Dvit018588.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Daktulosphaira vitifoliae
Gene Symbol
jarid2b
Assembly
None
Location
scaffold89:331368-343236[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 3 3.1 1.1e+04 -2.7 0.1 12 30 1165 1183 1163 1206 0.76
2 3 3.6e-21 1.3e-17 64.4 0.0 6 89 1287 1368 1283 1368 0.92
3 3 2.6 9.5e+03 -2.5 0.0 49 63 1382 1394 1377 1419 0.74

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCATCTTTGAATGGTTTAGAAACAAGAAAACGTAAACAACAAAATAAAGAAGATTTTTTAATAGAATCAAACACAAAAAAAATCAAAGTTCAAGCTCAGCGCAAGTTTGCCCAAAATGCAGTTATACCTATAAGCTCACAACAAAAACCAGTTCAATCTCCATTAGTATCTAATAATGTGGTTAAACCTCCTACCAAAAGACCAAATACAGAAGACTTTCTTACATTTCTTTGTTTTAGAGGTACAAGCTTATTACCTCCACGATTAGATTTTTTTAACAAACCTCAACGTTCACTTACAGCTCAAGAAATTGCATCAGGAAAGAAAAGAAAAAAAAGTATTTCAACCCAGCCAACCAAAAATTTGGTTGATAATCAAGTTAGCAATGGTTCTAATGAAAAAAAGAAAGTGAAACAAATTATTCCTCAAACTAAATACCCATTATCAAAACTTGGACAAAAAGTTATAGGTCGTAATTTGGTTAGATCTGGATCAAGATTTGCTATTAGACAAGAAGCTATAACTTTGCGTCAACTTGCACTTCGACATGGTACCAAAATAAGAAAAATCAAGCCTCAAATTCAGAAAACTCAAAGTTCTCATAAAGTAAAATATGATATTAAGAATAAAGAAAAGCAACAGTCTCTTGATGGTAAACAAAATAAATTTAAAGGACGTATAACAAGATCAAATTCATTGCCAAATGTATTCGGCCCTGGCATAAACCAACTTCGAGATGATAAAGGTAAATGGTGTAAGGGCAAAACCTCTTCAACGACATCTAAAGATTCTGACATTGAAGAAAGATCATCTAGGAAGAAAAGTTCATCTAAAACTGTTGAATGTCGTAGTAATAGTTTGATAGATATTAAACAAAATGATTCAAAAGCAAATTCTAACCATAGAAAAACCAGAAGCTTAGTTTTGAAACACCATGAAAATTGTAACAAGAATTTAGAAATATTTGACAAAAACACTAAGACTGCATCATCTAAGTTTAAATCTAGGAATATAACTGAAACAAAAATAATTCTTGATAAACATAAAGTTAGTAATGACAACAGAAGTTTTGATATAATGGTCCGTTCAAGGCCTCCCAGAAGAACTAAGGAAGCAGCAACTATATTCATGGATATGTTGAAAAAAGATATACAATGTTCTAATGAGAAAGAAGGTGATTCATCTTCTATAGAAAGTTTTCCTGAGCTGCCAAATATAAAAATAAAGGAAGCAAAAGAAACAAAGTTGAGTGCAATTGTTAAAACTAAACACCCATCAGTTACACAGGTGCGTTCAAAACAGAGCTCATGTAAAAGAAATTTAAGGCCTCGTCGCTCATCTACTGTACTTGATGATTATATAATGACTGATTCAGAAGATGATGAAACTTCTGGCCATAAAGTAGATATTAATAGCAAAAAATCTAGATCAACACCAACAACTAAAGCTGCAGAACCAAAAAAAGTATCTGTAATTAATTCTAATGAAATAGCTGAAAAAAATATTAAATTGAATAAGACTGAAATTAAGACAAAAAAAAGTTTGAACAAAGTAAATTCGGAAAGTAGCTTAGATCATAAAGATTTAGTTTCTGATTGTGCTATTTTAAAATGTGGAAAAGATCTTGATATTAAAAAAAATAATGAAAAAAGAAAAGAGAAACCAATTAAACATAAGACTGATAAATTTAATAGTAGAGTAACTGATAGAAATAATTCCATAGAATTAGCTAATAATTTGTCTTCTAAAGATTTACACAAAAAAGAAGATCAAAAAGGGAAAAAAACAAATTTAGATTTGTATAATAATAATAAGAAAAAATCGATACCATCATCTGCAATGTTCACTAATAATGCTAGTCAAACAAAAGATGAGCTCCTAGAACAAATGGCAGCTAATTTTGTAAACAAACATTTAGAAAATGATGATATAGAAAGTAAAAAGCTAGCTAACATAAATGTTTTGAGAAAACAATCGCCACCTAATATTGAAGAAGCAAATAAAAAGTCTAAAATAGGAAATATAGATGTTCAATCATTAAAAGGAGAAATTTGTATTGATAATAAAACAGATCAAATTGAAATTATTAATAAAATACAGAAAAGAGAAAATTTAGTGGTTAATGAGTTAGATAAAGTTGAATGTATACTAAATGAATCAGTTAAAAATGTTTTGGGTCCAGAAATAAATGATAATGTCAAAATTAATATACCTGAGTATTTTTCTAGTAAAAGTTTTCAACTACCTAAGTTTAAACAATCTGATGGTTTATCAGTTTTATCAGAAATTTGTAGTGCTCTTCCTAGGTTTAATGAACCATGCGTCTCAAACAAACAATTATTAACCAAGTTATCTATGTCATCTGAAAGTATTAATACAAAATATTCTGATGACAAAAAGGATGAAAAAACTTTTGAAAGTCGTACTATGAAAATTGTTAATTTAGCCAGAAATACCAATGAAAAAAAAGATCTAGCTTCTTGGAGACAGGCTTTTAAAAATGTTAAAGTACCAAAAAATGGTTTAAGTCCAAATGGAAACACCTGGATTAACAAAAAATTAATTGATAATCAAAGTAAGAAAACAGAAATCAGTTGTTCTACTAATGATATTGATCACAAACAAATATTAGAAAACAAAATTCATGACACTCTGAATTCTTCATTGGCTGAAGAAAAAAATATTGAAACTAAACACAGCTTGATTAATCATAATGAACCTAAAATTGATCCAGATAAAAAAGGAAACTCAAATTATTTAACTAAAACAACTATTTTACCCTGTACAAAATATGATCTGAAGTTTGAAAAAAGACTTTCTAAACAACAAAAATCTATGGAAGTAAATATTTTATCACAAGATGATCTAACTCCAGAGAAGAAAATTTTTCAACAAAGAAGGCTATCAACTGCTCAGTCTTGTAGTGGAAACAGTTCTGATGCTTTTTCCCCTGAAAATGAAACGAGTGTTTATGCTTTTCAACCTGATTTACCAGTTTCTAGTACTCCGTTCCGTAGAAATAAGACTCAGTCACCAATTAAATCAAGAACTGTATCACCCAATACATCTATTTCGGTGAATTTTGAAACTGATTTAATGGAAGGGAAATCACAATCTTCTACAAATTCAATAGATATTGAAAATGAAGAAGGTCGTTTGTTTTATATACCTTTACCAGCTGGAGTTCAAACTCAGCCATCAATTCAAGGGGTTACAGTTAAACTTGGTACTGAAGGACCACAAAATAAATTGGTGATGAGTGCGAAATTAGTAACAAAACCTCCTAATTCTACAATATCAATCAGTTCTATATCATCAAAATCGGAACAAAAAATAAAACCCTTATGTGTTAGTAAAATTTCAAATAAGACAACTCCTGTTGGAACTGTTCAACCTACTACTCGTTTAGTTCAACCTACTAAAAACATACCTACAACATCAAAAGAAATTTTTCCATTTAACAAATCAAATTGCAGTGATGAATCAAAAATTTATACTCAACGAAATACAGAGTTGAAACGGATACCAACTGCTGATAAAAAGAAATCCAAAAAGATTGAAAAACGAGTTATTAAAAAAAAAGTTAGTGAAAAAATTTCAAACAAGACAACCATTTTTGAAGAATGTGCTGTTATGGTGGATGCTCCGACTTTTTACCCAACAGAAGATGAGTTTAAAGATCCTTTAGAATATTTTGAAGTTATTAAATTAGTCGCCCAAAAATATGGTATTTGTCGAGTTGTACCACCTGCCAGTTTTAAGCCTGAATGCAAAGTTAGTGATGATATGCGCTTCACAGCATACAATCAGTATGTTCATAAGATGATGGATCGTTGGGGTCCTAATGTCCGTGAAATGACTGCTATTAAAAAATATTTGGAAACACAATCTATAATTTTATCAAATCCCCCTCTAATTGGAGGAATGGAGCTTGATCTTCCTAGATTATATCATACAGTTCAAGAACTAGGTGGCTTAAAAGAGGTAATTGAATTGGATAAGTGGTCTCGTGTTGCAGATTTGATGAAAATACCAAAAAGTGCTCAAGATCGTGTGACCAAGCTTGATGATATATATTGCAAGTATTTGTTACCTTATGACACACTGAATCCTGATGAAAGACAAAAATTAATGAACGATGTTGATAAAGAATGGAAACAAATATGTCGTAAAGGTGATACAGAAAATGAAATATATGAAGATATTAATGATTGCATTACAAAAGGTCGTAGCATTGCACTTAGTGCGTACTATAGAGTTGCACGTAATACTAGTGCTATGTGGTTTAAAGAAACTCAAACAAACTCAAAGCTTCCTGATCATAGTATTAAAGCAGAAGATGTTGAGTCATTTTATTGGAAACAAGTAGAAGAAAAAAAAAATCATATATGTGTTCTATCAGGTTCCATTGATTCAGGAACTGAAGGTTATGGTTTTCCTACTACCAAGACTGCAACATTTACCAAACATCCTTGGAATTTGAAAGTATTGACAAATAATTCTGCATCAGTTTTAAAATCATTAGGTCCTGTTATGGGTATGACAGTACCAACAATCCATATGGGTATGATATTTTCAGCATGTTGTTGGTATAAAGATCCTCATGGTTTACCTTGGATCGAATACTCACATACTGGTGCAGATAAAATTTGGTATAGTGTTTCGTGTAATGAAAATTCTAAGTTTCGACAAGCTATGAAAACATTATTACCTAGAGCTGTTGCTGAAGGAAAAAATAACCATTCATGGTTAGCTGCTGATAGTGGAATGGTTCCTCCAACTAAATTATTAGAACATGGTGTAACTTTAACTCGGACTATTCAAAATCCTGGTCAATTTTTAATTGTCATGCCAAATGCATACACTTGTAATATTTCTACTGGTTATGTTATATCAGAAAGTGTTTACTTTACACAAAGTGGGTGGTTGAATAATGCTGATAAAATTTTTCAGGATTTACAAAGAAACTGCGAACCAGCAGCTTTTTCTTTTGAGAAACTCCTTATAAATATGTCAACAGATTCTAGAACACCACATAATATTCTAATGCAGTTACTTAATACATTGAGTAACATGAGAGATTGTGAAATAGCACTAAGAAGTCAACTAGAAGATTTAGGACTCAAAACTTCAGAACGTATTCAGTTGTCAATTACATCAAAGTTAACTGAGCAAAATGATGAGTATGAATGTGATGTTTGTCATTCAATTCTTTATGTATCAATGGTGCACAATTCACACGAAGACTGTGATTATTGCTTAAGACATGGAATAGAAATTTTAGCAAAAAAGCATAATCAACTAAAATTTTTTAAATTTATGTATACTTTAGATGAGAATGAATTGGACTCAATTATAGTGAAGTTGAAGGAAAAAATGGAGTCAAAGAAGAAGAAGTTAAAAAAAAATATATGA
Protein Sequence
MSSLNGLETRKRKQQNKEDFLIESNTKKIKVQAQRKFAQNAVIPISSQQKPVQSPLVSNNVVKPPTKRPNTEDFLTFLCFRGTSLLPPRLDFFNKPQRSLTAQEIASGKKRKKSISTQPTKNLVDNQVSNGSNEKKKVKQIIPQTKYPLSKLGQKVIGRNLVRSGSRFAIRQEAITLRQLALRHGTKIRKIKPQIQKTQSSHKVKYDIKNKEKQQSLDGKQNKFKGRITRSNSLPNVFGPGINQLRDDKGKWCKGKTSSTTSKDSDIEERSSRKKSSSKTVECRSNSLIDIKQNDSKANSNHRKTRSLVLKHHENCNKNLEIFDKNTKTASSKFKSRNITETKIILDKHKVSNDNRSFDIMVRSRPPRRTKEAATIFMDMLKKDIQCSNEKEGDSSSIESFPELPNIKIKEAKETKLSAIVKTKHPSVTQVRSKQSSCKRNLRPRRSSTVLDDYIMTDSEDDETSGHKVDINSKKSRSTPTTKAAEPKKVSVINSNEIAEKNIKLNKTEIKTKKSLNKVNSESSLDHKDLVSDCAILKCGKDLDIKKNNEKRKEKPIKHKTDKFNSRVTDRNNSIELANNLSSKDLHKKEDQKGKKTNLDLYNNNKKKSIPSSAMFTNNASQTKDELLEQMAANFVNKHLENDDIESKKLANINVLRKQSPPNIEEANKKSKIGNIDVQSLKGEICIDNKTDQIEIINKIQKRENLVVNELDKVECILNESVKNVLGPEINDNVKINIPEYFSSKSFQLPKFKQSDGLSVLSEICSALPRFNEPCVSNKQLLTKLSMSSESINTKYSDDKKDEKTFESRTMKIVNLARNTNEKKDLASWRQAFKNVKVPKNGLSPNGNTWINKKLIDNQSKKTEISCSTNDIDHKQILENKIHDTLNSSLAEEKNIETKHSLINHNEPKIDPDKKGNSNYLTKTTILPCTKYDLKFEKRLSKQQKSMEVNILSQDDLTPEKKIFQQRRLSTAQSCSGNSSDAFSPENETSVYAFQPDLPVSSTPFRRNKTQSPIKSRTVSPNTSISVNFETDLMEGKSQSSTNSIDIENEEGRLFYIPLPAGVQTQPSIQGVTVKLGTEGPQNKLVMSAKLVTKPPNSTISISSISSKSEQKIKPLCVSKISNKTTPVGTVQPTTRLVQPTKNIPTTSKEIFPFNKSNCSDESKIYTQRNTELKRIPTADKKKSKKIEKRVIKKKVSEKISNKTTIFEECAVMVDAPTFYPTEDEFKDPLEYFEVIKLVAQKYGICRVVPPASFKPECKVSDDMRFTAYNQYVHKMMDRWGPNVREMTAIKKYLETQSIILSNPPLIGGMELDLPRLYHTVQELGGLKEVIELDKWSRVADLMKIPKSAQDRVTKLDDIYCKYLLPYDTLNPDERQKLMNDVDKEWKQICRKGDTENEIYEDINDCITKGRSIALSAYYRVARNTSAMWFKETQTNSKLPDHSIKAEDVESFYWKQVEEKKNHICVLSGSIDSGTEGYGFPTTKTATFTKHPWNLKVLTNNSASVLKSLGPVMGMTVPTIHMGMIFSACCWYKDPHGLPWIEYSHTGADKIWYSVSCNENSKFRQAMKTLLPRAVAEGKNNHSWLAADSGMVPPTKLLEHGVTLTRTIQNPGQFLIVMPNAYTCNISTGYVISESVYFTQSGWLNNADKIFQDLQRNCEPAAFSFEKLLINMSTDSRTPHNILMQLLNTLSNMRDCEIALRSQLEDLGLKTSERIQLSITSKLTEQNDEYECDVCHSILYVSMVHNSHEDCDYCLRHGIEILAKKHNQLKFFKFMYTLDENELDSIIVKLKEKMESKKKKLKKNI

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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