Basic Information

Gene Symbol
rbr-2
Assembly
GCA_027564275.1
Location
JANSTW010008896.1:8352-15961[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 1.4e-21 3.3e-18 66.7 1.1 5 88 14 91 11 92 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
CTTAATGAAATAGATGCTCTCTTTCGTGTTCGTATTATTTTTATTAACAAACTTGTTAATTTTTGGCACTTACAAGGTCAACAATTCCGATTACCATGGGTGGAAAACAAATACATTGATTTATATCGACTTCGTAAGTTGGTTGAAGAATTTGGTGGCTTGAAGAAAATTAATACTGAGAGGAAATGGTCTCAAATTGCTAAGCAACTGGGCTTTAAAAATTCTAGTGCATCTAGTCTTAAACAAAATTATACCAAATGGGTTTATCCTTACGTTAAAAGTATAGAAAAAGTAGAAGATGAGGACGAAAAAGACAAAAATACTCTAAATCCTTCTAGCAACATAAAATCGGAAAAGTGTAGTGTATTGAATCAAACACAAATGCGTCGTAAATCTGGAAGAATGATGGCTGGACTTAAACAAAAGCCGTTACCTTCAATTGATAAAAGTAGTTTGGCAATTGATTTGGTCTATTGTAGTAAATGCGGTGGTGGTGGAGATGAAGATCGACTTTTGCTTTGTGAATCATGTGATCGTCCTCTTCATACATATTGTCTTGATCCCCCTTTAAATGCTGTACCTAAAGGTGAATGGCGTTGTCCGCAATGTGTTGAAAATGCTGTAAAAAAAGTATCATTTGAATTTGGTTTTTTGGATTCAAATATGAAGTTTAATTTGGATACATTTGGAGAATGGGCCAACAACTTTAAACAAACTTATTTTAATCAAGCGCCGTGTGATGTATCATCTGAAATTGTTGAAACAGAATTTTGGCAAAATGTTATCAATATTGATAAAGATGTTTCTGTAAAGTATGGGGCTGACTTGATCACAAGTAAAATGGGCAGTGGATTTCCTCGAAAAACAGATTTATTTAAAGGTGTTGATGCAAAAGAAAAAATTTTTTATGCGAATCATCCATGGAATTTAAATAATTTACCTATTTTACGAGAATCTGTTTTGAGTCATATTAATACGGATATATCTGGAATGATGGTGCCATGGGTATATGTTGGAATGTGCTTTAGTACGTTTTGCTGGCATGTGGAAGATCATTGGACGTATAGTATTAATTATAACCATTGGGGTGAACGTAAAGTATGGTATGGATTAGCTGGAAAAGACGCGGAAAAATTTGACCATATTGTTCGTAATTGTGTGCCAGAACTATTTATTACTCAACCAGACCTTTTGCATCATATGACAACCTCGATGAATCCACGTTTCCTTATTGATAAAGGTCTTTCTATTTATACTGTGCATCAAAATCCTGGAGAGTTTGTTGTCACTTTTCCAAAAGCTTATCATGCTGGTTACAATGAAGGGTTAAATTTTGCTGAGGCTGTAAATTTTGCGCCTTCTGATTGGCTTTATATGGGACGTTTATGTTTACGTAATTATGCAAGTGTTCGACGTACTTGCGTTTTTTCTCATGAGGAATTAGTTATGCAGATGGTACATATGTCAGATAAAATGAATATTGATATGTGTTTGGCTACTTTGGAGGAACTTTGTTACATAACATCACATGAAACGAAGTTTCGTAAATATTTGGCTGAAAAGGGACTTTATAAGAGTGAATTTTACAAGTTTGAAAATATTCCTGATGATGAGCGATCCTGTCAAATTTGTCGAACTACATTGTATATTTCAGCTTTAGTTTGTAAACATGCGCCGTCCAAAATTGTTTGTATGAACCATGTTGAGGAACTTTGCAATGAATGTTTAATAAGTGATTGCTTTTTACGATATCGGTATACTCTAGAAGATTTTATTCCTTTGGCTGATAAACTTGCTCATCGGACAAATGCTTTTGAAAATTGGCGCAAAAAAATATATCATTTGGGAGATGTAAAACAAGGAAACAGAGTTAAAATGCAAGTTAGTGATTTGCGTGATTTGATTGAAACTTGGAAGTCGAAACGTTATCCGCATTGCAGAGAAATTACTGAAATAATGGATGTAGTATCTCGATTCGATAAAATTGCGTTTACTGTAAACAAGATTATAAATCGTAAAATTCGCTTAAGAGACAATACAAGATGTCAAAAGGCAGATACTCGTTATGAATTCAGTGAATTAGAACGTCTTCGAAATGAATTAAACGAATTAAATATAATGGACGAAAACTTAGAAATGTCAATAAAGTCTTTGTGCGATCGAATAACGAAGTGGCGATTCAAGATTAATGAAATTTTGCCATCTTTTAAAGAAATTTATCATGGTATTAAAGGCGTCGATAATCTTTTGGGACTTATCTATGAAGGCGAAGAATTTAACCTTAAATTGTCTGAAATGGATTTGTTGAAAAAGGAACTAAATCGTTGTCAGTGGCTTTTACGTGTAAATCAAATCATCCATTGGGATCAATGTGGTCAAAACCAAAAAAAAATTAAAAAAAATCAAAGTGTTTTTGTTTCAACAACTAAATTAGAATCTAGGTTGCAAGACAAAAGTAACGATTGTGAAACCTGTATTGAAAGTGAGTTTAGGACTTACAAAAGTGATATTGATAATGAGAGCGAAGAAGAACAGTCAGAAATTGTTCGTTTTACTTCTAGTTCTGTAAAGAAATTAATTTTGGAAGGAAACAGGTTTAAGGAAGGTACTTCTGATATTGTAAAACAATTTAACGATATGCTTCTTGACATGCATAATTGTGGATTAGAATGTGAACTAAAGGCAAAAGAATTTCTTCACAATTGCGAAGGAATTGGTTTTATGGTGGCTGAAAAATGTTGGCTTGAAGACTTGCACAAAGCTGATTGGCTTGACTCAGAAATTATGAATTTATTTAGAGAGGAACTTGAAAATTCGCTTGAAATTGAACGTCAGTTTTCAGAAATAATTGAATGCGACAATGCAAAATTATCTTTGAAAGTTATTGAATGTTTACTTACTCAGTGTGAACGTTCACTTTTTGAACGTAATGGAAAAAATTATATAAAATTGTTGGATTTGCATACGAGACTCAAAAAATTTGTTGAGAAGATTACAAACATGTTTCAAAAATCTGTTGGTTATTATAACGTCTTTGAGATAATTGCAGGACGCGATGACTTAACAGCTTTGGTAGAAGGTGATCTATTACCACGCACTCTGTTTACTTCAACTCGATATAATGATAACTTTAGTCAACTTAAACAATTTAATACTAGTCATTTCTTAACTGATCATTTAACTGCAATTGCTGAACAACAATCAAATTTATTAATGGCATTACGCATTGTTAATGAAGAACGTTCGCTGAAAGAAACTTGTATTTGCGGACAAGACTCAGTAAAATCATCAAGATCTACACCTTCCCTTGACGAAACTTTACATGAATGTACATGTGCACAATGGGAGCCATTTATGGACCGTTTACCTGTAGGTATTTTTTTATGTCCGCGATGTATGAGAAGTCGTAGACCATGTATAGAAGATGTAGAAGCTGCATGCGAATCTGCACCACACAATTCTTTAGAACATTTGTTAGTAGATAGTTTAGTAAAACGATCTACGAAAGCATTTTGTAATTTGCAAAGAAATGTTTATGATATTTCAAGTTATGACGACTTTTCAACTTTATCAGTTGAACAAAAACTATTGATTCAAGAGTTCTTTGTGATGGCATTTTCTTTAGAAATAATGGATGTAGAAGCATATAAAATGGCATTTTCTTCGGCGCATTTCACAAAAATTTTTCCTATAAGCAATGAACAGATTGCTGTTTGGCGTCGTATGCAGTTACGAATGGTAGAAGCTTTGCCGCGCCAACTTATTTTTTCTTCCCATTTACCCAGTTCATCATCTGGAACCAGATCTTTACTTGCACCAAACTCTGTACCTTCTCGTAGAAACGGTAAACGTCATAATGCTGGATGTTTAATGCAATCTGCAAATAACTTTTCTATGAATAACGGCGGGCCTATAAGTCAGTTACAAACAGAAGAGTTTATGGAAATTTTAGATGCTAATTTACTGCAAAATGATGCTCCAAAAGAAGATTTGGCCAAAAATAACTTAGCAATTGCTGGTACGTATGGAAAGAAGAAGTGTCGTGATTCAATTTATCGACACGGTGATAAAGAATTTTGTGCGGCGGATAAATGCCTTAGGCCATACAGTAAGTCAAATTCTTTTATCTATTTATAA
Protein Sequence
LNEIDALFRVRIIFINKLVNFWHLQGQQFRLPWVENKYIDLYRLRKLVEEFGGLKKINTERKWSQIAKQLGFKNSSASSLKQNYTKWVYPYVKSIEKVEDEDEKDKNTLNPSSNIKSEKCSVLNQTQMRRKSGRMMAGLKQKPLPSIDKSSLAIDLVYCSKCGGGGDEDRLLLCESCDRPLHTYCLDPPLNAVPKGEWRCPQCVENAVKKVSFEFGFLDSNMKFNLDTFGEWANNFKQTYFNQAPCDVSSEIVETEFWQNVINIDKDVSVKYGADLITSKMGSGFPRKTDLFKGVDAKEKIFYANHPWNLNNLPILRESVLSHINTDISGMMVPWVYVGMCFSTFCWHVEDHWTYSINYNHWGERKVWYGLAGKDAEKFDHIVRNCVPELFITQPDLLHHMTTSMNPRFLIDKGLSIYTVHQNPGEFVVTFPKAYHAGYNEGLNFAEAVNFAPSDWLYMGRLCLRNYASVRRTCVFSHEELVMQMVHMSDKMNIDMCLATLEELCYITSHETKFRKYLAEKGLYKSEFYKFENIPDDERSCQICRTTLYISALVCKHAPSKIVCMNHVEELCNECLISDCFLRYRYTLEDFIPLADKLAHRTNAFENWRKKIYHLGDVKQGNRVKMQVSDLRDLIETWKSKRYPHCREITEIMDVVSRFDKIAFTVNKIINRKIRLRDNTRCQKADTRYEFSELERLRNELNELNIMDENLEMSIKSLCDRITKWRFKINEILPSFKEIYHGIKGVDNLLGLIYEGEEFNLKLSEMDLLKKELNRCQWLLRVNQIIHWDQCGQNQKKIKKNQSVFVSTTKLESRLQDKSNDCETCIESEFRTYKSDIDNESEEEQSEIVRFTSSSVKKLILEGNRFKEGTSDIVKQFNDMLLDMHNCGLECELKAKEFLHNCEGIGFMVAEKCWLEDLHKADWLDSEIMNLFREELENSLEIERQFSEIIECDNAKLSLKVIECLLTQCERSLFERNGKNYIKLLDLHTRLKKFVEKITNMFQKSVGYYNVFEIIAGRDDLTALVEGDLLPRTLFTSTRYNDNFSQLKQFNTSHFLTDHLTAIAEQQSNLLMALRIVNEERSLKETCICGQDSVKSSRSTPSLDETLHECTCAQWEPFMDRLPVGIFLCPRCMRSRRPCIEDVEAACESAPHNSLEHLLVDSLVKRSTKAFCNLQRNVYDISSYDDFSTLSVEQKLLIQEFFVMAFSLEIMDVEAYKMAFSSAHFTKIFPISNEQIAVWRRMQLRMVEALPRQLIFSSHLPSSSSGTRSLLAPNSVPSRRNGKRHNAGCLMQSANNFSMNNGGPISQLQTEEFMEILDANLLQNDAPKEDLAKNNLAIAGTYGKKKCRDSIYRHGDKEFCAADKCLRPYSKSNSFIYL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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