Basic Information

Insect: Condylostylus longicornis
Gene Symbol: zfh2
Assembly: GCA_029603195.2
Location: JAQSLO010000057.1:592064-615494[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-C2H2
Domain: zf-C2H2 domain
PFAM: PF00096
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 14 0.34 37 5.7 0.7 2 23 79 101 78 101 0.95

2 14 0.00029 0.031 15.4 1.4 2 23 793 815 792 815 0.96

3 14 7.1e-05 0.0077 17.3 0.7 1 23 847 871 847 871 0.92

4 14 0.022 2.4 9.4 0.4 1 22 1030 1051 1030 1054 0.91

5 14 0.015 1.6 10.0 0.1 2 23 1735 1757 1734 1757 0.93

6 14 7.7 8.3e+02 1.5 1.4 1 23 1962 1987 1962 1987 0.88

7 14 0.0015 0.16 13.1 1.5 1 23 2000 2022 2000 2022 0.96

8 14 0.0027 0.29 12.4 1.9 2 23 2029 2051 2028 2051 0.94

9 14 7.9 8.5e+02 1.4 3.0 1 23 2230 2254 2230 2254 0.91

10 14 0.024 2.6 9.3 0.6 1 22 2285 2306 2285 2309 0.89

11 14 0.011 1.2 10.4 0.1 1 23 2436 2460 2436 2460 0.93

12 14 0.89 97 4.4 5.0 1 19 2660 2678 2660 2683 0.92

13 14 0.00017 0.018 16.1 2.8 1 23 3497 3519 3497 3519 0.98

14 14 0.002 0.21 12.8 2.6 1 23 3658 3680 3658 3680 0.96

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	14	0.34	37	5.7	0.7	2	23	79	101	78	101	0.95
2	14	0.00029	0.031	15.4	1.4	2	23	793	815	792	815	0.96
3	14	7.1e-05	0.0077	17.3	0.7	1	23	847	871	847	871	0.92
4	14	0.022	2.4	9.4	0.4	1	22	1030	1051	1030	1054	0.91
5	14	0.015	1.6	10.0	0.1	2	23	1735	1757	1734	1757	0.93
6	14	7.7	8.3e+02	1.5	1.4	1	23	1962	1987	1962	1987	0.88
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Sequence Information

Coding Sequence: 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