Cced002401.1
Basic Information
- Insect
- Cinara cedri
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_902439185.1
- Location
- CABPRJ010000502.1:786359-795995[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- TF_bZIP
- Domain
- bZIP domain
- PFAM
- AnimalTFDB
- TF Group
- Basic Domians group
- Description
- bZIP proteins are homo- or heterodimers that contain highly basic DNA binding regions adjacent to regions of α-helix that fold together as coiled coils
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 1.3e-10 1.2e-07 31.7 9.1 3 47 1177 1221 1175 1224 0.96
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTCAAAATTAGAGACTAGTGATTCTTCTAACTTGTCTTTGTATTATAAAGAGTTTGGAAGGATGGATGAAAATCCAAATATTACAGCCCAAAATAAACTGTTTCAGGAGCTCAATGAGATGATGATGGAATCATTTTATTTACCGCTTACAGAAGATGTGCAATATAGTTCTGAAATTACTGATCTCATTACTAATTACCAGATAGATTGGAATATTGAATTATGTTTTGAAAATGGTATTGATTTGACAGAAAATGGCATATCCCTTCCATCATCACCTTCATCAAATGAATCAATACTGAGTAGTGATTCTCAATCATCATTAAATTCAAACAGAGAAAAATTGAACATATCAAATTTAAGTAATGATAATAATGCATGTAAAACCCTCGATACAGATTCTTCACCTCCTGAGATTTGGAAATTTCCAGTTCCTACAGAACAAACATTAAATAAAGATATTTCTTCCAAAACTAATACTTCAATAAATAATAATTTGTCTTTAATGCTCAGTAATCATGCAAATAACATATCCTCTCCAGCATCACCTTCATCAAGTTTATCAACACTGAGTAATGATTTTCAATCATCATTAAATTTAAACAGAGAAAAATCAAAAATATTTGAAAATTTAAGTAATGACAATAATACGTTTGAAACCCGCAAGGCAGATTCTCCAACTCGTGTGATTTGGACATTTCCAGTTCCTACGGAACCCACATTAAATGCAAATATTTCGTCCAAAACTAATAGATCAATAAATAATAATTTTGATATGTGTTCAATGCTCAGTAATCGTACAAATAACATATCCTCTCCAGCATCACCTTCATCAAGTTTATCAACACTGAGTAGTGATTCGCAATCATCATTAAATTTAAACAGAGAAATATTGAAAATATCTGAAAATTTAAGTAATGACAATAATACGTTTCAAACCCGCAGGGCAGCTTCTCCAACTCGTGTGATTTGGACATTTCCAGTTTCTACAGAACAAACATTAAATGCAGATATTTCTTCCAAATCTAATAGTACAATAAATAATAATTGTGATGTGCCATCAATAATCAGTAATCATACTAATAACATATCGCCTCCATCATCACTTTCATTTATTGATTTAACATTGAGTAGTGATTCTCAAACATCATTAAATTCAAACAGAGAAAAATCAAAAGTAACTGCTAATTTAAATAATGACAATAATATGTGTCAACCCCGCAATGCAAATGCTTCAGCTCATGAGATTTGGACATTTCCTGTTCCTACGGAACAAACAGTAAATGAAGATATTTCTTCCAAAACTAATAGTTCAAGAAATAATAATTGTGATGTGCCATCAATGCTCAGTAATCATATAAATAACATATCCCCTCCCGTATCACTTTCATTGATTGAATCAGCATTAAGTAGTAATTCTCTATCATCAATAAATTTAAACAGAAAAAAATCGAAAAAATCTACAAATTTAATCAATGAAAATAATATGAGTAAAACCCGCAACACAGATTCTCGAACTCGTAGAATTAGAAAATTTCCAGTTCGTACAAAACCAACATTAAAAGCAGATATTTCCAAGGAAACAAATAGTTCAATAAATAATAATTGTGATGTGCCATCAAGGCTCAGTAATCATATAAATAACATATCCCCTCCCGTATCACTTTCATTGATTGAATCAACATTGAGTAGTGATTCTCAAACATCAATTAATTCAAACAGAAAAAAATCGAAAAAATCTTCAATTTTAAGCAGTGAAAATGATATGTGTAAAACCCACAATACAGTTTCTCGAACATCTAAAATTAGTAAATTTACAGTTCCTACAAAGCCGACATTAAATGCAGATATGTCTTCTGAAACCATTAGTTCAAATAATAATAATTTTTCATTATTAGTTGATGTGTGTTCAATGCTCAGTAATCGTACAAATACCATATCCCCTCCAGCATCACTTTCATCGATTGAATCAACATTGAGTAGTAATACTCAATCATCATTAAATTTAAACAGAAAAAAATTGAAGACATCAAATTTAAGTAATGAAAATAATATGTGTGAACCCCACAATACAGATTCTGCAACTCCTATAATCAAAAAATTTCCAGTTCCTACAAAACCAACATTAAATGCAGATATTTCTTCCATAACTAATAGTTCTATAAATGATAATTTTTCTTTATTAGTTGATGTATGTTCAATGATCAGTAATCATACAAATAACATGTCTCCTCCAGCATCACTTTCATCTATTCAATCAACATCAAATAGTGGTTCTCAATCATCATTAAATTTAAACAGAAAAAAATCAAAAAAATCTTCAAATTTAACCAATGAAAGTAATATGTGTAAAACCAGCAATACAGACTCTCGAACTCGTAAAAATAAAAAATTGTCAGTTTCTACAAAACCAACATTAAATGCAGATATTTCTTCAGAAACTAATAGCTCAACAATTGATGTGTCTTTATCGCTTAGTAATCATATAAATAACATTTGCCCTCCAGCATTACCTGCATCAATTGAATCAACACCGAGTAGAGATTCTCAATCGTCATTAAATTTGAACAGAAAAAAATTGAAAAAATCTCCAAATTTAAGCAATGAAAATATTATGTGTAATACCCGCAATACAGTTTCTCGATCCCGTAATATTAAAAAATTTCCAGTTCCTACAAAATCAACATTAAATGCAGATATTTCTTCTGAAACCAATAGTTCAAAAAATAATAATTTTTGTTTATTAGTTGATGTGTGTTCAATGCTCAGTAATCATACAAATAACATATCTTCTCCAGCATTACCTCCATCAATTGAATCAACACCGAGTAGAGATTCTCAATCGCCATTAAATTTGAACAAAAAAAAATTGAAAAAATCTTCAAATTCAAGCAATGAAAATAATATGAGTAAAACCCGCAATACAGTCTCTCGAACTCGTAAAATTAAAAAATTGTCAGTTCCTACAAAACCAACATTAAATGCAGATATTTCTTCTGAAACTAATAGTTCAACAATTGATATGTCTTTATTGCTTAGTAATCATATAAATAACATTTGCCCTCCAGCATTACCTCCATCAATTGAATCAACACCGAGTAGAGATTCTCAATCGTCATTAAATTTGAACAAAAAAAAATTGAAAAAATCTTCAAATTTAAGCAATGAAAATTTTATATGTAAAACCCGCGATACAGATTCGCCAATTGCTAAAATTAGAAATTTGCCAGTTCCTACAAATCCAACATTAAATGCAGATATTTCTTCCGAAACTAATATTGATGTGTCTTCATTGCTTTGTAATCCTATAAATAGTTCCCAAAGTACAGAATCAAATATTTGTGCATCAAATGACCCTCAAACAATTTCATTAACTCCAGTTGGCTTTGGCTTTTCAAAAATAACCAAATTAATTTGTGGTTCAGTAATTCCAGGAGTATTAAAAAGTAAAACAAAATCTAATAATCGGTTGACATTGCCAAAAGGTGGAATTGATAAATCATTTTCTAGTTTACCCATAGCTAACCAAAAACGTCTTCAACGATTGATAAGAAATCGAGAAGCTGCATGTTTATCTCGTTTAAAAAGAAAAGAGTATGTAGCATCCATTGAAAAAAAATTACATATTTTAGAAAAAGAAAATTTGAAATTAAAAAAGCCAACAAGGCTACAGCTGTATTATCTATCAGTGTTTTTAATGATCTCATTAAATATTGTACCTTTGGGACTATTTAGTCCAGAGCCAATTGACAATTCAGTGATGCATACAAATCATAACATCTTGTGTTTATCATTTATAAATATATCTGAATCAAAAAGAATTGACACTGTGAAAATGGATCGAACCAAGGCATTTTAA
- Protein Sequence
- MSKLETSDSSNLSLYYKEFGRMDENPNITAQNKLFQELNEMMMESFYLPLTEDVQYSSEITDLITNYQIDWNIELCFENGIDLTENGISLPSSPSSNESILSSDSQSSLNSNREKLNISNLSNDNNACKTLDTDSSPPEIWKFPVPTEQTLNKDISSKTNTSINNNLSLMLSNHANNISSPASPSSSLSTLSNDFQSSLNLNREKSKIFENLSNDNNTFETRKADSPTRVIWTFPVPTEPTLNANISSKTNRSINNNFDMCSMLSNRTNNISSPASPSSSLSTLSSDSQSSLNLNREILKISENLSNDNNTFQTRRAASPTRVIWTFPVSTEQTLNADISSKSNSTINNNCDVPSIISNHTNNISPPSSLSFIDLTLSSDSQTSLNSNREKSKVTANLNNDNNMCQPRNANASAHEIWTFPVPTEQTVNEDISSKTNSSRNNNCDVPSMLSNHINNISPPVSLSLIESALSSNSLSSINLNRKKSKKSTNLINENNMSKTRNTDSRTRRIRKFPVRTKPTLKADISKETNSSINNNCDVPSRLSNHINNISPPVSLSLIESTLSSDSQTSINSNRKKSKKSSILSSENDMCKTHNTVSRTSKISKFTVPTKPTLNADMSSETISSNNNNFSLLVDVCSMLSNRTNTISPPASLSSIESTLSSNTQSSLNLNRKKLKTSNLSNENNMCEPHNTDSATPIIKKFPVPTKPTLNADISSITNSSINDNFSLLVDVCSMISNHTNNMSPPASLSSIQSTSNSGSQSSLNLNRKKSKKSSNLTNESNMCKTSNTDSRTRKNKKLSVSTKPTLNADISSETNSSTIDVSLSLSNHINNICPPALPASIESTPSRDSQSSLNLNRKKLKKSPNLSNENIMCNTRNTVSRSRNIKKFPVPTKSTLNADISSETNSSKNNNFCLLVDVCSMLSNHTNNISSPALPPSIESTPSRDSQSPLNLNKKKLKKSSNSSNENNMSKTRNTVSRTRKIKKLSVPTKPTLNADISSETNSSTIDMSLLLSNHINNICPPALPPSIESTPSRDSQSSLNLNKKKLKKSSNLSNENFICKTRDTDSPIAKIRNLPVPTNPTLNADISSETNIDVSSLLCNPINSSQSTESNICASNDPQTISLTPVGFGFSKITKLICGSVIPGVLKSKTKSNNRLTLPKGGIDKSFSSLPIANQKRLQRLIRNREAACLSRLKRKEYVASIEKKLHILEKENLKLKKPTRLQLYYLSVFLMISLNIVPLGLFSPEPIDNSVMHTNHNILCLSFINISESKRIDTVKMDRTKAF
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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