Dfer010295.1
Basic Information
- Insect
- Diadocidia ferruginosa
- Gene Symbol
- rbr-2
- Assembly
- GCA_027564275.1
- Location
- JANSTW010008896.1:8352-15961[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 1.4e-21 3.3e-18 66.7 1.1 5 88 14 91 11 92 0.94
Sequence Information
- Coding Sequence
- CTTAATGAAATAGATGCTCTCTTTCGTGTTCGTATTATTTTTATTAACAAACTTGTTAATTTTTGGCACTTACAAGGTCAACAATTCCGATTACCATGGGTGGAAAACAAATACATTGATTTATATCGACTTCGTAAGTTGGTTGAAGAATTTGGTGGCTTGAAGAAAATTAATACTGAGAGGAAATGGTCTCAAATTGCTAAGCAACTGGGCTTTAAAAATTCTAGTGCATCTAGTCTTAAACAAAATTATACCAAATGGGTTTATCCTTACGTTAAAAGTATAGAAAAAGTAGAAGATGAGGACGAAAAAGACAAAAATACTCTAAATCCTTCTAGCAACATAAAATCGGAAAAGTGTAGTGTATTGAATCAAACACAAATGCGTCGTAAATCTGGAAGAATGATGGCTGGACTTAAACAAAAGCCGTTACCTTCAATTGATAAAAGTAGTTTGGCAATTGATTTGGTCTATTGTAGTAAATGCGGTGGTGGTGGAGATGAAGATCGACTTTTGCTTTGTGAATCATGTGATCGTCCTCTTCATACATATTGTCTTGATCCCCCTTTAAATGCTGTACCTAAAGGTGAATGGCGTTGTCCGCAATGTGTTGAAAATGCTGTAAAAAAAGTATCATTTGAATTTGGTTTTTTGGATTCAAATATGAAGTTTAATTTGGATACATTTGGAGAATGGGCCAACAACTTTAAACAAACTTATTTTAATCAAGCGCCGTGTGATGTATCATCTGAAATTGTTGAAACAGAATTTTGGCAAAATGTTATCAATATTGATAAAGATGTTTCTGTAAAGTATGGGGCTGACTTGATCACAAGTAAAATGGGCAGTGGATTTCCTCGAAAAACAGATTTATTTAAAGGTGTTGATGCAAAAGAAAAAATTTTTTATGCGAATCATCCATGGAATTTAAATAATTTACCTATTTTACGAGAATCTGTTTTGAGTCATATTAATACGGATATATCTGGAATGATGGTGCCATGGGTATATGTTGGAATGTGCTTTAGTACGTTTTGCTGGCATGTGGAAGATCATTGGACGTATAGTATTAATTATAACCATTGGGGTGAACGTAAAGTATGGTATGGATTAGCTGGAAAAGACGCGGAAAAATTTGACCATATTGTTCGTAATTGTGTGCCAGAACTATTTATTACTCAACCAGACCTTTTGCATCATATGACAACCTCGATGAATCCACGTTTCCTTATTGATAAAGGTCTTTCTATTTATACTGTGCATCAAAATCCTGGAGAGTTTGTTGTCACTTTTCCAAAAGCTTATCATGCTGGTTACAATGAAGGGTTAAATTTTGCTGAGGCTGTAAATTTTGCGCCTTCTGATTGGCTTTATATGGGACGTTTATGTTTACGTAATTATGCAAGTGTTCGACGTACTTGCGTTTTTTCTCATGAGGAATTAGTTATGCAGATGGTACATATGTCAGATAAAATGAATATTGATATGTGTTTGGCTACTTTGGAGGAACTTTGTTACATAACATCACATGAAACGAAGTTTCGTAAATATTTGGCTGAAAAGGGACTTTATAAGAGTGAATTTTACAAGTTTGAAAATATTCCTGATGATGAGCGATCCTGTCAAATTTGTCGAACTACATTGTATATTTCAGCTTTAGTTTGTAAACATGCGCCGTCCAAAATTGTTTGTATGAACCATGTTGAGGAACTTTGCAATGAATGTTTAATAAGTGATTGCTTTTTACGATATCGGTATACTCTAGAAGATTTTATTCCTTTGGCTGATAAACTTGCTCATCGGACAAATGCTTTTGAAAATTGGCGCAAAAAAATATATCATTTGGGAGATGTAAAACAAGGAAACAGAGTTAAAATGCAAGTTAGTGATTTGCGTGATTTGATTGAAACTTGGAAGTCGAAACGTTATCCGCATTGCAGAGAAATTACTGAAATAATGGATGTAGTATCTCGATTCGATAAAATTGCGTTTACTGTAAACAAGATTATAAATCGTAAAATTCGCTTAAGAGACAATACAAGATGTCAAAAGGCAGATACTCGTTATGAATTCAGTGAATTAGAACGTCTTCGAAATGAATTAAACGAATTAAATATAATGGACGAAAACTTAGAAATGTCAATAAAGTCTTTGTGCGATCGAATAACGAAGTGGCGATTCAAGATTAATGAAATTTTGCCATCTTTTAAAGAAATTTATCATGGTATTAAAGGCGTCGATAATCTTTTGGGACTTATCTATGAAGGCGAAGAATTTAACCTTAAATTGTCTGAAATGGATTTGTTGAAAAAGGAACTAAATCGTTGTCAGTGGCTTTTACGTGTAAATCAAATCATCCATTGGGATCAATGTGGTCAAAACCAAAAAAAAATTAAAAAAAATCAAAGTGTTTTTGTTTCAACAACTAAATTAGAATCTAGGTTGCAAGACAAAAGTAACGATTGTGAAACCTGTATTGAAAGTGAGTTTAGGACTTACAAAAGTGATATTGATAATGAGAGCGAAGAAGAACAGTCAGAAATTGTTCGTTTTACTTCTAGTTCTGTAAAGAAATTAATTTTGGAAGGAAACAGGTTTAAGGAAGGTACTTCTGATATTGTAAAACAATTTAACGATATGCTTCTTGACATGCATAATTGTGGATTAGAATGTGAACTAAAGGCAAAAGAATTTCTTCACAATTGCGAAGGAATTGGTTTTATGGTGGCTGAAAAATGTTGGCTTGAAGACTTGCACAAAGCTGATTGGCTTGACTCAGAAATTATGAATTTATTTAGAGAGGAACTTGAAAATTCGCTTGAAATTGAACGTCAGTTTTCAGAAATAATTGAATGCGACAATGCAAAATTATCTTTGAAAGTTATTGAATGTTTACTTACTCAGTGTGAACGTTCACTTTTTGAACGTAATGGAAAAAATTATATAAAATTGTTGGATTTGCATACGAGACTCAAAAAATTTGTTGAGAAGATTACAAACATGTTTCAAAAATCTGTTGGTTATTATAACGTCTTTGAGATAATTGCAGGACGCGATGACTTAACAGCTTTGGTAGAAGGTGATCTATTACCACGCACTCTGTTTACTTCAACTCGATATAATGATAACTTTAGTCAACTTAAACAATTTAATACTAGTCATTTCTTAACTGATCATTTAACTGCAATTGCTGAACAACAATCAAATTTATTAATGGCATTACGCATTGTTAATGAAGAACGTTCGCTGAAAGAAACTTGTATTTGCGGACAAGACTCAGTAAAATCATCAAGATCTACACCTTCCCTTGACGAAACTTTACATGAATGTACATGTGCACAATGGGAGCCATTTATGGACCGTTTACCTGTAGGTATTTTTTTATGTCCGCGATGTATGAGAAGTCGTAGACCATGTATAGAAGATGTAGAAGCTGCATGCGAATCTGCACCACACAATTCTTTAGAACATTTGTTAGTAGATAGTTTAGTAAAACGATCTACGAAAGCATTTTGTAATTTGCAAAGAAATGTTTATGATATTTCAAGTTATGACGACTTTTCAACTTTATCAGTTGAACAAAAACTATTGATTCAAGAGTTCTTTGTGATGGCATTTTCTTTAGAAATAATGGATGTAGAAGCATATAAAATGGCATTTTCTTCGGCGCATTTCACAAAAATTTTTCCTATAAGCAATGAACAGATTGCTGTTTGGCGTCGTATGCAGTTACGAATGGTAGAAGCTTTGCCGCGCCAACTTATTTTTTCTTCCCATTTACCCAGTTCATCATCTGGAACCAGATCTTTACTTGCACCAAACTCTGTACCTTCTCGTAGAAACGGTAAACGTCATAATGCTGGATGTTTAATGCAATCTGCAAATAACTTTTCTATGAATAACGGCGGGCCTATAAGTCAGTTACAAACAGAAGAGTTTATGGAAATTTTAGATGCTAATTTACTGCAAAATGATGCTCCAAAAGAAGATTTGGCCAAAAATAACTTAGCAATTGCTGGTACGTATGGAAAGAAGAAGTGTCGTGATTCAATTTATCGACACGGTGATAAAGAATTTTGTGCGGCGGATAAATGCCTTAGGCCATACAGTAAGTCAAATTCTTTTATCTATTTATAA
- Protein Sequence
- LNEIDALFRVRIIFINKLVNFWHLQGQQFRLPWVENKYIDLYRLRKLVEEFGGLKKINTERKWSQIAKQLGFKNSSASSLKQNYTKWVYPYVKSIEKVEDEDEKDKNTLNPSSNIKSEKCSVLNQTQMRRKSGRMMAGLKQKPLPSIDKSSLAIDLVYCSKCGGGGDEDRLLLCESCDRPLHTYCLDPPLNAVPKGEWRCPQCVENAVKKVSFEFGFLDSNMKFNLDTFGEWANNFKQTYFNQAPCDVSSEIVETEFWQNVINIDKDVSVKYGADLITSKMGSGFPRKTDLFKGVDAKEKIFYANHPWNLNNLPILRESVLSHINTDISGMMVPWVYVGMCFSTFCWHVEDHWTYSINYNHWGERKVWYGLAGKDAEKFDHIVRNCVPELFITQPDLLHHMTTSMNPRFLIDKGLSIYTVHQNPGEFVVTFPKAYHAGYNEGLNFAEAVNFAPSDWLYMGRLCLRNYASVRRTCVFSHEELVMQMVHMSDKMNIDMCLATLEELCYITSHETKFRKYLAEKGLYKSEFYKFENIPDDERSCQICRTTLYISALVCKHAPSKIVCMNHVEELCNECLISDCFLRYRYTLEDFIPLADKLAHRTNAFENWRKKIYHLGDVKQGNRVKMQVSDLRDLIETWKSKRYPHCREITEIMDVVSRFDKIAFTVNKIINRKIRLRDNTRCQKADTRYEFSELERLRNELNELNIMDENLEMSIKSLCDRITKWRFKINEILPSFKEIYHGIKGVDNLLGLIYEGEEFNLKLSEMDLLKKELNRCQWLLRVNQIIHWDQCGQNQKKIKKNQSVFVSTTKLESRLQDKSNDCETCIESEFRTYKSDIDNESEEEQSEIVRFTSSSVKKLILEGNRFKEGTSDIVKQFNDMLLDMHNCGLECELKAKEFLHNCEGIGFMVAEKCWLEDLHKADWLDSEIMNLFREELENSLEIERQFSEIIECDNAKLSLKVIECLLTQCERSLFERNGKNYIKLLDLHTRLKKFVEKITNMFQKSVGYYNVFEIIAGRDDLTALVEGDLLPRTLFTSTRYNDNFSQLKQFNTSHFLTDHLTAIAEQQSNLLMALRIVNEERSLKETCICGQDSVKSSRSTPSLDETLHECTCAQWEPFMDRLPVGIFLCPRCMRSRRPCIEDVEAACESAPHNSLEHLLVDSLVKRSTKAFCNLQRNVYDISSYDDFSTLSVEQKLLIQEFFVMAFSLEIMDVEAYKMAFSSAHFTKIFPISNEQIAVWRRMQLRMVEALPRQLIFSSHLPSSSSGTRSLLAPNSVPSRRNGKRHNAGCLMQSANNFSMNNGGPISQLQTEEFMEILDANLLQNDAPKEDLAKNNLAIAGTYGKKKCRDSIYRHGDKEFCAADKCLRPYSKSNSFIYL
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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- 80% Identity
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