Ccup040151.1
Basic Information
- Insect
- Ctenicera cuprea
- Gene Symbol
- Abca5
- Assembly
- GCA_958336395.1
- Location
- OY284493.1:6392532-6430626[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- HTH
- Domain
- HTH_psq domain
- PFAM
- PF05225
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 8.2 1.5e+03 0.6 0.0 25 36 710 721 704 723 0.89 2 2 1.9e-06 0.00035 21.9 0.0 2 35 974 1007 973 1017 0.88
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAATTTGGGACCAGAGCTATCGTGGTCGTATTTTCCTTCAAATGAAGATTTACTGACCGCCTATTGGTTGGAACCCAGAACAATTCCATTAGCTGTAATTTTTGATGGACCTAACCCTTTAAATGAATCTCTTAGatacgAAATACGCATAAATCCGTCATTCTTTGAAACGCCTTCAACTACTGAATTATTCAGTTCCCCTGCCCTGTGCAGACAATCTTCTGGTCGCTGGTCCGCGGCTTTGTCGATCGAAAACAGGGAAACTTGTCCCGTCAACGAGTACTATTACTCTGGTTTCGTTGCCTTACAAGCTCTCTTAGACTACGCCAAAATTAAGAACCATACTGGAAGAAATGACACCAGCGTGCCTCATTTGCTGCTAGAAATGTTCCCCAAAGAAGCTTTTACTGGAAATTGGATGGTAGCTTTCAGGGTGGTGATTCCACTTTATATGGTCATGGCATTATCGCAATTTGTAGCGTATCTCTTAATCCTTATAGTCGGCGAAAAGGAAAATAAGATTAAGGAAGGGATGAAAATTATGGGGTTAAAGGACTCTGTATTCtgGTTATCATGGTTTATAATATACGCAGCGTTTGTGTTATTCCTGTCAACAGTATCCTGTATTTTGGTATTTGCCCTACGAGTATTTCAAAACACCAACTTGATACTCATATTCCTTCTTGTGTTATTATATTCGTTGTCTATAATTATGTTTGGCTTTATGATAACACCTTTCTTCGATAAATCAAGGACTGCTGGAATATTGGGCaacttttcaataaatatactGAGTTTACTGTATTTTATTCAAGTGTTCGTTGATGAGACGAGTTCTACAGCTTTCTGGATTGTTTCGTTAATAAGTTCTACAGGATTTGCATTAGCAATGGATAAGgcTTTGGTGATGGATTTATCTGGTGAAGGagtaaatttcaataacttaTGGTCAGGACCTGGAATACCTTTTGGTGGAAGTTTAATAATGATGGGACTGGATATTGTTTTATATGGTTTTTTGGCTTTTTACTTGGACAGTGTAATTCCAAgtgaaCATGGCACAAAAAGGCCACCTCTGTTTTGCTTCAAACCTTCATATTGGTGCAGAAAAAGAACAGTGCGTgtgcCACTAGCCAACGGTCACTCTGTAGGTTCTTTTAATAATGGCGAAGAAGTTAACGCTGATATAGAACAAGTGCCACGAGAAATGAAAGGAAGAGAAGCTATTAAGATTGTTGATCTGTATAAATCTTTTCAGCACTGTCGGAAGCCAGAAGTTAAAGCCGTTAATGGCATAAACCTAACCATATATGAAGGTCAAATAACAGCAATCTTAGGGCACAATGGTGCAGGAAAAACTACGTTATTCAACATATTAACAGGACTCACCTCACCATCTTCTGGCACGGCCTATGTATTTGGATATGACATAAGAGACCAAGATGATATGGATCAAATTAGAAGAATGACTGGTGTTTGCCCACAACATGACAtcctttttgataacttaacaCCAAGAGAACATCTAGAATTTTTCGCTGCTGTTAAGGGAATTCCTTCTGCTATAAGAGATTTTGAAGTAAACAGAACACTCAAGGACATCGATTTAACTGAGAAGGCTGGTACTTTTGCAAAACATTTAAGTGGAGGGCAGAAAAGAAAATTGTCAGTTGGTATTGCAGTTATAGGAGATCcaaagATTATAATTCTTGACGAACCTACTGCTGGTGTTGATCCTTATTCGAGAAGGCACATGTGGTCAGTTTTACAAAATCGACGGCAtggaaaagttattttattgacAACTCATTTTATGGACGAAGCAGATATTTTagCTGATAGAAAAGCGGTGGTAGCAAAAGGTAAACTACGATGTTGCGGTAGTTCCTTGttcctgaaaaataaatttggtataGGATATCACCTTACATTAGTATTAGAAGgtatAAGTAGGGAACATGCAATAACCAAGTTAGTAATATCTCATGTACCTAAGGCAGAAAAGGCCAGGCGTCATGGAAGAGAACTAAGTTTCATTTTACCTCATAACGCTGTTAACAACTTTGCCGCATTATTTTCTGCTATTGAACAAGAAATTAACAGTGGTGGAAAATTAGgtATTTCTAGTTATGGTGTGTCAATGACTACTTTAGAAGAAGTATTTCTACATTTGGAACGAGATGAAGAAACTGAAGGGTCTGTAGAAAATTTGTCTAAAAAGATAGTACGAAATCGAGCTCTTAGTAGAAGTTTAAGTCTTCAAAGTAAAAGCACTAGTTATCAGTCGTTACAAAATGAAAGCAATTCTAATCATTCCGATGGGAGAGgAATGGGAGACATGCAGTTACCTGGCCTAGAAGTAATATGTGAAACGAAATCGCCTATTGTTGGCCtaggtttagaaaaaattgaaactaatCCAAACGCTTTGCAAACTTTTATTGCCTTATTAACTCTGAGAGTTTTGCGACTGATAAGGGATATTCAAAAGTTGTATTTCATGATTTTATTGCCACTTGGTTTAGCGGCAATTGGCctatatttaaatagtattcAAGGTACACATCATAAAATGAAGGTATTGAATTTAAATGCCTGGACTTACAATGGTACCACATCAAATTTCCTAATTCACAACGACACTGGCCAAGACTTAGACACTTTCGTAGATACATTAAAAGAGGTTAGCTCGAAACACGTTAACGTGTATAATGGCAACTTTTCTTTGCTGTTAAATATAGCACCACATATGGCTGCCTTGAATATTAACGTACTAGAATTTCCGAAAACTAATATTACTGTGATTTATAATGATACTCTGCAACACAGCCTACCTATTATCATCAATATGATCGATAACACCATATATAGGAAGATAATGTCGCagaaaacgaataaaaaaagaaagttgtGGAATGACGAGAGGATGTCGGCAGTTGTTACAGCGGTACGACAAAAGCAAATGGGTTACCTAAAGGCAGCAAAAGAATTTCAAGTACCTAGAACCACACTATTTCGGCTATGCCAAAACGAAGGTACACCTCATCAAATTTCAAAGATTAAATTAGGAAGAAAACCTGTGTTTTCATCAGAATTGGAAGATGAGCTCGAAAGACACTTGTTAGACATGGACAAGCATTACTTTGGGATGACAAGAATGGACGTCATGAGATTGGCATATCAGTTAGCAGTTGCAAACGGAGTTGACCACAGATTTTCTGAGCATATTCAGCGGGCTGGACGAAAGTGGCTGAAGTGTTTTTTGCAGAGACACCCAAGGTTAACAATTAGAAAACCTACTGGAACTTCACTGGTGAGAGTTCTTGGATTTACACAGGAGAATGTTGGCAGATTTTTTGATCTCCTTGAAGCAAAAATGGATGAACATAACTATCCACCAGACAGAGTCTTTAACACGGACGAAACTGGCTTAACTATCGTTCCGTCCAAATGCAGTGAATTTATATCCTTGAAGGGAAAACGGCAGGCAGACTATGTGACCGTTGTAAGCTTACCACCGCATACGTCGCACAAAATGCAGCCTTTAGATAAATCCATAATGGGGCCTTTAAAGACGTTTTACTCCGAGGAAATCCGCATTTTTGTGAGGCAACATCAACGTGCAGTTACTCAGTTTGATGTAGCTGAAGTGTTTGGTAAAGCCTACCTCAAAGTGCAGAGTGGTGCCTATGCTAAAAATGGATTTGAGGCAACCGGCGTGTATCCAGTCAACCGAAACATATTCGACCAATCAGAATTTCTATCTGCCGAACTAGAACAAGAGAAACGCTTAGACGATAGCTCATCAGACACTGATATGAATCGCCCTAATTACGTTTCGCCTAAAGCAATAATGCCAGTTCCAtcacttaaaaaaaaggttGGATCCAGAGGGAGAAAACCAGGTAAGGCGAATGTGATAACTTCATCTCCGTATCTCAAAGAGCTGGAAACTTCGATGGTCGCAAGCGccgaaaagaaattaaaagctACAAGGCGTCTTACAACAGATAAcaacaaacagaaaaacaatgACAAAAGAAACACTAATGAAGCAGGGCCAAGCGGATTAGCCGTTACCAAAAGACAGCAACGAAAACGTTTGCCATCTAGCTCATCAGATGGATCAAATGACGCTTTTGAACTACAAGATTCTTCCGATGATGATCTATCTAGCGAAGTATCTGCAAAATCTCCTGACGACGATGCTGCTTGCATATTTTGCTACAGACGTTTTTCCGAAGACACTAGCGGAGAAATCTGGATTCAGTGTAGTTTGTGCAGATTACTAATGGATAACAGAAAAACAGAATGGCAACCAattgaagttagggtatttCCTTTTCAACAAACTGCTCAGCCAGAGGAATTTAATATCGGGGTATTTTCTACCTCTCTTTTCTTAGGAatgatgtttattttaattcctGTGAGCTTAGCAGTAGATATGGTTTATGATCGAGAGattaaagcaaaaaatcaatTGCGTGTGAATGGTTTATCATTCTCTACGTATTTCCTCACATATTTTGTGGTATTAGCAGGATTGATGATTTTAATATCCGCTGCACTGTTGATTATAATTTTGCTCTTTGATATACCTTCATTAAGAGGTTGGCCAGCCCTATCTGCATTGGGAATTATCTTACTACTACATTGTCCGGCATCAATATTGTTTTCCACCTGTATAAGttacatttttgataaaactgAGTCAGCTTTATCTATTTTGCCAAACATTGCTACGTTAGTTGGAATGGTTCCCTTTTTTTTGGTCTTTGCTTTGGATATGTTTCGTGTAGgTGGAAAGGCAGCGTATGCTCTGCatgtatttttttctcttgtaAACACAATGTACATACCATATGGGGCCGTATATTACATTCAACGCGTTTACTTAATGTGTACTGAATATCGTGGTTGCACTGCAGTAACACTGGGTGATTATATGACACGTGAAATAATAATCATGATTGTTGGAATTGTACTACATTTGCCTCTGTGGTTTTTTATCCTCATGGTTGTGGATATTGTTAAAGCTGGAGGAAAAGTCAGTGatgctttcaaaatttttggatCAAATGATGAGGTTAAAACTGATGATGTTAATGAATTGAGTGATATTGGTGAAAATGAAGATAACGACGTTAAAACAGAAAGGCAGAAGGTGAAAGATCTTATACATAGCCCGCCTCAAAATCCGCCTGTTGTAGTGGTTCAGAATTTGCATAAAGAATATAGAAGAAGCAGAACAAAATTATGCGAAGCGTGTAAGAAAGATGAAGAGTCAAAGATCACGGTGGCTGTGAAGAGTTTGTCTTTAGCTATTGACGCGGGGGAAGTTTTCGGTTTGCTTGGTCATAACGGAGCTGGAAAAACCACAACTATGAAGATTATAATTGCCGAAGAAGCGCCTACTAGAGGAAgaGTTCAAATTGgtggaaaaaatataacttgtaACTTAAACAAAGCGTTCCAATTATTGGGATACTGTCCACAACATGATGCACAGTGGAAGAACATTACTGTTAGAGAACATCTAGAATGTTATGCAGCAATACGCGGAGTTCCTTTCAAAAACATTCCCAGgGTAGTAGAACTGTACTTATCTGGATTGCAAATAGAAGAGCATGCCTCAAAACAAACTCAACATTGTTCAGGAGGCACAAGACGCAAATTATCTTTTGCTATGGCTATGGTTGGCAATCCTAAAGTAGTTTTATTAGATGAACCAAGTACTGGAATGGATCCTCGTAGTAAACGTTTCTTATGGGATACAATTTTAGCAAGTTTCCAGGGTTCAAAAGGAGCCATCTTAACAACACATTCAATGGAAGAAGCTGATGCTCTCTGTTCAAAAGTAGGAATTATGGTAAAAGGAGAACTAAGatgtTTGGGATCAACTcaacacttaaaaaatttatatggtGCTGGATATACATTAGAAATGAAATTAAGTGGAGGTGATCGTACACCTACATCAGCATCAGCTGATAAACTAAAAGAACTTAAAGATTTTGTGAATGGTCTTTTCCCTGAAGCGACGCTACAGGAAACGTTTGCAGACCGTTTAGTGTTTAGTGTTCCACAACAAAGTGTTCCTTCCTTAGCTAATTGTTTTTCAGAACTAGAAAAAGtaaaaaCTGATTTACATATTGAAGAGTACAGCTTTAGTCAAACAACACTTGAACAAGTTTTTCTGAAATTCGCGCAGTACGACGAAGTTAGTAATAGTGAATAG
- Protein Sequence
- MNLGPELSWSYFPSNEDLLTAYWLEPRTIPLAVIFDGPNPLNESLRYEIRINPSFFETPSTTELFSSPALCRQSSGRWSAALSIENRETCPVNEYYYSGFVALQALLDYAKIKNHTGRNDTSVPHLLLEMFPKEAFTGNWMVAFRVVIPLYMVMALSQFVAYLLILIVGEKENKIKEGMKIMGLKDSVFWLSWFIIYAAFVLFLSTVSCILVFALRVFQNTNLILIFLLVLLYSLSIIMFGFMITPFFDKSRTAGILGNFSINILSLLYFIQVFVDETSSTAFWIVSLISSTGFALAMDKALVMDLSGEGVNFNNLWSGPGIPFGGSLIMMGLDIVLYGFLAFYLDSVIPSEHGTKRPPLFCFKPSYWCRKRTVRVPLANGHSVGSFNNGEEVNADIEQVPREMKGREAIKIVDLYKSFQHCRKPEVKAVNGINLTIYEGQITAILGHNGAGKTTLFNILTGLTSPSSGTAYVFGYDIRDQDDMDQIRRMTGVCPQHDILFDNLTPREHLEFFAAVKGIPSAIRDFEVNRTLKDIDLTEKAGTFAKHLSGGQKRKLSVGIAVIGDPKIIILDEPTAGVDPYSRRHMWSVLQNRRHGKVILLTTHFMDEADILADRKAVVAKGKLRCCGSSLFLKNKFGIGYHLTLVLEGISREHAITKLVISHVPKAEKARRHGRELSFILPHNAVNNFAALFSAIEQEINSGGKLGISSYGVSMTTLEEVFLHLERDEETEGSVENLSKKIVRNRALSRSLSLQSKSTSYQSLQNESNSNHSDGRGMGDMQLPGLEVICETKSPIVGLGLEKIETNPNALQTFIALLTLRVLRLIRDIQKLYFMILLPLGLAAIGLYLNSIQGTHHKMKVLNLNAWTYNGTTSNFLIHNDTGQDLDTFVDTLKEVSSKHVNVYNGNFSLLLNIAPHMAALNINVLEFPKTNITVIYNDTLQHSLPIIINMIDNTIYRKIMSQKTNKKRKLWNDERMSAVVTAVRQKQMGYLKAAKEFQVPRTTLFRLCQNEGTPHQISKIKLGRKPVFSSELEDELERHLLDMDKHYFGMTRMDVMRLAYQLAVANGVDHRFSEHIQRAGRKWLKCFLQRHPRLTIRKPTGTSLVRVLGFTQENVGRFFDLLEAKMDEHNYPPDRVFNTDETGLTIVPSKCSEFISLKGKRQADYVTVVSLPPHTSHKMQPLDKSIMGPLKTFYSEEIRIFVRQHQRAVTQFDVAEVFGKAYLKVQSGAYAKNGFEATGVYPVNRNIFDQSEFLSAELEQEKRLDDSSSDTDMNRPNYVSPKAIMPVPSLKKKVGSRGRKPGKANVITSSPYLKELETSMVASAEKKLKATRRLTTDNNKQKNNDKRNTNEAGPSGLAVTKRQQRKRLPSSSSDGSNDAFELQDSSDDDLSSEVSAKSPDDDAACIFCYRRFSEDTSGEIWIQCSLCRLLMDNRKTEWQPIEVRVFPFQQTAQPEEFNIGVFSTSLFLGMMFILIPVSLAVDMVYDREIKAKNQLRVNGLSFSTYFLTYFVVLAGLMILISAALLIIILLFDIPSLRGWPALSALGIILLLHCPASILFSTCISYIFDKTESALSILPNIATLVGMVPFFLVFALDMFRVGGKAAYALHVFFSLVNTMYIPYGAVYYIQRVYLMCTEYRGCTAVTLGDYMTREIIIMIVGIVLHLPLWFFILMVVDIVKAGGKVSDAFKIFGSNDEVKTDDVNELSDIGENEDNDVKTERQKVKDLIHSPPQNPPVVVVQNLHKEYRRSRTKLCEACKKDEESKITVAVKSLSLAIDAGEVFGLLGHNGAGKTTTMKIIIAEEAPTRGRVQIGGKNITCNLNKAFQLLGYCPQHDAQWKNITVREHLECYAAIRGVPFKNIPRVVELYLSGLQIEEHASKQTQHCSGGTRRKLSFAMAMVGNPKVVLLDEPSTGMDPRSKRFLWDTILASFQGSKGAILTTHSMEEADALCSKVGIMVKGELRCLGSTQHLKNLYGAGYTLEMKLSGGDRTPTSASADKLKELKDFVNGLFPEATLQETFADRLVFSVPQQSVPSLANCFSELEKVKTDLHIEEYSFSQTTLEQVFLKFAQYDEVSNSE
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -