Cruf002258.1
Basic Information
- Insect
- Chrysomya rufifacies
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_014858695.1
- Location
- JACGTJ010032674.1:1-13036[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- THAP
- Domain
- THAP domain
- PFAM
- PF05485
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 34 0.00085 1.3 9.9 0.5 1 28 26 51 26 54 0.86 2 34 1e-07 0.00015 22.4 1.7 1 56 65 113 65 114 0.79 3 34 1.3e-15 1.9e-12 47.8 0.3 1 87 155 227 155 227 0.83 4 34 2e-14 2.9e-11 43.9 3.4 1 86 308 376 308 377 0.78 5 34 1.1e-15 1.6e-12 48.0 5.5 1 87 401 473 401 473 0.81 6 34 1.7e-12 2.4e-09 37.8 1.0 1 87 508 576 508 576 0.81 7 34 1.1e-11 1.6e-08 35.1 2.8 1 86 617 686 617 692 0.73 8 34 1.3e-14 1.9e-11 44.5 0.2 1 87 714 784 714 784 0.80 9 34 1.6e-15 2.4e-12 47.4 1.2 1 86 806 875 806 876 0.80 10 34 3.8e-14 5.6e-11 43.0 1.8 1 87 904 976 904 976 0.85 11 34 2.5e-05 0.037 14.8 0.1 1 79 1047 1117 1047 1125 0.72 12 34 1.7e-10 2.5e-07 31.3 0.4 1 86 1148 1219 1148 1220 0.78 13 34 8.3e-16 1.2e-12 48.4 2.7 1 87 1251 1322 1251 1322 0.80 14 34 4.9e-15 7.2e-12 45.9 3.6 1 87 1368 1441 1368 1441 0.85 15 34 3e-13 4.4e-10 40.2 0.8 1 86 1463 1530 1463 1531 0.82 16 34 1.5e-15 2.2e-12 47.5 0.4 1 87 1827 1896 1827 1896 0.80 17 34 1.6e-13 2.3e-10 41.1 4.5 1 86 1954 2037 1954 2038 0.78 18 34 8.5e-13 1.3e-09 38.7 0.8 1 87 2072 2144 2072 2144 0.80 19 34 4.6e-12 6.8e-09 36.4 0.9 1 85 2172 2239 2172 2241 0.81 20 34 5.4e-14 7.9e-11 42.6 0.8 1 87 2261 2331 2261 2331 0.79 21 34 1.4e-13 2.1e-10 41.2 2.0 1 87 2354 2425 2354 2425 0.80 22 34 2.1e-05 0.031 15.0 0.2 1 59 2441 2488 2441 2515 0.77 23 34 2.1e-12 3.1e-09 37.4 4.0 1 86 2529 2598 2529 2599 0.81 24 34 1.5e-12 2.2e-09 37.9 3.6 1 86 2624 2694 2624 2695 0.81 25 34 8.7e-15 1.3e-11 45.1 2.5 1 86 2715 2787 2715 2788 0.76 26 34 1.6e-11 2.3e-08 34.6 2.9 1 86 2808 2877 2808 2878 0.80 27 34 7.1e-14 1e-10 42.2 4.0 1 86 3310 3386 3310 3387 0.82 28 34 1.7e-08 2.5e-05 24.9 0.7 1 86 3406 3476 3406 3477 0.76 29 34 2.4e-12 3.6e-09 37.3 4.3 1 86 3494 3565 3494 3566 0.79 30 34 0.00026 0.39 11.5 1.7 1 61 3604 3664 3604 3688 0.71 31 34 6.6e-13 9.8e-10 39.1 2.2 1 87 3711 3785 3711 3785 0.85 32 34 1e-14 1.5e-11 44.8 1.8 1 86 3808 3880 3808 3881 0.84 33 34 2.1e-13 3.1e-10 40.7 4.0 1 86 4044 4119 4044 4120 0.83 34 34 3e-12 4.4e-09 37.0 0.3 1 86 4145 4214 4145 4215 0.82
Sequence Information
- Coding Sequence
- GCTTCTAATTCAACAACAAATTCTTCATTTTCCTACCACAATAACAATGATGCCATACAAGATGATGATGCCATGTGTTGTGTACCAAAATGTGGTGTTAGTAAATATTCAGCACCATCTTTACAATTCTTTGGTTTCCCCAGAGATGAAAAAGAAAGTTCTGGAGGATTTCCGGGTGGAGAAATGGCTAAATGTAGCATGCCCGGATGTCCTTCTCAAAGAGGAGAAACAAATGTAAAATTTCATGTTTTCCCAAGGGATTTGAAAACCTTAATAAAATGGTGTCAAAATTCACGTCTACCAGTGCACAGTAAAGATAATAGATTCTTTTGTTCTCGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGCACAGTTTATGGTAAAATCCATGATAATCCTAATATTTATCAAGAAGAGAAAAAATGCTTTTTACCTTTTTGTCGACGTAGTAGATCTTATGATTGTAATTTATCTTTGTATAGATTCCCTAGAGATGAAACTTTATTAAGACGTTGGTGTTATAATTTAAGATTAGATCCTAATATGTATAGAGGTAAGAATCATAAAATATGTTCTTCACATTTTATAAAAGAAGCCTTAGGCTTAAGAAAACTAAATCCAGGGGCCGTGCCCACTTTAAATTTAGGTCATAATGATAGATTTAATATATATGAAAATGAATTGTATACACCACCGCCGCCGCCACCTCCACCGCCTACACAACCTTCCACTTCAAAAGCACATAAATTTGAAAGACTTTTTAAACAGGAAATGGGTTCGGGTTCACATATTTACGATAATGTTTTTATGAATTCTATGGTGCAAAAATATTCCTCTTCGACGTCCTCTAATTCCGGCAATAATTTAGATTTAGGTGATGTTTGCTTAGTGCCCTCGTGTAAAAGAACTAGACATACAACAGATATTACTTTACATACGGTACCAAAACGTCCAGAGCAATTGAAGAAATGGTGTCATAATTTGAAGTTGGATTTAACCAAAATGCACAAAAGTGTAAGAATTTGTAGTGCACATTTCGAAAAGTATTGTATTGGTGGCTGTATGCGTCCTTTTGCTGTACCCACTTTAGAATTGGGTCATGAAGACACAAATATCTATCGTAATCCTGATGTTATTAAGAAACTTAATATAAGAGAAACTTGCTGCGTACAATCGTGTAAAAGAAATCGTGATCGTGATCATGCTAATCTTCATAGGTTTCCAACACATCCCGAGTTACTGCAAAAATGGTGTGAGAATCTACAGAAGCCTATACCCGATGGCACTAAGCTATTTAATGATGCTGTTTGTGAAATACATTTCGAAGATAGATGTTTGCGTAATAAACGTTTAGAAAAATGGGCTATACCCACTTTGAATTTAGGTTGGGATGAGGCGCCTCACAGTTTGCCTTCAGAGGAAGAAATAAATGAAAATTGGGTTAAGCCTTTTGCTCCCAATAATGGTGATGAACAAGGAGAATGCTGTGTTGCCTCTTGTAAACGTAATCCTCAAATTGATGATATTAAATTGTATCGACCTCCGGAAGATGCTGAACAATTAGTTAAATGGGCCCATAATTTACAGGTAGAAGTAACGGAATTACCAAACCTTAAAATTTGTAATCTGCATTTTGAGCAGCATTGCATAGGCAAAAGATTACTTAACTGGGCCATGCCTACTTTGAACTTGGGAGGCAAAGTTGAACATCTCTTTGAAAATCCTCCACCTATGCCTACGGTTTACAAAAAGAAAGTTAAACCTGAAAGAATGTTATCAAATCAAGAAGCTATTAAATGGTCACCTAGATGTTGTCTACCTCACTGTCGTAAAATGCGTTCAGTGGACAAAGTGCATTTGTTCCGTTTTCCCTATAACAATCGCCAAACTTTGGCCAAATGGTGTCATAATTTACAGCTACCTTTGGTGGGTTCTTCCCACCGCAGAATATGTTCTTCACATTTTGAATCTTCTGTTTTAACTAAACGCTGTCCCATGTCATTGGCTGTACCCACCTTAGATTTAAATGCACCTCCTGGCTATAAAATCTATCAAAATCCCGCACGTTTAAAACAAGTAAAACCAGGTGCCCAAAGACAATGTATTATAGAGTCTTGCCGTAAAACTAAATTGGATGGTGTTACTTTATATCGCTTTCCTAACAATCGATCTATTTTATATAAATGGCGTCATAATATTAAAAATTGGCCTAAGGGTAAATTGACTTCACTAATGAGAATTTGTGCGGAACATTTTGAGCCGCATTCGGTAAGTGAAAGAAAATTATCTCCCGGAGCAATACCAACTTTAAATTTGGGTCATGATTCTAAAGATTTATATTCAAATGAAACAAGATCGTATTTCGATTTGGAAAAATGTGTAGTAAATGGTTGTGATTCTCGTAAAGAGATGGAAGATATACGTCTATTCCGTTTCCCCAGAGATGATGAGGAATTGTTAAAGAAATGGTGCCATAATTTACAAATGAATCCTAATGATTGTGTCGGTATTAAATTATGTAGCAAACACTTTGAGGCGGAATGTTTGGGTCCCAGACAGCTTTATAAATGGGCTATACCCACTTTGAAATTGGGACATAAAGAAGATGATTTGGTAGATATAATACCAAATCCACCACCGGAACAAAGAAGCGGAGAATTCCTTTTCAAATGTTGTGTTCCGGGTTGTGGTAAAACACGTAAATATGATGATGCTCAAATGAATAGTTTCCCCAAACATTTGAAACTATTCCGCAAATGGAAACATAATTTGAAATTGGACTTTCTTAACTTTAAGGAAAGAGATAAATATAAAATATGTAATGATCATTTCGAACCTATATGCGTGGGTAAAACTAGACTTAACTTTGGAGCTTTACCTACTTTAAATTTGGGCCACGATGATGTAGATGACCTTTATCAAATTAATCCCGAAAGAATAAGACCCAATTTGTTTATTAAACATAAAGATGCTGAAAGATTGGAACGCCGAAGAATCTTACGCTCAGAACAAACAGAACAATATGATCAGTGTGAAGAAGAAACCCAGCCCCAAGAAGAAGCAACAGATCCTTTAAGTTTAGAGCCTACAGATGTAAAATGCTGTGCGACAGAATGTGCTGCTCCCAAAACTATCATGAGAGAACCTTATGATTTACCAGATTCCAAAACATTTAAACAAATGTGGCTTAAGGAGTTAGCAGACCAAGAAGAAGAGGAAATAGACGATTTTCCTTTGTTGGATAATAAAATTTGTGGTTTACATTTCCAAATGGTATTCAATAAATTTAAGGATAAAATGCAGCAACTAAGTGAGGACAATGAGGAATTATTAACGGACTTTAATAAATTATTATATAATTATCAAAAATCAAATATATCTTTAGTGGTTAATAGCTATCAGTGCAGAGTTTTGGAGTGCACTTCCAATTTATTAAATCCCAACTTAAGATTGTACTTCTTTCCCTATGGCAAAAATTTAGTTGCCAAATGGTCTCACAACACTGGTATAATACCCGACGAACATCGTCGTTATATGAACAAAGTGTGTAATTTACATTTTGAGTCTTATTGTATAACTGAAAACCAAAGACTAAGATCCTGGGCTATACCCACTTTAAAACTACCACAACAAGAAGAAAATAAAACCATATATAAGAATCCTGATCTTACCAAGTTGGATAAAAGAATGTTGGGTCCACAAATCTTTAAATGCGCAGTTAAGAATTGTAATTCCTCTAAATCTGATGACACGGAAACGATTAAACTTTTTAACTTTCCTAGCGATGACAAACTACTTAAGCAATGGTGTGACAATCTTAAAATGTCTCATCATTTTACACCCCTATTGAAAATATGTTCTTTACATTTTGAGAAATTATGCTTTGGCAATACACGCATTAGATCCTGGGCTATACCTACACTTAATTTGGGCCACAATGACCAACCCGAACATGTTAACAAAACTGTTATAAACAAAGAAGTTGTAGAAGAAACTCCTGTCGAGACTAAAGATCTACAATTAAAACAAGTTAAGATCAAAAGAGTTTTAGATAGTGCCAAATGTTTTGTGTCCTCTTGTCGTAAAAGTCGTTTAAAACATGGTGTACGTTTCTATAGTTTACCCTCTAATCCACGTTTAAAACGCAAATGGTTGCATAATTTACAAATTAAAAATTTAAAATCCTTACCAAAAATGCAAAATATTAAAATCTGCAATTTACATTTCCATAAACGTTGTCTAGATGGTAAACAATTAAAATCTTGGGCTGTTCCCACACTACATTTGGGCCATGGCGATAATATCCATGACAATCCACGTAGACGACAAAATATACCTTTGTTACGTTGTGCTTTAAAGCATTGCAAAAATCATGAGAATCTTAAGGGTATCAGAGCATTTGTTTTTCCCAAATCTTTGGAATTTCTAGAGAAATGGTCTAAGAATTTAAAATTAGATTTAGACAAGTGTAAGGGTCGTATATGCCGGGAACATTTCGAACCTGAAGTTATAGGTGAACGTAAACTAAAAAGTGGTGCTGTTCCCACAAGAAATTTGGGGCATAATGATCCTGACATTTATGATAATAGTGGCTTAAAGGAAAAGTCTGTCACACATAAAATCGAAGAAGTTAAAATAACCTCAGACAATGATGTAGATTATGAACCTCATTCTGAAGAGGAAGAGGAGGAATTATGGGAGACTGATGTAGAAGAGGAAGAACAGGAGGAGCAAGAAGAGGAACTAGAGCAAATTAATTATGATGATGAGGAGGAGGAAGAAGAAAACGAAGATGAAGAAGAAGAATTAGAAATAGACGAGGAAGAGATAGATCGAGAAGAAGATGAAGATGAAGAAGAAGTTTATACAAAGGAAAAAGTTGAAGAAAGATCTGTGGAAGATGATAATATTAGTGTTAGTTATTCCATTAGTGATTGGAGTTCTATTAAGTTTAAGGAGTT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- Protein Sequence
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