACAGGAAaagCAACTAGAACACTatcaacatcaacatttacatcatcaacatcacaatcaaaatcaaaatcaaaatcatcagCTCCTCAAAAATCAACAACAGATAAAATACAAATCAGAACGGACCAGTGACCATAAAAAAACATCACAAAAAACACCGAAAAAATCATCAGCAAAAAAACGTTCAtcaccacaacaacaacaacaacaaccaaaaccaaaactactagaaaaagatattaaaatgaCTGTGTCAGAAGTGAATGGAACCCGATTAAGATTAGTTCGGGTATTAGACGATGACTTACAAACgaataaaagaagaaaaaaacaatcgGAAATTTCTGAACAACGAACCTCTTCACGATTAACAACCGCACAGATGAATAAAACAATTGTGACGACAATGACGACAATGACGTCTACGACAACGACATCTACAACAATTGCTGTACAACCGTCGTCGTCGTCTCCGTCATCGCCATCTACAATTTCACCTTTAATACAACAATCTTTAATAACGCAAGTGATGACAGcgacaacgacaacaacaacaacgacgacgacgacgacaacaacaacaacaacttcACCAACCACCAACACAACCCCCACAACGAGACGTTCGATGCGTATccaacaaaatgaaaatatcgcctctttaaataatacaaaaattatcgAAACAGCGGAATTGGCCGCCCGAACAACAACACCGAGGATGACGCCGACGACTCTGACGACGACGCAGACTCTAACGACGCCACCATCATCCAAacaatcacaacaacaacaacaacaacaaaataaaaaatcacaatCTCAACGATGTCGTAATGACTTTAAAAATATGACTTCaacaaatttaacaaataaaagatTTCGATTGGGTGGTCACCCTCATAACGTTACTGATGATATTGACCCTGTCACTAATCGTCAACGTCGTCGTCCACGACAACTTCGTCGACGTCGTCGTcgcaatcatcatcatcatcatcatccgcaTCAGAAACGTCGCCGTCAACGCAATTGTCTTACATTTGATCATCGTCAATTCACTAACGATCAAACACAACAAAATCCAATGAACGCATCACAAATTGATTCCGGTATTCGGTATCATGATGatggaaattttttaaattgtcaaACTCTGAACAACGGAATGGAAATGGTAAATGGTAAATTGGGAATAAAATGGCGTTTGTCTGCCTTTTCACAATTGCGTCAAATTGAAGCGGACGCAACGATAACGGTACGGCAACGTTCAATGATCGCTATCGTTCATGAACGCCTAAAATCACATGCACAAAAAGCAACACAATGTGCAATGACATTGACATTGGCCCGCAGTGGAACACAAGCGGCAATTGCCGCCTATCAACGCATCGGTGATCCGTTGGCAAATTACATTTGTCGTATTTGTAATCAAGGTGATGCTGAAGATCGTATGCTATTGTGTGATAATTGTGATGATAGTTATCatacattttgtttaaatcCACCGTTACGTGAAATACCCAGCGATGATTGGCGATGTCCGCAATGTGTTCGGCAAGAGATTACCATACAAATGGAACCGTACGGTTTTGAACAATCAACGGAACAGTATACATTACGACAGTATGCGGCAATTGCTGATAAATTTAAagatgtatattttaattcatgtCAAATGTCAAGTGGATGCGTTTCGTGGATGCCCAGCGCCGCCAGCGTAACGCAACAAGGGAAAacgccgccgccgccgccgccgccgcaacctacaattaatttaattgaacgTGAATTTTGGCGTTTAGTTTCGTCAATTGATGAAAATGTAACCGTTGAATATGGAGCTGATTTGCATACGACGGCGACGGCAACGTCAACGTCAACGTCAACGTCAGCGTCACGGTCAGCGTCAACGAACGATGAATTTGAACAAAATAACGGACAGCCAAcagaacaaaaacaaaaatggaatttaaataatttaaatggcAATTCACGGTCAATGTTCAGTTACATAAATGGTGATATTTCGGGTATGAAAATTCCATGGTTGTATGTGGGCATGTGTTTTTCAACATTTTGTTGGCATAACGAAGACCATTGGAGTTATtcgataaattatttacatcaGGGAGCGGTTAAAACATGGTATGGGGTACCGGGACCGTATGCACCGCGCTTCGAAGAAATTATGAAACAACAAGTACCGGAATTGTTCGATACCCAACCGGATTTATTACATCAATTGGTCACCCTATTGAATCCGAATATCTTGATGCAAAATCAATTGCCCGTTTATCGATGCGATCAACGTATGGgtgaatttataataacatttccGCGGGCCTATCATGCGGGATTCAATCATGGTTTTAATATTGCGGAAGCGGTTAATTTTGCGCCGGCCCATTGGATTGGCATGGGCCGACAAAGTATCGAATATTATTCGACGTTACATCGGGTTTGTGTTTTTTCGCACGATGAATTGATATGGCGAATGGCGACCATGGTAATGCAGAGAATTGGACGAAGGAGCGGGAGAATTTTGAGTGAAACAAATCGTGATGATGACGTGGAAATGGAAGTTGATGAAGATGtggaaaaaaacaatttaccatcatttaatattgaaaCAATTTGGGCTATTCATCGGGATATGATTGAAATGATTGAAATTGAACGAAATTTACGGAATGAAATTATGGAAATGACCGATAAAATGGAATTTGATGCATTTGAATTGCGTACCGATGAATTACGTCAATGTTGTTGGTGTAAAACAACTTGTTATTTATCGgcaataaaatgtttaaaatgttcaataaTTTCTAGTTCTACCTTAACCGGACCGTCAAACTCACCCTCATCTATTCCATccattcccattcccattcccCAATCCCCATCCCCAATTGTTTGTCTTCGtcattttgataaattatgtaaatgtaataaaaatcaatatattttattgtatcgTCATACAATCAATGAATTGGAACGGCTATTAAAAGATATTGCCGATATTTCGGAATGTCTTCAAACAATCAATcgaaaaacaattgaaatattaaaatatcgtAATTCGGACAATTCGGAAAATCCTACAAAAATCCTCATAACTTttgaagaattaaaaaattttatttacgaAATTAATCagaaatttcaaaattatccAGAATTAATGGAAAATTCCGTAAACATTAAACGATTAATGGCagaatttttagaatataaaaatctattaataaaattaaaaaattcacaaattaTTCCTGACACAAATCCGACAGAACCGAATGAAACCGTAGCTGATCTTCatcaatcaacaacaaaaccaattcaaacaatttccgaattaaaatcaatttataatattttaaaattagcTCATtgtaaatttacaaataatgaATTGGAATTGATTGAATTGTGCTTGCGGAAATCTACGGAATTCATTGAATCCATTCAAAATACCatggaattttttaataaaaagtcAGTGGCGCCGGTGCAATTCGAACGGAACGAAGATGACGACGGCGACGGCGACGA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Protein Sequence
MVPWNDPLMERRSINDHKDGVEVIKQEKKDEEDEENHKNFIKLTEKFDSTENSNVFHDQLNHDSTINNLTIWLNKNQQPFESFEDYQHHKLNIWPKLRPIILNTGKIQFKHLDNSMVEEEEEKDPEDQAHDQDQKKELTLKIERMMNEKSSSINNSMINDDEINMKLKKINDPWIHGTKMVDVDDVDVDESILYSKQSTNPIGTHLTKHIEFKQFSIDKWNAFEWNQPAEAPTFYPTYDEFSNLMEYIESIRMVGEQFGICKIVPPVKDWLPPLQANDLTFHTRVQRLNELDGQIRIKLNFLGQIMKFWELQDCPLKIPLIDDSGGVSGGGSGSGSVVGQPLDLYALHNLVNKEGGLEQVIKHNKWKEIGRRLLNNHHHHHHHQNATTTTTTTTTKYHSSNSQQPQQQQRNGSSNSNSNSNRFGIFLRKQYERILYPFDIFLAQLRTADANDGHYDDDDDDDDDYFDVIEAVQMMETKVRLQEKQLEHYQHQHLHHQHHNQNQNQNHQLLKNQQQIKYKSERTSDHKKTSQKTPKKSSAKKRSSPQQQQQQPKPKLLEKDIKMTVSEVNGTRLRLVRVLDDDLQTNKRRKKQSEISEQRTSSRLTTAQMNKTIVTTMTTMTSTTTTSTTIAVQPSSSSPSSPSTISPLIQQSLITQVMTATTTTTTTTTTTTTTTTTSPTTNTTPTTRRSMRIQQNENIASLNNTKIIETAELAARTTTPRMTPTTLTTTQTLTTPPSSKQSQQQQQQQNKKSQSQRCRNDFKNMTSTNLTNKRFRLGGHPHNVTDDIDPVTNRQRRRPRQLRRRRRRNHHHHHHPHQKRRRQRNCLTFDHRQFTNDQTQQNPMNASQIDSGIRYHDDGNFLNCQTLNNGMEMVNGKLGIKWRLSAFSQLRQIEADATITVRQRSMIAIVHERLKSHAQKATQCAMTLTLARSGTQAAIAAYQRIGDPLANYICRICNQGDAEDRMLLCDNCDDSYHTFCLNPPLREIPSDDWRCPQCVRQEITIQMEPYGFEQSTEQYTLRQYAAIADKFKDVYFNSCQMSSGCVSWMPSAASVTQQGKTPPPPPPPQPTINLIEREFWRLVSSIDENVTVEYGADLHTTATATSTSTSTSASRSASTNDEFEQNNGQPTEQKQKWNLNNLNGNSRSMFSYINGDISGMKIPWLYVGMCFSTFCWHNEDHWSYSINYLHQGAVKTWYGVPGPYAPRFEEIMKQQVPELFDTQPDLLHQLVTLLNPNILMQNQLPVYRCDQRMGEFIITFPRAYHAGFNHGFNIAEAVNFAPAHWIGMGRQSIEYYSTLHRVCVFSHDELIWRMATMVMQRIGRRSGRILSETNRDDDVEMEVDEDVEKNNLPSFNIETIWAIHRDMIEMIEIERNLRNEIMEMTDKMEFDAFELRTDELRQCCWCKTTCYLSAIKCLKCSIISSSTLTGPSNSPSSIPSIPIPIPQSPSPIVCLRHFDKLCKCNKNQYILLYRHTINELERLLKDIADISECLQTINRKTIEILKYRNSDNSENPTKILITFEELKNFIYEINQKFQNYPELMENSVNIKRLMAEFLEYKNLLIKLKNSQIIPDTNPTEPNETVADLHQSTTKPIQTISELKSIYNILKLAHCKFTNNELELIELCLRKSTEFIESIQNTMEFFNKKSVAPVQFERNEDDDGDGDEERKLFEELLKKGRSLNLPMIQNECHQLENLLLKIEWLNVCEKIPWLSLKSKWPLSLLIENQNGVVVVDNNKMEMTATNNSKTFNPTISILNQLIEFSFRWTTETEQFSGEMANGIGIGSCVDSSNVVTEQKSVFRNVKMLEIKMNLKKLYELIFFASQWESMTTEYFRKPVKCEPAAIETLLKLANCIPVRFDGTVHSEMVTAYQQLHLWYANVRKYENNSLNNSIASLENLIAAGHELRFNLKGSGGGSDGSGGGFGGGGFKGSDGGRAGGDFGMLMEQLEKRLGKAKRWLEQVKILFMPKLAKSLSSSTDQSNPEQLTFYDILLPTMQTFNILNENETEVSSIGGGGGSSGGGGGGSSGGAGADGSGDFRQNNQNNRNQLQKDFEQNQFNNLLTVNWNELLKQYKLIECRFRTSITQLRQQNVKKFLLKLTDDLNSTATEIFDDSPTKMASTTASAKNIFYCSLCLNIFYRKENLTVAASTLGTLGQYPHQNPPETSNNFFLRKKSTELKYLCAGCKRTNRPSLNETIRLYKKYERLGLETIGTSAGTSDGTSGTGTSGTSGPATMKLVLPEAIPIKCQLDNAMKWRFRVRKFLQKSDIQRALDKFKMGLMEMERVETTENRMSDVNNKKMFDGLMRIATATATTTTATTATTATMTDMNLNDIKPNDDEEFLYQIKLSNFQTTFNHLYSIESSSSSSSSSSSIYKRPYQNLPKIDHPVIDLPTKLIIELEYLLFEGDLLLIDCPEIQELWNFLLATQPNIKTSQLIYELEENSRQRRRQQKQQQQQQQRHRQQQQHHKMEEKLENVNEKCPIEMETTAAAAAAAAAAVAVAVPVVAELATYESKLINRQSVIVENFQHNHSIDQTTAAAAASPPLIATIEKLTATTELPTKSVAELPSSTPIPSSSSSSSPSPSPSSPPPLPPPPPPPPPPPSLIPNEVNHNMDIIDEITKSIQYSMDCEANFVEQRLKRKRKRKRRGGGGAGGSRRNSRSYRNGTTTKTTKDGVDGDFLQHHQNGNKEEVEEEEEEMESSQQQQQQQQQEIIEMCVPEICKLPIGDEVHWIQCDGVCNRWYHMECVNINPMIVKDDDVFICKKCQGPTDPPSPPPPKRQNNKTKSSKSKRAATATAVTATTAVTTTTTTPVTTSMMIQTKPNKKLVKLKEELKIAQQLMDIIENDANEVESWKKRRNERDERHFEDDDDDDVHSEDDDEDGDDDEDEDDGDEDGDDGDDGDGNENKITKPIPSPQPMPHLMVQQQQQQQQQQQQQQSMPQHPIRQQSIPPPPPPPPPPPPLMMMRMIPAPSQPTHLTFNHFITDFNPSSSRNNNNNNKSQQQFCEKMENIEKQRNDFGAPPPPPPPPPPPSLSGLSSPPSSGLSQLKCGLSGLSQPSQSILMSRLSSPSPSPLSSPRPPSANYKQQQQHRHLVIVSNPQNILLMQRSAQPPPSSLPPLSLSSSQQQQQQQRYQQQHQQRYQQQQQQPEPDPQQHQY

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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