Basic Information

Insect: Catotricha subobsoleta
Gene Symbol: zfh2_2
Assembly: GCA_011634745.1
Location: JAABKK010000077.1:9386036-9427710[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-C2H2
Domain: zf-C2H2 domain
PFAM: PF00096
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 17 1.4 1.2e+02 4.1 0.4 2 23 136 158 135 158 0.94

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10 17 0.00063 0.053 14.6 2.5 2 23 1508 1530 1507 1530 0.94

11 17 0.00096 0.081 14.0 3.9 1 23 1624 1648 1624 1648 0.92

12 17 0.026 2.2 9.5 0.6 1 22 1670 1691 1670 1694 0.89

13 17 0.012 0.99 10.6 0.1 1 23 1778 1802 1778 1802 0.93

14 17 5.2 4.4e+02 2.3 4.2 1 19 1971 1989 1971 1994 0.91

15 17 0.00018 0.015 16.3 2.8 1 23 2680 2702 2680 2702 0.98

16 17 0.00098 0.082 14.0 2.3 1 23 2845 2867 2845 2867 0.98

17 17 0.006 0.5 11.6 0.3 2 23 3263 3285 3262 3285 0.97

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	17	1.4	1.2e+02	4.1	0.4	2	23	136	158	135	158	0.94
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Sequence Information

Coding Sequence: 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