Basic Information

Gene Symbol
cnc
Assembly
GCA_001014335.1
Location
JXOR01000130.1:3893-64050[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
TF_bZIP
Domain
bZIP domain
PFAM
AnimalTFDB
TF Group
Basic Domians group
Description
bZIP proteins are homo- or heterodimers that contain highly basic DNA binding regions adjacent to regions of α-helix that fold together as coiled coils
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 7.6e-17 4.9e-14 51.5 7.7 3 64 973 1034 971 1035 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
atgatcTCGAAAAAAGTGTATGTGAAACAGCTATTACAGCTGGCATTGGCATTAAGTCTGATGCGTGTTGATCCGGATAGTTATTTGGGTTGGGGATTAGAATCCCAATTAGCATTAAGAGATACCGGTGGCTGGCAATTGGAATTACGTGCAGCCCCATTGACTGAATATCCATATGCAAATCGTAAGGCAATGATGCCGTTAATCGAGGATTTGGTACGTTTTAATCGTATACCAGAGCCGGATACAAATAATGTAACTGCCTACCTCCTAAACGTACAGTCGGaaataaatcaaacaaatcCAACTGTAGCGTCTACACAACAATCAGATCATGATACGACCAATAGTTTACATGATAGCAGAACAAATTCAACGAATGGTGGTTTTTTGTCACCGATGGTGCCTTCTGAATATGATGCATTCTTTAACCCGGATTTATTAATGGATTCACAATCGGTATTGGAACAAAATTTAGCTGATCTCAGTGATTATGGTGAAAATCCGTTTGCCAATTTTCCATATGCTGGTTTACCAATGAAAGATGAACCCCAAGATTTAAATGTTGATCCATTTAATTTGGCAACGGTTGAAGATGTTGCGGCCAGTACAAGTCGCTTAACTGGTGCGTTATTAACATCACCTGATTCACCACAAACTAATTATTCTTTGCTGATTaacttaaatgatttatatgaGCCGGATAACAATGTGGCTGAGgtgaatgaaacgaaaattaaagaagaacCAGATGTAGAAAAAGAAGAAGTGGTGGTTGTTGATGGTATTCAAGAAGATGACGTGAAACAAGAATCTACAAATGATGATGAACGGAATTCAACAAGTGGTATTAGCGTTAGCACCGTTGAACTGACGGAAGAGGAGAGTGAAATTGTTGAAGGACTATGGAAACAAGACGTTGATCTGGGGTATACATTACAACCACCAAAAATAGCACCGGTAGCTGAACCAAAATTAACAGCTGAATCagatgatgatattgaaaaattgaagGCACTACaagaattgaaaaatgaaaatAAAGATGATTCACCAAAAGAGATCGATGAATGGGCCGgtatttcatttaccattgaCAATGAAACAGGTGAATATATTCAACTACCGCTTCAATTGGATGATATTTTACCAGAAGTTTTTGAGTTTCCTGATCTAACGGATGAAACATCGCAGGATAAAGATATTAAGGAACCAGTGAAAAAATTTGATGAAGAACAATCCGAAGACGATAAATTGCGAGAACGATTAGAAGAAATAATTGACGATTTTTTCGAAGATACAAATCAGCGTGGTGAAACAGCAAGTGcattaaaaattgatcaaGAATTTGATCTAACAAAcgatttatcattaattaatttggaGGATAATGCAACCGATTTAACTGTTGAATTAGAAAAAATGATACAATCAGCTGGACCATTCCAAACGGCTCGTCCGGGTCAAAGTTATGGTCATGCTACAGCAAATGGTTATAGACAACCAGCCTCTTATCATCACCAGtCACGAGTTGGACGATCGGTATCAATGGAACAACGTTTACAAGATTTGGCTAGTTTCTTCAATCCGATACCAAGCATGGGTGTCGGTATGGGCGTAGGTGATATGAGTTACAATCCTCATCATTATCCTTATCACTATCAAgGTACAAATCCTATGGCACATCAACATAGTCAATTCACACATCCTCATCCACAGTTGCATCATAATGCAACCTTATCGGATTTGGGGGCCGCTGTACAACCACATTATGGTCCTAATTTAGGAACAGCAGTATCTTCTAGTATGCACTTAACAAACTCATCACATGATTCAGATGCTGGTGCATCTGGTTATAAATTAGATCACGATATGATGTATTATTCTAATACTTCATCTGAACTGAATCATACTGATGGtttgattaattcaatattcaacgATGAGGATTTACAGCTAATGGACATGGGAGTGAATGATGgCTACTATACGATGCGAATGCTCGAACAAAATTCAACGAGCAACAATTCATCAGTACTAAGCGGTGTAAGTGGCGGTAACCATTTGAATGGTGGTCTTACAGTAAATTCAATGCAAGCAACAAATGTTGGTGCAATTGGTAATCTCGGTGGTACCCATACAGGTGCCGGTGATCGTTTAGATGCATCTAGTGATAGTGCTGTTAGTTCAATGGGATCAGAACGTGTACCGTCTCTATCCGATGGTGAATGGGGTGATACTGGCAGTGATTCAGCTCAAGATTATCATCAAAGTAAATATAATCGGCCCTATAATTACAGTTATAATACACGTTTGGGTGATACAATGGGTAGCCGTCAACCGGCCGTTGCACAAAAGAAACATCAAATGTTTGGTAAACGTATGCAACATGAACAGAATGTGCCATCAACAATGTCTCAACCGGCTGGTGGTGTATTACCACCAACTGAACCAATACAAATtggtaaatatgaatataattcatatggTATGCCGCCACCAGTGACCCAACATAATTTATTGGATGATAATACACCAACAGGTGTTAATGGTTGTCCACCAATTAAGAATGGCGTTATTGGTGGTGGTTGTCCCGGTGCTGGCCAACAATTGATTACAcctgaaatgaaatattcaacaacaTTAGACTTTACACGGCAACGTAACATACATGAATtgataaatcataatcatacGTATACCATGCCGGCAAATAATAATGGTGCAACACCACGGCCACAAATCCGTGATAAAAAGGCACGTAATAAGGCCGAAGATGAGCATCTAACACGCGATGAGAAACGAGCACGCGCTGCAAATATTCCAATGCAAGTACATGATATCATCAATCTACCAATGGATGAGTTTAATGAACGTTTatcaaaatatgatttaagtgaaaatcaGTTATCGTTAATTCGTGATATCCGTCGCCGTGGTAAAAATAAGGTGGCAGCACAAAATTGTCGTAAACGGAAATTGGATCAAATCTTATCGCTAGCTGATGAAGTTAAAGAAGTGAGACGGCGCAAGGAACGTTTATTGTCTGAACGGGATTCAATacataatgaaaagaaacgtATCATGAATAAGTTTTCAGCATTGCACCGACATATTTTCCAgaatctTCGTGATCCAGATGGTAATCCGTATTCATCAGCTCAATATACATTACAACAATCAGCCGATGGATCGGTATTTTTATTGCCCCGtgataataaaacagattCATCTGGTGGTGgcaataattcaaataatccaCACCAAAATAATAGTAATAAGCAAGGTCATGGACATCATtcgcatcatcatcatcatcaatcaCATCGTAAAGAATGA
Protein Sequence
MISKKVYVKQLLQLALALSLMRVDPDSYLGWGLESQLALRDTGGWQLELRAAPLTEYPYANRKAMMPLIEDLVRFNRIPEPDTNNVTAYLLNVQSEINQTNPTVASTQQSDHDTTNSLHDSRTNSTNGGFLSPMVPSEYDAFFNPDLLMDSQSVLEQNLADLSDYGENPFANFPYAGLPMKDEPQDLNVDPFNLATVEDVAASTSRLTGALLTSPDSPQTNYSLLINLNDLYEPDNNVAEVNETKIKEEPDVEKEEVVVVDGIQEDDVKQESTNDDERNSTSGISVSTVELTEEESEIVEGLWKQDVDLGYTLQPPKIAPVAEPKLTAESDDDIEKLKALQELKNENKDDSPKEIDEWAGISFTIDNETGEYIQLPLQLDDILPEVFEFPDLTDETSQDKDIKEPVKKFDEEQSEDDKLRERLEEIIDDFFEDTNQRGETASALKIDQEFDLTNDLSLINLEDNATDLTVELEKMIQSAGPFQTARPGQSYGHATANGYRQPASYHHQSRVGRSVSMEQRLQDLASFFNPIPSMGVGMGVGDMSYNPHHYPYHYQGTNPMAHQHSQFTHPHPQLHHNATLSDLGAAVQPHYGPNLGTAVSSSMHLTNSSHDSDAGASGYKLDHDMMYYSNTSSELNHTDGLINSIFNDEDLQLMDMGVNDGYYTMRMLEQNSTSNNSSVLSGVSGGNHLNGGLTVNSMQATNVGAIGNLGGTHTGAGDRLDASSDSAVSSMGSERVPSLSDGEWGDTGSDSAQDYHQSKYNRPYNYSYNTRLGDTMGSRQPAVAQKKHQMFGKRMQHEQNVPSTMSQPAGGVLPPTEPIQIGKYEYNSYGMPPPVTQHNLLDDNTPTGVNGCPPIKNGVIGGGCPGAGQQLITPEMKYSTTLDFTRQRNIHELINHNHTYTMPANNNGATPRPQIRDKKARNKAEDEHLTRDEKRARAANIPMQVHDIINLPMDEFNERLSKYDLSENQLSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLDQILSLADEVKEVRRRKERLLSERDSIHNEKKRIMNKFSALHRHIFQNLRDPDGNPYSSAQYTLQQSADGSVFLLPRDNKTDSSGGGNNSNNPHQNNSNKQGHGHHSHHHHHQSHRKE

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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