Ccas014714.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Coronaproctus castanopsis
Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_032883995.1
Location
CM065052.1:210416559-210421115[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 8.8e-23 6.7e-19 69.6 0.1 3 89 83 165 81 165 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGTTGACGGAGAATTCAAATTTACAATACCGCCAGAAGCGCCCGTATTTGAGCCGAGTCCCGAAGAGTTTTTAGATCCTCTTGCTTATATTCTGAAAATTAAAccaatcgctgaaaaaattggtatatgtaaaataaaacctCCTCCTGAATGGGATCCACCTTTCGCGGTTGACGTAGATTCATTTAAATTTACGCCGCGCGTTCAAAAATTACACGAATTAGAAGGTAACACTAGaatcaaactttattttctGGATCGTTTGGCGACTTTTTGGAATTTTCAAGGTGTACAAATTAGAATTCCAGCTATTAATGAGAAAACTGTAGACATGTACTCTTTATATACGATTGTAAAAATGGAAGGAGGTTTTGatgtggtcaacatggaaaaaaaGTGGGGCAAAGTAGCCACTAGAATGGGATACGCTAATGAAAAAACGGTAATTTCGGCGTTAAAGACTAATTACAAACGTTTATTACTGCCATttgaaatgtttgaaaaatctataaatttaGCGAAGTTTAAAACTGACGAGAAAATAGAATCGACTAGCGATACTAGCAGTAATAGTAGTAACTGTGGTAGTCCTATGAAACAAACCGCTGAATGCGgaagtaataatagtaataaacgtCGTACGCGATCGAACTATACGGAAAATGATACAGAAATATTGGTCAGTGAAACATTTAAAGATCCGCTCATGCaagataaaaacaaagaattacAACGTTTAACATTTTACGGTCCCGGACCTAAAATTTTAGGTTCGAATAAGCgtaaattagataaatttatttcgtcttCATCTCAAATAATGGAAGATTGTACCGGTTACGCTTGCGTAATTTGTAAAAGTGGAGAAACAGACGATAACATTATATTATGCGATGGTTGTGAAGACTCGTATCATACATACTGTCTAATACCGGCTTTGAGTACACCGTCGAAAGGTAAATGGCGCTGTCATAAGTGTATATGGACGGTTATTAATAAGACACACGATGCATTCGGTTTCGAACAGTCGGATCGTGAATACACGTTACAACAGTTTGGTGAAATGGCGGATCagtttaaatcgaattatttcaaCATGCCCGTTCATTTGGTGCCAACTGATCGTGTAGAACATGAATACTGGCGTATAATGTCTTCGTTGGATTCGACTGTATCCGTCGAATATGGAGCAGATCTTCATTCGATGGACCACGGTTCGGGGTTTCCAACTCAAGTTAAGTTAGAAGAATGCGGCGACGAATCTAATTATTATAAACGATATGTGGAATCAAGTTggaatttaaacaatattccGGTGTTAGAAGGTTCGGTATTAGGCTATATCGATGCCGACATATCGGGTATGAAGATTCCGTGGATGTACGTCGGTATGTGTTTTTCTACTTTTTGTTGGCATAACGAAGATCACTGGAgttattcgattaattatttacattggGGCGAACCAAAAACCTGGTACGGTGTTCCCGGATCGAAAGCGGAAGAATTTCAAAAAGTAATGCAACAAACCGCACCCGACTTGTTTTATACGCAACCAGATTTGTTACACCAATTGGTAACGATTTTAAATCCGAACATACTAATGGATAAAGGTATACCGGTATATCATATAAATCAAATGGCCGGCGAATTTGTACTTACATTCCCACGTTCCTATCATGCCGGTTTTAATCACGGATATAATTTCGCGGAAGCGGTAAATTTTGCACCGGCCGATTGGATACCGATTGGACGAATGTGTATCGATGATTATTCCAGTCTGCAtcgtatgtgtgtgttttcGCACGACGAATTGATTTGTAAAATTGCTTCGTTTGAAGGCAATTTAAATTCGACGTTGATCACTGCTGCCTGCGAAGATACGAAGAAAATGTTTGACACggaaaataaacaacgaaaagctttgttagaATGGGGAGTAGTGAACGCTGAGAAAGTAAACTTCGAATTATTAGCCGATGATGCGCGACAATGTATCGAGTGTAATACCACCTGTTTTTTGTCCGCCGTTAAATGTAAATGCAATCCGGACAAATTATCGTGTTTACGTCATTATCAGAATATGTGTAGCAATTGCGCTCCGTTGGATCATACGTTGAAATATCGATTCACCTTAGACGAATTAATGTTGATATTAAcgaatttgaaagaaaaatataattcggTCGATGTATGGGCCGCAAAAGTTCACGACGCTTTAGATTTAAATACACCCAGGACTATTACTTTGTCAGGTTTAAAAGATCTTTTGAATGAAGCGATAGACAAAAATTTCCCCGAAACTTCGCCGTTGGGTTTATTGTCAACCGCAATTAATTCCGTCGAAAAAGCACTAGCGGCAAATATCAACAAGATTCTTTCGcagaaatttattttaccgACAAGAATAAAACTCAAGGAAATCGAAGGTTACTACGACGAGCTTAAATGTATACCGTGCGTATTGCCTCAAGAAATACCGGTAGCCGAGTTTTTAGATTtcataaaagaatttaaaaataaagttaccaTCATAATTAACGACGATAGAAACGAATGGAACGTTCGGGATATCGAAAGAATTTTAGAAGAGGTAAATTTTCCGAACATCGACATACCGGAAGTGAATACGTTACGAAAATTTTTGACCGCTCAACAGTGGTTAGAAACTTGCAATCAATTGATCGGTTCGAAAACAGACGCCACCGAAGACGAAATTGATAAACTTTTATCTTCCGGTAAAAATCTGCTTCAATTTCCGATGGTcgctgaaaatattaaacgaattgCCGAACTGAAAAGAAAGATAATCGAGTTACGACATTTAGCGGAAATGTATTTAACAACCGTCGTAACGTCTACGTTGAAGCCTACGATGGATGACTTACAAAGGTTAGTAAACGAAATGAATTCTTTAAATGTAACGTTTACCGAAAGAGGCAAAATTATGCGCCTTATTAAAACGGCTTCAGAATGGCAAAAAGCGGCTGTCGATTTATTGGCGTCGTGTAAAAGTTGTCCGCCTTATTTATATCGTATCGAAGATATGGTGGAAAAAGGTCAATCTAGCCCGGTTAATTTTGAAGAGGTCGGTAAATTACAAGCGATGATCGCCTCGGCTTATACTTGGAAACATTGCGTGAAGAAGATGTTTGTGAAAGAAACTTCCAAATTATCGCTGTTGGAAATTGTCATGCCGAGAATATTTCGGAAGTACGCGTACTTTTGTCGCGATCAGTCGTTCGATAAGAAATTTTTCTTAGACGTTACGTTGAACGGTATAGACGATACGGAGAATATAATGGGCCAAATTGAAGATGCGGAAAAACGAGAAATGGAATTAATAGTATCTTTAAGAGTTAAAAATGTTACGAAACAACTCTATCGAAGTAGCGCTCGATATTGTTTATGTAATTCGTCGTTTTCCGCAGACATGATCGAATGTATCTTATGTCGTGGTTTATTTCACGCGTCTTGTTTGAACGTCAAAAATGACAATAGCGATAGTCGTAGCAATAATATGTCGAAGATTTTGTGTTCCGTTTGTCAACGTGGCAAACGACCGTCATTAGAAAATGCTGTTAGAGAATTGAAAAAtctgaaattattaaaagttcaACTATTCGAAGGTACAGCTTTAATTCGTCTGATCGATCGGGCGACGACTTGGAAGACCGAAATAACAAATCTGATTAATTCCGATAATGCGCTGAAAAAAGCTTTCTTTAAATTACAAGAAAGTCATAGTAACGACGTTATAATTCGTCTGACTATCGACGAGACGATTAGAAATAAATTGCAGGACTTTCTCATGCGCGGTAATTTAATCGAATTGGGTATAAGTGAAACTGATATAGTTtggaaattgttaaaatattctCAACCGCCGTTAACAGATTCGTCCGCCGATCAGCAACGGTTGGAATTTATCAAACGTGAACTAAGTTGCGAAGAGACTTTCTTTCAAAATGAAATGTTGGAAATAATCTCAATTCAGAAACATAAGAAACGTCGTATCGTTTCAACGACtaagaatagtaataataataataatatcgacggAAGCAGCAACGTTGTCTCTAGCGGTAAATCGTTTGAAAAATCTGCTAATTGTTCTTCCGATCACTATCGTGGGAATAATAATATGGCCGCCGCCGCCGccggtaatattaataaaattaaaccgaaAATAAAAAGCACGCGGAAAATGACGAGCaacaaaataaactataaaaaaactATTCACGATAATAAAGATACCAGTTTTAACGACGAAGAGGACGATAATGGTAAACCTTGCCATATGAAGAACTGTTTACAGCCTACTGAGGATCACGTAGACTGGGTGGAATGCGACTGTTGTAAAAAATGGTTGCATATGATTTGTGCCGGTGTTACAAGACTTCAAGTGGAATCGCAGACTGAATTTATATGCGACGAGTGTTTACAATTGAAAAGAAGTTTACCAGGTGTTCAGGTATTAACTTCTAAAAGTAGgaataataatgacaatttaTTAGACGACTCAGACGACGACGTAATTTGTATCGATTAA
Protein Sequence
MVDGEFKFTIPPEAPVFEPSPEEFLDPLAYILKIKPIAEKIGICKIKPPPEWDPPFAVDVDSFKFTPRVQKLHELEGNTRIKLYFLDRLATFWNFQGVQIRIPAINEKTVDMYSLYTIVKMEGGFDVVNMEKKWGKVATRMGYANEKTVISALKTNYKRLLLPFEMFEKSINLAKFKTDEKIESTSDTSSNSSNCGSPMKQTAECGSNNSNKRRTRSNYTENDTEILVSETFKDPLMQDKNKELQRLTFYGPGPKILGSNKRKLDKFISSSSQIMEDCTGYACVICKSGETDDNIILCDGCEDSYHTYCLIPALSTPSKGKWRCHKCIWTVINKTHDAFGFEQSDREYTLQQFGEMADQFKSNYFNMPVHLVPTDRVEHEYWRIMSSLDSTVSVEYGADLHSMDHGSGFPTQVKLEECGDESNYYKRYVESSWNLNNIPVLEGSVLGYIDADISGMKIPWMYVGMCFSTFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGSKAEEFQKVMQQTAPDLFYTQPDLLHQLVTILNPNILMDKGIPVYHINQMAGEFVLTFPRSYHAGFNHGYNFAEAVNFAPADWIPIGRMCIDDYSSLHRMCVFSHDELICKIASFEGNLNSTLITAACEDTKKMFDTENKQRKALLEWGVVNAEKVNFELLADDARQCIECNTTCFLSAVKCKCNPDKLSCLRHYQNMCSNCAPLDHTLKYRFTLDELMLILTNLKEKYNSVDVWAAKVHDALDLNTPRTITLSGLKDLLNEAIDKNFPETSPLGLLSTAINSVEKALAANINKILSQKFILPTRIKLKEIEGYYDELKCIPCVLPQEIPVAEFLDFIKEFKNKVTIIINDDRNEWNVRDIERILEEVNFPNIDIPEVNTLRKFLTAQQWLETCNQLIGSKTDATEDEIDKLLSSGKNLLQFPMVAENIKRIAELKRKIIELRHLAEMYLTTVVTSTLKPTMDDLQRLVNEMNSLNVTFTERGKIMRLIKTASEWQKAAVDLLASCKSCPPYLYRIEDMVEKGQSSPVNFEEVGKLQAMIASAYTWKHCVKKMFVKETSKLSLLEIVMPRIFRKYAYFCRDQSFDKKFFLDVTLNGIDDTENIMGQIEDAEKREMELIVSLRVKNVTKQLYRSSARYCLCNSSFSADMIECILCRGLFHASCLNVKNDNSDSRSNNMSKILCSVCQRGKRPSLENAVRELKNLKLLKVQLFEGTALIRLIDRATTWKTEITNLINSDNALKKAFFKLQESHSNDVIIRLTIDETIRNKLQDFLMRGNLIELGISETDIVWKLLKYSQPPLTDSSADQQRLEFIKRELSCEETFFQNEMLEIISIQKHKKRRIVSTTKNSNNNNNIDGSSNVVSSGKSFEKSANCSSDHYRGNNNMAAAAAGNINKIKPKIKSTRKMTSNKINYKKTIHDNKDTSFNDEEDDNGKPCHMKNCLQPTEDHVDWVECDCCKKWLHMICAGVTRLQVESQTEFICDECLQLKRSLPGVQVLTSKSRNNNDNLLDDSDDDVICID

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
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80% Identity
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