Basic Information

Insect: Conomelus anceps
Gene Symbol: X-element\ORF2
Assembly: GCA_948455865.1
Location: OX418218.1:685278-689993[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: HTH
Domain: HTH_psq domain
PFAM: PF05225
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 1.5e-09 8.1e-07 31.0 0.0 4 38 1324 1358 1323 1358 0.94

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	1.5e-09	8.1e-07	31.0	0.0	4	38	1324	1358	1323	1358	0.94

Sequence Information

Coding Sequence: ATGATGGCCGTGGACTATGTGGTTAACTCTCCGTGTGGGCTCTGTGATAAACCCATTAAAGAAAATGCAGATGCAATTGGCTGTGATCTTTTTTGTGAAAAGTGGTTTCACTCTAAATGTGTCAAAGTCTCAAAAGATGATTTTGTAAAAATTCAATCCCTGGGTGATCATGTGAAGTGGCATTGTTCGGCTTGTGAGGATAGGTTATGTTCGGTAAGGAAGCTTAAAATCGACGACGTTTTATCTTTTTCAACTAAGGTAGATAAAATGGACATTAAACTTGACTCTTTTGAATCTTCCAATAAAGACTTATTAAGAAAAGTTGAGAATTTATTTGAAGAAAAGTTTCAAAAAATGTTTGACCTTAACAGAGATAGTTCTATTCGTGTTTCTCAATTCAATTCAAACAAAAGTGTTGAGGCTGCTGATCAATATCTGACTTGTCAAAGTGTTCCTAAAACAAGTGAAGAATCGTCTGCTCATAAGAATTCGATTCTTAAAATCGATCTTGTTGACTATGGACGATCGACAATGGATGCTGTTCGACTTGACATGAACTGTGATGTTTTGAACAAACTTTCACCGAATAAAGTTAATTGTGGAGAATCTGATTCTTTTCCTACACTTATTTCTACATCCAGTGTATCAAATAAATCAAGATCTCGTTCTGGAACTGACTGTTTACTGACTTGCAGTGCTGATAATAATAAAGCTTTAGATTTAGAAGGTGACAGTCTTACTGATGCTAATGAACATAACCCTACTGCCAACAACTGGACTGAGGTAGTGAAGAGACAAGGTAGGAAAGCTAAAAACTCATTTCCTGATAATAAAGCTCAACCTAATAAAGCTCAACCAGTTATAAGTTCTAAATTTTCTGGTAATGGAAATGGCAAGAAGAATAGGAATTTTATCACCGGTAACATGACTGGCATTGACTCTCTGAAAAGTATGGACCGTAGAGTGTTTCTGTTTGTTTCCAGATTCATTCCAGAAACAACTAGTGAGGACATTTCGGGCTTTTTAACCAAACAGGGTGTTAGTGACTCTCTGGTTGAAAAACTGGTTTCCAATCATCCTAATTCCTATTCGTCTTTTAAGGTTGGTGTTCCTGCCTCTGTGTTTGAAAAAGTATACAAGGCAGAATTTTGGCCTATGAACACTTATGTAGCAAGTTTGGTTGTTGTTCACTGGAATGCCCAGGGTTTGCTCAATAAATTGGATGAACTCATCTGCTTAAATTTTAAATTTGATGTGGACATACTTTGCTTATGTGAGCACTGGCTTGGTTCACTTGAACTTGGTGAAACTACAGTCTTGGGCTATAAGTGTATTAGCGCTTATTGTAGATCCTATGGTAAAAGAGGAGGCTCTGCTATATTTTTGAAAGATGGTTTATTGGGCACTGAAATCGAATACTTAACAGAACTCTCAGTGTTGCGTGTCTGTGAGATTTCAGCAGTGCTCATTACTGAGCTTAATGTCATCTGTATTGAGGTTTACAGAGTTCCTGATGATAGCAACTTTGAAATTTTTATTGAAATTATCTTCAACTTACTTGATAGAATTAATAATAGAAATAAATCAAAAGCTTCTGTGATTCTATGTGGTGATTTTAATATTGACGTTTTGAATAATTCTTCTTTTAAGTTAGTTTTTCAGAATATTTTAATTAGCTTTAATCTCAATTTAGTAATTAATGAAGTTACCAGACCAGCCTCTTCCCTGCATGGAATGGGGTCATGTATCGACAATGTTGCTACTTCTATACATGTAGACAGAATTGTAGCAGCTGCAGTTGAACCGATGTTGATGTCTGACCATTCTGCCATAGTTTTTAAGTGTTCTTTAGATCTGAGTGCTCATAAGACTGATGATCAAGTTGATCTTGGTAGAGTTATTAGACCCATGAATAAGACTGATGTTTGTTATTTTAAATCTTTACTGGCAGAAGTTAATTGGCTAGGTATTTACTTAATTGACTCAACTGAGGTCAAATTTTCTCATTTTCTTGACCGGTTCTTGTATATTGTAAACTGTGTGTTTCCTTTAAAGCATGTTTTCAACAATAAGGATTCACATTGCAATTTCAAGTGGTATAATAGTGAAATAAGACAAGTTAGAGAATTGTGCTTTATTATGTTCGAATTGTACAGAAATACTGGTTCAGTCAATTATAGATTAAATTATATAAATTATAAAAAACTTTATAGAAAAATGGTAAAAGAAGCCAAACTTAATTTTAACAATAATCGTATCCTTCTTGCAAGTGACAAACCCAAAGAATTGTGGTCAATAGTGAAAGAGAATTTGAATAGAAATGATGTCTCCAAGAGTGTTGACAGTAATTGTCATACATCGGATGGCTTTAATGATTTCTTTTTGAATGGTGTAAGTAATGTTGTTCTTGGTGTACCTGCTGCTGCTCACAGTGTTGATTACTATATGGAAAATCATAAAAATTCTTCAGCTGTACCTGTTACTACTACCTTTGCTTTCAGTCACACTAGTGTTGAGCAAGTTTATGAAACCATATTATCTTTAAAAAATAGTTCCTGTCTTGATGTGTATAATCTCAACTCTTTTTTTGTAAAACTTGCTTCTCCATTCATCTGTGAAATTTTATGCTGTTTATTTAATGATTGCATTGATCATGGGATATTCCCAAAATGTCTAAAATTTTCAAAGGTTATTCCGTTGTTTAAGAAAGGTTCTGCTTCTGATTATAATAATTTTAGACCTATATCAATAATTCCTGTGTTCTCTAAAATTTTTGAGAATATTCTGTACAAGCAGATTATTGAATATTTTGAGATCAACCATCTATTTAGTGACAGTCAATATGGGTTTAGACCTAAAAGAGGAACTGGAATGGCTATCTCAGAATTTATGAAGTGCTGCATGTATTCTATGGATGAGAGCCACAAGGTTAAAGGTAGTTTCTATGATATGTCCAAAGCATTTGATACTATATCGCATGAAATTTTAATTCAGAAACTTAGATTTTATGGTTTTGATGACGTAGCAATTAGTCTAATGTCATCTTACTTGAATGATAGGTATCAGTCTGTTTTTTACAATAATGCTTTCTCTAATTTCTTAGAAGTGAAATCAGGTGTCCCCCAAGGATCAACATTGGGGCCACTTCTGTTTATTATTTATGTGAATGATCTCCCTGCTGCCATAAGTACTGACTTTGTGAAGCCATTCATGTTTGCGGATGATCTGGCTGTACAGACTAAGTGTATTAATTTATTCAGTGAGCTCCATACATTTGTAAATCATATAATTGATGACTGGACTGCGGCAAATTCACTTTGTTTAAACAAAGAAAAAACTCAAATGTTGGAGTTTGGTTTCAATTTAAATACTAACAATTCTAAATTTTTAGGCATAGTTGTTCAAAGTAATCTTAAGTGGGAGTCTCACATAAATTTGTTGCACAGCAGACTGTCAAGAGGTATATTTTTGCTCAGCCGTTTAAAATTTATTGTCAACACTTTTGTTTTAACTACAGTTTATTTTTCATATGTACATAGTCATTTATCTTATGGAATTATTGCTTGGGGAAATGATACAAATGTAGGGAAACTATTTGTACTGCAAAAACGAGCCATAAGAATAATTGCTCGTGTTCCTAGTCGCACACATTGCAAACCAATTTTCAAGCAAATGAAAATATTGACAATTCATGCTATTTATGCATTTGAATGTTTATTATATATAAAGAAAAACTTGTCACGTATTCCTTTAAATAGCTCTGTCCATGGCCATTACACAAGGAACGCTTCATCGCTCAGACTGAATCGTTGTAATTACTCTTATACATTGAATGGATTTGTTGAGTATGGAACAAGGCTTTATAATTGTCTGCCAAATAATCTTAAGGTTAATGATATTGAATGTTTTAAAAAGAATATTAAAAATTATCTTGTTGATAAATCTTACCGGCGCAATTACGATGTCAATAACATCGAATTGGCATTAAATGCTGTCATAGAAAATCGTATGTCTTTCTCACATGCATCAGAAAGGTTTGGTGTACCAAAAATGACGATTTACAGACGGTATGAATAG
Protein Sequence: MMAVDYVVNSPCGLCDKPIKENADAIGCDLFCEKWFHSKCVKVSKDDFVKIQSLGDHVKWHCSACEDRLCSVRKLKIDDVLSFSTKVDKMDIKLDSFESSNKDLLRKVENLFEEKFQKMFDLNRDSSIRVSQFNSNKSVEAADQYLTCQSVPKTSEESSAHKNSILKIDLVDYGRSTMDAVRLDMNCDVLNKLSPNKVNCGESDSFPTLISTSSVSNKSRSRSGTDCLLTCSADNNKALDLEGDSLTDANEHNPTANNWTEVVKRQGRKAKNSFPDNKAQPNKAQPVISSKFSGNGNGKKNRNFITGNMTGIDSLKSMDRRVFLFVSRFIPETTSEDISGFLTKQGVSDSLVEKLVSNHPNSYSSFKVGVPASVFEKVYKAEFWPMNTYVASLVVVHWNAQGLLNKLDELICLNFKFDVDILCLCEHWLGSLELGETTVLGYKCISAYCRSYGKRGGSAIFLKDGLLGTEIEYLTELSVLRVCEISAVLITELNVICIEVYRVPDDSNFEIFIEIIFNLLDRINNRNKSKASVILCGDFNIDVLNNSSFKLVFQNILISFNLNLVINEVTRPASSLHGMGSCIDNVATSIHVDRIVAAAVEPMLMSDHSAIVFKCSLDLSAHKTDDQVDLGRVIRPMNKTDVCYFKSLLAEVNWLGIYLIDSTEVKFSHFLDRFLYIVNCVFPLKHVFNNKDSHCNFKWYNSEIRQVRELCFIMFELYRNTGSVNYRLNYINYKKLYRKMVKEAKLNFNNNRILLASDKPKELWSIVKENLNRNDVSKSVDSNCHTSDGFNDFFLNGVSNVVLGVPAAAHSVDYYMENHKNSSAVPVTTTFAFSHTSVEQVYETILSLKNSSCLDVYNLNSFFVKLASPFICEILCCLFNDCIDHGIFPKCLKFSKVIPLFKKGSASDYNNFRPISIIPVFSKIFENILYKQIIEYFEINHLFSDSQYGFRPKRGTGMAISEFMKCCMYSMDESHKVKGSFYDMSKAFDTISHEILIQKLRFYGFDDVAISLMSSYLNDRYQSVFYNNAFSNFLEVKSGVPQGSTLGPLLFIIYVNDLPAAISTDFVKPFMFADDLAVQTKCINLFSELHTFVNHIIDDWTAANSLCLNKEKTQMLEFGFNLNTNNSKFLGIVVQSNLKWESHINLLHSRLSRGIFLLSRLKFIVNTFVLTTVYFSYVHSHLSYGIIAWGNDTNVGKLFVLQKRAIRIIARVPSRTHCKPIFKQMKILTIHAIYAFECLLYIKKNLSRIPLNSSVHGHYTRNASSLRLNRCNYSYTLNGFVEYGTRLYNCLPNNLKVNDIECFKKNIKNYLVDKSYRRNYDVNNIELALNAVIENRMSFSHASERFGVPKMTIYRRYE

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: -
90% Identity: -
80% Identity: -