Basic Information

Gene Symbol
C08B11.3
Assembly
GCA_027564275.1
Location
JANSTW010055723.1:2725-11735[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 5.7e-09 1.3e-05 26.3 0.0 40 89 63 110 60 110 0.90

Sequence Information

Coding Sequence
ATGCAATGGATAACAGGATGGTTGATTTGCCTAATTTTAACTTTTTATTCCATATTTGGACTTTTTAATTATTCTAAAACAGGTGACATAAGTGACTGGTATGCAATACTTTATACCTTAGCAGGACGACCTTCGTTTGCTTTTGCATTAGGATGGATTACCTTTGCGTGCGAAACAAATCATGGAGTAGTTTCTCTTGGTGGATTTCAAAAAGTTTCTAACGGGGAAAGATGGGCGGAGGTATTACGTGAGATATCTCTTGATGAAGATATTCAAATGGCTGAGTATGGTATTAAAATGATTTATATGCGTTTTTTGTCTAAATATGAGCAGAATGAATTGGGCAATGAAGCAGACGAGCATGACAACGATTTGTTAGGTAGTAGAACGCGTCTCAAAAATTTTGCTTTAGTTGCTAATACAGAATCTCCTGTTCCGATGCCAAAACATTACGGCTTTACTGAAAATGTGGAACCCGAATATCGCAAAATAGTTAAATCTCTTCTAAGTGGACTGCCAAATGAAGTTGATTTTGCCATAAATATTTGTACCTTACTTTCTCATCCTGGTCCATATTTATTACGAATTTCGGATTGCCCTCAGCTTCTTACCACACTTATTGCACATTGTGGCATTTTCGCAGATGATGACTCCAGTCTATCAGATCTCTACTTTAATTCTTGGAAGAAACAATCAAATCATGATTATTGTGTATTTTGGAAAGAGGCAGGTATACACGAAAGTGATATTTTGGCATTGTTGCCTACCGATCAAAAGGTTAAAAATACTTCCGAAGTTTCAACTAGCACATATAGTTTAGAAATGCTTGAAAAATTTTTTTCTATTACTGATGGACGAATTGATTTAAAAGAAGTGAAAAGCTGGCGTGTTTTCCACGTGCTTTCCATTCTTCGAAATCTTTCTTTTGAAGAGTGCAATAAGACTTCTATGGCTGAAAATTTGCCCTGTTTAAAATTTTTGTTAGCTTGTTGTTATTCAAAATATCAGGTTTTAATCAGCAATGCTTTTGATACACTCAGCAATATCTCTTCTGAGATTGATCTCAATACAGAAGGTTCCGTCTTTGAAAATTATTTATTACTTAAGTTAATATCAAAGGGCCTTTTCTCAAATGACAAATTCGAAATTCTTCGTTCCCTGGAAATTTTGACGGGACTTTGCTATACTAAAAATAACGAATCGTTAATTTGTGATTTTGTTGACGAAACCATCTTGACACGGATATTTACTCTGGTTACTATTAAGGATATTTTATTGTGCATTTTTACTTTGGAAACAATTTATCAGATGTCTGAGATGGGTCGACCTTCATGTGAAGTTCTTAGCCGTTATAATCATAGTGTAGATATACTTGTTGACTTGGCAACTTCGGACGCAGCATCATTTGGTGTTTCCGGTTTAGCTGGCATTAAAGTTGTTGAAATTCATGGATTAACTGGCCAGTTACAACCATATCATCCTCCACAAAAATTACCAAATACTGTTCAAAATAATATGTCTAATGCTTCAACTTCTGTAAAATCTACTTTTGCACCTCCAGCTTCTTTAAATTCAACTAATCGATTTCCGTACTCTACGTCAATTCCTTCAAATTCTATGGTCCAGTCATCTACTACAAAGCCTCTTCAACCCTCTAATACTTATAATCAACATCATCATTATCAGTCGTATGTGCCGCCGTCACCCTCACCATTGGCTACGCACATAAGACCTTCGTCTGTGGCACCTATTTCGGCACCAAATGCTTCGTCCTTTTCTTATATAACTTCGACGCCTGTATCAAATGTATTGAGTTCGGCCGCTAATATGAATAACGGCATTCTAACAGCTCAGACACCCGCGTCAAATACTTGTAATGTAATTACACCTATATCGAAATCGAAAAGCTTTTCAAAGAAGTTAACTAGTGGAAGAACTTTTAAATCACGGTCTTCTGTTAAGAATTTGTCATCTGCTCTCTCGGTTGCTATCGATCGTTCTCCTCCACAAGCAGTACAAGATGTTGTAGCGGCAATTGCTTCAAATATTCAAGCAAATAAAGACAATTCTTTACTTAATGCTAACGGTAATAATGGGGAAAGCAGACTGGAACAACTAACTAAATCATGGATTAATGAACATTGTATATTGGAGGAAAACTCTATTGCGAATCGAGGAGATATGTACGCTTGTTATGTTGACTACGTTCGAGCTGAATATAACATATTAGCATGCAGTATGCAAATGTTTATAAATCAGCTAAAGACTATTTTTCCATCAATTACTATTACGCATTCACCCGGTAGTACTATTCATGCTGTTGAAGGATTGCGATTTTTAAAAGATGGCAAAAGTAATGTTTTAACAAAATCAGTACCAGAAAAAGCCTTTAATGTAGCTGCTCAACATCCGTTAATGCAACAAATGTTGTCTTCTCCTTCTGCTTTATCAGTTACGGGTATAAATGAACAGGCTAACAATTATTTACCTTCAAATCCTGTTAATGGAATTGTGGTACGAGATAACCCTAACTTATCAGTTAATGAAAATAAATCAAGTGATATTTTAAATGGCATTGCTTTAACAGATAAGAAGATTTTATTAAACACTGAGAATGAAAACTATCTCTTGGCAAAAGGTGTTCAAAAGATATCAGATTATAACGGTGGATCTCTTTTATGCAATGGTTCTGATGTATTAAAAAATTCAATTGGTGAGGTAAATCAAAATGTCAACATGAATAACAATGGTGATAAGAAAAATGATTTAAATGGCGTTTCGGATCAATTGGAGGATGTTAAATTTATTGAAACAATTAATGGAACTTTAACAGACAATATGGATGAAATTCATAATTCTATTAAAACCGATATTGAACAACAACCGTTGAAAACAAATTTGAATCAAGGAAAAAATAATTTTGAATCAAAAGAATTTCAAAATGGTTGTGACAGCATTAATCATACTTTGTCTATTAATGAAGGTGGAGATCGCTTAATAATGCCTACTTTAGTGCCATTAGATCCTTCATCACAGCCGCATCCGGTTTTTCTTGAAGACAAAGAATCTAAAGATTTATTAAATGGACTTCCTATCAAAGGGAAAAAGAGGTTGGCTACATCTAATGGTTTGTCTAAAAACTTTAATAAGAAGTCAAAAGTTTCTACAACAAAAAGTAGTTTTTCATCTTTAACAAGTAATTTGACTACAGATTGTTCAAATTTTTCTAATGCAGCTTCTTCTGAAGCAAATTATATTTACGAAATGGGTGCTCCACCGCCAATGACTAGTTTGAGTAAAGTAACAAGCAACGGGACTAGGCAAGGTTCATCGACTATTAATAACGTCAGTGATATTTCAACACAAAGGATTGTTTATGACGTATCCATACCGTCAACTTCATCTGTTCAGGGCGATTATATGTGCGAGTGGGATGGTTGTGGAAGATTTTTTACATCAGCAAATGCAATGCTTTTTCATAATACAAATGATCATTTACAAAGACCGAATGAAAATTCTAACCATACCAATACTGTTGGTTGTTTAGAGAAATGTAAGCCAAAAATATCCGAGCCTTTAATAATTTGTCGATGGCCGGCTTGTGACACAACACCGCGCTCCAAATGGTCGACTGTATCTCATTTGCAGGATCATCACTGTACAGAATCTGTTCTTCAATTTGCCTATCGAAAACGTCTTGAGATGGGTCACTTAAATTATATGACATTTGTTAAGCAAAGAATAGAGAAATTAAAAGAGGAAGATATAATTCAACAACAGCCAAACCAAACAATACATCCAGGTTATTCAAGATTTGCAGCTGTAGACGCTATTAAACGACATGCGTTTTCATTTTTACCGAAAGATATAACTGAGGATTCTGAAGGTCCGGTTACTAGAAGCATGAGACTAACAAGTTGCTTAATTTTAAGGAATATTGCTAAACACTCTGTTGAAGGACGAAGGAAAATTCGTAAGCATGAATCTTATCTAAGTTGGATGGCATTGTCAAAAATGGAATCAAGTGCGGCTTTGGCACAATGCCTTGGTGAACTTGCTACACATTCTATAATCCCAACTGACATTTCTTTATTTCCTAATTTTTTGCAAATGAATAGTGAAGCAAGGAGCATAATATCTAGCAATAACGTTACATTGAGCAAAGGAATTGAAGGTGACAAATAG
Protein Sequence
MQWITGWLICLILTFYSIFGLFNYSKTGDISDWYAILYTLAGRPSFAFALGWITFACETNHGVVSLGGFQKVSNGERWAEVLREISLDEDIQMAEYGIKMIYMRFLSKYEQNELGNEADEHDNDLLGSRTRLKNFALVANTESPVPMPKHYGFTENVEPEYRKIVKSLLSGLPNEVDFAINICTLLSHPGPYLLRISDCPQLLTTLIAHCGIFADDDSSLSDLYFNSWKKQSNHDYCVFWKEAGIHESDILALLPTDQKVKNTSEVSTSTYSLEMLEKFFSITDGRIDLKEVKSWRVFHVLSILRNLSFEECNKTSMAENLPCLKFLLACCYSKYQVLISNAFDTLSNISSEIDLNTEGSVFENYLLLKLISKGLFSNDKFEILRSLEILTGLCYTKNNESLICDFVDETILTRIFTLVTIKDILLCIFTLETIYQMSEMGRPSCEVLSRYNHSVDILVDLATSDAASFGVSGLAGIKVVEIHGLTGQLQPYHPPQKLPNTVQNNMSNASTSVKSTFAPPASLNSTNRFPYSTSIPSNSMVQSSTTKPLQPSNTYNQHHHYQSYVPPSPSPLATHIRPSSVAPISAPNASSFSYITSTPVSNVLSSAANMNNGILTAQTPASNTCNVITPISKSKSFSKKLTSGRTFKSRSSVKNLSSALSVAIDRSPPQAVQDVVAAIASNIQANKDNSLLNANGNNGESRLEQLTKSWINEHCILEENSIANRGDMYACYVDYVRAEYNILACSMQMFINQLKTIFPSITITHSPGSTIHAVEGLRFLKDGKSNVLTKSVPEKAFNVAAQHPLMQQMLSSPSALSVTGINEQANNYLPSNPVNGIVVRDNPNLSVNENKSSDILNGIALTDKKILLNTENENYLLAKGVQKISDYNGGSLLCNGSDVLKNSIGEVNQNVNMNNNGDKKNDLNGVSDQLEDVKFIETINGTLTDNMDEIHNSIKTDIEQQPLKTNLNQGKNNFESKEFQNGCDSINHTLSINEGGDRLIMPTLVPLDPSSQPHPVFLEDKESKDLLNGLPIKGKKRLATSNGLSKNFNKKSKVSTTKSSFSSLTSNLTTDCSNFSNAASSEANYIYEMGAPPPMTSLSKVTSNGTRQGSSTINNVSDISTQRIVYDVSIPSTSSVQGDYMCEWDGCGRFFTSANAMLFHNTNDHLQRPNENSNHTNTVGCLEKCKPKISEPLIICRWPACDTTPRSKWSTVSHLQDHHCTESVLQFAYRKRLEMGHLNYMTFVKQRIEKLKEEDIIQQQPNQTIHPGYSRFAAVDAIKRHAFSFLPKDITEDSEGPVTRSMRLTSCLILRNIAKHSVEGRRKIRKHESYLSWMALSKMESSAALAQCLGELATHSIIPTDISLFPNFLQMNSEARSIISSNNVTLSKGIEGDK

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
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80% Identity
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