Ccar005221.1
Basic Information
- Insect
- Chrysoperla carnea
- Gene Symbol
- L3MBTL3
- Assembly
- GCA_905475395.1
- Location
- FR997756.1:33089854-33099340[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2HC
- Domain
- zf-C2HC domain
- PFAM
- PF01530
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This is a DNA binding zinc finger domain.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 0.76 4.5e+03 -1.8 0.1 7 12 942 947 938 948 0.83 2 2 5.5e-10 3.2e-06 27.4 2.3 1 29 1078 1107 1078 1107 0.98
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGAGTCAAATACGGGCAGTAGCGTACGCTGCACAATCGAAAATATGGATACAAACCAACCAACGGTATCCGGTGTTGTCGAAACAGTTCGAAGTTTACCACCATCAGTTAATGCAACATCAACAATTCTAAGCAAACCAATTCCATTACGACCGGTTGGGCTGGGATCATCACGTGTGGTTGTTATACAAAGTCCAAATTTAAAAGCATCAGAATTTACACAAGGATCAAATGGACAAATAATGCTATCAGCATTAACACAAAAATCTGCAACCGCAAATAAATCAATACCGTTAACCAATTCCATAATAATTCCATCATCGAATGCATCTCTCATATCCGGCAAATCGCAAATTATGTTACAAACCCCTAAAAATATTGTGCCTGTAACAGTTTCTACTTCGACTGGTAATAAACAACAGTACGCGTACTTAAGTACAATTATGAAACCAGTAACTGCCGTTAACCGTAAAACAAATGAGAATCAAATTTTAACACATCTATCAGTCGTACCAGCACCAACAAATCAAAAAATCGTTTTTAAATCAATTAAACCGAAAGTTCAAACAAGTACCGTGCGACGATTATCTGCAGAAGCTATAAATCCGTTAAACACACCAAAACCCGTTACCCAACAAACAATTCCTACAACCATTAATTCGAATAATTTATTTCTTCCTATTTCCACAGCCACACGTTCTCCTATTATAAAACCTAAACCTTTAAGTTCTGTAATTAATTTAAAAATAACGAATGGTCAAATACAGAGTGAAAATAAATCGGGCATAACAGTATTACGTGAAAATTCGTTTCCTACTATGGCTTCTTCACAACAACAAGTACCTCAACCGCCTAGACCTCACCAACCTCCACCCTTACAATTGTTAACAAAACCAATGCCATCAATGCCGGCACCCACAATTACCACAAGTTGTGTGAAAATTCCAACTCCAACAGAAAAAGAAATCCCACCGATCATAACAGCCGAAAAAGAGTATACGCTTTCTATACCAGAGGGAAATACAAATTTTCTCGATGCTGATTCATCAATTGAATTGTCAATAAAAGAAAATTCGACTGATACCGTGGAAGTAACATGTACTATATCAAACTCGAAAGAAAAACCGAAAAACGGTAGTAGTAGTGGAAATGGTGATAAAAATCGAAGTGATTTGACGATCGAGAAAAATAATAATACGGCAGCAAATGAACCATCAAGTACACCGAAAAAAATTCATGAAGTAGCAATTTTAAAAAAACCGCGTCTATCGTTACAAGATACAGATTGGAAAAAATCACGTACTGATTTTGTTTCAATTCTTGATCGGGATAAAGAGAAAAAACCGGATGAAATAGATACGGTCAAAATCGTTCCGCTAAATTTGGAAATGAAGAAAAAAGAAAAAGAACCAGACATTCAAGAGGCAGTTATTGAGAATAAACTGCCAGAAATAACGAAAACAATTGTTACAGAACGCCGACGTAAATCGCATAATACAATTTTAAAGGACGATGATGAAATCGAATTCACGTCAAGTATGTCACCAGAATATGATGATCAAGGACCACCAAAATTTAAACCACATCTAGATACAACATTCAAAAAATTATCTATGCGTAAAGAGTTAGCAACGAAATCAAAGTTGGCCGTAGATGATATACAAATTGAGTTAATAAAAAAAGAGGAGCCACCATCTGAATTAACATCTGAAGAAGATTTTGATTTAATCAAAGCTTTAGAATGGGAAGATGGTATTGGTAAATTGCCTGGAAGTGATTTAAAATTCCATATCAATGAATTTGGTTTTGTACAAATGGTTACTGACAGTGATATTGAACGTATCAAGTCATCGTCGACCGCTATTAATAAAATGGAAAATAATGGATGTGAATTTACAAAACCAATTAAGAAATTAGATTCAGAGATTGTTTTATATTGTATTGCTTGCGGCTGCTACGGTTGTCGATCGGAATTTATGTCGTCAATGTTTTGTTCCACATCATGTTCGGAACGATATTCTAAAGAAACTGATGCTAAGAATAAGAAAAAAGGCGATAAGAAACCAGTTAATTTAAGTAAAAAGAAATCTTCTAATGAATTCGAAACAACGTCAGCAAATATAAAAACAGAAGTCGGTAGTTCAAACGGTACACCAGCCCAAAGTGATGATGATAATACATCAAACGATACGACACAAGGCCGAACATACCCATGGCTAACCGGTAAAAAAGGTTTTTCATGGGCAAAATATTTAACACATATTAATGGCAAATCAGCACCAATAAAATTATTTAAAGAACCATTTCCATACACAAAAAATGGCTTTAAAGTTGGTATGAAATTAGAAGGTATTGATCCACAACATCCGTCCCATTATTGCGTATTGACTGTTGCCGAAGTATTAGGATACCGTTTACGTTTACATTTTGATGGATATCCAGATAAACATGATTTTTGGGTGAATGCCGATTCATTAAATATATTCCCAATTGGGTGGTGTGATAAAAATAATCATAAGCTATATCCACCAAAAGGACATTCTCAGGATGTTTTTAATTGGACGACATATTTGAAACAATGCAAAGCACAACCAGCTCCACGTGGGTTGTTCTTAAATCGTCCAGAAAATTCACCATGTCCAAATGGATTTAGACTTGGTATGAAATTAGAAGCAGTTGATAGAAAAAATTCGTCTCTAGTTTGTGTAGCAACGGTTTCTGATATTATGGACAACCGAATACTTGTACATTTTGATAGTTGGGATGATATTTATGATTACTGGGCAGATCCTTCATCACCATACATACATCCTGTTGGATGGTGTGAATCAAAGGGACATAGTTTAACACCACCAAATAAAATCTACAAGTTTTCCCAACAATACGATGGATCAAGTTTTAAAGATCCAGAAACATTCACTTGGGAAACGTATTTAAAAGAAACAAAATCACAAGCAGCGCCTGCGAGAGCATTTAAACAACGACCTCCAAAGGAATTTAAACGTGGTATGCGTATTGAATGTGTTGATAAACGTGTACCGCGGTTTATTCGTGTTGCAACTGTCGACGATGTTCGTGATCATCAGATACGTGTTAGTTTTGATGGGTGGCCGGATAAGTATAGCTATTGGGTTGATGATGATAGTCCAGATATACATCCCGCTGGTTGGTGCCAAAAAAGTGGTCACCCGATTCAACCTCCGTTAACACCGGAAGATATTTATAGTTCAGAATGTACTACACCTGGATGTCGAGGTTGGGGTAATGCATTAGGACCACATTTAGAAGTTCATCATATAGCCGCTGCGTGTCCATATTCTGATGAGAATTACGATAAAGAATTAATTTCGGATCGATTATTGGGTGACTTGAAACCTGAAAAACCTGACGAAGCTGTACCGTTATCTAAAGAACCAAAAAGACATGCAGCAGATTCTACAACTGCAAGTTCCACAATTAAAGAAAATAAATATACGAAACGAAAAAATTATAACTGTGATAGTGATGACGAATGGTCGTCTATACGTGGCGCTATGAATGTTGGAAATATTGACAAATCAAAACCGAGCAAAAAACGAAAACGTACTCAATCACAGGATCAAGACGACGACAACCACCCATCACTTAACAACTTTGTATCAAAATTAATGGTACGACCTGATGCAGATTTATTAAAAAGTGTTACGCAAGATAATTACGATCCAACTTTAATACCAGATCCAAATAAAATCACTCCATTCCGTTGGGAAAAACATTCAAAGAATATCGCACCATATGTAAATAATGTAAAAGATCCACGCACATGGACCGAACATGATGTTGTTGAATTTATTAGCACAATACCAAGTTGTAAAGATTTAAGTATTGTGTTCTCAAAACATCAAATTGATGGCGAGGCATTGTTAATGTTATCACAACATGATTTAACATCCATATTAGGTTTTAAATTAGGTCCCGCCATTAAATTATATAACAGTATTGTGCTATTAAGACAAAATGTTTTAATGTGTTGTTAA
- Protein Sequence
- MESNTGSSVRCTIENMDTNQPTVSGVVETVRSLPPSVNATSTILSKPIPLRPVGLGSSRVVVIQSPNLKASEFTQGSNGQIMLSALTQKSATANKSIPLTNSIIIPSSNASLISGKSQIMLQTPKNIVPVTVSTSTGNKQQYAYLSTIMKPVTAVNRKTNENQILTHLSVVPAPTNQKIVFKSIKPKVQTSTVRRLSAEAINPLNTPKPVTQQTIPTTINSNNLFLPISTATRSPIIKPKPLSSVINLKITNGQIQSENKSGITVLRENSFPTMASSQQQVPQPPRPHQPPPLQLLTKPMPSMPAPTITTSCVKIPTPTEKEIPPIITAEKEYTLSIPEGNTNFLDADSSIELSIKENSTDTVEVTCTISNSKEKPKNGSSSGNGDKNRSDLTIEKNNNTAANEPSSTPKKIHEVAILKKPRLSLQDTDWKKSRTDFVSILDRDKEKKPDEIDTVKIVPLNLEMKKKEKEPDIQEAVIENKLPEITKTIVTERRRKSHNTILKDDDEIEFTSSMSPEYDDQGPPKFKPHLDTTFKKLSMRKELATKSKLAVDDIQIELIKKEEPPSELTSEEDFDLIKALEWEDGIGKLPGSDLKFHINEFGFVQMVTDSDIERIKSSSTAINKMENNGCEFTKPIKKLDSEIVLYCIACGCYGCRSEFMSSMFCSTSCSERYSKETDAKNKKKGDKKPVNLSKKKSSNEFETTSANIKTEVGSSNGTPAQSDDDNTSNDTTQGRTYPWLTGKKGFSWAKYLTHINGKSAPIKLFKEPFPYTKNGFKVGMKLEGIDPQHPSHYCVLTVAEVLGYRLRLHFDGYPDKHDFWVNADSLNIFPIGWCDKNNHKLYPPKGHSQDVFNWTTYLKQCKAQPAPRGLFLNRPENSPCPNGFRLGMKLEAVDRKNSSLVCVATVSDIMDNRILVHFDSWDDIYDYWADPSSPYIHPVGWCESKGHSLTPPNKIYKFSQQYDGSSFKDPETFTWETYLKETKSQAAPARAFKQRPPKEFKRGMRIECVDKRVPRFIRVATVDDVRDHQIRVSFDGWPDKYSYWVDDDSPDIHPAGWCQKSGHPIQPPLTPEDIYSSECTTPGCRGWGNALGPHLEVHHIAAACPYSDENYDKELISDRLLGDLKPEKPDEAVPLSKEPKRHAADSTTASSTIKENKYTKRKNYNCDSDDEWSSIRGAMNVGNIDKSKPSKKRKRTQSQDQDDDNHPSLNNFVSKLMVRPDADLLKSVTQDNYDPTLIPDPNKITPFRWEKHSKNIAPYVNNVKDPRTWTEHDVVEFISTIPSCKDLSIVFSKHQIDGEALLMLSQHDLTSILGFKLGPAIKLYNSIVLLRQNVLMCC
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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