Clon010008.1
Basic Information
- Insect
- Condylostylus longicornis
- Gene Symbol
- Zmiz1
- Assembly
- GCA_029603195.2
- Location
- JAQSLO010000038.1:15467710-15476589[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-MIZ
- Domain
- zf-MIZ domain
- PFAM
- PF02891
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 0.4 5.9e+03 -2.2 0.9 4 24 655 675 652 679 0.86 2 2 3.9e-24 5.8e-20 71.5 3.8 1 49 737 785 737 786 0.97
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAATGCTCAGGGCGGCTCTTCCAGGGCTCTAGCCTTAGGGAGCCAATTATCACCCCAAGGAGCGTATTCATCACCTTCAAATACATCAACATTTGATACATCATCacatcaacaacagcaacaacttcaacaacatcaacaccaacaacaacaatttcaaCAACATAACGGTGGTTTtggggaaaattttaataatagtaataataataataataattttaatgcaaattatggtggaaattataataacagtaataataataacaataatgacagtttaacaaatttaaaaaattcatttgggCCAAACTCTGAATttacatcaaatttaaattgtgatacaagtaataatatattaggaattaataataataataataataataacagtaacagtaataataataataataatagtaatccTTTAAATACTGGTGGTAATAATAGTTATCATCAGTCAAGTGGTTTAATGAATGGAAACATGGTAGCTGCTACCGGTACACAACAAACAATGGATGGAATGAGTTTCAAttcacaaaTGACCAATATGCAAATGCATAATGGTGGTAATGGTGGTAATGGCAGTATGACAGGTCATCATCCACATCAATATATGAATGGTATGAACGGTATGGGATCAAATAGTATGAACGCAAATACAGGAATGACTGGTATGAATGGTATGAACGGTATGAATAGTATGACACCAAATGGTATGGGACCTATGCCAAATATGAATGGTATGCAAAGTGGTGGTGGTATGGGTGGTATGAATACAAATCAAATGATGGCTGCAAATAATGGAAATGGAATGCAAATGAATTCAATGGGACATATgaataatatgaattataatatgGCAAGACATcataataTGTCTCCAATGAatcaaatgcaaaatatgacCATGAGTATGGGACCAATGGGCCCAAATCCAAATGCAATGGGTGGTATGGGTCAACATCATCCATCAATGACTgcacatcatcatcatcaacagcaAATGAATGCAATGAATCCTATGGCTAAAATGCAAGGTATGGCAAATGGTGTTTATCCACAACAGAGGCGAATAGCACCATATCCAAATCCCCAAATGCATGCAGCACAAAAACGACATGCATCAAGTGCTgctgcagcagcagcagcagctgcTGCTAATATGCATCAAAATATGGCAAATTATCAAAATCCAAATGTTCCTCCACATGCAGTATCGCAACAACATCCCGGGCAAATGCAATTTTCCCATCATCAGTCAGCAAATGGTGTACCAGTTCCTATGCAACCATCTGGTTATGGTCGATCAATGCCAATGAATCCATATGCCGGTAGTAGAGCCGGTGCAATGGGTGCAACTGGAATAGCCGGTAATATGGGAGGTAATGGTGGTATGATTGGTCCACAACAAAGACAAACAACACCACCATATACAAATCCAATGCAACATCAACAATTTTATCCTGGTGGCAATGGTAATCCTTCTGGCAATAATGGAATGGGAAATAGTTATTCCAGTGCTCAaggTTTCCAACAAGAAGTTCGAATGAATATGAACACTTATCAACATAGTCCAGTTCCAGGAAATCCAACACCACCATTAACACCTGCTTGTTCAATTCCATATGTTAGTCCTAATCCAGATATCAAACCACAAATTGATCATAATGAAGAAATGCGATTAACGTTTCCAGTACGTGATGGCATTATATTAGCACCTTTCCGATTATTACATAATCTATCTGTTAGCAATcatgtatttaatttgaaacaaacCGTTTATAATACATTAATGAGcagaaGCGATCTggaattgcaattaaaatgctTCCATCAAGAAGATCGACAAATGAACACTAACTGGCCACATACTGTAACGGTTTCAGCAAATGCTACACCTTTAGTTATTGAACGATCAGAAAAAACTGGTCAAGCACTGCGGCCTCTCTACTTAAAACAAGTTTGTCAGCCTGGACGCAATACACTGCAATTAACGGCCAGTTCTTGCTGTTGTTCACATTTATTCGTCCTTCAATTAGTACATCGTCCATCAGTAAGGCAAGTTTTACACAGTTTGCATAGACGAAATCTTTTGCCGGTTGAGCACAGTGTTGCCAAAATCAAAAGATACTTTGCTATGGGTATGGCTGGACAAGGTTCACCTTCAGCTGATGGTTCATCCGTTAACAAtgcagaatttattaaaatatcgctTAAATGTCCAATTACAAAGAATCGAATACGATTCCCAGCTCGTGGACATGAATGCAAACACATTCAATGCTTTGACTTGGAAAGTTATTTGTTATTGAATTGTGAACGAGGTAGTTGGAGATGCCCAGAATGCAAtAATCCGGCTCTAACTGAAGGCCTAGAAATCGATCAATATATGTGGGCAATTTTAAATACGCTGAGTCAATGTTTAGATGTCGATGAAGTAACAATAGACCAATTTGCAAATTggcagaaaattatgaaaaatgttcCTGGACAAATGCATCAACAACCACAACCACAACAACACTTGCAGCCCGGTGCAAATATGCAAGGTAACGGAAATGGTAACAATGATGGAAGTGGCAACGTCAACAATAGTAACGTTCCACAAATCAAACAAGAAACTCCTGATGttgatgatttaaaaaatctagCAAAAGTTATGTCACCTGGATCAACAGCTTTGCCAACATGGGATAATTCTCAGGCAATGAGCCCATATATGTGTCATGACATGAATTCAATTGCAAGTGGAAATATGATGGGAAGttgCAACAGCTCTCGAAACTCATATGATTCATTTGGAAATAGTAATCAAAATGACAACAATACTGTACCAGATCCTCTCTCACATTTAAGTGATTCCGTTAATTCTTTGGATCCATTAAATGCTATGGAAAAATCACTTAACGATCagatGCCTCATACACCTCACACACCACATACGCCTGGTGGTAATTCTAGTCATCCTTTAACTCCAGGTGGACCACCAAGTGTTAGTTCAGCGCACAATGAAAATATTGGAAGTTCAAATACCAATAGTgtaaacaatagtaataataataaaaataataatggcaaCAATAACAGCCAAAGTAATAATAGTTGCCATAATTCACCTCAACAACATCAAAATCATCCATCTCctcaaaatagtaataatagcaaTGGTAGTAGTAATcagcaacaacaaaatcaagCACAATGTACATCTACGCCaaataaaaatagtagtaacaataataatagtaataatattagtaataataacagtaataataacagtaatagtaatagtaataataatattaataatagtaataatgatagtaattgtaataataatgataatgataactgtagtaataataataatgaaaataatagtaataattcaaataattgtaatagtaatagtgataatagtaatattgataatagtattaatacacaacatcaacaacatcaaataataaattcattaattcaatcacaaaatgataatttaattaatttaaatgatactGATTTAAATGCTGATCTTAATTTTGATCCATCAGCTGTTATTGATAGTGATGCAACACATGATTTAAATTTATTATCAGATAGTGTTGTCGATCCaatggaaatattaaattatttagatcCACAACCTGATCTAAATACACCACCATCAAGTGGATCAAGTAATAATCCAAATCAAGAGGATATATTAGCATCATTATTCGATTGA
- Protein Sequence
- MNAQGGSSRALALGSQLSPQGAYSSPSNTSTFDTSSHQQQQQLQQHQHQQQQFQQHNGGFGENFNNSNNNNNNFNANYGGNYNNSNNNNNNDSLTNLKNSFGPNSEFTSNLNCDTSNNILGINNNNNNNNSNSNNNNNNSNPLNTGGNNSYHQSSGLMNGNMVAATGTQQTMDGMSFNSQMTNMQMHNGGNGGNGSMTGHHPHQYMNGMNGMGSNSMNANTGMTGMNGMNGMNSMTPNGMGPMPNMNGMQSGGGMGGMNTNQMMAANNGNGMQMNSMGHMNNMNYNMARHHNMSPMNQMQNMTMSMGPMGPNPNAMGGMGQHHPSMTAHHHHQQQMNAMNPMAKMQGMANGVYPQQRRIAPYPNPQMHAAQKRHASSAAAAAAAAAANMHQNMANYQNPNVPPHAVSQQHPGQMQFSHHQSANGVPVPMQPSGYGRSMPMNPYAGSRAGAMGATGIAGNMGGNGGMIGPQQRQTTPPYTNPMQHQQFYPGGNGNPSGNNGMGNSYSSAQGFQQEVRMNMNTYQHSPVPGNPTPPLTPACSIPYVSPNPDIKPQIDHNEEMRLTFPVRDGIILAPFRLLHNLSVSNHVFNLKQTVYNTLMSRSDLELQLKCFHQEDRQMNTNWPHTVTVSANATPLVIERSEKTGQALRPLYLKQVCQPGRNTLQLTASSCCCSHLFVLQLVHRPSVRQVLHSLHRRNLLPVEHSVAKIKRYFAMGMAGQGSPSADGSSVNNAEFIKISLKCPITKNRIRFPARGHECKHIQCFDLESYLLLNCERGSWRCPECNNPALTEGLEIDQYMWAILNTLSQCLDVDEVTIDQFANWQKIMKNVPGQMHQQPQPQQHLQPGANMQGNGNGNNDGSGNVNNSNVPQIKQETPDVDDLKNLAKVMSPGSTALPTWDNSQAMSPYMCHDMNSIASGNMMGSCNSSRNSYDSFGNSNQNDNNTVPDPLSHLSDSVNSLDPLNAMEKSLNDQMPHTPHTPHTPGGNSSHPLTPGGPPSVSSAHNENIGSSNTNSVNNSNNNKNNNGNNNSQSNNSCHNSPQQHQNHPSPQNSNNSNGSSNQQQQNQAQCTSTPNKNSSNNNNSNNISNNNSNNNSNSNSNNNINNSNNDSNCNNNDNDNCSNNNNENNSNNSNNCNSNSDNSNIDNSINTQHQQHQIINSLIQSQNDNLINLNDTDLNADLNFDPSAVIDSDATHDLNLLSDSVVDPMEILNYLDPQPDLNTPPSSGSSNNPNQEDILASLFD
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -