Basic Information

Gene Symbol
NFIL3
Assembly
GCA_029603195.2
Location
JAQSLO010000282.1:339518-343488[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
TF_bZIP
Domain
bZIP domain
PFAM
AnimalTFDB
TF Group
Basic Domians group
Description
bZIP proteins are homo- or heterodimers that contain highly basic DNA binding regions adjacent to regions of α-helix that fold together as coiled coils
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 5.4e-14 7.2e-11 42.6 2.8 1 62 150 211 150 214 0.92
2 2 0.23 3.1e+02 2.2 0.0 39 60 1065 1086 1060 1089 0.82

Sequence Information

Coding Sequence
atggtGGCGGAGTTTGTCGCCCGCCAACATCATTCTAGTTCCCCTGTTAACGGAGAAACACCAGctcaaaattattctaatacaCCGTTATCATTTCATAACAGTTTGAAAGGAACACCATTTATTAATAGTGGTAATAGTAATacttcatcatcatcaccaacacacaatacaaataacaataaaagtaatagtaataataatttaaataacagtgACTCaggaataatatcaaatatgcGTATGACACATTCACCAGCGTTATCAATTAATGGTAACTCAAATGGATCAAATTCagGACATGGATTATTATTACCGAGATCACCTATGTCTCCTATGTCACCACAACATGATAGCTATTCACAAAGTAATTATGAAATGAATCAATTAAAACGTAAAGATTTATTTACGCAACGTAAACAACGGGAATTTATACCAGATAATAAAAAAGATGAGAGCTATTGGGATAGAAGACGTCGTAATAATGAAGCAGCAAAACGTTCACGTGAAAAAAGACGTTTTAATGATATGGTATTAGAACAACGTGTTGTTGAGTTAACAAAAGAGAATCATGTTCTTAAAGCTCAATTGGATGCCATTagagataaatttaatatatgtggTGAAAAATTAGTTAGCGTTGACCAAATATTAGCAACATTACCAACAAGTGAACAAGTTTTAAGTATTACAAAACGtgctaaaatatcaaatacagTACCACCAACAATTATTTATCCATTATCATCAAGTCCAATTTTAACATCTGTTATACAACCATCATTACAAACAAATTCTTTAATagatagtaatagtaataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataacaataataataataataataacaataataataatattaataataataataataataataataatagtggaaGAGATAGTAACATTCCAATTGGTAGCTCGATAACAGCAACAACATCATCTTTATTAAATCATACTACAAATATATTATCTTCCTCATCTTCATCGTCATCCTCTTCTTCTTCATCATCATCTTTATCAACAGCTTTACAAAATCAACCAACATCATCTCAACTAAATTCACCTATTGGTTATATATCATCACGTTCTTATTCAACAAGTACAAcaataaatcaaaagaatttaaataatagtaattcaACTTCACCTGGActacagcaacaacaacattcAAATCAACCACATCCACTGCAACAACATCAAAGTATACTATCTTGTGACAGTACTTCTTCAACAAGTTATTCtcatcatcataataataataaaaataaagtaatatatCATCAGCAACAGCAATTACAATCaaatcatcatcattttcatcataCTAATTGTAATCATCATGATGATAATATCTGTcatcatatatataataataatagtaacaacaacaataataatggaaatcaaaataattctaattcatCATCGAATATTAGTGGACGTTTGGAACGTAATAGTTTTCATCACCGTCCAATATTTGatcaaagaaatgaaaattcaaataataacagCATTAACAGCAGTAGTAATAATGGCAATTTATCTTCTGCTCCAACACCATCATCCACATCGCCATATGATCATCATTCTATATTTTCACATACAAATCATCATCATTTGTCTGGACATTTACCATTCTCTGGTAATAATACAACAAATTCTGGTACTATAATTaatccaaataatattttattatcaaatgatCAAATTGATATACCAACTGGATCAACATCATCAATATTAAATCGTGCGATGTCATCgccgaaattaataattaaaaataatttaaataatggtaCTTTAATTAGTTGTAATAATAACAGCTCTGCAACACCTTCATTATCTTcgccatcatcatcatcgtcaacTGCATCAACAagagaaataagaaataatggtattaacaataataatggaaatataacattaggaaataataataatccgCCACCTTATATTGAACAATATGGTCTTGATGAATTAGCAACAACAACACCACATTTATCTTCAcaccacaataataataataatcaaaatcatCACCATCATTATCATATTCAACATCATCACGATATACATGATCGAGAATACAATGATATAATGAaacatacaattaatttatcatcaaaaataataacacccggtacaacatcatcatcaacagCAGCAGGTACAACAAATATTGATTGTAATAGCCCAACATCATTAATTATCGGTtcgtcatcatcattatcatcatcaccgTCATCAGTATCTggttcatcatcatcaccaacaTCAGCATCAGCTGTTGCAGCTGCAGCAGTTGCATCAGCAGCAgctgctgttgttgctgctgcATCAATACATGGTGTTGTATTAAATGGTAATAATGTATTGAATTTATCACGTCGTAATGTTAATAACAATGACATGggtaataacaataacagttCTAAcatgaatgaaataaataataatacaaatatttgtatCAATAACcgtggtaataataataataataatagtaataataataataataataacaataataataataataaaaataataataatactaataataataataataataataataatagtaataatagtaataataataatagtaataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataacggtgGTTCAACATCACCATGTGATTATTTATCACATTGTAATGTATCATCGAATACATCAAATGATGACGATAATGAAACATGTGGTGACAATTTAGTAACAGCTGTTGATTTACATAATAGTTTGCCACTTAAATTACGTCATAAATCTCATTTGGGTGATAAGGATGCAGCAACAGCACTATTAGCATTACAGCATATTAAACAAGAATATTTACCATCATCACAATCAAGTCCACCATGGGATAATGAAGGTTCAAGTGATGAAAGAGATTCTGGTATATCAATTGGTACAACTGAATGGACATTACATCATCAACGCAAAAATCTAAATAGtagtaataacaacaacaataatgtgaataataataatagtaatggacatataaaaaaatcttctgtgATAAGTGATAAGGAAGAAAATATACATTTGAAATCTCAATTAGCAAGATTAGAATCAGAAGTGgctaatattaaaagtatgatGATACTTGGTACAACGAATGTTGTTAATACAAATTCACAGTAa
Protein Sequence
MVAEFVARQHHSSSPVNGETPAQNYSNTPLSFHNSLKGTPFINSGNSNTSSSSPTHNTNNNKSNSNNNLNNSDSGIISNMRMTHSPALSINGNSNGSNSGHGLLLPRSPMSPMSPQHDSYSQSNYEMNQLKRKDLFTQRKQREFIPDNKKDESYWDRRRRNNEAAKRSREKRRFNDMVLEQRVVELTKENHVLKAQLDAIRDKFNICGEKLVSVDQILATLPTSEQVLSITKRAKISNTVPPTIIYPLSSSPILTSVIQPSLQTNSLIDSNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNINNNNNNNNNSGRDSNIPIGSSITATTSSLLNHTTNILSSSSSSSSSSSSSSSLSTALQNQPTSSQLNSPIGYISSRSYSTSTTINQKNLNNSNSTSPGLQQQQHSNQPHPLQQHQSILSCDSTSSTSYSHHHNNNKNKVIYHQQQQLQSNHHHFHHTNCNHHDDNICHHIYNNNSNNNNNNGNQNNSNSSSNISGRLERNSFHHRPIFDQRNENSNNNSINSSSNNGNLSSAPTPSSTSPYDHHSIFSHTNHHHLSGHLPFSGNNTTNSGTIINPNNILLSNDQIDIPTGSTSSILNRAMSSPKLIIKNNLNNGTLISCNNNSSATPSLSSPSSSSSTASTREIRNNGINNNNGNITLGNNNNPPPYIEQYGLDELATTTPHLSSHHNNNNNQNHHHHYHIQHHHDIHDREYNDIMKHTINLSSKIITPGTTSSSTAAGTTNIDCNSPTSLIIGSSSSLSSSPSSVSGSSSSPTSASAVAAAAVASAAAAVVAAASIHGVVLNGNNVLNLSRRNVNNNDMGNNNNSSNMNEINNNTNICINNRGNNNNNNSNNNNNNNNNNNNKNNNNTNNNNNNNNNSNNSNNNNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGSTSPCDYLSHCNVSSNTSNDDDNETCGDNLVTAVDLHNSLPLKLRHKSHLGDKDAATALLALQHIKQEYLPSSQSSPPWDNEGSSDERDSGISIGTTEWTLHHQRKNLNSSNNNNNNVNNNNSNGHIKKSSVISDKEENIHLKSQLARLESEVANIKSMMILGTTNVVNTNSQ

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

80% Identity
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