Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_014858695.1
Location
JACGTJ010002562.1:1800-7285[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 4e-10 4.1e-07 30.0 0.1 3 45 1181 1223 1181 1224 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAGACAAACTAAACAAACGACAGCACAGGTGACGGTATCCTCACCTAACAGTAGTCAATCTTATAAAATAGATACAAATCCCCAGCCAACGGCACAGACACAAACACAAAATTCCAGACCCAGAACTTGGAATATGCAATTGCTAAATTCCTCCCAAAATGTGGCCATAACTGTTGATGAGGTAAATACCGATAATACCAATGATTCCTCTAATAATTCCCAAACTAAAATAAAAGAGGAAGAAATTGAAATTGGTTTATCCAATACCATTAATTCCAATCTTTTCAATTTGGTTAAAATTGATCAGAAACCTGTAGAATGTAATTTATGTCATCGTAAATTTAAAAATGTACCCGCCCTTAATGGTCATATGCGTCTACATGGTGGCTATTTCAAAAAGGATCCCGAAACCAAGAAAAGCGAGAAGAAAGAAAACAGTGGTCCTCCCTTGCAGACGGCAAGTATAGGTGTCAGAGCCTTAATAGAAGAGAAAATTATAAGTAAAAGAAGTAAAGATTTAAATAAGGGTGCCTTTGTAGTCCCTGCACCTCCCTCGATTAATAATCAAAGTACTAGCACCACCTTACGTAGATCCATTAGTGGAGATTTGGATAGCTTCCTTAATCCCAAGCCCCAAACGAATAGTACAACAACCACTTCAACGTCAAATCAACAAAATTCCACACAACAACAGCTACCAGCGGCAACAACTATAAAAAATACTACCAAATCCAATATCAATGTACAAGATATTAACTTGCCACAAAGTATCGAAATCTATAGTACTAAGCAGCAGCAACAAAAGACAATGAATAATACCGGAGTTGGCACCACAACTGCCACCTCCCTAAATGTCGAACGTAGTGCAACGAAATTAACTACAACAACAGCAACGATTAATACAACGACAACACGAAGTACATCAACCGATCCAAAAGATTCAACGTTAATTGAATTATTGAAACGAGGTACTCGCATAGCGGTAACCCAAAAACCGCCCAATAATACACCTTTGGGAGGGGTAACCCGGCAAATAATAACAAATAAAAATAATTGTAGTGTTATAATACCCTCCGAGGTACAAGTGGTATCAACCAAAGGTAAACTCAAGAAAGATGATCATTTACAAATGTCAAATTCCACTAATGTAACCCTGCCCGATGGTACACCTTTGTCTTTGACTATTGCCCAGGGTGGGGATAGTAATAGTGAAGTATATACGGTTACCTATACCAGTGATGGTTCGGCTATATTTGGTGAAAATGAAGTTTATAATGTCAGTGAAGCTGAAATGTTGTTGCAAACTGTCGATACTATGCAGTTGTTGAGTGATGCTGGCGATAATTTAAAATCTGAACATTCCGAACAATTTGAAGTCATGGATGATAAAATTAAACTGGAAATTGAGCAACAAAATCGTGAGGATCAACAGCAACAACAGCAACAGTTGTCTCAAAATACCAACCAATGTCAAACTACACAAAGTTTACCTAATTTCCAACATTTCCATTCCAAAGAATTAATCATACAAAATTCAAATTTAATTAATCACCAACATCAACAGCCAGCCCAACAAATTAGAACAAATACCTTGTCGTTGCCACAAGATATGAAAAACCAGTTTGCCTCTTCTCTTAATTCGCCTATACATTCTCCTTTAGCTTATCCCACACCACCCTCCAGCCATGAAAATGTTACTCAAACTTCTCCCTATATAGAGGATAATCACCATTTCAATGATGCACCCAATATATTCTTTAGTGAGTCTTTAATATCCAACAATCAAGCAGCCGAAAGTGATAATGATAAGATAATGAAATTAAAAAGTGTTTTAGAAGATAACTCTTTCGATTCTAACATAAAGGTTGAAGATTTATTAAATGGCACTGATCCAGATACAGAATGTGATTTACGAGAATTTGCTGAAGCTAATTTATCTTTCCTCGATGAAGATCAAGAATTCTTAAACGATTCTCGTAATGCTACTTCTCCTTTGTCAGAATCATTCTTCACTAGTGGCATAGGAACAGCTGAAGAAGTAAAAGAGGTATTACGTGAGGTTCTTACAGAAGATCAATTAAATTTGAATTGTGAAAATCAAGGGGAGAATATTATAGATTTGTATTATTTACCTGGTTTAAGTTTACAATCACAAATGATGCCCAATTCTGAAGATCCTTTATTATCCTCATCGCCAAGAGATTTTGGTCAGCAACAGAAAATGCCCAATCAAATGTCTCAACAGCAACAAACTCAAACACAACAACAGCAACCTAATCAGACACAACAAATCCAACACATTCCTCAACAACAGCAACAAAATCTTAATCAACAACACTCTATAAATTTTAATAATCAACATCAACAGCAACAAATGGGGCAACAAACCCAAACTGTTAAAATTTCATTGGATGCTAATGCTCAATCATCAGTAGGTTCCACTAATTCTTCCACAGAAATAAATCAATTGATTTTAAATATACCTTCTAATGTAATACAGAACTCCTGCAATCCAAATTCTAATTCAAATATAAATTCCTCCAATAATACTACAACTATACACTATAATGTACAAAATTTACCACAAGTACAAAATCAAACTACTACAAATAATAATCAAATCCAGTCTCAATCCCAACAGCAGCAACAACAAACGTTACACTTGCAACCCCAGCAGCAGTCACAACAATTCTTAAACTCTACCAGCATAAATTCTCTAAATGAGGCCTTAATGCAGCCTATAATTTATACTAGTGGTACCACCGATAAAATGGAACTAAAATTAGACAACAGTAACACTCACACAAATTCCAATAACACACAACTCTCAAATATTCTTAATCTCAATAAACCTGTAGATATCGTAAAAAGCACTTCCTCCAGCCATATAATATTTCCGCAACAACATCACTCCTCCAGCTCTGCAGTCTCCACTTCGTTGCAACCTTTATCAAATCAAACAAACTCTATTTTAAAAAGACGTTTAAAAGGTCATGGTCATTCTTCTTTGGATACTTCTTCATCACATTCTTCTTTCTCCAAATATCAAGCTTTATCGCCATATAAATCAAAACTTCGCAAACCTTCTCGTACTCACTACACGCCTGCACCTATTTTAAATCCAGAACGGAAAGGGCACGGTTTGTATTGTAATGTTTTGAAACAACTGGGTTGTTCACTATTGAGTTTTGATACATTTGATGATGATTTCGACGATCCAGTGGGTTTGGTCGATTTCTCCGACGAATCTAAAGTTAACTTGGGCTCAGCTTATCAAGCTGCTATACCTGCATTTAACGAAGCAGCTAGTTCAACGGCACAAGTAGAGGAACCTGTTGGTTGTGATCTGATGTGGGATCCGGAAGTTCAAAAGGATGATAAGATTTTAATGAGATTCATAGATTTAAGTAAATCTTCCGCTGTACCCTTGGGCAGTCACTCGGAGGAGGTTGCTTTGGAAGCTCTACTAAAGGCTCAGGGTAATACAGCAACGGCTGTTTTGACATTACTACAGACCCAATCTAATTCATTCCAAATCAAGTGGTCATCACAGGAGTTGGAGGTATTTTTAAAGGGTTTGGAAAAATATGGGAAGGAGTTTAGTAAGATTTCGAAGGAGCTTGGTTCGAAAAGCACAGGCGAATGTGTACAAATGTATTATTTCTGGAAGAAATTATGTGTAGACTATAAGGTAACCCACCTTAAAACCGAAACACCACCACAAAGTCATGCCAATGATCCCAAACCTTATGTATGCGAAATACCAGATTGTTCAGCGAGCTTTTCCTCCAAAGCTGCTTTGCATGGTCACACTCGCATCCATACTTATGGGCGTAATTCTCACAATAACCAACATAGTAGCAATAACAATACGAATGCCACAACTACTAATAGCAACGCAAATTCCTCGCAAGCTTCTGCTACAAATAGCAGTAGCAATCACCATCCAATGCATAACAATACCCAATCTAGTCATGCCAATACGGCGAATCCAAACCAAAAAGATAATAATGCCAATAAAGACAATACCGAATTCCCCTGCAAGGTGTGCGGCAACGAAGATTCTCTACTCATAGAAGTTTTTAAACAAAATCGTTGA
Protein Sequence
MRQTKQTTAQVTVSSPNSSQSYKIDTNPQPTAQTQTQNSRPRTWNMQLLNSSQNVAITVDEVNTDNTNDSSNNSQTKIKEEEIEIGLSNTINSNLFNLVKIDQKPVECNLCHRKFKNVPALNGHMRLHGGYFKKDPETKKSEKKENSGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRSKDLNKGAFVVPAPPSINNQSTSTTLRRSISGDLDSFLNPKPQTNSTTTTSTSNQQNSTQQQLPAATTIKNTTKSNINVQDINLPQSIEIYSTKQQQQKTMNNTGVGTTTATSLNVERSATKLTTTTATINTTTTRSTSTDPKDSTLIELLKRGTRIAVTQKPPNNTPLGGVTRQIITNKNNCSVIIPSEVQVVSTKGKLKKDDHLQMSNSTNVTLPDGTPLSLTIAQGGDSNSEVYTVTYTSDGSAIFGENEVYNVSEAEMLLQTVDTMQLLSDAGDNLKSEHSEQFEVMDDKIKLEIEQQNREDQQQQQQQLSQNTNQCQTTQSLPNFQHFHSKELIIQNSNLINHQHQQPAQQIRTNTLSLPQDMKNQFASSLNSPIHSPLAYPTPPSSHENVTQTSPYIEDNHHFNDAPNIFFSESLISNNQAAESDNDKIMKLKSVLEDNSFDSNIKVEDLLNGTDPDTECDLREFAEANLSFLDEDQEFLNDSRNATSPLSESFFTSGIGTAEEVKEVLREVLTEDQLNLNCENQGENIIDLYYLPGLSLQSQMMPNSEDPLLSSSPRDFGQQQKMPNQMSQQQQTQTQQQQPNQTQQIQHIPQQQQQNLNQQHSINFNNQHQQQQMGQQTQTVKISLDANAQSSVGSTNSSTEINQLILNIPSNVIQNSCNPNSNSNINSSNNTTTIHYNVQNLPQVQNQTTTNNNQIQSQSQQQQQQTLHLQPQQQSQQFLNSTSINSLNEALMQPIIYTSGTTDKMELKLDNSNTHTNSNNTQLSNILNLNKPVDIVKSTSSSHIIFPQQHHSSSSAVSTSLQPLSNQTNSILKRRLKGHGHSSLDTSSSHSSFSKYQALSPYKSKLRKPSRTHYTPAPILNPERKGHGLYCNVLKQLGCSLLSFDTFDDDFDDPVGLVDFSDESKVNLGSAYQAAIPAFNEAASSTAQVEEPVGCDLMWDPEVQKDDKILMRFIDLSKSSAVPLGSHSEEVALEALLKAQGNTATAVLTLLQTQSNSFQIKWSSQELEVFLKGLEKYGKEFSKISKELGSKSTGECVQMYYFWKKLCVDYKVTHLKTETPPQSHANDPKPYVCEIPDCSASFSSKAALHGHTRIHTYGRNSHNNQHSSNNNTNATTTNSNANSSQASATNSSSNHHPMHNNTQSSHANTANPNQKDNNANKDNTEFPCKVCGNEDSLLIEVFKQNR

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01194890;
90% Identity
-
80% Identity
-