Dtru033834.1
Basic Information
- Insect
- Deroplatys truncata
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_030765065.1
- Location
- CM060979.1:138143459-138146284[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- HTH
- Domain
- HTH_psq domain
- PFAM
- PF05225
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 17 2.8 3.7e+03 0.6 0.0 25 36 51 62 50 64 0.83 2 17 1.6 2e+03 1.4 0.0 25 36 67 78 66 80 0.84 3 17 1.6 2e+03 1.4 0.0 25 36 83 94 82 96 0.84 4 17 1.6 2e+03 1.4 0.0 25 36 99 110 98 112 0.84 5 17 1.6 2e+03 1.4 0.0 25 36 354 365 353 367 0.84 6 17 1.1 1.4e+03 1.9 0.0 25 36 546 557 545 559 0.86 7 17 2.4 3.2e+03 0.8 0.0 25 36 562 573 561 575 0.85 8 17 2.8 3.7e+03 0.6 0.0 25 36 626 637 625 640 0.85 9 17 1.1 1.4e+03 1.9 0.0 25 36 658 669 657 671 0.86 10 17 2.4 3.2e+03 0.8 0.0 25 36 674 685 673 687 0.85 11 17 2.7 3.5e+03 0.6 0.0 25 36 722 733 721 735 0.85 12 17 2.9 3.8e+03 0.5 0.0 25 36 754 765 753 766 0.84 13 17 1.8 2.3e+03 1.2 0.0 25 36 770 781 769 783 0.85 14 17 5.5 7.2e+03 -0.4 0.0 26 36 787 797 785 798 0.84 15 17 1.9 2.5e+03 1.1 0.0 25 36 818 829 817 831 0.85 16 17 2.9 3.8e+03 0.5 0.0 25 36 850 861 849 862 0.84 17 17 1.8 2.3e+03 1.2 0.0 25 36 866 877 865 879 0.85
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGACTAGAGTCAGAGGTGCTGAGTATCTGATCCTCCTATCACTAGAGTTTCCTATATCAGCCTATCATACAAACATCAAGTCTAAGGTGTGTCATATCACAGGCTATGATATTTCTACAAGTAGAAGGTCAGAGGTGGTAACTATCACAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTTAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCAATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCAATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCAATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCAATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCTATGATACTTCTGCAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTGCAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCACCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCACCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATGTTTCTACAAGTACAATCTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCACAGCCTATGATGTTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATGTTTCTACAAGTACAATCTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATGTTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATGTTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGACTATGATGTTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATATTTCTACAAGTGCAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATGTTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATATTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCTCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTGTTAACTATCGCAGCCTATGATACTTCTACAAGTACAATGTCAGAGGTTTTGCCTATCACAGCCTATGATATTTCTACAAGAAGAATTCTTGAGAATTCTCAGCCTATGATATTAATACAAATGGAATGTCAAGACGGTGGCCTATGA
- Protein Sequence
- MTRVRGAEYLILLSLEFPISAYHTNIKSKVCHITGYDISTSRRSEVVTITAYDISTSTMLEVLTISAYDISTSTMSEVLTISAYDISTSTMSEVLTISAYDISTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTIAANTSTSTMSEVLTIAANDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTIAANDTSTSTMSEVLTIAANDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTITAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTITAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDISTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTITAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTIAAYDTSASTMSEVLTISAYDTSASTMSEVLTISPYDTSTSTMSEVLTISPYDTSTSTMSEVLTIAAYDTSTSTMSEVLTISAYDVSTSTISEVLTIAAYDISTSTMSEVLPITAYDTSTSTMSEVLPITAYDTSTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTITAYDVSTSTMSEVLTITAYDTSTSTMSEVLTISAYDVSTSTISEVLTIAAYDISTSTMSEVLPITAYDTSTSTMSEVLPITAYDTSTSTMSEVLTISAYDVSTSTMSEVLPITAYDTSTSTMSEVLTISAYDVSTSTMSEVLPITAYDISTSTMSEVLTISDYDVSTSTMSEVLPITAYDISTSAMSEVLPITAYDISTSTMSEVLPITAYDTSTSTMSEVLTISAYDVSTSTMSEVLPITAYDISTSTMSEVLTISAYDTSTSTMSEVLTIAAYDTSTSTMSEVLPITAYDISTRRILENSQPMILIQMECQDGGL
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -